More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_0554 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_0554  Histidine kinase  100 
 
 		 687 aa  1318    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.158949  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3280  histidine kinase  47.54 
 
 		 664 aa  420  1e-116  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00155771  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6579  Histidine kinase  42.65 
 
 		 689 aa  365  2e-99  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.218867  normal  0.148163 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2603  Histidine kinase  44.08 
 
 		 720 aa  344  4e-93  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00739798  normal  0.140215 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0555  Signal transduction histidine kinase-like protein  59.78 
 
 		 461 aa  327  4.0000000000000003e-88  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.137266  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2605  Histidine kinase  42.7 
 
 		 650 aa  325  1e-87  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.209527  normal  0.327771 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1533  histidine kinase  51.03 
 
 		 451 aa  255  2.0000000000000002e-66  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0016197  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1447  Histidine kinase  37.79 
 
 		 691 aa  248  3e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.705239  normal  0.184804 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3834  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.92 
 
 		 709 aa  220  7.999999999999999e-56  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.154622  normal  0.0585187 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3330  Histidine kinase  36.86 
 
 		 653 aa  207  7e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.323144 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1434  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.81 
 
 		 731 aa  188  3e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.278277  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3408  histidine kinase  45.83 
 
 		 686 aa  169  1e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000158036  hitchhiker  0.000062789 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4581  hypothetical protein  35.21 
 
 		 663 aa  155  2.9999999999999998e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.267565 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3325  histidine kinase  30.85 
 
 		 696 aa  133  1.0000000000000001e-29  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.868866  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5374  histidine kinase  49.02 
 
 		 218 aa  127  5e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06146  sensory box histidine kinase  40.85 
 
 		 710 aa  125  3e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0682167  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01020  sensory box histidine kinase  40.85 
 
 		 710 aa  125  3e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0755055  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1082  GAF sensor signal transduction histidine kinase  39.92 
 
 		 401 aa  124  8e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0341  GAF sensor signal transduction histidine kinase  36.64 
 
 		 725 aa  124  9e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0143238  hitchhiker  0.0051816 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1055  putative signal transduction histidine kinase  39.92 
 
 		 401 aa  121  3.9999999999999996e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.64157  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1071  GAF sensor signal transduction histidine kinase  39.92 
 
 		 401 aa  121  3.9999999999999996e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0809665 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0442  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.34 
 
 		 485 aa  121  4.9999999999999996e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.12569  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0357  sensor histidine kinase  37.91 
 
 		 459 aa  120  7.999999999999999e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.450318  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1564  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  38.32 
 
 		 395 aa  119  3e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1357  GAF sensor signal transduction histidine kinase  40.98 
 
 		 403 aa  118  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.246673  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2803  histidine kinase  36.25 
 
 		 422 aa  117  6e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.367455 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2487  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  41.84 
 
 		 412 aa  117  7.999999999999999e-25  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1783  histidine kinase  37.04 
 
 		 501 aa  116  1.0000000000000001e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000211372 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3491  putative signal transduction histidine kinase  39.71 
 
 		 624 aa  116  1.0000000000000001e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6699  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.44 
 
 		 621 aa  116  1.0000000000000001e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0674  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 447 aa  116  1.0000000000000001e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.504244  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2291  histidine kinase  33.74 
 
 		 596 aa  116  2.0000000000000002e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1399  PAS  37.78 
 
 		 683 aa  116  2.0000000000000002e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.04458 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3956  histidine kinase, dimerization and phosphoacceptor region  37.8 
 
 		 323 aa  116  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0031  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.97 
 
 		 468 aa  116  2.0000000000000002e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.231222  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0946  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.43 
 
 		 1229 aa  115  2.0000000000000002e-24  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1029  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.79 
 
 		 411 aa  115  2.0000000000000002e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.342445  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0153  histidine kinase  39.25 
 
 		 325 aa  115  3e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4606  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.9 
 
 		 417 aa  115  3e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0890367  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1596  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.36 
 
 		 420 aa  115  3e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.310205  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003135  sensor histidine kinase  31 
 
 		 451 aa  115  3e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.291514  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2107  histidine kinase  32.51 
 
 		 379 aa  115  3e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013207  Aaci_3079  histidine kinase  33.5 
 
 		 223 aa  114  5e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4728  histidine kinase  36.21 
 
 		 429 aa  114  5e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4898  ATPase domain-containing protein  38.46 
 
 		 491 aa  114  7.000000000000001e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.246184  normal  0.165682 
 
 
-
 
NC_002936  DET1064  sensory box sensor histidine kinase  36.74 
 
 		 1101 aa  114  8.000000000000001e-24  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4528  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.58 
 
 		 461 aa  114  8.000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.25442  normal  0.575982 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02702  histidine kinase  30.67 
 
