More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_3119 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_3119  ATPase domain-containing protein  100 
 
 		 535 aa  1024    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0974  putative signal transduction histidine kinase  39.95 
 
 		 584 aa  200  7e-50  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.575526  normal  0.658515 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4870  GAF sensor signal transduction histidine kinase  36.92 
 
 		 566 aa  177  3e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.125677  normal  0.401535 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3278  ATPase domain-containing protein  34.87 
 
 		 563 aa  153  8e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.471224  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3510  histidine kinase  35.24 
 
 		 559 aa  151  4e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.026405 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4921  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.74 
 
 		 412 aa  105  1e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0892179  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4013  histidine kinase  34.31 
 
 		 637 aa  103  6e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0153  histidine kinase  36.63 
 
 		 325 aa  101  3e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1070  histidine kinase  35.51 
 
 		 430 aa  101  3e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2020  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.62 
 
 		 771 aa  100  5e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1316  sensor histidine protein kinase  30 
 
 		 525 aa  100  5e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.176896  normal  0.0650582 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0826  Histidine kinase  35.21 
 
 		 412 aa  100  6e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2612  GAF sensor signal transduction histidine kinase  40.39 
 
 		 391 aa  99.8  1e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0662  sensor histidine kinase  34.15 
 
 		 381 aa  97.8  4e-19  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_600  sensor histidine kinase  34.15 
 
 		 381 aa  97.8  4e-19  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0751439  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1809  histidine kinase  32.22 
 
 		 640 aa  97.1  6e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0341  GAF sensor signal transduction histidine kinase  35.29 
 
 		 725 aa  97.4  6e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0143238  hitchhiker  0.0051816 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1685  Histidine kinase  35.68 
 
 		 397 aa  97.1  7e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.842631 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0631  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.15 
 
 		 381 aa  97.1  7e-19  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000982334  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5078  histidine kinase  35.5 
 
 		 368 aa  95.1  2e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.9788 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0744  sensory box histidine kinase  33.99 
 
 		 799 aa  95.5  2e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.13864  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0614  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.21 
 
 		 468 aa  95.1  3e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2497  histidine kinase  35.71 
 
 		 1031 aa  94.4  5e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0918719  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07820  putative histidine kinase  33.5 
 
 		 797 aa  94  6e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0365473 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3241  Histidine kinase  33 
 
 		 393 aa  93.6  7e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4708  histidine kinase  34.16 
 
 		 523 aa  93.6  8e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2027  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  28.92 
 
 		 401 aa  93.2  9e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.109719  normal  0.72788 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1108  GAF sensor signal transduction histidine kinase  28.44 
 
 		 464 aa  92.8  1e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3926  histidine kinase  33.48 
 
 		 598 aa  92.8  1e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3498  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.95 
 
 		 596 aa  93.2  1e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00492042 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5127  PAS/PAC sensor Signal transduction histidine kinase  32.91 
 
 		 799 aa  92  2e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0179  histidine kinase  37.44 
 
 		 418 aa  92.4  2e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1706  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.28 
 
 		 564 aa  92.4  2e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.98975  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3248  histidine kinase  32.21 
 
 		 403 aa  92  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.298805  normal  0.646005 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0848  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.94 
 
 		 363 aa  91.7  3e-17  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1880  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.05 
 
 		 662 aa  91.7  3e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0862215  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06640  histidine kinase  29.13 
 
 		 404 aa  92  3e-17  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.106239  normal  0.143286 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0789  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.55 
 
 		 469 aa  91.7  3e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2510  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.58 
 
 		 640 aa  92  3e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3261  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.64 
 
 		 463 aa  91.7  3e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3594  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.02 
 
 		 598 aa  91.7  3e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1763  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.82 
 
 		 594 aa  91.3  4e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5329  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.49 
 
 		 595 aa  91.3  4e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2464  ATPase domain-containing protein  26.13 
 
 		 344 aa  91.3  4e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1965  histidine kinase  31.64 
 
 		 662 aa  91.3  4e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.632766  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1687  signal transduction histidine kinase, nitrate/nitrite-specific, NarQ  34.13 
 
 		 643 aa  91.3  4e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.461201  normal  0.659068 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2416  histidine kinase  26.13 
 
 		 344 aa  91.3  4e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3080  bacteriophytochrome  31.02 
 
 		 783 aa  90.9  5e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1296  GAF sensor signal transduction histidine kinase  35.09 
 
 		 386 aa  90.5  6e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.99492 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1998  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.25 
 
