More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_2927 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_2927  histidine kinase  100 
 
 
383 aa  737    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000936268  hitchhiker  0.0000101948 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5647  histidine kinase  44.04 
 
 
433 aa  290  4e-77  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.559873  normal  0.146404 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4728  histidine kinase  45.05 
 
 
429 aa  285  8e-76  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1961  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  46.47 
 
 
444 aa  276  3e-73  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  unclonable  0.000000367534  hitchhiker  0.000000631341 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2507  Signal transduction histidine kinase-like protein  47.06 
 
 
405 aa  270  2.9999999999999997e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.401085  normal  0.727575 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0635  histidine kinase  43.29 
 
 
430 aa  248  1e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.181904 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3934  histidine kinase  39.9 
 
 
442 aa  231  2e-59  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4456  histidine kinase  40.38 
 
 
410 aa  224  2e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9331  Signal transduction histidine kinase-like protein  39.43 
 
 
508 aa  221  1.9999999999999999e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.542521 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2757  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  40.64 
 
 
433 aa  220  3e-56  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.128423  normal  0.0502627 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3907  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.11 
 
 
428 aa  218  1e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2700  histidine kinase  42.15 
 
 
429 aa  217  2e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000000394923  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0386  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.9 
 
 
418 aa  215  9e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.482475 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4333  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  53.15 
 
 
343 aa  211  2e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0375931  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3546  histidine kinase  44.3 
 
 
489 aa  208  1e-52  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.871685 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1916  histidine kinase  43.67 
 
 
410 aa  206  5e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6198  Signal transduction histidine kinase-like protein  36.06 
 
 
415 aa  197  3e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.129005  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0199  histidine kinase  38.59 
 
 
452 aa  194  3e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2249  histidine kinase  38.66 
 
 
420 aa  194  3e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.795375  normal  0.159293 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4415  Signal transduction histidine kinase-like protein  38.16 
 
 
386 aa  192  7e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0384972 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3718  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  49.53 
 
 
586 aa  188  2e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.118329  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0308  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  48.87 
 
 
405 aa  187  4e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.130128 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1360  histidine kinase  36.34 
 
 
476 aa  181  2e-44  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.388977 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0329  signal transduction histidine kinase  42.26 
 
 
435 aa  177  4e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.982298  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6138  Signal transduction histidine kinase-like protein  36.57 
 
 
403 aa  176  5e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.278868  normal  0.229544 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4726  histidine kinase  36.07 
 
 
405 aa  176  6e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3763  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  46.96 
 
 
375 aa  176  6e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.200679  normal  0.834979 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3200  Signal transduction histidine kinase-like protein  46.64 
 
 
395 aa  175  1.9999999999999998e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0609  histidine kinase  36.05 
 
 
442 aa  174  1.9999999999999998e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.54142 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0949  histidine kinase  43.64 
 
 
416 aa  168  1e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2525  histidine kinase  49.07 
 
 
434 aa  167  2.9999999999999998e-40  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0362104  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4660  histidine kinase  45.09 
 
 
402 aa  165  1.0000000000000001e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4606  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  45.75 
 
 
417 aa  164  3e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0890367  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3491  putative signal transduction histidine kinase  44.81 
 
 
624 aa  163  6e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2758  histidine kinase  47.21 
 
 
389 aa  160  3e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00845914  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2298  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  49.11 
 
 
432 aa  160  4e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.317439  normal  0.783172 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2301  Histidine kinase  34.68 
 
 
412 aa  159  6e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4021  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  48.29 
 
 
411 aa  159  9e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0185539  normal  0.088504 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1255  histidine kinase  42.01 
 
 
463 aa  158  1e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2091  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.04 
 
 
466 aa  158  1e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09220  signal transduction histidine kinase  35.29 
 
 
492 aa  158  1e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.253701 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0424  histidine kinase  33.25 
 
 
438 aa  158  2e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.680525  hitchhiker  0.00719111 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1652  Histidine kinase  48.72 
 
 
439 aa  158  2e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.527879  normal  0.680022 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12660  signal transduction histidine kinase  43.97 
 
 
444 aa  157  3e-37  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.224023  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4688  histidine kinase  42.91 
 
 
419 aa  154  2e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2642  histidine kinase  37.22 
 
 
426 aa  153  5e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.992033  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2433  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.08 
 
 
461 aa  152  1e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.189775  normal  0.142881 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0204  histidine kinase  34.62 
 
 
446 aa  151  2e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3867  histidine kinase  35.35 
 
 
434 aa  151  2e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.265271  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3908  putative signal transduction histidine kinase  42.98 
 
