More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_4050 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_4050  Histidine kinase  100 
 
 		 374 aa  713    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.313821  hitchhiker  0.00550271 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2340  histidine kinase  51.08 
 
 		 388 aa  321  9.999999999999999e-87  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3516  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  48.84 
 
 		 388 aa  255  9e-67  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.370817  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2132  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  59.26 
 
 		 433 aa  253  4.0000000000000004e-66  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.569038  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8723  Histidine kinase  57.36 
 
 		 365 aa  228  1e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3934  histidine kinase  43.98 
 
 		 442 aa  183  4.0000000000000006e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1255  histidine kinase  46.43 
 
 		 463 aa  182  9.000000000000001e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0308  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  50.92 
 
 		 405 aa  180  4e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.130128 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0329  signal transduction histidine kinase  45.88 
 
 		 435 aa  176  8e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.982298  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4415  Signal transduction histidine kinase-like protein  41.37 
 
 		 386 aa  174  1.9999999999999998e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0384972 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0949  histidine kinase  46.55 
 
 		 416 aa  172  1e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4728  histidine kinase  46.64 
 
 		 429 aa  171  2e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3908  putative signal transduction histidine kinase  45.04 
 
 		 435 aa  171  2e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2507  Signal transduction histidine kinase-like protein  41.41 
 
 		 405 aa  171  2e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.401085  normal  0.727575 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3982  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  45.04 
 
 		 435 aa  171  2e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.335335  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3923  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  45.04 
 
 		 435 aa  171  2e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.534106  normal  0.212662 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4385  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  44.77 
 
 		 445 aa  170  3e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3867  histidine kinase  44.27 
 
 		 434 aa  168  1e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.265271  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2281  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  45 
 
 		 445 aa  167  4e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.67096  normal  0.255683 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1360  histidine kinase  46.49 
 
 		 476 aa  163  4.0000000000000004e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.388977 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0199  histidine kinase  47.91 
 
 		 452 aa  163  4.0000000000000004e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1961  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.68 
 
 		 444 aa  162  6e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  unclonable  0.000000367534  hitchhiker  0.000000631341 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3718  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  48.57 
 
 		 586 aa  159  1e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.118329  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0386  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.94 
 
 		 418 aa  159  1e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.482475 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4660  histidine kinase  46.41 
 
 		 402 aa  158  2e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4606  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  46.12 
 
 		 417 aa  158  2e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0890367  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3491  putative signal transduction histidine kinase  46.89 
 
 		 624 aa  157  3e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6138  Signal transduction histidine kinase-like protein  47.8 
 
 		 403 aa  157  3e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.278868  normal  0.229544 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2525  histidine kinase  37.95 
 
 		 434 aa  156  4e-37  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0362104  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2249  histidine kinase  43.84 
 
 		 420 aa  156  4e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.795375  normal  0.159293 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3907  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  43.23 
 
 		 428 aa  156  5.0000000000000005e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2301  Histidine kinase  44.59 
 
 		 412 aa  156  6e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3200  Signal transduction histidine kinase-like protein  41.9 
 
 		 395 aa  154  2.9999999999999998e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0204  histidine kinase  39.35 
 
 		 446 aa  153  4e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5647  histidine kinase  43.72 
 
 		 433 aa  153  5e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.559873  normal  0.146404 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3763  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.93 
 
 		 375 aa  152  7e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.200679  normal  0.834979 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2433  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.37 
 
 		 461 aa  152  1e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.189775  normal  0.142881 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6198  Signal transduction histidine kinase-like protein  45.97 
 
 		 415 aa  152  1e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.129005  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0635  histidine kinase  40.87 
 
 		 430 aa  151  2e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.181904 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2091  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.71 
 
 		 466 aa  150  2e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3546  histidine kinase  42.79 
 
 		 489 aa  149  7e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.871685 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2927  histidine kinase  43.87 
 
 		 383 aa  148  1.0000000000000001e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000936268  hitchhiker  0.0000101948 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09220  signal transduction histidine kinase  40.46 
 
 		 492 aa  148  1.0000000000000001e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.253701 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0531  histidine kinase  48.1 
 
 		 429 aa  148  2.0000000000000003e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.005431  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2757  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  40.69 
 
 		 433 aa  148  2.0000000000000003e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.128423  normal  0.0502627 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4726  histidine kinase  44.2 
 
 		 405 aa  146  5e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0609  histidine kinase  40.22 
 
 		 442 aa  146  6e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.54142 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1652  Histidine kinase  50.26 
 
 		 439 aa  145  1e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.527879  normal  0.680022 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17590  signal transduction histidine kinase  41.3 
 
 		 326 aa  145  1e-33  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0109488  normal  0.353356 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4456  histidine kinase  43.09 
 
 		 410 aa  145  1e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2700  histidine kinase  41.74 
 
