More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_2249 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_2249  histidine kinase  100 
 
 		 420 aa  818    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.795375  normal  0.159293 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4688  histidine kinase  50 
 
 		 419 aa  324  2e-87  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4021  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  53.17 
 
 		 411 aa  306  4.0000000000000004e-82  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0185539  normal  0.088504 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4456  histidine kinase  41.77 
 
 		 410 aa  260  4e-68  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4726  histidine kinase  41.93 
 
 		 405 aa  239  5.999999999999999e-62  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4415  Signal transduction histidine kinase-like protein  43.83 
 
 		 386 aa  238  2e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0384972 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2642  histidine kinase  43.03 
 
 		 426 aa  234  3e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.992033  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1961  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.4 
 
 		 444 aa  228  2e-58  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  unclonable  0.000000367534  hitchhiker  0.000000631341 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5647  histidine kinase  37.97 
 
 		 433 aa  228  2e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.559873  normal  0.146404 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2758  histidine kinase  41.92 
 
 		 389 aa  223  6e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00845914  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4728  histidine kinase  40.1 
 
 		 429 aa  223  7e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1993  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  45.71 
 
 		 422 aa  221  9.999999999999999e-57  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2507  Signal transduction histidine kinase-like protein  38.44 
 
 		 405 aa  221  1.9999999999999999e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.401085  normal  0.727575 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0635  histidine kinase  38.39 
 
 		 430 aa  215  9.999999999999999e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.181904 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0308  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.53 
 
 		 405 aa  214  2.9999999999999995e-54  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.130128 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3934  histidine kinase  38.63 
 
 		 442 aa  209  8e-53  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2757  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  38.67 
 
 		 433 aa  208  2e-52  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.128423  normal  0.0502627 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2700  histidine kinase  38.73 
 
 		 429 aa  205  1e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000000394923  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3546  histidine kinase  50 
 
 		 489 aa  205  1e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.871685 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3907  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.17 
 
 		 428 aa  202  9.999999999999999e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1255  histidine kinase  49.77 
 
 		 463 aa  196  8.000000000000001e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2927  histidine kinase  37.78 
 
 		 383 aa  192  1e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000936268  hitchhiker  0.0000101948 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9331  Signal transduction histidine kinase-like protein  49.08 
 
 		 508 aa  189  9e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.542521 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2340  histidine kinase  47.96 
 
 		 388 aa  188  1e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0949  histidine kinase  48.4 
 
 		 416 aa  186  5e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0199  histidine kinase  39.14 
 
 		 452 aa  185  1.0000000000000001e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4333  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  46.61 
 
 		 343 aa  182  7e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0375931  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1916  histidine kinase  41.69 
 
 		 410 aa  180  4.999999999999999e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3200  Signal transduction histidine kinase-like protein  46.89 
 
 		 395 aa  177  3e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3718  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  45 
 
 		 586 aa  173  3.9999999999999995e-42  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.118329  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2301  Histidine kinase  48.86 
 
 		 412 aa  172  1e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4660  histidine kinase  47.27 
 
 		 402 aa  170  4e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0386  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  44.6 
 
 		 418 aa  170  4e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.482475 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2433  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  43.97 
 
 		 461 aa  169  7e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.189775  normal  0.142881 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0354  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.94 
 
 		 438 aa  167  2e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2298  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  49.32 
 
 		 432 aa  167  4e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.317439  normal  0.783172 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6198  Signal transduction histidine kinase-like protein  34.73 
 
 		 415 aa  166  1.0000000000000001e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.129005  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0424  histidine kinase  34 
 
 		 438 aa  165  1.0000000000000001e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.680525  hitchhiker  0.00719111 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3763  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  43.14 
 
 		 375 aa  164  2.0000000000000002e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.200679  normal  0.834979 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4606  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  44.95 
 
 		 417 aa  165  2.0000000000000002e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0890367  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6138  Signal transduction histidine kinase-like protein  45.63 
 
 		 403 aa  163  6e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.278868  normal  0.229544 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3908  putative signal transduction histidine kinase  43.67 
 
 		 435 aa  162  1e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2091  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.53 
 
 		 466 aa  162  1e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2525  histidine kinase  41.12 
 
 		 434 aa  162  1e-38  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0362104  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3982  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  43.67 
 
 		 435 aa  162  1e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.335335  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3923  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  43.67 
 
 		 435 aa  162  1e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.534106  normal  0.212662 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0329  signal transduction histidine kinase  41.6 
 
 		 435 aa  160  4e-38  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.982298  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2281  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  44.4 
 
 		 445 aa  160  4e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.67096  normal  0.255683 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0609  histidine kinase  45.62 
 
 		 442 aa  157  4e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.54142 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1652  Histidine kinase  50.77 
 
