More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_0204 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_0204  histidine kinase  100 
 
 		 446 aa  888    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1360  histidine kinase  44.39 
 
 		 476 aa  283  5.000000000000001e-75  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.388977 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09220  signal transduction histidine kinase  41.63 
 
 		 492 aa  279  6e-74  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.253701 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2525  histidine kinase  43.55 
 
 		 434 aa  272  8.000000000000001e-72  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0362104  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0609  histidine kinase  43.74 
 
 		 442 aa  265  2e-69  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.54142 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3934  histidine kinase  40.38 
 
 		 442 aa  245  9.999999999999999e-64  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0262  putative signal transduction histidine kinase  37.67 
 
 		 465 aa  238  2e-61  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.186103 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0386  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.13 
 
 		 418 aa  233  7.000000000000001e-60  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.482475 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0949  histidine kinase  38.3 
 
 		 416 aa  216  9e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4728  histidine kinase  37.74 
 
 		 429 aa  208  2e-52  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0199  histidine kinase  40.7 
 
 		 452 aa  200  5e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5647  histidine kinase  36.47 
 
 		 433 aa  197  4.0000000000000005e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.559873  normal  0.146404 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4415  Signal transduction histidine kinase-like protein  37.77 
 
 		 386 aa  187  3e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0384972 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2507  Signal transduction histidine kinase-like protein  35.35 
 
 		 405 aa  183  6e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.401085  normal  0.727575 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6198  Signal transduction histidine kinase-like protein  35.53 
 
 		 415 aa  181  2.9999999999999997e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.129005  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1961  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.32 
 
 		 444 aa  179  1e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  unclonable  0.000000367534  hitchhiker  0.000000631341 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3907  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.55 
 
 		 428 aa  178  2e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1255  histidine kinase  33.55 
 
 		 463 aa  175  9.999999999999999e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0635  histidine kinase  35.58 
 
 		 430 aa  174  2.9999999999999996e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.181904 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1652  Histidine kinase  36.56 
 
 		 439 aa  172  7.999999999999999e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.527879  normal  0.680022 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2700  histidine kinase  42.74 
 
 		 429 aa  170  6e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000000394923  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0308  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  44.49 
 
 		 405 aa  167  4e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.130128 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2757  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  37 
 
 		 433 aa  167  4e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.128423  normal  0.0502627 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0424  histidine kinase  33.26 
 
 		 438 aa  167  4e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.680525  hitchhiker  0.00719111 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3546  histidine kinase  44.1 
 
 		 489 aa  166  8e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.871685 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2301  Histidine kinase  38.19 
 
 		 412 aa  164  3e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3200  Signal transduction histidine kinase-like protein  44.91 
 
 		 395 aa  161  2e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9331  Signal transduction histidine kinase-like protein  43.15 
 
 		 508 aa  161  3e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.542521 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4660  histidine kinase  47.37 
 
 		 402 aa  160  4e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3763  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  43.13 
 
 		 375 aa  160  5e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.200679  normal  0.834979 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2927  histidine kinase  34.52 
 
 		 383 aa  159  7e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000936268  hitchhiker  0.0000101948 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4456  histidine kinase  34.98 
 
 		 410 aa  159  8e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6138  Signal transduction histidine kinase-like protein  43.17 
 
 		 403 aa  158  2e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.278868  normal  0.229544 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2132  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.34 
 
 		 433 aa  157  3e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.569038  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4726  histidine kinase  35.15 
 
 		 405 aa  156  8e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2249  histidine kinase  35.53 
 
 		 420 aa  155  1e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.795375  normal  0.159293 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0354  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.1 
 
 		 438 aa  154  4e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3908  putative signal transduction histidine kinase  41.37 
 
 		 435 aa  153  7e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3982  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.37 
 
 		 435 aa  153  7e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.335335  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3923  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.37 
 
 		 435 aa  153  7e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.534106  normal  0.212662 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2340  histidine kinase  38.82 
 
 		 388 aa  153  7e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3867  histidine kinase  44.62 
 
 		 434 aa  152  1e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.265271  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0329  signal transduction histidine kinase  39.84 
 
 		 435 aa  152  1e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.982298  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4050  Histidine kinase  44.73 
 
 		 374 aa  152  1e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.313821  hitchhiker  0.00550271 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2433  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.93 
 
 		 461 aa  151  2e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.189775  normal  0.142881 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4385  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.04 
 
 		 445 aa  151  2e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12660  signal transduction histidine kinase  46.44 
 
 		 444 aa  151  2e-35  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.224023  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4606  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  45.05 
 
 		 417 aa  150  3e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0890367  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3330  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.71 
 
