More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_3280 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_3280  histidine kinase  100 
 
 
664 aa  1280    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00155771  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0554  Histidine kinase  44.04 
 
 
687 aa  396  1e-109  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.158949  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2603  Histidine kinase  45.17 
 
 
720 aa  386  1e-106  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00739798  normal  0.140215 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2605  Histidine kinase  42.66 
 
 
650 aa  375  1e-102  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.209527  normal  0.327771 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6579  Histidine kinase  43.68 
 
 
689 aa  374  1e-102  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.218867  normal  0.148163 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0555  Signal transduction histidine kinase-like protein  54.42 
 
 
461 aa  366  1e-100  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.137266  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1533  histidine kinase  49.54 
 
 
451 aa  283  6.000000000000001e-75  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0016197  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1447  Histidine kinase  38.6 
 
 
691 aa  270  5e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.705239  normal  0.184804 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3834  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.42 
 
 
709 aa  257  4e-67  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.154622  normal  0.0585187 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3330  Histidine kinase  36.42 
 
 
653 aa  234  3e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.323144 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1434  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.28 
 
 
731 aa  226  1e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.278277  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3408  histidine kinase  36.08 
 
 
686 aa  200  6e-50  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000158036  hitchhiker  0.000062789 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4581  hypothetical protein  39.84 
 
 
663 aa  184  6e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.267565 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3325  histidine kinase  33.45 
 
 
696 aa  167  5.9999999999999996e-40  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.868866  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0341  GAF sensor signal transduction histidine kinase  38.72 
 
 
725 aa  139  1e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0143238  hitchhiker  0.0051816 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0442  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.84 
 
 
485 aa  131  4.0000000000000003e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.12569  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4157  histidine kinase  34.23 
 
 
663 aa  130  5.0000000000000004e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.921776  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5374  histidine kinase  47.85 
 
 
218 aa  129  1.0000000000000001e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1783  histidine kinase  36.69 
 
 
501 aa  127  9e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000211372 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2107  histidine kinase  31.65 
 
 
379 aa  123  9.999999999999999e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1809  histidine kinase  37.02 
 
 
640 aa  122  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2189  histidine kinase  31.02 
 
 
608 aa  121  3e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2043  histidine kinase  30.84 
 
 
388 aa  121  3.9999999999999996e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2912  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.57 
 
 
339 aa  121  3.9999999999999996e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4528  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.2 
 
 
461 aa  121  4.9999999999999996e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.25442  normal  0.575982 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1268  histidine kinase  31.16 
 
 
392 aa  120  7e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0476  histidine kinase  43.48 
 
 
464 aa  120  7.999999999999999e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3669  histidine kinase  39.58 
 
 
489 aa  120  9e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3934  histidine kinase  40.71 
 
 
442 aa  119  9.999999999999999e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2334  sensor histidine kinase  37.61 
 
 
470 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4415  Signal transduction histidine kinase-like protein  38.03 
 
 
386 aa  119  9.999999999999999e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0384972 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1970  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.52 
 
 
421 aa  119  1.9999999999999998e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2803  histidine kinase  36.32 
 
 
422 aa  119  1.9999999999999998e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.367455 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1874  histidine kinase  40.09 
 
 
293 aa  119  1.9999999999999998e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0789  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.61 
 
 
469 aa  119  3e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4477  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.96 
 
 
471 aa  118  3e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1652  histidine kinase  39.91 
 
 
373 aa  118  3e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000168648  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4606  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.38 
 
 
417 aa  118  3.9999999999999997e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0890367  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1965  histidine kinase  36.15 
 
 
662 aa  117  6e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.632766  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2249  histidine kinase  38.14 
 
 
420 aa  117  6e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.795375  normal  0.159293 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6398  histidine kinase  34.51 
 
 
461 aa  117  6e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.176497 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0284  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.52 
 
 
591 aa  117  6e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21830  histidine kinase  29.05 
 
 
391 aa  117  6.9999999999999995e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00305219  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1880  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.15 
 
 
662 aa  117  6.9999999999999995e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0862215  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3993  histidine kinase  34.67 
 
 
456 aa  117  7.999999999999999e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.841388  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3064  GAF sensor signal transduction histidine kinase  34.41 
 
 
544 aa  116  1.0000000000000001e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.980645 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3937  histidine kinase  29.86 
 
 
366 aa  116  1.0000000000000001e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0383335  n/a   
 
