More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_3330 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_3330  Histidine kinase  100 
 
 		 653 aa  1245    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.323144 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1447  Histidine kinase  39.5 
 
 		 691 aa  278  3e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.705239  normal  0.184804 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3280  histidine kinase  36.45 
 
 		 664 aa  258  2e-67  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00155771  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6579  Histidine kinase  35.59 
 
 		 689 aa  242  2e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.218867  normal  0.148163 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2605  Histidine kinase  37.35 
 
 		 650 aa  238  4e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.209527  normal  0.327771 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0554  Histidine kinase  35.88 
 
 		 687 aa  226  8e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.158949  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3834  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.08 
 
 		 709 aa  224  4.9999999999999996e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.154622  normal  0.0585187 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2603  Histidine kinase  32.19 
 
 		 720 aa  216  1.9999999999999998e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00739798  normal  0.140215 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1434  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 731 aa  203  6e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.278277  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3408  histidine kinase  35.88 
 
 		 686 aa  184  4.0000000000000006e-45  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000158036  hitchhiker  0.000062789 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3325  histidine kinase  33.28 
 
 		 696 aa  173  7.999999999999999e-42  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.868866  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1533  histidine kinase  45.6 
 
 		 451 aa  162  2e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0016197  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0555  Signal transduction histidine kinase-like protein  40.06 
 
 		 461 aa  134  3.9999999999999996e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.137266  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4898  ATPase domain-containing protein  41.98 
 
 		 491 aa  130  8.000000000000001e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.246184  normal  0.165682 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2189  histidine kinase  35.6 
 
 		 608 aa  129  2.0000000000000002e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1706  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  39.02 
 
 		 564 aa  125  3e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.98975  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4157  histidine kinase  30.83 
 
 		 663 aa  116  1.0000000000000001e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.921776  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3594  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  39.04 
 
 		 598 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7687  Signal transduction histidine kinase-like protein  28.9 
 
 		 587 aa  115  3e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3926  histidine kinase  38.77 
 
 		 598 aa  114  6e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3064  GAF sensor signal transduction histidine kinase  33.21 
 
 		 544 aa  112  2.0000000000000002e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.980645 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5716  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.93 
 
 		 700 aa  111  3e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00700823 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1808  histidine kinase  33 
 
 		 461 aa  112  3e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0649  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.13 
 
 		 490 aa  111  3e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0284  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.19 
 
 		 591 aa  112  3e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0974  putative signal transduction histidine kinase  38.7 
 
 		 584 aa  112  3e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.575526  normal  0.658515 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5015  GAF sensor signal transduction histidine kinase  35.55 
 
 		 399 aa  111  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.36327  normal  0.324397 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5078  histidine kinase  37.16 
 
 		 368 aa  111  5e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.9788 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2521  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  38.33 
 
 		 594 aa  110  7.000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0533071  normal  0.360744 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2414  GAF sensor signal transduction histidine kinase  32.46 
 
 		 545 aa  110  8.000000000000001e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0031  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.5 
 
 		 468 aa  110  8.000000000000001e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.231222  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0835  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.09 
 
 		 513 aa  110  1e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.506396  normal  0.822234 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2634  histidine kinase  38.54 
 
 		 343 aa  110  1e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000175326  hitchhiker  0.00557176 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1399  PAS  32.22 
 
 		 683 aa  108  2e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.04458 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1055  putative signal transduction histidine kinase  36.58 
 
 		 401 aa  109  2e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.64157  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1071  GAF sensor signal transduction histidine kinase  36.58 
 
 		 401 aa  109  2e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0809665 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1082  GAF sensor signal transduction histidine kinase  36.58 
 
 		 401 aa  109  2e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41030  Periplasmic sensory histidine protein kinase, two-component  38.08 
 
 		 458 aa  108  3e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0649951  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5549  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  39.15 
 
 		 370 aa  108  4e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.441753  normal  0.532681 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4581  hypothetical protein  32.35 
 
 		 663 aa  107  5e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.267565 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0674  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.52 
 
 		 447 aa  107  5e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.504244  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2912  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.52 
 
 		 339 aa  107  6e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6031  Histidine kinase  38.78 
 
 		 338 aa  107  7e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.542402  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1913  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.5 
 
 		 700 aa  107  9e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.6571 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003135  sensor histidine kinase  31.58 
 
 		 451 aa  106  1e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.291514  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0437  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33 
 
 		 513 aa  106  1e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4921  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.89 
 
