More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_0456 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_0456  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 775 aa  1539    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00143274 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1706  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  43.46 
 
 		 564 aa  149  1.0000000000000001e-34  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.98975  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4226  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.57 
 
 		 682 aa  146  1e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.203059 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0227  GAF sensor signal transduction histidine kinase  40.74 
 
 		 421 aa  142  1.9999999999999998e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0341  GAF sensor signal transduction histidine kinase  38.39 
 
 		 725 aa  140  1e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0143238  hitchhiker  0.0051816 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1105  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.04 
 
 		 546 aa  135  1.9999999999999998e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2810  putative signal transduction histidine kinase  36.59 
 
 		 501 aa  134  5e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2043  histidine kinase  32.77 
 
 		 388 aa  128  4.0000000000000003e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1347  sensor histidine kinase  33.8 
 
 		 351 aa  128  5e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.31288  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1321  sensor histidine kinase  33.8 
 
 		 351 aa  128  5e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000375238  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1320  sensor histidine kinase  33.8 
 
 		 351 aa  128  5e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00123004  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1456  sensor histidine kinase  33.8 
 
 		 351 aa  128  5e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00592106  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1530  sensor histidine kinase  33.8 
 
 		 351 aa  128  5e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.90364e-25 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4661  histidine kinase  37.78 
 
 		 380 aa  127  1e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.249963  hitchhiker  0.00746099 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2849  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.29 
 
 		 682 aa  126  1e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.790064  normal  0.747278 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2729  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.87 
 
 		 665 aa  127  1e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2580  histidine kinase  36.44 
 
 		 422 aa  126  1e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.880661  normal  0.0603036 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1562  sensor histidine kinase  33.33 
 
 		 351 aa  125  2e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000749794  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1362  histidine kinase  33.33 
 
 		 351 aa  126  2e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0117705  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1600  sensor histidine kinase  33.33 
 
 		 351 aa  125  3e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000696667  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3850  sensor histidine kinase  33.33 
 
 		 351 aa  124  5e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000154691  hitchhiker  0.000000000165716 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1494  sensor histidine kinase  33.33 
 
 		 351 aa  124  5e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000467986  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0507  Histidine kinase  38.97 
 
 		 373 aa  124  8e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3248  histidine kinase  30.83 
 
 		 403 aa  123  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.298805  normal  0.646005 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4896  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.59 
 
 		 517 aa  122  3e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0133704  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1842  histidine kinase  35.42 
 
 		 529 aa  121  4.9999999999999996e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5536  sensor histidine kinase  35.78 
 
 		 523 aa  120  6e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2080  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.06 
 
 		 370 aa  121  6e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0347  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.47 
 
 		 442 aa  121  6e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0286068  normal  0.880673 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19690  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.78 
 
 		 352 aa  120  7.999999999999999e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5541  sensor histidine kinase, putative  36.24 
 
 		 523 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0641  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.21 
 
 		 1648 aa  119  9.999999999999999e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5416  sensor histidine kinase  35.78 
 
 		 516 aa  120  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5092  two-component sensor protein  35.78 
 
 		 523 aa  119  1.9999999999999998e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1992  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.27 
 
 		 574 aa  119  1.9999999999999998e-25  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0873865  normal  0.754427 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5206  GAF sensor signal transduction histidine kinase  35.32 
 
 		 523 aa  119  1.9999999999999998e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5592  sensor histidine kinase  35.78 
 
 		 523 aa  118  3e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5507  sensor histidine kinase  35.78 
 
 		 523 aa  119  3e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1903  GAF sensor signal transduction histidine kinase  35.07 
 
 		 370 aa  117  6e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000111521  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1937  histidine kinase dimerisation and phosphoacceptor region  35.07 
 
 		 370 aa  117  6e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000507079  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3669  histidine kinase  38.94 
 
 		 489 aa  117  6.9999999999999995e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1385  sensor histidine kinase  33.8 
 
 		 377 aa  117  8.999999999999998e-25  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00939681  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4486  GAF sensor signal transduction histidine kinase  35.98 
 
 		 582 aa  116  1.0000000000000001e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2487  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.64 
 
 		 412 aa  117  1.0000000000000001e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1029  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.39 
 
 		 411 aa  115  2.0000000000000002e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.342445  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5264  two-component sensor protein, C-terminus  35.27 
 
 		 193 aa  116  2.0000000000000002e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5109  sensor histidine kinase  35.32 
 
 		 523 aa  116  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1070  histidine kinase  33.49 
 
 		 430 aa  115  2.0000000000000002e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0826  Histidine kinase  36.49 
 
