19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_2445 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_2445  hypothetical protein  100 
 
 		 685 aa  1316    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000212553  normal  0.0137307 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2643  hypothetical protein  35.46 
 
 		 388 aa  172  2e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0558734  hitchhiker  0.00643545 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1447  Histidine kinase  29.12 
 
 		 691 aa  105  3e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.705239  normal  0.184804 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3280  histidine kinase  28.52 
 
 		 664 aa  98.2  5e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00155771  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6579  Histidine kinase  29.9 
 
 		 689 aa  94.4  6e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.218867  normal  0.148163 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3330  Histidine kinase  28.57 
 
 		 653 aa  77.4  0.0000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.323144 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0554  Histidine kinase  29.22 
 
 		 687 aa  72.8  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.158949  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2603  Histidine kinase  26.8 
 
 		 720 aa  71.6  0.00000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00739798  normal  0.140215 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2605  Histidine kinase  29.93 
 
 		 650 aa  68.9  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.209527  normal  0.327771 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1745  hypothetical protein  28.4 
 
 		 414 aa  67.4  0.0000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.736982  normal  0.0165675 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1434  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.03 
 
 		 731 aa  64.7  0.000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.278277  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3834  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30 
 
 		 709 aa  62  0.00000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.154622  normal  0.0585187 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3408  histidine kinase  26.76 
 
 		 686 aa  58.2  0.0000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000158036  hitchhiker  0.000062789 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3357  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.85 
 
 		 970 aa  54.3  0.000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.984464  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1461  hypothetical protein  29.65 
 
 		 592 aa  50.1  0.0001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.523283  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3325  histidine kinase  29.11 
 
 		 696 aa  47.8  0.0008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.868866  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2641  histidine kinase  27.11 
 
 		 453 aa  47  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0175588  hitchhiker  0.00721729 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1744  putative signal transduction histidine kinase  27.45 
 
 		 723 aa  46.6  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.0103404 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7687  Signal transduction histidine kinase-like protein  29.1 
 
 		 587 aa  44.3  0.008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>