 		 658 aa  90.5  7e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3575  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.64 
 
 		 475 aa  90.5  7e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0649  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.38 
 
 		 490 aa  90.1  9e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3765  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.31 
 
 		 638 aa  90.1  9e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1983  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.12 
 
 		 469 aa  89.7  1e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.143525 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1783  histidine kinase  33.48 
 
 		 501 aa  90.1  1e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000211372 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1913  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.16 
 
 		 700 aa  89.7  1e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.6571 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1362  histidine kinase  28.84 
 
 		 351 aa  89.7  1e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0117705  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1652  histidine kinase  38.24 
 
 		 373 aa  89.7  1e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000168648  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_935  sensor histidine kinase  29.59 
 
 		 1226 aa  89.7  1e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5015  GAF sensor signal transduction histidine kinase  34.48 
 
 		 399 aa  90.1  1e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.36327  normal  0.324397 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2170  GAF sensor signal transduction histidine kinase  28.04 
 
 		 550 aa  89  2e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1562  sensor histidine kinase  28.46 
 
 		 351 aa  89  2e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000749794  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06146  sensory box histidine kinase  32.82 
 
 		 710 aa  89  2e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0682167  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0347  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.67 
 
 		 442 aa  89.4  2e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0286068  normal  0.880673 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2634  histidine kinase  34.18 
 
 		 343 aa  89  2e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000175326  hitchhiker  0.00557176 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0117  serine/threonine protein kinase and signal transduction histidine kinase with GAF and PAS/PAC sensor  34.67 
 
 		 2361 aa  89  2e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4477  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.79 
 
 		 471 aa  89  2e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01020  sensory box histidine kinase  32.82 
 
 		 710 aa  89  2e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0755055  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1064  sensory box sensor histidine kinase  28.21 
 
 		 1101 aa  88.6  3e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1231  histidine kinase  30.88 
 
 		 482 aa  88.2  3e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1347  sensor histidine kinase  30.77 
 
 		 351 aa  88.2  3e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.31288  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1321  sensor histidine kinase  30.77 
 
 		 351 aa  88.6  3e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000375238  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1320  sensor histidine kinase  30.77 
 
 		 351 aa  88.6  3e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00123004  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1600  sensor histidine kinase  28.46 
 
 		 351 aa  88.2  3e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000696667  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1456  sensor histidine kinase  30.77 
 
 		 351 aa  88.2  3e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00592106  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1530  sensor histidine kinase  30.77 
 
 		 351 aa  88.6  3e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.90364e-25 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3788  phytochrome  33.67 
 
 		 772 aa  88.6  3e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0317187 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0159  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.59 
 
 		 508 aa  88.2  3e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0895  sensor histidine kinase  30.21 
 
 		 451 aa  88.2  3e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.622783  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5256  histidine kinase  30.15 
 
 		 1063 aa  88.2  3e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.015523  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0946  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.57 
 
 		 1229 aa  87.8  4e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4005  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.52 
 
 		 801 aa  88.2  4e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2521  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.51 
 
 		 594 aa  88.2  4e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0533071  normal  0.360744 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1633  putative signal transduction histidine kinase  32.72 
 
 		 636 aa  87.8  4e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0985206 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6470  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.75 
 
 		 471 aa  88.2  4e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.629472  normal  0.491206 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1315  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 344 aa  87.8  5e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2171  histidine kinase  35.32 
 
 		 594 aa  87.4  5e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1902  histidine kinase  34.8 
 
 		 457 aa  87.4  5e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.723867  normal  0.134322 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0746  histidine kinase  31.71 
 
 		 387 aa  87.8  5e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2714  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.31 
 
 		 1168 aa  87.8  5e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6964  histidine kinase  33.62 
 
 		 399 aa  87.4  6e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.198128  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1261  sensor histidine kinase  28.9 
 
 		 467 aa  87  7e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.405254  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1204  multi-sensor signal transduction histidine kinase  24.93 
 
 		 779 aa  87  7e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4793  cyclic nucleotide-binding protein  35.2 
 
 		 795 aa  87.4  7e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.271636  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0440  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.14 
 
 		 795 aa  87  8e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2487  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.32 
 
 		 412 aa  87  8e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1055  putative signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 401 aa  87  8e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.64157  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1071  GAF sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 401 aa  87  8e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0809665 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5386  two component sensor kinase  32.35 
 
 		 361 aa  87  8e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1029  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.76 
 
 		 411 aa  87  8e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.342445  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>