More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_3325 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013530  Xcel_3325  histidine kinase  100 
 
 
696 aa  1285    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.868866  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1447  Histidine kinase  33.48 
 
 
691 aa  177  7e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.705239  normal  0.184804 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3834  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.93 
 
 
709 aa  174  5e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.154622  normal  0.0585187 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3280  histidine kinase  32.98 
 
 
664 aa  171  3e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00155771  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3330  Histidine kinase  33.18 
 
 
653 aa  167  9e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.323144 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1434  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 
731 aa  163  1e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.278277  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6579  Histidine kinase  31.9 
 
 
689 aa  141  3e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.218867  normal  0.148163 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3408  histidine kinase  33.46 
 
 
686 aa  139  2e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000158036  hitchhiker  0.000062789 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0554  Histidine kinase  30.67 
 
 
687 aa  136  9.999999999999999e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.158949  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2605  Histidine kinase  30.42 
 
 
650 aa  128  4.0000000000000003e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.209527  normal  0.327771 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4898  ATPase domain-containing protein  38.39 
 
 
491 aa  122  1.9999999999999998e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.246184  normal  0.165682 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2603  Histidine kinase  32.61 
 
 
720 aa  120  7e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00739798  normal  0.140215 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0153  histidine kinase  37.67 
 
 
325 aa  112  3e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0555  Signal transduction histidine kinase-like protein  36.83 
 
 
461 aa  110  7.000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.137266  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1533  histidine kinase  37.25 
 
 
451 aa  109  1e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0016197  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1880  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.45 
 
 
662 aa  108  3e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0862215  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1965  histidine kinase  39.45 
 
 
662 aa  108  3e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.632766  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4157  histidine kinase  30.36 
 
 
663 aa  107  8e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.921776  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0027  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.61 
 
 
461 aa  105  2e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.755533 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5188  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.2 
 
 
480 aa  105  3e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4564  histidine kinase  33.2 
 
 
460 aa  105  3e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.562879  normal  0.0736505 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5671  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.2 
 
 
480 aa  105  3e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0241273 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1809  histidine kinase  39.45 
 
 
640 aa  104  6e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1998  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.39 
 
 
658 aa  104  7e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5497  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.61 
 
 
459 aa  103  8e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00170786 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2334  sensor histidine kinase  34 
 
 
470 aa  103  9e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5321  histidine kinase  35.09 
 
 
470 aa  103  1e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1568  histidine kinase  36.12 
 
 
462 aa  102  2e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3187  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.74 
 
 
459 aa  102  2e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.134921 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4945  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.61 
 
 
459 aa  102  2e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0549839 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4477  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.86 
 
 
471 aa  102  2e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1462  sensor kinase protein  33.6 
 
 
466 aa  101  4e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3491  putative signal transduction histidine kinase  37.78 
 
 
624 aa  101  4e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3247  putative sensor histidine kinase  33.6 
 
 
466 aa  101  4e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1983  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.02 
 
 
469 aa  101  5e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.143525 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6470  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.14 
 
 
471 aa  101  6e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.629472  normal  0.491206 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1099  sensor histidine kinase  33.6 
 
 
466 aa  100  9e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1378  sensor histidine kinase  33.6 
 
 
466 aa  100  9e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.922617  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3132  putative sensor histidine kinase  32.8 
 
 
466 aa  100  9e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2363  sensor histidine kinase  33.6 
 
 
466 aa  100  9e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0649  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.18 
 
 
490 aa  100  1e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0789  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.52 
 
 
469 aa  99.8  2e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4230  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.24 
 
 
478 aa  99.4  2e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.304751 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2070  sensor histidine kinase  33.2 
 
 
466 aa  98.6  4e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4921  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.44 
 
 
412 aa  97.8  5e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0892179  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4257  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.51 
 
 
425 aa  97.4  7e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.944202  normal 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4905  ATPase domain-containing protein  35.41 
 
 
496 aa  97.4  7e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.92947  normal  0.728538 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2912  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.44 
 
 
339 aa  97.4  8e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7760  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.4 
 
 
486 aa  97.1  9e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3418  sensor histidine kinase  34.14 
 
 
481 aa  97.1  1e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.986219  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2942  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.07 
 
 
333 aa  95.9  2e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.940404  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6398  histidine kinase  33.05 
 
