More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_1916 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_1916  histidine kinase  100 
 
 		 410 aa  767    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4728  histidine kinase  45.12 
 
 		 429 aa  267  2e-70  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2700  histidine kinase  42.65 
 
 		 429 aa  248  1e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000000394923  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2757  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  43.93 
 
 		 433 aa  248  1e-64  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.128423  normal  0.0502627 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3546  histidine kinase  49.36 
 
 		 489 aa  237  3e-61  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.871685 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0635  histidine kinase  44.57 
 
 		 430 aa  236  5.0000000000000005e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.181904 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5647  histidine kinase  42.33 
 
 		 433 aa  232  8.000000000000001e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.559873  normal  0.146404 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2507  Signal transduction histidine kinase-like protein  44.18 
 
 		 405 aa  229  7e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.401085  normal  0.727575 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1961  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  44.62 
 
 		 444 aa  226  6e-58  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  unclonable  0.000000367534  hitchhiker  0.000000631341 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9331  Signal transduction histidine kinase-like protein  47.15 
 
 		 508 aa  224  2e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.542521 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2927  histidine kinase  43.67 
 
 		 383 aa  221  1.9999999999999999e-56  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000936268  hitchhiker  0.0000101948 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2249  histidine kinase  42.38 
 
 		 420 aa  204  2e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.795375  normal  0.159293 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3934  histidine kinase  38.37 
 
 		 442 aa  195  2e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4415  Signal transduction histidine kinase-like protein  39.56 
 
 		 386 aa  193  4e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0384972 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3907  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.7 
 
 		 428 aa  191  2.9999999999999997e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4456  histidine kinase  38.21 
 
 		 410 aa  187  3e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4726  histidine kinase  39.69 
 
 		 405 aa  187  4e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3718  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  50.94 
 
 		 586 aa  184  2.0000000000000003e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.118329  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0199  histidine kinase  41.54 
 
 		 452 aa  184  2.0000000000000003e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4333  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  49.07 
 
 		 343 aa  184  3e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0375931  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1255  histidine kinase  36.83 
 
 		 463 aa  183  4.0000000000000006e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0308  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.76 
 
 		 405 aa  183  4.0000000000000006e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.130128 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4688  histidine kinase  40.92 
 
 		 419 aa  177  3e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6138  Signal transduction histidine kinase-like protein  42.19 
 
 		 403 aa  172  1e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.278868  normal  0.229544 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0386  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.68 
 
 		 418 aa  172  1e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.482475 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0949  histidine kinase  45.06 
 
 		 416 aa  168  2e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3200  Signal transduction histidine kinase-like protein  46.01 
 
 		 395 aa  167  4e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3763  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  43.35 
 
 		 375 aa  161  2e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.200679  normal  0.834979 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1360  histidine kinase  36.34 
 
 		 476 aa  160  3e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.388977 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1993  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.55 
 
 		 422 aa  159  7e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2758  histidine kinase  46.84 
 
 		 389 aa  158  1e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00845914  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4606  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.86 
 
 		 417 aa  156  6e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0890367  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09220  signal transduction histidine kinase  34.6 
 
 		 492 aa  155  1e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.253701 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2433  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.08 
 
 		 461 aa  153  5e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.189775  normal  0.142881 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2642  histidine kinase  39.47 
 
 		 426 aa  153  7e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.992033  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2091  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  43.24 
 
 		 466 aa  153  7e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2340  histidine kinase  36.59 
 
 		 388 aa  152  8.999999999999999e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0609  histidine kinase  34.63 
 
 		 442 aa  151  2e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.54142 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4660  histidine kinase  47.12 
 
 		 402 aa  149  8e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0354  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.75 
 
 		 438 aa  149  9e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1652  Histidine kinase  38.17 
 
 		 439 aa  147  4.0000000000000006e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.527879  normal  0.680022 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0531  histidine kinase  45.28 
 
 		 429 aa  146  6e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.005431  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3923  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.87 
 
 		 435 aa  145  1e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.534106  normal  0.212662 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3908  putative signal transduction histidine kinase  40.87 
 
 		 435 aa  144  2e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2301  Histidine kinase  34.53 
 
 		 412 aa  145  2e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3982  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.87 
 
 		 435 aa  144  2e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.335335  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6198  Signal transduction histidine kinase-like protein  35.62 
 
 		 415 aa  144  3e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.129005  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2298  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  44.09 
 
 		 432 aa  144  3e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.317439  normal  0.783172 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0329  signal transduction histidine kinase  42.59 
 
 		 435 aa  143  6e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.982298  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0424  histidine kinase  33.98 
 
 		 438 aa  142  8e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.680525  hitchhiker  0.00719111 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0204  histidine kinase  33.64 
 
 		 446 aa  142  9.999999999999999e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4021  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.88 
 