 		 412 aa  106  1e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0892179  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1357  GAF sensor signal transduction histidine kinase  36.54 
 
 		 403 aa  106  1e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.246673  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1564  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 395 aa  105  2e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2833  histidine kinase  33.85 
 
 		 447 aa  105  2e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.665069  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3510  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.85 
 
 		 447 aa  105  2e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0126  sensory box histidine kinase/response regulator  36.4 
 
 		 619 aa  105  3e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.799989  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6313  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.2 
 
 		 448 aa  105  3e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0153  histidine kinase  36.92 
 
 		 325 aa  105  3e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1633  sensory box histidine kinase  36.4 
 
 		 680 aa  104  4e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.736823  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2820  GAF sensor signal transduction histidine kinase  30.89 
 
 		 545 aa  104  5e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.771324  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1550  sensory box histidine kinase  36.4 
 
 		 680 aa  104  5e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3044  Sensor DegS domain protein  33.17 
 
 		 381 aa  104  6e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000367044  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5329  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.44 
 
 		 595 aa  104  6e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3498  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.44 
 
 		 596 aa  103  7e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00492042 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1652  histidine kinase  37.39 
 
 		 373 aa  103  8e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000168648  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3956  histidine kinase, dimerization and phosphoacceptor region  34.47 
 
 		 323 aa  103  9e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0789  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.73 
 
 		 469 aa  103  9e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2612  GAF sensor signal transduction histidine kinase  37.22 
 
 		 391 aa  103  9e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0084  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.98 
 
 		 449 aa  103  1e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4564  histidine kinase  36.48 
 
 		 460 aa  103  1e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.562879  normal  0.0736505 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0252  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.91 
 
 		 591 aa  103  1e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0165579 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3614  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.95 
 
 		 298 aa  103  1e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.753486  normal  0.27992 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6398  histidine kinase  35.55 
 
 		 461 aa  102  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.176497 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4477  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.73 
 
 		 471 aa  102  2e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0027  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.33 
 
 		 461 aa  102  2e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.755533 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5188  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.79 
 
 		 480 aa  102  2e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5671  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.79 
 
 		 480 aa  102  2e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0241273 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2942  ATPase domain-containing protein  40.2 
 
 		 485 aa  102  2e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3132  putative sensor histidine kinase  36.28 
 
 		 466 aa  102  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2127  sensor histidine kinase  34.95 
 
 		 313 aa  102  3e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.289713  normal  0.113702 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02702  histidine kinase  31.58 
 
 		 456 aa  102  3e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6470  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.74 
 
 		 471 aa  102  3e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.629472  normal  0.491206 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21830  histidine kinase  31.88 
 
 		 391 aa  101  4e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00305219  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0227  GAF sensor signal transduction histidine kinase  33.94 
 
 		 421 aa  101  4e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1462  sensor kinase protein  36.28 
 
 		 466 aa  101  4e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1099  sensor histidine kinase  36.74 
 
 		 466 aa  101  4e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1378  sensor histidine kinase  36.74 
 
 		 466 aa  101  4e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.922617  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3247  putative sensor histidine kinase  36.28 
 
 		 466 aa  101  4e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2363  sensor histidine kinase  36.74 
 
 		 466 aa  101  4e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2298  histidine kinase  28.99 
 
 		 1093 aa  101  5e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3187  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.73 
 
 		 459 aa  101  5e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.134921 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0921  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.2 
 
 		 446 aa  100  6e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3261  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.26 
 
 		 463 aa  100  8e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1983  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.08 
 
 		 469 aa  100  8e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.143525 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1345  histidine kinase  35.86 
 
 		 338 aa  99.8  1e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000383255 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4945  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.87 
 
 		 459 aa  100  1e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0549839 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4456  histidine kinase  35.91 
 
 		 410 aa  99.8  1e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3491  putative signal transduction histidine kinase  38.36 
 
 		 624 aa  100  1e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4905  ATPase domain-containing protein  36.79 
 
 		 496 aa  100  1e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.92947  normal  0.728538 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2445  hypothetical protein  27.99 
 
 		 685 aa  100  1e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000212553  normal  0.0137307 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1405  sensor histidine kinase  32.86 
 
 		 483 aa  99.4  2e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0589016  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3080  bacteriophytochrome  33.65 
 
 		 783 aa  99  2e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0092  histidine kinase  37.25 
 
 		 461 aa  99.4  2e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7760  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.42 
 
 		 486 aa  99.4  2e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>