More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_2132 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_2132  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 433 aa  817    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.569038  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8723  Histidine kinase  57.14 
 
 		 365 aa  253  6e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4050  Histidine kinase  59.5 
 
 		 374 aa  238  1e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.313821  hitchhiker  0.00550271 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2340  histidine kinase  43.16 
 
 		 388 aa  237  3e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3516  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  48.22 
 
 		 388 aa  207  3e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.370817  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1255  histidine kinase  40.27 
 
 		 463 aa  179  9e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0199  histidine kinase  44.74 
 
 		 452 aa  177  3e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0308  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  47.69 
 
 		 405 aa  171  2e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.130128 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4728  histidine kinase  35.2 
 
 		 429 aa  168  1e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3200  Signal transduction histidine kinase-like protein  43.78 
 
 		 395 aa  167  4e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0949  histidine kinase  43.69 
 
 		 416 aa  166  1.0000000000000001e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4660  histidine kinase  47.25 
 
 		 402 aa  161  2e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2433  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  44.05 
 
 		 461 aa  160  4e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.189775  normal  0.142881 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0329  signal transduction histidine kinase  44.98 
 
 		 435 aa  160  5e-38  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.982298  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0386  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.7 
 
 		 418 aa  159  1e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.482475 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1360  histidine kinase  47.23 
 
 		 476 aa  159  1e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.388977 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4415  Signal transduction histidine kinase-like protein  40.07 
 
 		 386 aa  157  2e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0384972 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3491  putative signal transduction histidine kinase  46.35 
 
 		 624 aa  158  2e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3908  putative signal transduction histidine kinase  42.62 
 
 		 435 aa  157  4e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3982  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.62 
 
 		 435 aa  157  4e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.335335  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3934  histidine kinase  38.08 
 
 		 442 aa  157  4e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3923  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.62 
 
 		 435 aa  157  4e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.534106  normal  0.212662 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3867  histidine kinase  44.31 
 
 		 434 aa  156  6e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.265271  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2507  Signal transduction histidine kinase-like protein  40.23 
 
 		 405 aa  154  2.9999999999999998e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.401085  normal  0.727575 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2525  histidine kinase  46.41 
 
 		 434 aa  152  2e-35  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0362104  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4385  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.8 
 
 		 445 aa  151  3e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3718  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  47.25 
 
 		 586 aa  150  3e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.118329  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2757  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  41.34 
 
 		 433 aa  150  4e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.128423  normal  0.0502627 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2091  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  43.16 
 
 		 466 aa  150  4e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4606  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  43.72 
 
 		 417 aa  149  8e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0890367  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1961  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.9 
 
 		 444 aa  147  2.0000000000000003e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  unclonable  0.000000367534  hitchhiker  0.000000631341 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6138  Signal transduction histidine kinase-like protein  42.15 
 
 		 403 aa  148  2.0000000000000003e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.278868  normal  0.229544 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0967  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.12 
 
 		 408 aa  147  3e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.849709 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0531  histidine kinase  47.64 
 
 		 429 aa  147  4.0000000000000006e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.005431  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2927  histidine kinase  41.04 
 
 		 383 aa  147  4.0000000000000006e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000936268  hitchhiker  0.0000101948 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2301  Histidine kinase  44.74 
 
 		 412 aa  146  6e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3763  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.75 
 
 		 375 aa  146  7.0000000000000006e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.200679  normal  0.834979 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3907  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.79 
 
 		 428 aa  145  1e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09220  signal transduction histidine kinase  43.88 
 
 		 492 aa  145  2e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.253701 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4726  histidine kinase  43.7 
 
 		 405 aa  144  2e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5647  histidine kinase  37.45 
 
 		 433 aa  144  3e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.559873  normal  0.146404 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6198  Signal transduction histidine kinase-like protein  42.52 
 
 		 415 aa  144  3e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.129005  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5907  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.93 
 
 		 408 aa  144  5e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.155683  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2281  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.56 
 
 		 445 aa  143  5e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.67096  normal  0.255683 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12660  signal transduction histidine kinase  45.34 
 
 		 444 aa  142  9.999999999999999e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.224023  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4333  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.9 
 
 		 343 aa  140  3.9999999999999997e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0375931  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2298  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40 
 
 		 432 aa  140  4.999999999999999e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.317439  normal  0.783172 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3546  histidine kinase  42.34 
 
 		 489 aa  140  6e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.871685 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07210  histidine kinase  45.74 
 
 		 237 aa  139  7e-32  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2249  histidine kinase  39.41 
 
 		 420 aa  138  2e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.795375  normal  0.159293 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0635  histidine kinase  42.67 
 
 		 430 aa  137  3.0000000000000003e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.181904 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2700  histidine kinase  37.27 
 
