More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_1842 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013946  Mrub_1842  histidine kinase  100 
 
 
529 aa  1030    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2703  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  70.51 
 
 
552 aa  701    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.191431 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1992  multi-sensor signal transduction histidine kinase  43.04 
 
 
574 aa  322  9.999999999999999e-87  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0873865  normal  0.754427 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1568  histidine kinase  36.6 
 
 
462 aa  178  2e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3261  multi-sensor signal transduction histidine kinase  47.6 
 
 
463 aa  170  5e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1983  multi-sensor signal transduction histidine kinase  45.67 
 
 
469 aa  162  2e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.143525 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0760  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.19 
 
 
610 aa  149  1.0000000000000001e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000018635  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2549  GAF sensor signal transduction histidine kinase  31.77 
 
 
456 aa  144  3e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21830  histidine kinase  37.19 
 
 
391 aa  144  6e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00305219  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1268  histidine kinase  35.02 
 
 
392 aa  143  9.999999999999999e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2043  histidine kinase  41.38 
 
 
388 aa  139  2e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3064  GAF sensor signal transduction histidine kinase  30.93 
 
 
544 aa  137  5e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.980645 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2414  GAF sensor signal transduction histidine kinase  30.42 
 
 
545 aa  137  5e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2790  Sensor DegS domain protein  39.63 
 
 
393 aa  135  1.9999999999999998e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1864  Sensor DegS domain protein  37.5 
 
 
391 aa  135  1.9999999999999998e-30  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000165606  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1108  GAF sensor signal transduction histidine kinase  29.3 
 
 
464 aa  134  6e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5201  GAF sensor signal transduction histidine kinase  37.29 
 
 
393 aa  133  6.999999999999999e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.849708 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0798  histidine kinase  37.81 
 
 
347 aa  133  1.0000000000000001e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0507  Histidine kinase  35.07 
 
 
373 aa  132  1.0000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3775  GAF sensor signal transduction histidine kinase  28.25 
 
 
548 aa  132  2.0000000000000002e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2820  GAF sensor signal transduction histidine kinase  30.39 
 
 
545 aa  131  3e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.771324  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4921  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.99 
 
 
412 aa  124  6e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0892179  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0227  GAF sensor signal transduction histidine kinase  35.5 
 
 
421 aa  121  3e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0456  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.42 
 
 
775 aa  121  3e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00143274 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3746  GAF sensor signal transduction histidine kinase  33.21 
 
 
373 aa  121  3.9999999999999996e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.200726  normal  0.275416 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1399  PAS  38.31 
 
 
683 aa  118  1.9999999999999998e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.04458 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0153  histidine kinase  40.8 
 
 
325 aa  119  1.9999999999999998e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19690  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.5 
 
 
352 aa  118  3e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1551  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.5 
 
 
407 aa  117  3.9999999999999997e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.538677  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5536  sensor histidine kinase  27.68 
 
 
523 aa  117  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3248  histidine kinase  34.45 
 
 
403 aa  117  5e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.298805  normal  0.646005 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0159  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.82 
 
 
508 aa  117  6e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5592  sensor histidine kinase  28.05 
 
 
523 aa  116  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013207  Aaci_3079  histidine kinase  31.22 
 
 
223 aa  115  1.0000000000000001e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2027  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  34.84 
 
 
401 aa  115  2.0000000000000002e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.109719  normal  0.72788 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3937  histidine kinase  31.95 
 
 
366 aa  115  2.0000000000000002e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0383335  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1928  GAF sensor signal transduction histidine kinase  30.5 
 
 
652 aa  114  3e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.18674  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2107  histidine kinase  35.05 
 
 
379 aa  115  3e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0341  GAF sensor signal transduction histidine kinase  34.63 
 
 
725 aa  114  5e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0143238  hitchhiker  0.0051816 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2729  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.15 
 
 
665 aa  114  5e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1706  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.78 
 
 
564 aa  113  8.000000000000001e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.98975  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1530  sensor histidine kinase  32.11 
 
 
351 aa  113  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.90364e-25 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1347  sensor histidine kinase  32.11 
 
 
351 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.31288  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1321  sensor histidine kinase  32.11 
 
 
351 aa  113  1.0000000000000001e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000375238  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1320  sensor histidine kinase  32.11 
 
 
351 aa  113  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00123004  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0602  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.38 
 
 
584 aa  112  1.0000000000000001e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.416305  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1456  sensor histidine kinase  32.11 
 
 
351 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00592106  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1204  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.95 
 