 		 398 aa  150  5e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0149067  normal  0.138525 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2298  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  45.42 
 
 		 432 aa  149  8e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.317439  normal  0.783172 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3491  putative signal transduction histidine kinase  43.6 
 
 		 624 aa  145  2e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2281  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.22 
 
 		 445 aa  144  2e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.67096  normal  0.255683 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0971  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.11 
 
 		 417 aa  143  5e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0531  histidine kinase  46.92 
 
 		 429 aa  143  8e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.005431  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3916  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  48.47 
 
 		 431 aa  142  9.999999999999999e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.257994  normal  0.0672811 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3718  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  43.64 
 
 		 586 aa  140  3.9999999999999997e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.118329  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4333  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.53 
 
 		 343 aa  140  4.999999999999999e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0375931  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1916  histidine kinase  33.64 
 
 		 410 aa  140  4.999999999999999e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0211  histidine kinase  32.22 
 
 		 463 aa  140  6e-32  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2091  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.11 
 
 		 466 aa  138  2e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6699  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  45.16 
 
 		 621 aa  137  3.0000000000000003e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8723  Histidine kinase  43.33 
 
 		 365 aa  136  8e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17590  signal transduction histidine kinase  43.32 
 
 		 326 aa  135  1.9999999999999998e-30  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0109488  normal  0.353356 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4688  histidine kinase  32.96 
 
 		 419 aa  133  6.999999999999999e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3104  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.41 
 
 		 459 aa  125  2e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.8316  hitchhiker  0.000380562 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11900  signal transduction histidine kinase  31.31 
 
 		 447 aa  125  2e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0319  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  40.17 
 
 		 382 aa  123  6e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.499307  normal  0.099987 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3516  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.01 
 
 		 388 aa  122  9e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.370817  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4021  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.03 
 
 		 411 aa  121  3e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0185539  normal  0.088504 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07210  histidine kinase  40 
 
 		 237 aa  120  6e-26  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35880  signal transduction histidine kinase  31.75 
 
 		 454 aa  119  7.999999999999999e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.263807 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0967  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.21 
 
 		 408 aa  116  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.849709 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5907  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.36 
 
 		 408 aa  115  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.155683  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2758  histidine kinase  42.13 
 
 		 389 aa  113  7.000000000000001e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00845914  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2642  histidine kinase  33.42 
 
 		 426 aa  111  3e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.992033  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0085  putative signal transduction histidine kinase  39.53 
 
 		 587 aa  110  5e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1993  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.33 
 
 		 422 aa  108  3e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2071  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.57 
 
 		 725 aa  105  1e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.249392  normal  0.37167 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2540  putative signal transduction histidine kinase  39.07 
 
 		 570 aa  105  2e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7224  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.09 
 
 		 594 aa  101  2e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3049  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.18 
 
 		 565 aa  99  2e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0199075  normal  0.598323 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6491  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.16 
 
 		 576 aa  97.4  4e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.194722  normal  0.40327 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5166  putative signal transduction histidine kinase  37.61 
 
 		 537 aa  90.1  7e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.153671  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0811  histidine kinase  35.58 
 
 		 580 aa  89  2e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0248  putative signal transduction histidine kinase  32.73 
 
 		 470 aa  85.9  0.000000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1560  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.82 
 
 		 569 aa  83.6  0.000000000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0554  Histidine kinase  34.9 
 
 		 687 aa  82.8  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.158949  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1464  putative signal transduction histidine kinase  48.91 
 
 		 486 aa  79.7  0.0000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4277  histidine kinase  31.03 
 
 		 659 aa  79.7  0.0000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.186124 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0560  histidine kinase  30.91 
 
 		 670 aa  79.7  0.0000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.618015  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4905  ATPase domain-containing protein  32.67 
 
 		 496 aa  78.6  0.0000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.92947  normal  0.728538 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1238  histidine kinase  28.46 
 
 		 377 aa  77.8  0.0000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0477765  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0257  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.46 
 
 		 404 aa  77  0.0000000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.5208 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7687  Signal transduction histidine kinase-like protein  37.06 
 
 		 587 aa  77  0.0000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1215  PAS  32.86 
 
 		 515 aa  75.9  0.000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0153  histidine kinase  29.17 
 
 		 325 aa  75.9  0.000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6031  Histidine kinase  34.16 
 
 		 338 aa  75.5  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.542402  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2027  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  28.33 
 
 		 401 aa  74.7  0.000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.109719  normal  0.72788 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0814  signal transduction histidine kinase, glucose-6-phosphate specific  29.52 
 
 		 466 aa  74.7  0.000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000114737  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1744  putative signal transduction histidine kinase  33.04 
 
 		 723 aa  74.3  0.000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.0103404 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>