More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_5374 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_5374  histidine kinase  100 
 
 		 218 aa  400  9.999999999999999e-111  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3280  histidine kinase  47.26 
 
 		 664 aa  129  4.0000000000000003e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00155771  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1434  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  43.16 
 
 		 731 aa  129  4.0000000000000003e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.278277  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0554  Histidine kinase  48.73 
 
 		 687 aa  125  4.0000000000000003e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.158949  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3408  histidine kinase  44.67 
 
 		 686 aa  114  7.999999999999999e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000158036  hitchhiker  0.000062789 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1533  histidine kinase  45.18 
 
 		 451 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0016197  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0341  GAF sensor signal transduction histidine kinase  40.1 
 
 		 725 aa  112  4.0000000000000004e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0143238  hitchhiker  0.0051816 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3834  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.25 
 
 		 709 aa  111  1.0000000000000001e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.154622  normal  0.0585187 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4905  ATPase domain-containing protein  41.58 
 
 		 496 aa  110  2.0000000000000002e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.92947  normal  0.728538 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21830  histidine kinase  29.33 
 
 		 391 aa  106  2e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00305219  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2603  Histidine kinase  44.62 
 
 		 720 aa  106  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00739798  normal  0.140215 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2605  Histidine kinase  42.71 
 
 		 650 aa  106  3e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.209527  normal  0.327771 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2043  histidine kinase  28.57 
 
 		 388 aa  105  4e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4898  ATPase domain-containing protein  42.05 
 
 		 491 aa  105  5e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.246184  normal  0.165682 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2107  histidine kinase  31.13 
 
 		 379 aa  105  7e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6579  Histidine kinase  43.43 
 
 		 689 aa  104  9e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.218867  normal  0.148163 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0635  histidine kinase  38.94 
 
 		 430 aa  100  1e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.181904 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4226  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.98 
 
 		 682 aa  99.8  3e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.203059 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1447  Histidine kinase  43.2 
 
 		 691 aa  99.4  4e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.705239  normal  0.184804 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4728  histidine kinase  40.58 
 
 		 429 aa  99.4  4e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3325  histidine kinase  41.59 
 
 		 696 aa  98.6  6e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.868866  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1399  PAS  33.18 
 
 		 683 aa  97.4  2e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.04458 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4157  histidine kinase  40.53 
 
 		 663 aa  97.1  2e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.921776  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2714  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.91 
 
 		 1168 aa  96.3  3e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2927  histidine kinase  39.23 
 
 		 383 aa  95.9  4e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000936268  hitchhiker  0.0000101948 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1204  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.22 
 
 		 779 aa  95.5  5e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06146  sensory box histidine kinase  35.75 
 
 		 710 aa  95.5  5e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0682167  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01020  sensory box histidine kinase  35.75 
 
 		 710 aa  95.5  5e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0755055  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3230  sensory box histidine kinase  34.62 
 
 		 518 aa  95.1  7e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5716  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.67 
 
 		 700 aa  94.4  1e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00700823 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0153  histidine kinase  36.23 
 
 		 325 aa  94.7  1e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1706  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.98 
 
 		 564 aa  94.4  1e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.98975  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0301  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.62 
 
 		 748 aa  94.7  1e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1872  sensor histidine kinase  29.19 
 
 		 1046 aa  94.4  1e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4385  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.74 
 
 		 445 aa  94  1e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4415  Signal transduction histidine kinase-like protein  38.65 
 
 		 386 aa  94.4  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0384972 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2757  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  39.8 
 
 		 433 aa  94  1e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.128423  normal  0.0502627 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1316  sensor histidine protein kinase  29.9 
 
 		 525 aa  94  2e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.176896  normal  0.0650582 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0674  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.58 
 
 		 447 aa  93.6  2e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.504244  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1231  histidine kinase  30.29 
 
 		 482 aa  93.2  3e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3261  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.12 
 
 		 463 aa  93.2  3e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2803  histidine kinase  38.83 
 
 		 422 aa  93.2  3e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.367455 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5078  histidine kinase  37.2 
 
 		 368 aa  92.8  4e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.9788 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3993  histidine kinase  34.8 
 
 		 456 aa  92.4  5e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.841388  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0253  sensory box histidine kinase  35.05 
 
 		 830 aa  92  6e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0308  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.15 
 
 		 405 aa  91.7  7e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.130128 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0466  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.16 
 
 		 780 aa  91.7  8e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00551586 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5647  histidine kinase  39.13 
 
 		 433 aa  91.7  9e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.559873  normal  0.146404 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3668  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.33 
 