 		 439 aa  156  8e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.527879  normal  0.680022 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4385  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  43.53 
 
 		 445 aa  155  1e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12660  signal transduction histidine kinase  46.36 
 
 		 444 aa  150  3e-35  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.224023  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0211  histidine kinase  50.23 
 
 		 463 aa  150  4e-35  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17590  signal transduction histidine kinase  40.83 
 
 		 326 aa  150  4e-35  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0109488  normal  0.353356 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3867  histidine kinase  46.64 
 
 		 434 aa  150  5e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.265271  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3491  putative signal transduction histidine kinase  41.28 
 
 		 624 aa  148  2.0000000000000003e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1360  histidine kinase  44.5 
 
 		 476 aa  147  5e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.388977 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4050  Histidine kinase  43.84 
 
 		 374 aa  145  1e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.313821  hitchhiker  0.00550271 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0204  histidine kinase  33.57 
 
 		 446 aa  143  6e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0531  histidine kinase  44.6 
 
 		 429 aa  143  7e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.005431  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6699  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  44.86 
 
 		 621 aa  142  8e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3916  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  49.05 
 
 		 431 aa  141  1.9999999999999998e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.257994  normal  0.0672811 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3516  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  43.61 
 
 		 388 aa  140  3e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.370817  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09220  signal transduction histidine kinase  42.31 
 
 		 492 aa  139  1e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.253701 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2132  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.41 
 
 		 433 aa  138  2e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.569038  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3330  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.51 
 
 		 398 aa  136  7.000000000000001e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0149067  normal  0.138525 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2540  putative signal transduction histidine kinase  43.06 
 
 		 570 aa  134  3.9999999999999996e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0811  histidine kinase  40.74 
 
 		 580 aa  133  6.999999999999999e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07210  histidine kinase  42.58 
 
 		 237 aa  132  1.0000000000000001e-29  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0967  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.42 
 
 		 408 aa  132  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.849709 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11900  signal transduction histidine kinase  43.06 
 
 		 447 aa  129  9.000000000000001e-29  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0262  putative signal transduction histidine kinase  41.92 
 
 		 465 aa  129  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.186103 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0971  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31 
 
 		 417 aa  128  2.0000000000000002e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35880  signal transduction histidine kinase  48.42 
 
 		 454 aa  126  8.000000000000001e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.263807 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3104  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  50.71 
 
 		 459 aa  125  2e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.8316  hitchhiker  0.000380562 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0085  putative signal transduction histidine kinase  40.34 
 
 		 587 aa  122  9.999999999999999e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5907  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.44 
 
 		 408 aa  119  7.999999999999999e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.155683  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0319  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  38.86 
 
 		 382 aa  118  1.9999999999999998e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.499307  normal  0.099987 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8723  Histidine kinase  36.33 
 
 		 365 aa  110  4.0000000000000004e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2641  histidine kinase  35.35 
 
 		 453 aa  109  1e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0175588  hitchhiker  0.00721729 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3280  histidine kinase  39.27 
 
 		 664 aa  108  1e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00155771  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1551  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  38.58 
 
 		 407 aa  108  2e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.538677  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7224  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.95 
 
 		 594 aa  107  4e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2071  multi-sensor signal transduction histidine kinase  41.12 
 
 		 725 aa  107  5e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.249392  normal  0.37167 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2605  Histidine kinase  39.01 
 
 		 650 aa  106  6e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.209527  normal  0.327771 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0248  putative signal transduction histidine kinase  35.44 
 
 		 470 aa  99.8  8e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2603  Histidine kinase  38.16 
 
 		 720 aa  99.4  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00739798  normal  0.140215 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4245  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.01 
 
 		 595 aa  99.4  1e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6031  Histidine kinase  39.18 
 
 		 338 aa  96.3  8e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.542402  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6579  Histidine kinase  35.29 
 
 		 689 aa  95.9  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.218867  normal  0.148163 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3834  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.78 
 
 		 709 aa  95.9  1e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.154622  normal  0.0585187 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3408  histidine kinase  36.36 
 
 		 686 aa  94.7  2e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000158036  hitchhiker  0.000062789 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0257  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.37 
 
 		 404 aa  94.7  3e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.5208 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0554  Histidine kinase  35.87 
 
 		 687 aa  94.4  4e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.158949  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1706  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.77 
 
 		 564 aa  93.6  6e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.98975  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5078  histidine kinase  37.86 
 
 		 368 aa  92.4  1e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.9788 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1533  histidine kinase  37.5 
 
 		 451 aa  92.8  1e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0016197  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6491  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.77 
 
 		 576 aa  92.4  1e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.194722  normal  0.40327 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2736  histidine kinase  35.29 
 
 		 430 aa  92  2e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.554536  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3575  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.76 
 
 		 475 aa  90.5  4e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>