More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_0971 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_0971  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 417 aa  831    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6138  Signal transduction histidine kinase-like protein  36.41 
 
 		 403 aa  186  8e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.278868  normal  0.229544 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2433  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.98 
 
 		 461 aa  172  1e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.189775  normal  0.142881 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3200  Signal transduction histidine kinase-like protein  34.48 
 
 		 395 aa  169  8e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4606  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.29 
 
 		 417 aa  166  8e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0890367  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0967  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.96 
 
 		 408 aa  163  6e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.849709 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0531  histidine kinase  40.97 
 
 		 429 aa  157  2e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.005431  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3934  histidine kinase  30.75 
 
 		 442 aa  149  8e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3867  histidine kinase  38.01 
 
 		 434 aa  147  3e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.265271  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4660  histidine kinase  34.93 
 
 		 402 aa  147  3e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0949  histidine kinase  42.04 
 
 		 416 aa  147  4.0000000000000006e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1255  histidine kinase  33.68 
 
 		 463 aa  145  1e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1961  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.8 
 
 		 444 aa  142  9.999999999999999e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  unclonable  0.000000367534  hitchhiker  0.000000631341 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0308  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.27 
 
 		 405 aa  142  9.999999999999999e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.130128 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0199  histidine kinase  34.3 
 
 		 452 aa  142  9.999999999999999e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2507  Signal transduction histidine kinase-like protein  42.67 
 
 		 405 aa  141  1.9999999999999998e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.401085  normal  0.727575 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2301  Histidine kinase  37.22 
 
 		 412 aa  140  3e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0386  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.46 
 
 		 418 aa  140  4.999999999999999e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.482475 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5907  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.93 
 
 		 408 aa  140  4.999999999999999e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.155683  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2700  histidine kinase  34.75 
 
 		 429 aa  140  6e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000000394923  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4456  histidine kinase  30.83 
 
 		 410 aa  136  5e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2132  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.17 
 
 		 433 aa  136  8e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.569038  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4728  histidine kinase  32.77 
 
 		 429 aa  136  8e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3907  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.77 
 
 		 428 aa  136  8e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0635  histidine kinase  37.35 
 
 		 430 aa  133  5e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.181904 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2091  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.74 
 
 		 466 aa  133  5e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4415  Signal transduction histidine kinase-like protein  31.91 
 
 		 386 aa  132  1.0000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0384972 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3718  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.72 
 
 		 586 aa  131  2.0000000000000002e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.118329  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2927  histidine kinase  30.63 
 
 		 383 aa  130  4.0000000000000003e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000936268  hitchhiker  0.0000101948 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07210  histidine kinase  39.81 
 
 		 237 aa  130  6e-29  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2525  histidine kinase  38.37 
 
 		 434 aa  129  1.0000000000000001e-28  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0362104  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0609  histidine kinase  32.29 
 
 		 442 aa  129  1.0000000000000001e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.54142 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2340  histidine kinase  33.88 
 
 		 388 aa  128  2.0000000000000002e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2249  histidine kinase  31.52 
 
 		 420 aa  127  4.0000000000000003e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.795375  normal  0.159293 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4726  histidine kinase  31.59 
 
 		 405 aa  126  7e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3491  putative signal transduction histidine kinase  38.89 
 
 		 624 aa  126  8.000000000000001e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3908  putative signal transduction histidine kinase  36.71 
 
 		 435 aa  125  1e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3982  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.71 
 
 		 435 aa  125  1e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.335335  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5647  histidine kinase  31.78 
 
 		 433 aa  125  1e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.559873  normal  0.146404 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3923  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.71 
 
 		 435 aa  125  1e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.534106  normal  0.212662 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4333  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.67 
 
 		 343 aa  124  2e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0375931  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0329  signal transduction histidine kinase  36.05 
 
 		 435 aa  124  3e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.982298  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3763  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.35 
 
 		 375 aa  124  4e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.200679  normal  0.834979 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09220  signal transduction histidine kinase  36.68 
 
 		 492 aa  123  5e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.253701 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0354  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.04 
 
 		 438 aa  123  5e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12660  signal transduction histidine kinase  34.15 
 
 		 444 aa  123  5e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.224023  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3546  histidine kinase  40.27 
 
 		 489 aa  122  8e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.871685 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0424  histidine kinase  34.4 
 
 		 438 aa  122  9e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.680525  hitchhiker  0.00719111 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17590  signal transduction histidine kinase  31.17 
 
 		 326 aa  122  9.999999999999999e-27  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0109488  normal  0.353356 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2281  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.44 
 
 		 445 aa  122  9.999999999999999e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.67096  normal  0.255683 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1360  histidine kinase  39.15 
 
 		 476 aa  122  1.9999999999999998e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.388977 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1652  Histidine kinase  33.01 
 