 		 650 aa  91.3  1e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7104  histidine kinase  35.98 
 
 		 462 aa  90.9  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.999935  normal  0.409362 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2080  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.02 
 
 		 370 aa  91.3  1e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3041  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.92 
 
 		 691 aa  90.5  2e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00734608 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0649  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.84 
 
 		 490 aa  90.1  2e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3908  putative signal transduction histidine kinase  34.11 
 
 		 435 aa  90.5  2e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3850  sensor histidine kinase  32.21 
 
 		 351 aa  90.1  2e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000154691  hitchhiker  0.000000000165716 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1494  sensor histidine kinase  32.21 
 
 		 351 aa  90.5  2e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000467986  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3982  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.11 
 
 		 435 aa  90.5  2e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.335335  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3923  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.11 
 
 		 435 aa  90.5  2e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.534106  normal  0.212662 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5549  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 370 aa  90.5  2e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.441753  normal  0.532681 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1864  Sensor DegS domain protein  30 
 
 		 391 aa  89.7  3e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000165606  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0191  transmembrane two component system sensor kinase transcription regulator protein  35.89 
 
 		 458 aa  89.7  3e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0364977 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1562  sensor histidine kinase  31.25 
 
 		 351 aa  89.4  4e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000749794  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0450  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.82 
 
 		 780 aa  89.4  4e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1983  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.91 
 
 		 469 aa  89  5e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.143525 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6050  histidine kinase  35.98 
 
 		 442 aa  88.6  6e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2849  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.83 
 
 		 682 aa  88.6  6e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.790064  normal  0.747278 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4606  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.04 
 
 		 417 aa  88.6  7e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0890367  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0902  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  38.69 
 
 		 509 aa  88.6  7e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0442  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.54 
 
 		 485 aa  88.6  7e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.12569  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2036  histidine kinase  33.49 
 
 		 381 aa  88.2  8e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.103366 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1385  sensor histidine kinase  29.05 
 
 		 377 aa  88.2  8e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00939681  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1362  histidine kinase  31.73 
 
 		 351 aa  88.2  8e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0117705  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1600  sensor histidine kinase  31.25 
 
 		 351 aa  88.2  8e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000696667  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1405  sensor histidine kinase  28.3 
 
 		 483 aa  87.4  1e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0589016  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1347  sensor histidine kinase  31.25 
 
 		 351 aa  87.8  1e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.31288  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1321  sensor histidine kinase  31.25 
 
 		 351 aa  87.8  1e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000375238  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1320  sensor histidine kinase  31.25 
 
 		 351 aa  87.8  1e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00123004  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2521  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.94 
 
 		 594 aa  87.8  1e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0533071  normal  0.360744 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1456  sensor histidine kinase  31.25 
 
 		 351 aa  87.8  1e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00592106  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1652  histidine kinase  35.78 
 
 		 373 aa  87.8  1e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000168648  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1530  sensor histidine kinase  31.25 
 
 		 351 aa  87.8  1e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.90364e-25 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3746  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.56 
 
 		 688 aa  87  2e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.632054  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0631  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.31 
 
 		 381 aa  86.7  2e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000982334  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1961  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.76 
 
 		 444 aa  87  2e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  unclonable  0.000000367534  hitchhiker  0.000000631341 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0159  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.86 
 
 		 508 aa  87  2e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1551  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.44 
 
 		 407 aa  87.4  2e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.538677  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1268  histidine kinase  27.88 
 
 		 392 aa  86.7  2e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1255  histidine kinase  36.36 
 
 		 463 aa  86.3  3e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3575  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.1 
 
 		 475 aa  86.3  3e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6138  Signal transduction histidine kinase-like protein  39.13 
 
 		 403 aa  86.3  3e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.278868  normal  0.229544 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3498  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.26 
 
 		 596 aa  86.3  3e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00492042 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1568  histidine kinase  34.23 
 
 		 462 aa  86.3  3e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6398  histidine kinase  34.43 
 
 		 461 aa  86.7  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.176497 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0893  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  34.65 
 
 		 359 aa  85.9  4e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1312  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.67 
 
 		 484 aa  86.3  4e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0729257  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0877  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.38 
 
 		 474 aa  86.3  4e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.858486  normal  0.37178 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3391  histidine kinase  36.32 
 
 		 356 aa  86.3  4e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.382044  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2281  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 445 aa  85.9  4e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.67096  normal  0.255683 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_600  sensor histidine kinase  30.84 
 
 		 381 aa  85.9  5e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0751439  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0199  histidine kinase  37.74 
 
 		 452 aa  85.9  5e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>