More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_2700 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_2700  histidine kinase  100 
 
 		 429 aa  841    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000000394923  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2757  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  51.91 
 
 		 433 aa  371  1e-101  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.128423  normal  0.0502627 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4728  histidine kinase  46.47 
 
 		 429 aa  312  5.999999999999999e-84  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0635  histidine kinase  48.49 
 
 		 430 aa  289  8e-77  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.181904 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5647  histidine kinase  42.62 
 
 		 433 aa  281  2e-74  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.559873  normal  0.146404 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3546  histidine kinase  43.26 
 
 		 489 aa  261  1e-68  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.871685 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1961  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.94 
 
 		 444 aa  261  2e-68  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  unclonable  0.000000367534  hitchhiker  0.000000631341 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2507  Signal transduction histidine kinase-like protein  43.34 
 
 		 405 aa  256  5e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.401085  normal  0.727575 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9331  Signal transduction histidine kinase-like protein  49.23 
 
 		 508 aa  253  6e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.542521 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1916  histidine kinase  42.89 
 
 		 410 aa  241  2.9999999999999997e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4456  histidine kinase  39.13 
 
 		 410 aa  226  7e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2927  histidine kinase  40.96 
 
 		 383 aa  221  1.9999999999999999e-56  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000936268  hitchhiker  0.0000101948 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3934  histidine kinase  38.65 
 
 		 442 aa  218  2e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2249  histidine kinase  38.87 
 
 		 420 aa  204  2e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.795375  normal  0.159293 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3907  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.14 
 
 		 428 aa  202  8e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4726  histidine kinase  38.57 
 
 		 405 aa  201  3e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4415  Signal transduction histidine kinase-like protein  40.91 
 
 		 386 aa  198  1.0000000000000001e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0384972 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0308  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  48.89 
 
 		 405 aa  196  5.000000000000001e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.130128 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0199  histidine kinase  39.02 
 
 		 452 aa  196  7e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4333  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  48.64 
 
 		 343 aa  188  1e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0375931  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3718  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  49.05 
 
 		 586 aa  186  5e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.118329  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0949  histidine kinase  47.6 
 
 		 416 aa  186  6e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1255  histidine kinase  36.1 
 
 		 463 aa  186  6e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3763  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  48.7 
 
 		 375 aa  185  1.0000000000000001e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.200679  normal  0.834979 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3200  Signal transduction histidine kinase-like protein  36.04 
 
 		 395 aa  184  3e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2758  histidine kinase  48.29 
 
 		 389 aa  178  2e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00845914  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0386  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  45.5 
 
 		 418 aa  178  2e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.482475 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3867  histidine kinase  38.68 
 
 		 434 aa  178  2e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.265271  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6138  Signal transduction histidine kinase-like protein  48.39 
 
 		 403 aa  177  3e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.278868  normal  0.229544 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3923  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  44.68 
 
 		 435 aa  176  5e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.534106  normal  0.212662 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4606  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  48.57 
 
 		 417 aa  176  5e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0890367  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3908  putative signal transduction histidine kinase  44.68 
 
 		 435 aa  176  7e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3982  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  44.68 
 
 		 435 aa  176  7e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.335335  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2301  Histidine kinase  46.38 
 
 		 412 aa  174  1.9999999999999998e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4385  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.86 
 
 		 445 aa  174  3.9999999999999995e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2525  histidine kinase  35.49 
 
 		 434 aa  171  3e-41  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0362104  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0262  putative signal transduction histidine kinase  36.13 
 
 		 465 aa  171  3e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.186103 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2281  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  44.4 
 
 		 445 aa  171  3e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.67096  normal  0.255683 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0609  histidine kinase  46.79 
 
 		 442 aa  167  2.9999999999999998e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.54142 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4688  histidine kinase  37.76 
 
 		 419 aa  167  2.9999999999999998e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2340  histidine kinase  44.84 
 
 		 388 aa  166  5e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6198  Signal transduction histidine kinase-like protein  35.99 
 
 		 415 aa  165  1.0000000000000001e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.129005  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1360  histidine kinase  44.73 
 
 		 476 aa  165  2.0000000000000002e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.388977 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2298  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.4 
 
 		 432 aa  161  2e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.317439  normal  0.783172 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0354  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.83 
 
 		 438 aa  160  3e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1652  Histidine kinase  36.68 
 
 		 439 aa  159  7e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.527879  normal  0.680022 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09220  signal transduction histidine kinase  44.49 
 
 		 492 aa  157  3e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.253701 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2433  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.66 
 
 		 461 aa  156  7e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.189775  normal  0.142881 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1993  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.5 
 
 		 422 aa  155  1e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0424  histidine kinase  33.92 
 
 		 438 aa  154  2.9999999999999998e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.680525  hitchhiker  0.00719111 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2642  histidine kinase  37.28 
 