 
461 aa  96.3  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.176497 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12660  signal transduction histidine kinase  36.73 
 
 
444 aa  95.1  4e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.224023  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38430  PAS domain S-box  34.14 
 
 
552 aa  94.7  5e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1992  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.15 
 
 
574 aa  94.7  5e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0873865  normal  0.754427 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0308  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.23 
 
 
405 aa  94.7  5e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.130128 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3261  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 
463 aa  94  8e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4660  histidine kinase  36.87 
 
 
402 aa  93.2  1e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4503  histidine kinase  33.49 
 
 
643 aa  93.6  1e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.604782 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5374  histidine kinase  40.19 
 
 
218 aa  93.6  1e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3510  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.18 
 
 
447 aa  93.2  1e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2833  histidine kinase  33.18 
 
 
447 aa  93.2  2e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.665069  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1055  putative signal transduction histidine kinase  38.22 
 
 
401 aa  92.4  2e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.64157  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1071  GAF sensor signal transduction histidine kinase  38.22 
 
 
401 aa  92.4  2e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0809665 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1122  histidine kinase  36.93 
 
 
467 aa  92.8  2e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.94341 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5015  GAF sensor signal transduction histidine kinase  35.19 
 
 
399 aa  92.8  2e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.36327  normal  0.324397 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2344  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.6 
 
 
480 aa  92  3e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.165919 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3908  putative signal transduction histidine kinase  31.49 
 
 
435 aa  91.7  4e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3982  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.49 
 
 
435 aa  91.7  4e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.335335  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3923  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.49 
 
 
435 aa  91.7  4e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.534106  normal  0.212662 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1652  histidine kinase  32.41 
 
 
373 aa  91.3  5e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000168648  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3575  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.92 
 
 
475 aa  91.3  5e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0877  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.77 
 
 
474 aa  91.3  5e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.858486  normal  0.37178 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2131  sensor histidine kinase  31.96 
 
 
394 aa  91.3  6e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0760  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30 
 
 
610 aa  91.3  6e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000018635  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0906  sensor histidine kinase  28.33 
 
 
469 aa  90.9  7e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0178022  hitchhiker  0.0000002134 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0442  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.89 
 
 
485 aa  90.9  7e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.12569  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0895  sensor histidine kinase  28.93 
 
 
451 aa  90.9  7e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.622783  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41030  Periplasmic sensory histidine protein kinase, two-component  33.75 
 
 
458 aa  90.5  1e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0649951  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3993  histidine kinase  34.58 
 
 
456 aa  90.5  1e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.841388  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3863  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.8 
 
 
446 aa  90.1  1e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.165954  normal  0.826823 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1082  GAF sensor signal transduction histidine kinase  37.33 
 
 
401 aa  90.5  1e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3391  histidine kinase  33.49 
 
 
356 aa  90.5  1e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.382044  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6031  Histidine kinase  34.76 
 
 
338 aa  89.7  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.542402  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2132  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.71 
 
 
433 aa  89  2e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.569038  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1706  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.01 
 
 
564 aa  89.7  2e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.98975  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1913  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.31 
 
 
700 aa  89.7  2e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.6571 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4385  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.43 
 
 
445 aa  89.7  2e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5716  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.1 
 
 
700 aa  89.7  2e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00700823 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0560  histidine kinase  29.58 
 
 
670 aa  89  3e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.618015  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2249  histidine kinase  35.5 
 
 
420 aa  89  3e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.795375  normal  0.159293 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3200  Signal transduction histidine kinase-like protein  34.2 
 
 
395 aa  89  3e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1360  histidine kinase  36.1 
 
 
476 aa  88.6  3e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.388977 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1027  putative transmembrane sensor histidine kinase transcription regulator protein  32.22 
 
 
456 aa  89  3e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.573227  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3763  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.54 
 
 
375 aa  88.2  4e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.200679  normal  0.834979 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1255  histidine kinase  32.89 
 
 
463 aa  88.2  4e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0031  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 
468 aa  88.6  4e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.231222  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2281  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.16 
 
 
445 aa  88.2  5e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.67096  normal  0.255683 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1697  histidine kinase  30.39 
 
 
664 aa  88.2  5e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.182651 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3718  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.63 
 
 
586 aa  87.8  6e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.118329  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>