 		 411 aa  142  9.999999999999999e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0185539  normal  0.088504 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0262  putative signal transduction histidine kinase  37.24 
 
 		 465 aa  141  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.186103 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2525  histidine kinase  35.07 
 
 		 434 aa  141  3e-32  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0362104  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3491  putative signal transduction histidine kinase  45.15 
 
 		 624 aa  137  4e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4385  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.89 
 
 		 445 aa  135  9.999999999999999e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2281  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.27 
 
 		 445 aa  135  9.999999999999999e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.67096  normal  0.255683 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3867  histidine kinase  37.43 
 
 		 434 aa  135  9.999999999999999e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.265271  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0211  histidine kinase  48.13 
 
 		 463 aa  135  1.9999999999999998e-30  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2132  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.86 
 
 		 433 aa  133  6.999999999999999e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.569038  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17590  signal transduction histidine kinase  39.73 
 
 		 326 aa  131  2.0000000000000002e-29  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0109488  normal  0.353356 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3516  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.32 
 
 		 388 aa  130  6e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.370817  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4050  Histidine kinase  41.2 
 
 		 374 aa  128  2.0000000000000002e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.313821  hitchhiker  0.00550271 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11900  signal transduction histidine kinase  32.8 
 
 		 447 aa  128  2.0000000000000002e-28  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3104  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  48.85 
 
 		 459 aa  127  3e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.8316  hitchhiker  0.000380562 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3916  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  46.51 
 
 		 431 aa  127  4.0000000000000003e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.257994  normal  0.0672811 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12660  signal transduction histidine kinase  40.81 
 
 		 444 aa  126  8.000000000000001e-28  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.224023  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3330  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  43.2 
 
 		 398 aa  126  8.000000000000001e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0149067  normal  0.138525 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0967  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.89 
 
 		 408 aa  121  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.849709 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6699  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.66 
 
 		 621 aa  120  3.9999999999999996e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0971  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.35 
 
 		 417 aa  120  6e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0319  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.49 
 
 		 382 aa  119  9.999999999999999e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.499307  normal  0.099987 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5907  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.22 
 
 		 408 aa  119  9.999999999999999e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.155683  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0085  putative signal transduction histidine kinase  40.28 
 
 		 587 aa  118  1.9999999999999998e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07210  histidine kinase  41.01 
 
 		 237 aa  112  1.0000000000000001e-23  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0811  histidine kinase  41.46 
 
 		 580 aa  111  2.0000000000000002e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35880  signal transduction histidine kinase  44.3 
 
 		 454 aa  109  1e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.263807 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8723  Histidine kinase  40.59 
 
 		 365 aa  107  4e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7224  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.35 
 
 		 594 aa  107  5e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2071  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.72 
 
 		 725 aa  105  2e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.249392  normal  0.37167 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2540  putative signal transduction histidine kinase  35.98 
 
 		 570 aa  103  6e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6491  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 576 aa  101  2e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.194722  normal  0.40327 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2641  histidine kinase  33.49 
 
 		 453 aa  101  3e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0175588  hitchhiker  0.00721729 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4245  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.1 
 
 		 595 aa  92  2e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1082  GAF sensor signal transduction histidine kinase  37.74 
 
 		 401 aa  91.3  3e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2603  Histidine kinase  38.86 
 
 		 720 aa  89.4  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00739798  normal  0.140215 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5532  sensor histidine kinase  24.57 
 
 		 376 aa  88.6  2e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1055  putative signal transduction histidine kinase  38.32 
 
 		 401 aa  88.6  2e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.64157  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1071  GAF sensor signal transduction histidine kinase  38.32 
 
 		 401 aa  88.6  2e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0809665 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5483  sensor histidine kinase  24.57 
 
 		 376 aa  87.8  3e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5476  sensor histidine kinase  25.72 
 
 		 376 aa  87.8  3e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.412372  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1533  histidine kinase  39.25 
 
 		 451 aa  88.2  3e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0016197  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2605  Histidine kinase  37.56 
 
 		 650 aa  87.8  3e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.209527  normal  0.327771 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0357  sensor histidine kinase  33.64 
 
 		 459 aa  87.8  3e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.450318  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0456  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.89 
 
 		 775 aa  87.8  3e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00143274 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3834  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.73 
 
 		 709 aa  87.8  4e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.154622  normal  0.0585187 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5476  sensor histidine kinase  25.88 
 
 		 376 aa  86.7  7e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.324928  hitchhiker  0.0000000000347721 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3408  histidine kinase  37.26 
 
 		 686 aa  86.3  8e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000158036  hitchhiker  0.000062789 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1652  histidine kinase  33.33 
 
 		 373 aa  85.9  0.000000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000168648  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5166  putative signal transduction histidine kinase  37.25 
 
 		 537 aa  85.1  0.000000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.153671  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>