233 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_4581 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_4581  hypothetical protein  100 
 
 		 663 aa  1276    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.267565 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2605  Histidine kinase  42.89 
 
 		 650 aa  294  3e-78  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.209527  normal  0.327771 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6579  Histidine kinase  39.65 
 
 		 689 aa  274  4.0000000000000004e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.218867  normal  0.148163 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2603  Histidine kinase  48.87 
 
 		 720 aa  261  4e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00739798  normal  0.140215 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3280  histidine kinase  39.73 
 
 		 664 aa  224  4e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00155771  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0554  Histidine kinase  35.78 
 
 		 687 aa  180  7e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.158949  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1447  Histidine kinase  34.97 
 
 		 691 aa  155  2e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.705239  normal  0.184804 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3834  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.87 
 
 		 709 aa  131  4.0000000000000003e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.154622  normal  0.0585187 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0555  Signal transduction histidine kinase-like protein  40.48 
 
 		 461 aa  127  7e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.137266  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1533  histidine kinase  43.29 
 
 		 451 aa  112  2.0000000000000002e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0016197  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3330  Histidine kinase  31.76 
 
 		 653 aa  109  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.323144 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1434  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.28 
 
 		 731 aa  106  2e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.278277  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2091  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.05 
 
 		 466 aa  64.3  0.000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2445  hypothetical protein  29.01 
 
 		 685 aa  63.9  0.00000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000212553  normal  0.0137307 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2291  histidine kinase  30.36 
 
 		 596 aa  63.2  0.00000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0329  signal transduction histidine kinase  37.96 
 
 		 435 aa  61.6  0.00000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.982298  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3408  histidine kinase  35.27 
 
 		 686 aa  61.6  0.00000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000158036  hitchhiker  0.000062789 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1255  histidine kinase  36.51 
 
 		 463 aa  60.8  0.00000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3934  histidine kinase  38.26 
 
 		 442 aa  60.5  0.00000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2433  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.92 
 
 		 461 aa  60.1  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.189775  normal  0.142881 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2757  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  37.61 
 
 		 433 aa  59.3  0.0000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.128423  normal  0.0502627 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3867  histidine kinase  35.71 
 
 		 434 aa  58.9  0.0000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.265271  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0308  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.07 
 
 		 405 aa  58.2  0.0000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.130128 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0949  histidine kinase  33.33 
 
 		 416 aa  58.5  0.0000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4728  histidine kinase  35.96 
 
 		 429 aa  58.5  0.0000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4660  histidine kinase  36.28 
 
 		 402 aa  57.8  0.0000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4726  histidine kinase  32.76 
 
 		 405 aa  57.8  0.0000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1652  histidine kinase  37.21 
 
 		 373 aa  57.8  0.0000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000168648  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1706  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.71 
 
 		 564 aa  57.4  0.0000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.98975  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1744  putative signal transduction histidine kinase  28.49 
 
 		 723 aa  57.4  0.0000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.0103404 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3325  histidine kinase  27.75 
 
 		 696 aa  57.4  0.0000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.868866  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2301  Histidine kinase  29.21 
 
 		 412 aa  57.4  0.0000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5907  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.45 
 
 		 408 aa  56.6  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.155683  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0384  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.25 
 
 		 348 aa  57  0.000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0301  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.98 
 
 		 748 aa  57  0.000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0199  histidine kinase  33.64 
 
 		 452 aa  56.2  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1564  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  36.05 
 
 		 395 aa  55.5  0.000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6138  Signal transduction histidine kinase-like protein  39.05 
 
 		 403 aa  55.5  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.278868  normal  0.229544 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0649  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.21 
 
 		 490 aa  55.5  0.000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1055  putative signal transduction histidine kinase  37.63 
 
 		 401 aa  55.5  0.000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.64157  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1071  GAF sensor signal transduction histidine kinase  37.63 
 
 		 401 aa  55.5  0.000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0809665 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2111  ATP-binding region ATPase domain protein  35.23 
 
 		 645 aa  54.7  0.000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.184163  normal  0.230765 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4898  ATPase domain-containing protein  36.73 
 
 		 491 aa  54.7  0.000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.246184  normal  0.165682 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0967  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.46 
 
 		 408 aa  55.1  0.000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.849709 
 
 
-
 
NC_013207  Aaci_3079  histidine kinase  37.63 
 
 		 223 aa  54.7  0.000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4714  Two-component sensor histidine kinase  31.71 
 
 		 447 aa  54.3  0.000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4456  histidine kinase  39.33 
 
 		 410 aa  53.9  0.000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1864  Sensor DegS domain protein  40.26 
 