 
435 aa  150  4e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3982  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.98 
 
 
435 aa  150  4e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.335335  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3923  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.98 
 
 
435 aa  150  4e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.534106  normal  0.212662 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2132  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.04 
 
 
433 aa  147  4.0000000000000006e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.569038  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0262  putative signal transduction histidine kinase  33.85 
 
 
465 aa  147  4.0000000000000006e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.186103 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0211  histidine kinase  47.91 
 
 
463 aa  143  5e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4385  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.18 
 
 
445 aa  143  5e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2340  histidine kinase  40.49 
 
 
388 aa  141  9.999999999999999e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1993  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.68 
 
 
422 aa  141  1.9999999999999998e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3330  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  43.35 
 
 
398 aa  141  1.9999999999999998e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0149067  normal  0.138525 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2281  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.26 
 
 
445 aa  139  7e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.67096  normal  0.255683 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0354  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.83 
 
 
438 aa  139  7.999999999999999e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35880  signal transduction histidine kinase  46.79 
 
 
454 aa  138  1e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.263807 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0531  histidine kinase  44.95 
 
 
429 aa  137  3.0000000000000003e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.005431  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4050  Histidine kinase  43.87 
 
 
374 aa  135  9e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.313821  hitchhiker  0.00550271 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0319  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.24 
 
 
382 aa  134  3.9999999999999996e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.499307  normal  0.099987 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0971  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.63 
 
 
417 aa  130  4.0000000000000003e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11900  signal transduction histidine kinase  35.01 
 
 
447 aa  127  2.0000000000000002e-28  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0085  putative signal transduction histidine kinase  43.32 
 
 
587 aa  126  7e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0967  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.91 
 
 
408 aa  125  1e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.849709 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3104  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  48.31 
 
 
459 aa  125  2e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.8316  hitchhiker  0.000380562 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6699  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.57 
 
 
621 aa  124  2e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17590  signal transduction histidine kinase  36.25 
 
 
326 aa  124  3e-27  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0109488  normal  0.353356 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3516  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.93 
 
 
388 aa  124  4e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.370817  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07210  histidine kinase  40.54 
 
 
237 aa  122  7e-27  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0811  histidine kinase  40.68 
 
 
580 aa  117  3e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2540  putative signal transduction histidine kinase  39.42 
 
 
570 aa  117  3.9999999999999997e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5907  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.24 
 
 
408 aa  116  6.9999999999999995e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.155683  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7224  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.67 
 
 
594 aa  115  1.0000000000000001e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8723  Histidine kinase  42.47 
 
 
365 aa  115  2.0000000000000002e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2641  histidine kinase  34.72 
 
 
453 aa  113  6e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0175588  hitchhiker  0.00721729 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2071  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.38 
 
 
725 aa  105  1e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.249392  normal  0.37167 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3280  histidine kinase  37.09 
 
 
664 aa  98.6  1e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00155771  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3049  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.46 
 
 
565 aa  96.7  6e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0199075  normal  0.598323 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6491  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.22 
 
 
576 aa  96.7  6e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.194722  normal  0.40327 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1533  histidine kinase  38.16 
 
 
451 aa  96.7  7e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0016197  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0554  Histidine kinase  35.58 
 
 
687 aa  94.4  3e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.158949  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3834  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.09 
 
 
709 aa  94  4e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.154622  normal  0.0585187 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0341  GAF sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 
725 aa  94  4e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0143238  hitchhiker  0.0051816 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6579  Histidine kinase  36.54 
 
 
689 aa  93.2  6e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.218867  normal  0.148163 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2736  histidine kinase  34.74 
 
 
430 aa  93.2  7e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.554536  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4245  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.86 
 
 
595 aa  92  1e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3408  histidine kinase  37.86 
 
 
686 aa  92  2e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000158036  hitchhiker  0.000062789 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5374  histidine kinase  38.65 
 
 
218 aa  90.9  3e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1357  GAF sensor signal transduction histidine kinase  33.19 
 
 
403 aa  91.3  3e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.246673  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1551  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.59 
 
 
407 aa  88.2  2e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.538677  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0456  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.5 
 
 
775 aa  88.6  2e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00143274 
 
 
-
 
NC_013207  Aaci_3079  histidine kinase  30.5 
 
 
223 aa  87.8  3e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2027  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  28.76 
 
 
401 aa  87.4  4e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.109719  normal  0.72788 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2603  Histidine kinase  37.38 
 
 
720 aa  87  5e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00739798  normal  0.140215 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0257  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.42 
 
 
404 aa  87  6e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.5208 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>