 		 429 aa  140  3e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000000394923  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0211  histidine kinase  47.42 
 
 		 463 aa  140  3.9999999999999997e-32  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9331  Signal transduction histidine kinase-like protein  42.86 
 
 		 508 aa  139  7.999999999999999e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.542521 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2298  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.6 
 
 		 432 aa  138  1e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.317439  normal  0.783172 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6699  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  46.67 
 
 		 621 aa  138  2e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3916  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  46.98 
 
 		 431 aa  137  4e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.257994  normal  0.0672811 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4333  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.82 
 
 		 343 aa  135  8e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0375931  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12660  signal transduction histidine kinase  43.59 
 
 		 444 aa  135  9.999999999999999e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.224023  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2758  histidine kinase  43.05 
 
 		 389 aa  134  1.9999999999999998e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00845914  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07210  histidine kinase  44.04 
 
 		 237 aa  130  4.0000000000000003e-29  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0262  putative signal transduction histidine kinase  38.13 
 
 		 465 aa  130  5.0000000000000004e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.186103 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0967  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.28 
 
 		 408 aa  128  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.849709 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4021  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.3 
 
 		 411 aa  126  7e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0185539  normal  0.088504 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0424  histidine kinase  41.36 
 
 		 438 aa  124  3e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.680525  hitchhiker  0.00719111 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0354  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.79 
 
 		 438 aa  124  3e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5907  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.79 
 
 		 408 aa  122  9.999999999999999e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.155683  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2540  putative signal transduction histidine kinase  41.67 
 
 		 570 aa  122  9.999999999999999e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4688  histidine kinase  34.64 
 
 		 419 aa  121  1.9999999999999998e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0811  histidine kinase  38.89 
 
 		 580 aa  119  7e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35880  signal transduction histidine kinase  45.58 
 
 		 454 aa  118  1.9999999999999998e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.263807 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0319  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  38.93 
 
 		 382 aa  117  3.9999999999999997e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.499307  normal  0.099987 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0085  putative signal transduction histidine kinase  42.08 
 
 		 587 aa  117  3.9999999999999997e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11900  signal transduction histidine kinase  40.64 
 
 		 447 aa  117  3.9999999999999997e-25  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1916  histidine kinase  38.4 
 
 		 410 aa  117  3.9999999999999997e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0971  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.55 
 
 		 417 aa  116  5e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3104  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  44.81 
 
 		 459 aa  113  6e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.8316  hitchhiker  0.000380562 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2071  multi-sensor signal transduction histidine kinase  41.71 
 
 		 725 aa  110  3e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.249392  normal  0.37167 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3330  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.89 
 
 		 398 aa  110  4.0000000000000004e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0149067  normal  0.138525 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2642  histidine kinase  40.93 
 
 		 426 aa  109  6e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.992033  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3049  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.35 
 
 		 565 aa  109  9.000000000000001e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0199075  normal  0.598323 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1993  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.86 
 
 		 422 aa  108  1e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0153  histidine kinase  33.78 
 
 		 325 aa  100  4e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7224  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.62 
 
 		 594 aa  98.6  2e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5166  putative signal transduction histidine kinase  39.61 
 
 		 537 aa  96.7  5e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.153671  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2388  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.89 
 
 		 618 aa  95.5  1e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.227088  decreased coverage  0.00155525 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3834  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.75 
 
 		 709 aa  94.4  3e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.154622  normal  0.0585187 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0674  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.55 
 
 		 447 aa  93.6  5e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.504244  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3391  histidine kinase  32.2 
 
 		 356 aa  93.2  7e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.382044  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0814  signal transduction histidine kinase, glucose-6-phosphate specific  27.33 
 
 		 466 aa  91.3  2e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000114737  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6491  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.18 
 
 		 576 aa  91.3  2e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.194722  normal  0.40327 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2444  histidine kinase  37.23 
 
 		 425 aa  90.9  3e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000824837  normal  0.0922124 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6031  Histidine kinase  35.57 
 
 		 338 aa  90.9  3e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.542402  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2641  histidine kinase  35.12 
 
 		 453 aa  90.9  3e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0175588  hitchhiker  0.00721729 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_935  sensor histidine kinase  30.61 
 
 		 1226 aa  90.5  5e-17  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2634  histidine kinase  33.8 
 
 		 343 aa  90.1  6e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000175326  hitchhiker  0.00557176 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1316  sensor histidine protein kinase  28.51 
 
 		 525 aa  89.7  7e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.176896  normal  0.0650582 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1744  putative signal transduction histidine kinase  36.87 
 
 		 723 aa  88.2  2e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.0103404 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3669  histidine kinase  33.21 
 
 		 489 aa  88.2  2e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1652  histidine kinase  36.28 
 
 		 373 aa  87.4  3e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000168648  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1296  GAF sensor signal transduction histidine kinase  38.61 
 
 		 386 aa  87.8  3e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.99492 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>