 		 439 aa  121  1.9999999999999998e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.527879  normal  0.680022 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0204  histidine kinase  31.11 
 
 		 446 aa  121  1.9999999999999998e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2757  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  37.14 
 
 		 433 aa  120  6e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.128423  normal  0.0502627 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4385  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.56 
 
 		 445 aa  119  7.999999999999999e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2298  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.08 
 
 		 432 aa  119  9e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.317439  normal  0.783172 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6198  Signal transduction histidine kinase-like protein  30.41 
 
 		 415 aa  116  6e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.129005  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6699  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.71 
 
 		 621 aa  115  2.0000000000000002e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0085  putative signal transduction histidine kinase  40.1 
 
 		 587 aa  115  2.0000000000000002e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0319  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.76 
 
 		 382 aa  113  5e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.499307  normal  0.099987 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3516  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.22 
 
 		 388 aa  111  2.0000000000000002e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.370817  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2540  putative signal transduction histidine kinase  36.92 
 
 		 570 aa  111  2.0000000000000002e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9331  Signal transduction histidine kinase-like protein  38.92 
 
 		 508 aa  108  1e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.542521 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2642  histidine kinase  30.08 
 
 		 426 aa  107  5e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.992033  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0211  histidine kinase  37.56 
 
 		 463 aa  105  1e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7224  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.12 
 
 		 594 aa  104  3e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0811  histidine kinase  37.56 
 
 		 580 aa  103  4e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1916  histidine kinase  30.37 
 
 		 410 aa  102  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0262  putative signal transduction histidine kinase  30.62 
 
 		 465 aa  101  2e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.186103 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0248  putative signal transduction histidine kinase  36.24 
 
 		 470 aa  100  5e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4050  Histidine kinase  38.74 
 
 		 374 aa  100  5e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.313821  hitchhiker  0.00550271 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2071  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.04 
 
 		 725 aa  99.8  9e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.249392  normal  0.37167 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3916  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.43 
 
 		 431 aa  98.2  2e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.257994  normal  0.0672811 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8723  Histidine kinase  35.48 
 
 		 365 aa  98.6  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4021  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.34 
 
 		 411 aa  98.2  2e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0185539  normal  0.088504 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2641  histidine kinase  33.06 
 
 		 453 aa  97.8  3e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0175588  hitchhiker  0.00721729 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0257  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.98 
 
 		 404 aa  97.8  3e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.5208 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11900  signal transduction histidine kinase  35.71 
 
 		 447 aa  97.8  3e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2758  histidine kinase  38.26 
 
 		 389 aa  97.4  4e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00845914  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1082  GAF sensor signal transduction histidine kinase  31.56 
 
 		 401 aa  95.9  1e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1055  putative signal transduction histidine kinase  31.82 
 
 		 401 aa  95.1  2e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.64157  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1071  GAF sensor signal transduction histidine kinase  31.82 
 
 		 401 aa  95.1  2e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0809665 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4898  ATPase domain-containing protein  32.8 
 
 		 491 aa  93.6  6e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.246184  normal  0.165682 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5166  putative signal transduction histidine kinase  34.17 
 
 		 537 aa  91.3  3e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.153671  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1993  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.7 
 
 		 422 aa  91.3  3e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3104  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.58 
 
 		 459 aa  90.5  4e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.8316  hitchhiker  0.000380562 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2634  histidine kinase  35.81 
 
 		 343 aa  90.9  4e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000175326  hitchhiker  0.00557176 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6031  Histidine kinase  37.19 
 
 		 338 aa  89.7  9e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.542402  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3049  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.9 
 
 		 565 aa  87.8  3e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0199075  normal  0.598323 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4688  histidine kinase  34.94 
 
 		 419 aa  87.8  3e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3162  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.57 
 
 		 381 aa  86.7  6e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.541775  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2942  ATPase domain-containing protein  34.16 
 
 		 485 aa  87  6e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1357  GAF sensor signal transduction histidine kinase  31.48 
 
 		 403 aa  85.9  0.000000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.246673  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1652  histidine kinase  33.73 
 
 		 373 aa  86.3  0.000000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000168648  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3408  histidine kinase  38.5 
 
 		 686 aa  85.5  0.000000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000158036  hitchhiker  0.000062789 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0674  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.27 
 
 		 447 aa  85.1  0.000000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.504244  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1193  histidine kinase  34.31 
 
 		 497 aa  85.1  0.000000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0280854  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0153  histidine kinase  33.48 
 
 		 325 aa  84.3  0.000000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1296  GAF sensor signal transduction histidine kinase  36.82 
 
 		 386 aa  83.2  0.000000000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.99492 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5015  GAF sensor signal transduction histidine kinase  29.6 
 
 		 399 aa  82.4  0.00000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.36327  normal  0.324397 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>