15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_2643 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_2643  hypothetical protein  100 
 
 		 388 aa  738    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0558734  hitchhiker  0.00643545 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2445  hypothetical protein  36.41 
 
 		 685 aa  167  2.9999999999999998e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000212553  normal  0.0137307 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1447  Histidine kinase  30.17 
 
 		 691 aa  95.5  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.705239  normal  0.184804 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3280  histidine kinase  31.44 
 
 		 664 aa  82  0.00000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00155771  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3834  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.7 
 
 		 709 aa  72  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.154622  normal  0.0585187 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3330  Histidine kinase  30.34 
 
 		 653 aa  71.6  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.323144 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2641  histidine kinase  28.91 
 
 		 453 aa  68.9  0.0000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0175588  hitchhiker  0.00721729 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3357  multi-sensor signal transduction histidine kinase  22.96 
 
 		 970 aa  63.9  0.000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.984464  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7687  Signal transduction histidine kinase-like protein  34.36 
 
 		 587 aa  60.8  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2605  Histidine kinase  30.24 
 
 		 650 aa  50.8  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.209527  normal  0.327771 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1434  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.86 
 
 		 731 aa  48.9  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.278277  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0554  Histidine kinase  25.71 
 
 		 687 aa  49.3  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.158949  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6579  Histidine kinase  28.88 
 
 		 689 aa  47.4  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.218867  normal  0.148163 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2603  Histidine kinase  27.05 
 
 		 720 aa  45.8  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00739798  normal  0.140215 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4581  hypothetical protein  27.25 
 
 		 663 aa  43.9  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.267565 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>