 		 426 aa  153  5.9999999999999996e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.992033  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4660  histidine kinase  44.44 
 
 		 402 aa  153  7e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0204  histidine kinase  33.8 
 
 		 446 aa  151  3e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0531  histidine kinase  43.85 
 
 		 429 aa  148  1.0000000000000001e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.005431  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4021  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  46.29 
 
 		 411 aa  148  2.0000000000000003e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0185539  normal  0.088504 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2091  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.4 
 
 		 466 aa  147  5e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0329  signal transduction histidine kinase  38.91 
 
 		 435 aa  147  5e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.982298  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0211  histidine kinase  45.83 
 
 		 463 aa  147  5e-34  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17590  signal transduction histidine kinase  41.67 
 
 		 326 aa  145  2e-33  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0109488  normal  0.353356 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3491  putative signal transduction histidine kinase  43.87 
 
 		 624 aa  145  2e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3104  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.46 
 
 		 459 aa  142  9.999999999999999e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.8316  hitchhiker  0.000380562 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0971  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.75 
 
 		 417 aa  140  4.999999999999999e-32  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3330  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  44.83 
 
 		 398 aa  138  2e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0149067  normal  0.138525 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2132  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.89 
 
 		 433 aa  136  8e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.569038  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11900  signal transduction histidine kinase  36.91 
 
 		 447 aa  135  9.999999999999999e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12660  signal transduction histidine kinase  42.29 
 
 		 444 aa  134  3e-30  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.224023  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6699  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.1 
 
 		 621 aa  134  5e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0967  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.1 
 
 		 408 aa  132  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.849709 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4050  Histidine kinase  41.74 
 
 		 374 aa  130  6e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.313821  hitchhiker  0.00550271 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3516  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.05 
 
 		 388 aa  128  2.0000000000000002e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.370817  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0085  putative signal transduction histidine kinase  39.91 
 
 		 587 aa  127  5e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35880  signal transduction histidine kinase  43.87 
 
 		 454 aa  124  2e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.263807 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3916  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  45.74 
 
 		 431 aa  123  6e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.257994  normal  0.0672811 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2540  putative signal transduction histidine kinase  39.42 
 
 		 570 aa  123  7e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0811  histidine kinase  42.41 
 
 		 580 aa  121  1.9999999999999998e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7224  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.79 
 
 		 594 aa  120  6e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0319  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.1 
 
 		 382 aa  119  7.999999999999999e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.499307  normal  0.099987 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5907  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.74 
 
 		 408 aa  117  3e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.155683  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8723  Histidine kinase  37.01 
 
 		 365 aa  117  3.9999999999999997e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07210  histidine kinase  39.71 
 
 		 237 aa  115  1.0000000000000001e-24  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2071  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.19 
 
 		 725 aa  106  6e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.249392  normal  0.37167 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3408  histidine kinase  35.93 
 
 		 686 aa  100  5e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000158036  hitchhiker  0.000062789 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3049  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.19 
 
 		 565 aa  99.4  1e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0199075  normal  0.598323 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1261  sensor histidine kinase  27.97 
 
 		 467 aa  96.3  1e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.405254  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1405  sensor histidine kinase  32.57 
 
 		 483 aa  94  5e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0589016  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5166  putative signal transduction histidine kinase  39.61 
 
 		 537 aa  93.6  7e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.153671  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6491  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.79 
 
 		 576 aa  92  2e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.194722  normal  0.40327 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2736  histidine kinase  34.56 
 
 		 430 aa  90.1  7e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.554536  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0554  Histidine kinase  34.93 
 
 		 687 aa  89  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.158949  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3834  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.48 
 
 		 709 aa  88.2  2e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.154622  normal  0.0585187 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2291  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.73 
 
 		 464 aa  88.6  2e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2641  histidine kinase  31.63 
 
 		 453 aa  87  5e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0175588  hitchhiker  0.00721729 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1568  histidine kinase  31.86 
 
 		 462 aa  86.3  0.000000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0248  putative signal transduction histidine kinase  31.67 
 
 		 470 aa  86.3  0.000000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0906  sensor histidine kinase  28.63 
 
 		 469 aa  85.9  0.000000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0178022  hitchhiker  0.0000002134 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3280  histidine kinase  34.82 
 
 		 664 aa  85.5  0.000000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00155771  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1055  putative signal transduction histidine kinase  33.96 
 
 		 401 aa  85.1  0.000000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.64157  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1071  GAF sensor signal transduction histidine kinase  33.96 
 
 		 401 aa  85.1  0.000000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0809665 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1744  putative signal transduction histidine kinase  34.93 
 
 		 723 aa  85.5  0.000000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.0103404 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4898  ATPase domain-containing protein  34.57 
 
 		 491 aa  84.7  0.000000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.246184  normal  0.165682 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>