 		 412 aa  116  2.0000000000000002e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4605  histidine kinase  34.32 
 
 		 403 aa  115  3e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.506334 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3542  histidine kinase  33.77 
 
 		 431 aa  115  4.0000000000000004e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.787824 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5201  GAF sensor signal transduction histidine kinase  34.65 
 
 		 393 aa  115  4.0000000000000004e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.849708 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1423  sensor histidine kinase VraS  30.08 
 
 		 348 aa  114  6e-24  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3924  PAS/PAC sensor Signal transduction histidine kinase  35.77 
 
 		 363 aa  114  8.000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.278559  hitchhiker  0.00726573 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2703  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.73 
 
 		 552 aa  112  2.0000000000000002e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.191431 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0321  sensor histidine kinase, putative  30.99 
 
 		 339 aa  113  2.0000000000000002e-23  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0614  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.65 
 
 		 468 aa  113  2.0000000000000002e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2107  histidine kinase  32.6 
 
 		 379 aa  112  3e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21830  histidine kinase  31.39 
 
 		 391 aa  112  4.0000000000000004e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00305219  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2549  GAF sensor signal transduction histidine kinase  32.29 
 
 		 456 aa  111  4.0000000000000004e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1159  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.8 
 
 		 355 aa  111  5e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3746  GAF sensor signal transduction histidine kinase  38.01 
 
 		 373 aa  111  5e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.200726  normal  0.275416 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2521  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.75 
 
 		 594 aa  110  1e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0533071  normal  0.360744 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1231  histidine kinase  30.52 
 
 		 482 aa  110  1e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3594  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.17 
 
 		 598 aa  110  1e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0649  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.72 
 
 		 490 aa  109  2e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0159  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.38 
 
 		 508 aa  109  2e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1685  Histidine kinase  36.48 
 
 		 397 aa  109  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.842631 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33000  PAS domain S-box  35.24 
 
 		 547 aa  108  3e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.569309  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3926  histidine kinase  34.3 
 
 		 598 aa  108  3e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3600  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.47 
 
 		 403 aa  107  7e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.242845  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3420  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.15 
 
 		 440 aa  107  7e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0662145 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3261  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.42 
 
 		 463 aa  107  8e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1285  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.89 
 
 		 742 aa  107  8e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5303  putative two-component system sensor kinase  33.8 
 
 		 367 aa  106  1e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0551174  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1133  putative signal transduction histidine kinase  31.39 
 
 		 403 aa  107  1e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5904  Histidine kinase  33.63 
 
 		 399 aa  106  2e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0106883  normal  0.0686301 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6241  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.39 
 
 		 748 aa  106  2e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0235  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.56 
 
 		 402 aa  105  2e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013207  Aaci_3079  histidine kinase  31.84 
 
 		 223 aa  105  2e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3241  Histidine kinase  35.45 
 
 		 393 aa  105  3e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0718  histidine kinase  35.16 
 
 		 433 aa  105  3e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.217794 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4921  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 412 aa  105  3e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0892179  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3408  histidine kinase  31.68 
 
 		 686 aa  105  4e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000158036  hitchhiker  0.000062789 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1315  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.03 
 
 		 344 aa  105  4e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0442  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.47 
 
 		 485 aa  104  6e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.12569  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3812  histidine kinase  31.27 
 
 		 402 aa  104  6e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00313261 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3718  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.2 
 
 		 586 aa  104  6e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.118329  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0301  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.95 
 
 		 748 aa  104  7e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0814  signal transduction histidine kinase, glucose-6-phosphate specific  34.6 
 
 		 466 aa  104  8e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000114737  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0778  methanol utilization control sensor protein moxY, putative  33.33 
 
 		 439 aa  103  1e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.125881  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2027  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  27.31 
 
 		 401 aa  103  1e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.109719  normal  0.72788 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2438  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.36 
 
 		 599 aa  103  1e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1983  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.8 
 
 		 469 aa  103  1e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.143525 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0966  Signal transduction histidine kinase  33.77 
 
 		 332 aa  103  1e-20  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.763704  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2086  GAF sensor signal transduction histidine kinase  33.78 
 
 		 372 aa  102  2e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0443237  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20450  signal transduction histidine kinase  34.19 
 
 		 441 aa  103  2e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0107895  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0748  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.81 
 
 		 393 aa  102  2e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.279755 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08500  signal transduction histidine kinase  30.71 
 
 		 420 aa  102  2e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.115699  normal  0.612619 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1268  histidine kinase  31.63 
 
 		 392 aa  102  2e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>