 
779 aa  112  2.0000000000000002e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4870  GAF sensor signal transduction histidine kinase  32.13 
 
 
566 aa  112  2.0000000000000002e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.125677  normal  0.401535 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0185  histidine kinase  32.5 
 
 
395 aa  112  2.0000000000000002e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000303796  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5416  sensor histidine kinase  28.74 
 
 
516 aa  112  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5541  sensor histidine kinase, putative  27.18 
 
 
523 aa  111  3e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0284  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.39 
 
 
591 aa  111  4.0000000000000004e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1105  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.72 
 
 
546 aa  110  4.0000000000000004e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5206  GAF sensor signal transduction histidine kinase  28.5 
 
 
523 aa  110  5e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5092  two-component sensor protein  29.56 
 
 
523 aa  110  6e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1562  sensor histidine kinase  31.19 
 
 
351 aa  110  8.000000000000001e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000749794  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0252  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.62 
 
 
591 aa  110  8.000000000000001e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0165579 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0235  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.28 
 
 
402 aa  110  9.000000000000001e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2580  histidine kinase  33.33 
 
 
422 aa  109  1e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.880661  normal  0.0603036 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2344  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.14 
 
 
480 aa  109  1e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.165919 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1600  sensor histidine kinase  31.19 
 
 
351 aa  109  1e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000696667  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1362  histidine kinase  31.19 
 
 
351 aa  109  1e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0117705  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5507  sensor histidine kinase  29.56 
 
 
523 aa  109  1e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4063  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.92 
 
 
372 aa  108  2e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5109  sensor histidine kinase  26.46 
 
 
523 aa  108  2e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1141  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.57 
 
 
445 aa  108  2e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.697723  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0880  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.05 
 
 
446 aa  108  3e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.263045  normal  0.427062 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2612  GAF sensor signal transduction histidine kinase  34.57 
 
 
391 aa  108  3e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3044  Sensor DegS domain protein  35.27 
 
 
381 aa  107  5e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000367044  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0718  histidine kinase  39.23 
 
 
433 aa  107  6e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.217794 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0921  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.12 
 
 
446 aa  107  6e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1070  histidine kinase  35.61 
 
 
430 aa  107  7e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3993  histidine kinase  37.81 
 
 
456 aa  106  8e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.841388  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3850  sensor histidine kinase  30.73 
 
 
351 aa  106  9e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000154691  hitchhiker  0.000000000165716 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1494  sensor histidine kinase  30.73 
 
 
351 aa  106  9e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000467986  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4365  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.17 
 
 
468 aa  106  1e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.665132  normal  0.714097 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1122  histidine kinase  33.02 
 
 
357 aa  106  1e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.277853  normal  0.812788 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0652  histidine kinase  38.26 
 
 
395 aa  106  1e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0746  histidine kinase  35.22 
 
 
387 aa  105  2e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0744  sensory box histidine kinase  37.62 
 
 
799 aa  104  3e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.13864  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0117  serine/threonine protein kinase and signal transduction histidine kinase with GAF and PAS/PAC sensor  36.61 
 
 
2361 aa  104  3e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0614  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.45 
 
 
468 aa  104  3e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1315  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.36 
 
 
344 aa  105  3e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2849  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.54 
 
 
682 aa  104  4e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.790064  normal  0.747278 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2291  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.82 
 
 
464 aa  104  4e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1029  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.64 
 
 
411 aa  104  5e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.342445  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41030  Periplasmic sensory histidine protein kinase, two-component  37.23 
 
 
458 aa  104  5e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0649951  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0631  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.47 
 
 
381 aa  103  8e-21  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000982334  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1033  Histidine kinase  36.58 
 
 
395 aa  103  9e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0662  sensor histidine kinase  31.25 
 
 
381 aa  103  1e-20  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0357  sensor histidine kinase  35.47 
 
 
459 aa  102  1e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.450318  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_600  sensor histidine kinase  31.25 
 
 
381 aa  103  1e-20  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0751439  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3420  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.38 
 
 
440 aa  102  1e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0662145 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6981  histidine kinase  35.18 
 
 
389 aa  103  1e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.69549  normal  0.8933 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3762  histidine kinase  31.58 
 
 
358 aa  102  2e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00011366  unclonable  0.0000145112 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4289  GAF sensor signal transduction histidine kinase  35.21 
 
 
552 aa  102  2e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2660  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.5 
 
 
494 aa  102  2e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.575282 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2291  histidine kinase  30.5 
 
 
596 aa  102  2e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0347  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.27 
 
 
442 aa  102  2e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0286068  normal  0.880673 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>