 		 391 aa  53.9  0.000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000165606  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4245  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.48 
 
 		 595 aa  53.9  0.000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2132  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.89 
 
 		 433 aa  53.9  0.000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.569038  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1215  PAS  28.57 
 
 		 515 aa  53.1  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2643  hypothetical protein  27.04 
 
 		 388 aa  53.9  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0558734  hitchhiker  0.00643545 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1916  histidine kinase  40.91 
 
 		 410 aa  53.5  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4021  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.46 
 
 		 411 aa  53.5  0.00001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0185539  normal  0.088504 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2344  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.3 
 
 		 480 aa  53.5  0.00001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.165919 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5647  histidine kinase  34.78 
 
 		 433 aa  53.9  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.559873  normal  0.146404 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2442  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.93 
 
 		 1030 aa  52.8  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.223882  normal  0.750566 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1668  histidine kinase  36.05 
 
 		 298 aa  53.1  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.891257 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2912  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.63 
 
 		 339 aa  52.4  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0560  histidine kinase  33.33 
 
 		 670 aa  52.8  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.618015  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3907  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.51 
 
 		 428 aa  52.8  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0386  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.65 
 
 		 418 aa  52.8  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.482475 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5166  putative signal transduction histidine kinase  34.4 
 
 		 537 aa  52.4  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.153671  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1204  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30 
 
 		 779 aa  52  0.00003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3668  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.84 
 
 		 650 aa  52.4  0.00003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1082  GAF sensor signal transduction histidine kinase  36.56 
 
 		 401 aa  52.4  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0635  histidine kinase  33.06 
 
 		 430 aa  52  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.181904 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6241  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  40.91 
 
 		 748 aa  52  0.00003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0811  histidine kinase  33.07 
 
 		 580 aa  52  0.00004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2249  histidine kinase  27.92 
 
 		 420 aa  51.6  0.00004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.795375  normal  0.159293 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3080  bacteriophytochrome  31.58 
 
 		 783 aa  52  0.00004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2127  sensor histidine kinase  36.05 
 
 		 313 aa  51.6  0.00005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.289713  normal  0.113702 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3418  sensor histidine kinase  31.13 
 
 		 481 aa  51.2  0.00005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.986219  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2525  histidine kinase  35.29 
 
 		 434 aa  51.6  0.00005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0362104  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1667  ATPase domain-containing protein  36.9 
 
 		 384 aa  51.6  0.00005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.436527  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4503  histidine kinase  37.33 
 
 		 643 aa  51.2  0.00005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.604782 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1984  histidine kinase  36.9 
 
 		 373 aa  51.2  0.00006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0746  histidine kinase  32.74 
 
 		 387 aa  51.2  0.00006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3230  sensory box histidine kinase  34.02 
 
 		 518 aa  50.8  0.00008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0262  putative signal transduction histidine kinase  35.48 
 
 		 465 aa  50.8  0.00008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.186103 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0623  sensor protein UhpB  30.91 
 
 		 527 aa  50.8  0.00008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4157  histidine kinase  29.62 
 
 		 663 aa  50.8  0.00008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.921776  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2020  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.94 
 
 		 771 aa  50.8  0.00009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3104  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.14 
 
 		 485 aa  50.8  0.00009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2958  histidine kinase  36.89 
 
 		 405 aa  50.4  0.00009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00418093  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1941  sensor histidine kinase  40.96 
 
 		 394 aa  50.1  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1872  sensor histidine kinase  29.91 
 
 		 1046 aa  50.1  0.0001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3614  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.88 
 
 		 298 aa  50.1  0.0001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.753486  normal  0.27992 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0252  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.03 
 
 		 591 aa  50.4  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0165579 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3049  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.9 
 
 		 565 aa  50.4  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0199075  normal  0.598323 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0284  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.74 
 
 		 591 aa  50.1  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1360  histidine kinase  29.29 
 
 		 476 aa  50.1  0.0001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.388977 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0531  histidine kinase  37.38 
 
 		 429 aa  49.3  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.005431  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3427  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  36.14 
 
 		 378 aa  49.3  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.117  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2483  histidine kinase  30.39 
 
 		 514 aa  49.7  0.0002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.705062  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8723  Histidine kinase  35.64 
 
 		 365 aa  49.7  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2961  ATP-binding region ATPase domain protein  33.33 
 
 		 645 aa  49.3  0.0002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.10084  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1961  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.5 
 
 		 444 aa  49.3  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  unclonable  0.000000367534  hitchhiker  0.000000631341 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4606  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.26 
 
 		 417 aa  49.3  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0890367  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0442  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34 
 
 		 485 aa  49.7  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.12569  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>