More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_3278 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_3510  histidine kinase  91.41 
 
 		 559 aa  920    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.026405 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3278  ATPase domain-containing protein  100 
 
 		 563 aa  1097    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.471224  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4870  GAF sensor signal transduction histidine kinase  55.74 
 
 		 566 aa  504  1e-141  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.125677  normal  0.401535 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0974  putative signal transduction histidine kinase  41.1 
 
 		 584 aa  280  6e-74  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.575526  normal  0.658515 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3119  ATPase domain-containing protein  36.54 
 
 		 535 aa  163  6e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1706  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.32 
 
 		 564 aa  108  3e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.98975  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0341  GAF sensor signal transduction histidine kinase  32.33 
 
 		 725 aa  106  1e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0143238  hitchhiker  0.0051816 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1108  GAF sensor signal transduction histidine kinase  31.37 
 
 		 464 aa  105  3e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2549  GAF sensor signal transduction histidine kinase  34.42 
 
 		 456 aa  105  3e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5015  GAF sensor signal transduction histidine kinase  39.71 
 
 		 399 aa  104  4e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.36327  normal  0.324397 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33000  PAS domain S-box  31.67 
 
 		 547 aa  103  6e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.569309  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1204  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.57 
 
 		 779 aa  103  1e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0284  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.69 
 
 		 591 aa  102  3e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1357  GAF sensor signal transduction histidine kinase  38.83 
 
 		 403 aa  101  3e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.246673  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0641  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.78 
 
 		 1648 aa  102  3e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1842  histidine kinase  35.29 
 
 		 529 aa  100  6e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1055  putative signal transduction histidine kinase  38.24 
 
 		 401 aa  100  7e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.64157  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1071  GAF sensor signal transduction histidine kinase  38.24 
 
 		 401 aa  100  7e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0809665 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1082  GAF sensor signal transduction histidine kinase  37.75 
 
 		 401 aa  100  7e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0662  sensor histidine kinase  31.58 
 
 		 381 aa  99.4  1e-19  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_600  sensor histidine kinase  31.58 
 
 		 381 aa  99.4  1e-19  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0751439  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2729  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.47 
 
 		 665 aa  99.8  1e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2043  histidine kinase  30.81 
 
 		 388 aa  99  2e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0631  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.1 
 
 		 381 aa  99.4  2e-19  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000982334  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2291  histidine kinase  29.67 
 
 		 596 aa  98.6  3e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2170  GAF sensor signal transduction histidine kinase  28.79 
 
 		 550 aa  95.1  3e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4013  histidine kinase  35.65 
 
 		 637 aa  95.1  3e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0760  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.17 
 
 		 610 aa  94.7  4e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000018635  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1568  histidine kinase  32.83 
 
 		 462 aa  94.4  5e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0602  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.44 
 
 		 584 aa  93.6  8e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.416305  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2712  nitrate/nitrite sensor protein NarQ  33.33 
 
 		 572 aa  92.8  1e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1285  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.19 
 
 		 742 aa  92.8  2e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19690  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.82 
 
 		 352 aa  92  2e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4896  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.14 
 
 		 517 aa  92.4  2e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0133704  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5967  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.88 
 
 		 605 aa  92  3e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.142305 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3746  GAF sensor signal transduction histidine kinase  34.63 
 
 		 373 aa  91.7  3e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.200726  normal  0.275416 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0064  GAF sensor signal transduction histidine kinase  34.42 
 
 		 396 aa  92  3e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.693223  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0252  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.69 
 
 		 591 aa  92  3e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0165579 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2849  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.68 
 
 		 682 aa  90.9  5e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.790064  normal  0.747278 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4226  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.44 
 
 		 682 aa  90.9  5e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.203059 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4708  histidine kinase  31.25 
 
 		 523 aa  91.3  5e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0507  Histidine kinase  32.18 
 
 		 373 aa  89.7  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3775  GAF sensor signal transduction histidine kinase  28.97 
 
 		 548 aa  89.7  1e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01200  sensory histidine kinase in two-component regulatory system with NarL  31.05 
 
 		 598 aa  89  2e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.690529  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2424  histidine kinase  31.05 
 
 		 598 aa  89  2e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0527369  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2401  nitrate/nitrite sensor protein NarX  31.05 
 
 		 598 aa  89  2e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000322457 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1705  nitrate/nitrite sensor protein NarX  31.05 
 
 		 598 aa  89  2e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.55706  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0456  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.72 
 
 		 775 aa  89.4  2e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00143274 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1652  histidine kinase  33.78 
 
 		 373 aa  89  2e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000168648  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4528  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.8 
 
 		 461 aa  89  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.25442  normal  0.575982 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1070  histidine kinase  34.02 
 
 		 430 aa  89  2e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01210  hypothetical protein  31.05 
 
 		 598 aa  89  2e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.678292  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1331  nitrate/nitrite sensor protein NarX  31.05 
 
 		 598 aa  89  2e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.150699  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1687  signal transduction histidine kinase, nitrate/nitrite-specific, NarQ  33.8 
 