 
-
 
NC_013207  Aaci_3079  histidine kinase  34.62 
 
 
223 aa  115  2.0000000000000002e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0674  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 
447 aa  115  2.0000000000000002e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.504244  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2070  sensor histidine kinase  38.26 
 
 
466 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1462  sensor kinase protein  37.99 
 
 
466 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1070  histidine kinase  34.62 
 
 
430 aa  116  2.0000000000000002e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1099  sensor histidine kinase  37.99 
 
 
466 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1378  sensor histidine kinase  37.99 
 
 
466 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.922617  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3247  putative sensor histidine kinase  37.99 
 
 
466 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2363  sensor histidine kinase  37.99 
 
 
466 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3575  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.67 
 
 
475 aa  115  3e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0301  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.15 
 
 
748 aa  115  3e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3132  putative sensor histidine kinase  37.99 
 
 
466 aa  115  3e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1215  PAS  36.99 
 
 
515 aa  114  4.0000000000000004e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5321  histidine kinase  34.33 
 
 
470 aa  115  4.0000000000000004e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0811  histidine kinase  32.85 
 
 
580 aa  115  4.0000000000000004e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0357  sensor histidine kinase  34.92 
 
 
459 aa  114  4.0000000000000004e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.450318  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1998  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.68 
 
 
658 aa  114  5e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0153  histidine kinase  38.64 
 
 
325 aa  114  5e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0760  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.02 
 
 
610 aa  114  5e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000018635  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3491  putative signal transduction histidine kinase  35.09 
 
 
624 aa  114  6e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5015  GAF sensor signal transduction histidine kinase  37.27 
 
 
399 aa  114  7.000000000000001e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.36327  normal  0.324397 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1551  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.44 
 
 
407 aa  113  9e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.538677  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5497  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.61 
 
 
459 aa  113  1.0000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00170786 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3420  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.53 
 
 
440 aa  113  1.0000000000000001e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0662145 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2036  histidine kinase  37.5 
 
 
381 aa  113  1.0000000000000001e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.103366 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4427  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.8 
 
 
462 aa  113  1.0000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4560  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.8 
 
 
462 aa  113  1.0000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.140942  normal  0.159095 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3418  sensor histidine kinase  37.9 
 
 
481 aa  112  2.0000000000000002e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.986219  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0179  histidine kinase  42.93 
 
 
418 aa  112  2.0000000000000002e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6470  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.02 
 
 
471 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.629472  normal  0.491206 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4898  ATPase domain-containing protein  38.33 
 
 
491 aa  112  2.0000000000000002e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.246184  normal  0.165682 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4905  ATPase domain-containing protein  38.38 
 
 
496 aa  112  2.0000000000000002e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.92947  normal  0.728538 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1568  histidine kinase  33.09 
 
 
462 aa  112  3e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2438  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.91 
 
 
599 aa  112  3e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4945  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.16 
 
 
459 aa  112  3e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0549839 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1357  GAF sensor signal transduction histidine kinase  38.57 
 
 
403 aa  112  3e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.246673  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1027  putative transmembrane sensor histidine kinase transcription regulator protein  34.7 
 
 
456 aa  112  3e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.573227  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0252  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.94 
 
 
591 aa  111  3e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0165579 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0607  histidine kinase  36.1 
 
 
413 aa  111  4.0000000000000004e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2414  GAF sensor signal transduction histidine kinase  33.2 
 
 
545 aa  111  4.0000000000000004e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1983  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.75 
 
 
469 aa  111  5e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.143525 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1864  Sensor DegS domain protein  31.02 
 
 
391 aa  111  5e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000165606  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4854  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.44 
 
 
394 aa  111  5e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0459585  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0031  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.1 
 
 
468 aa  111  5e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.231222  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4564  histidine kinase  36.07 
 
 
460 aa  110  6e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.562879  normal  0.0736505 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5549  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.02 
 
 
370 aa  110  6e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.441753  normal  0.532681 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0817  signal transduction histidine kinase, glucose-6-phosphate specific  34.41 
 
 
466 aa  110  6e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000394288  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0027  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.89 
 
 
461 aa  110  7.000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.755533 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3812  histidine kinase  36.69 
 
 
402 aa  110  7.000000000000001e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00313261 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4714  Two-component sensor histidine kinase  33.63 
 
 
447 aa  110  8.000000000000001e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4456  histidine kinase  38.6 
 
 
410 aa  110  8.000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3261  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.2 
 
 
463 aa  110  8.000000000000001e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5671  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.07 
 
 
480 aa  110  9.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0241273 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>