 		 429 aa  137  4e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000000394923  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0971  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.17 
 
 		 417 aa  136  6.0000000000000005e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0204  histidine kinase  40.73 
 
 		 446 aa  136  7.000000000000001e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17590  signal transduction histidine kinase  39.08 
 
 		 326 aa  134  3.9999999999999996e-30  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0109488  normal  0.353356 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6699  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  45.5 
 
 		 621 aa  132  2.0000000000000002e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4456  histidine kinase  42.67 
 
 		 410 aa  128  2.0000000000000002e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1652  Histidine kinase  46.39 
 
 		 439 aa  128  3e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.527879  normal  0.680022 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0211  histidine kinase  46.45 
 
 		 463 aa  124  3e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0609  histidine kinase  39.43 
 
 		 442 aa  124  3e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.54142 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9331  Signal transduction histidine kinase-like protein  38.99 
 
 		 508 aa  122  9.999999999999999e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.542521 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0354  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.35 
 
 		 438 aa  121  3e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1993  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.71 
 
 		 422 aa  120  3e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0424  histidine kinase  37.74 
 
 		 438 aa  119  9.999999999999999e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.680525  hitchhiker  0.00719111 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2758  histidine kinase  40.18 
 
 		 389 aa  117  5e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00845914  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35880  signal transduction histidine kinase  42.98 
 
 		 454 aa  115  1.0000000000000001e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.263807 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0319  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  39.3 
 
 		 382 aa  115  1.0000000000000001e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.499307  normal  0.099987 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2641  histidine kinase  36.82 
 
 		 453 aa  115  1.0000000000000001e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0175588  hitchhiker  0.00721729 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2540  putative signal transduction histidine kinase  41.26 
 
 		 570 aa  112  2.0000000000000002e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1916  histidine kinase  37.89 
 
 		 410 aa  110  4.0000000000000004e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2642  histidine kinase  40.56 
 
 		 426 aa  110  5e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.992033  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0262  putative signal transduction histidine kinase  36.25 
 
 		 465 aa  110  6e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.186103 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3330  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.65 
 
 		 398 aa  110  6e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0149067  normal  0.138525 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0811  histidine kinase  41.45 
 
 		 580 aa  110  7.000000000000001e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0085  putative signal transduction histidine kinase  42.31 
 
 		 587 aa  107  4e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4021  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.96 
 
 		 411 aa  106  9e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0185539  normal  0.088504 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3104  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.67 
 
 		 459 aa  105  1e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.8316  hitchhiker  0.000380562 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3916  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  43.72 
 
 		 431 aa  105  2e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.257994  normal  0.0672811 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2071  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.48 
 
 		 725 aa  103  5e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.249392  normal  0.37167 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1296  GAF sensor signal transduction histidine kinase  41.35 
 
 		 386 aa  102  1e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.99492 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6491  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.91 
 
 		 576 aa  99.8  9e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.194722  normal  0.40327 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3049  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.91 
 
 		 565 aa  99  1e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0199075  normal  0.598323 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06640  histidine kinase  32.85 
 
 		 404 aa  98.6  2e-19  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.106239  normal  0.143286 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4688  histidine kinase  32.69 
 
 		 419 aa  98.2  3e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0153  histidine kinase  35.27 
 
 		 325 aa  96.7  7e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1913  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.72 
 
 		 700 aa  94  5e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.6571 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0927  Histidine kinase  36.04 
 
 		 407 aa  93.6  6e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.163259  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11900  signal transduction histidine kinase  38.71 
 
 		 447 aa  93.6  7e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1744  putative signal transduction histidine kinase  36.11 
 
 		 723 aa  92.8  1e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.0103404 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1744  histidine kinase  34.54 
 
 		 399 aa  91.7  2e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.376505  normal  0.0197179 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2634  histidine kinase  36.98 
 
 		 343 aa  91.7  2e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000175326  hitchhiker  0.00557176 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1092  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.02 
 
 		 493 aa  91.7  2e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.614695 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0895  sensor histidine kinase  28.35 
 
 		 451 aa  91.3  3e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.622783  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0456  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.54 
 
 		 775 aa  91.3  3e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00143274 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0248  putative signal transduction histidine kinase  36.28 
 
 		 470 aa  90.9  4e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7224  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.71 
 
 		 594 aa  90.5  5e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1215  PAS  33.19 
 
 		 515 aa  90.1  7e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1261  sensor histidine kinase  27.62 
 
 		 467 aa  89.7  8e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.405254  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3325  histidine kinase  38.57 
 
 		 696 aa  89.7  8e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.868866  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0649  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.7 
 
 		 490 aa  89.4  1e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>