 		 643 aa  89.4  2e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.461201  normal  0.659068 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1372  nitrate/nitrite sensor protein NarX  31.05 
 
 		 598 aa  89  2e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.497152  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1918  nitrate/nitrite sensor protein NarX  31.05 
 
 		 598 aa  89  2e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0184147  normal  0.168413 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2899  nitrate/nitrite sensor protein NarX  33.33 
 
 		 594 aa  88.2  3e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2369  nitrate/nitrite sensor protein NarQ  31.5 
 
 		 563 aa  88.6  3e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1983  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.83 
 
 		 469 aa  88.2  4e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.143525 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2703  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.66 
 
 		 552 aa  88.2  4e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.191431 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6398  histidine kinase  34.3 
 
 		 461 aa  87.8  5e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.176497 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1670  signal transduction histidine kinase, nitrate/nitrite-specific, NarQ  29.45 
 
 		 446 aa  87.4  6e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38430  PAS domain S-box  31.97 
 
 		 552 aa  87.4  6e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0227  GAF sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 421 aa  87.4  7e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1510  histidine kinase  33.82 
 
 		 378 aa  87  8e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0382398 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2407  nitrate/nitrite sensor protein NarQ  33.49 
 
 		 572 aa  86.7  9e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3261  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 463 aa  87  9e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21830  histidine kinase  29.47 
 
 		 391 aa  87  9e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00305219  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1389  nitrate/nitrite sensor protein NarX  30.59 
 
 		 598 aa  86.3  0.000000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0922186  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1400  histidine kinase  27.6 
 
 		 413 aa  86.3  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.558809 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3489  nitrate/nitrite sensor protein NarQ  33.68 
 
 		 560 aa  86.7  0.000000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0416624  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02360  sensory histidine kinase in two-component regulatory system with NarP (NarL)  31.46 
 
 		 566 aa  85.5  0.000000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.161159  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1201  histidine kinase  31.46 
 
 		 566 aa  85.5  0.000000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2374  sensor histidine kinase  26.98 
 
 		 372 aa  85.5  0.000000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0968027  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2292  sensor histidine kinase  26.59 
 
 		 365 aa  85.5  0.000000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2414  GAF sensor signal transduction histidine kinase  31.34 
 
 		 545 aa  85.9  0.000000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02322  hypothetical protein  31.46 
 
 		 566 aa  85.5  0.000000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.147876  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3690  nitrate/nitrite sensor protein NarQ  31.46 
 
 		 566 aa  85.9  0.000000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2580  histidine kinase  31.4 
 
 		 422 aa  85.9  0.000000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.880661  normal  0.0603036 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1208  nitrate/nitrite sensor protein NarQ  31.46 
 
 		 566 aa  85.5  0.000000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2615  nitrate/nitrite sensor protein NarQ  31.46 
 
 		 566 aa  85.9  0.000000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.538567  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2463  GAF sensor Signal transduction histidine kinase  28.62 
 
 		 415 aa  86.3  0.000000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1033  Histidine kinase  33.33 
 
 		 395 aa  85.5  0.000000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2598  nitrate/nitrite sensor protein NarQ  31.46 
 
 		 566 aa  85.5  0.000000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2748  nitrate/nitrite sensor protein NarQ  31.46 
 
 		 566 aa  85.9  0.000000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.560652  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1897  nitrate/nitrite sensor protein NarX  30.14 
 
 		 598 aa  85.5  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.149462 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5201  GAF sensor signal transduction histidine kinase  33.48 
 
 		 393 aa  85.1  0.000000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.849708 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1557  nitrate/nitrite sensor protein NarX  30.14 
 
 		 598 aa  85.5  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0417714 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1374  nitrate/nitrite sensor protein NarX  30.14 
 
 		 613 aa  85.5  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0573196  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1961  nitrate/nitrite sensor protein NarX  30.14 
 
 		 598 aa  85.5  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.68817 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2497  histidine kinase  33.63 
 
 		 1031 aa  85.1  0.000000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0918719  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0833  GAF:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, HAMP region:histidine kinase, dimerization and phosphoacceptor region  30.18 
 
 		 646 aa  84.7  0.000000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0228489 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0444  signal transduction histidine kinase, nitrate/nitrite-specific, NarQ  30.8 
 
 		 603 aa  84.7  0.000000000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00168683  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2673  nitrate/nitrite sensor protein NarQ  30.2 
 
 		 566 aa  84.3  0.000000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2739  nitrate/nitrite sensor protein NarQ  30.2 
 
 		 566 aa  84.3  0.000000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2624  nitrate/nitrite sensor protein NarQ  30.2 
 
 		 566 aa  84.3  0.000000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2846  nitrate/nitrite sensor protein NarQ  30.2 
 
 		 566 aa  84.3  0.000000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2713  nitrate/nitrite sensor protein NarQ  30.2 
 
 		 566 aa  84.3  0.000000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.774679 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3064  GAF sensor signal transduction histidine kinase  31.5 
 
 		 544 aa  84.3  0.000000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.980645 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4230  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.95 
 
 		 478 aa  84  0.000000000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.304751 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>