 		 456 aa  114  9e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0179  histidine kinase  42.56 
 
 		 418 aa  113  1.0000000000000001e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1296  GAF sensor signal transduction histidine kinase  40.28 
 
 		 386 aa  113  1.0000000000000001e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.99492 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5904  Histidine kinase  37.73 
 
 		 399 aa  113  1.0000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0106883  normal  0.0686301 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4714  Two-component sensor histidine kinase  37.05 
 
 		 447 aa  112  2.0000000000000002e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1706  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.48 
 
 		 564 aa  112  2.0000000000000002e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.98975  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5015  GAF sensor signal transduction histidine kinase  38.11 
 
 		 399 aa  112  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.36327  normal  0.324397 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6398  histidine kinase  35.58 
 
 		 461 aa  112  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.176497 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5549  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.05 
 
 		 370 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.441753  normal  0.532681 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1215  PAS  33.9 
 
 		 515 aa  112  3e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4415  Signal transduction histidine kinase-like protein  33.81 
 
 		 386 aa  112  3e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0384972 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0895  sensor histidine kinase  34 
 
 		 451 aa  112  3e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.622783  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_935  sensor histidine kinase  36.74 
 
 		 1226 aa  111  4.0000000000000004e-23  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4456  histidine kinase  38.16 
 
 		 410 aa  111  5e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1913  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.54 
 
 		 700 aa  110  6e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.6571 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1255  histidine kinase  36.45 
 
 		 463 aa  110  7.000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1568  histidine kinase  34.47 
 
 		 462 aa  110  7.000000000000001e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2703  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.1 
 
 		 552 aa  110  8.000000000000001e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.191431 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0476  histidine kinase  39.51 
 
 		 464 aa  110  8.000000000000001e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3812  histidine kinase  33.88 
 
 		 402 aa  110  9.000000000000001e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00313261 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0347  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.98 
 
 		 442 aa  110  1e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0286068  normal  0.880673 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4478  histidine kinase  32.81 
 
 		 400 aa  110  1e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.334166 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3418  sensor histidine kinase  39.46 
 
 		 481 aa  110  1e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.986219  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2027  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  29.66 
 
 		 401 aa  110  1e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.109719  normal  0.72788 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21830  histidine kinase  30.13 
 
 		 391 aa  110  1e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00305219  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1268  histidine kinase  32.38 
 
 		 392 aa  110  1e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1845  histidine kinase  39.15 
 
 		 428 aa  109  1e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.307294  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1864  Sensor DegS domain protein  32.7 
 
 		 391 aa  109  1e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000165606  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2127  sensor histidine kinase  35.75 
 
 		 313 aa  109  2e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.289713  normal  0.113702 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0817  signal transduction histidine kinase, glucose-6-phosphate specific  36.21 
 
 		 466 aa  109  2e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000394288  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0308  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37 
 
 		 405 aa  109  2e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.130128 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1551  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.33 
 
 		 407 aa  109  2e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.538677  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5303  putative two-component system sensor kinase  38.5 
 
 		 367 aa  109  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0551174  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4854  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.12 
 
 		 394 aa  109  2e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0459585  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0253  sensory box histidine kinase  37.61 
 
 		 830 aa  108  3e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1872  sensor histidine kinase  26.97 
 
 		 1046 aa  108  3e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2912  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.04 
 
 		 339 aa  107  5e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1510  histidine kinase  36.92 
 
 		 378 aa  108  5e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0382398 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3261  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35 
 
 		 463 aa  107  6e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0893  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  35.51 
 
 		 359 aa  107  6e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4226  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.68 
 
 		 682 aa  107  7e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.203059 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2334  sensor histidine kinase  37.27 
 
 		 470 aa  107  8e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4157  histidine kinase  31.03 
 
 		 663 aa  107  8e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.921776  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0329  signal transduction histidine kinase  37.4 
 
 		 435 aa  107  9e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.982298  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2634  histidine kinase  36.36 
 
 		 343 aa  107  9e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000175326  hitchhiker  0.00557176 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0635  histidine kinase  35.75 
 
 		 430 aa  107  9e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.181904 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7345  histidine kinase  39.36 
 
 		 448 aa  106  1e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0358279 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2942  ATPase domain-containing protein  38.92 
 
 		 485 aa  107  1e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0437  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.84 
 
 		 513 aa  107  1e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0906  sensor histidine kinase  31.91 
 
 		 469 aa  107  1e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0178022  hitchhiker  0.0000002134 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3600  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.12 
 
 		 403 aa  107  1e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.242845  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1462  sensor kinase protein  35.69 
 
 		 466 aa  105  2e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3614  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.78 
 
 		 298 aa  106  2e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.753486  normal  0.27992 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>