More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_1447 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_1447  Histidine kinase  100 
 
 		 691 aa  1326    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.705239  normal  0.184804 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1434  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.44 
 
 		 731 aa  287  4e-76  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.278277  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3280  histidine kinase  39.97 
 
 		 664 aa  283  7.000000000000001e-75  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00155771  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3834  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.24 
 
 		 709 aa  265  2e-69  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.154622  normal  0.0585187 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3330  Histidine kinase  39.5 
 
 		 653 aa  254  3e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.323144 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6579  Histidine kinase  35.75 
 
 		 689 aa  250  5e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.218867  normal  0.148163 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0554  Histidine kinase  37.42 
 
 		 687 aa  246  9.999999999999999e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.158949  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2605  Histidine kinase  38.1 
 
 		 650 aa  245  1.9999999999999999e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.209527  normal  0.327771 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2603  Histidine kinase  38.66 
 
 		 720 aa  234  3e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00739798  normal  0.140215 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0555  Signal transduction histidine kinase-like protein  44.03 
 
 		 461 aa  205  3e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.137266  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3408  histidine kinase  34.46 
 
 		 686 aa  202  3e-50  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000158036  hitchhiker  0.000062789 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3325  histidine kinase  34.26 
 
 		 696 aa  172  2e-41  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.868866  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1533  histidine kinase  43.06 
 
 		 451 aa  164  6e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0016197  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2189  histidine kinase  33.53 
 
 		 608 aa  157  4e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4581  hypothetical protein  35.92 
 
 		 663 aa  130  7.000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.267565 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01020  sensory box histidine kinase  36.19 
 
 		 710 aa  122  3e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0755055  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06146  sensory box histidine kinase  36.19 
 
 		 710 aa  122  3e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0682167  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33000  PAS domain S-box  35.71 
 
 		 547 aa  120  9.999999999999999e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.569309  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1706  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  38.69 
 
 		 564 aa  119  9.999999999999999e-26  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.98975  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0341  GAF sensor signal transduction histidine kinase  36.36 
 
 		 725 aa  118  3e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0143238  hitchhiker  0.0051816 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5015  GAF sensor signal transduction histidine kinase  37.55 
 
 		 399 aa  117  7.999999999999999e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.36327  normal  0.324397 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2445  hypothetical protein  29.67 
 
 		 685 aa  116  1.0000000000000001e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000212553  normal  0.0137307 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3064  GAF sensor signal transduction histidine kinase  32.97 
 
 		 544 aa  116  2.0000000000000002e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.980645 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2414  GAF sensor signal transduction histidine kinase  32.97 
 
 		 545 aa  115  2.0000000000000002e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1204  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.13 
 
 		 779 aa  115  3e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4226  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.39 
 
 		 682 aa  114  5e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.203059 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1108  GAF sensor signal transduction histidine kinase  30.14 
 
 		 464 aa  114  6e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1215  PAS  38.91 
 
 		 515 aa  112  2.0000000000000002e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1998  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.08 
 
 		 658 aa  112  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5374  histidine kinase  45.24 
 
 		 218 aa  112  2.0000000000000002e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1880  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.35 
 
 		 662 aa  112  3e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0862215  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4898  ATPase domain-containing protein  40.54 
 
 		 491 aa  112  3e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.246184  normal  0.165682 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0507  Histidine kinase  35.25 
 
 		 373 aa  111  4.0000000000000004e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1055  putative signal transduction histidine kinase  38.4 
 
 		 401 aa  111  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.64157  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1071  GAF sensor signal transduction histidine kinase  38.4 
 
 		 401 aa  111  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0809665 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1357  GAF sensor signal transduction histidine kinase  38.1 
 
 		 403 aa  111  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.246673  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1082  GAF sensor signal transduction histidine kinase  38.4 
 
 		 401 aa  111  5e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0153  histidine kinase  36.44 
 
 		 325 aa  110  9.000000000000001e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1965  histidine kinase  35.89 
 
 		 662 aa  110  1e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.632766  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1385  sensor histidine kinase  26.5 
 
 		 377 aa  109  2e-22  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00939681  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1913  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.02 
 
 		 700 aa  109  2e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.6571 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4157  histidine kinase  32.64 
 
 		 663 aa  108  3e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.921776  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21830  histidine kinase  29.11 
 
 		 391 aa  108  3e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00305219  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1345  histidine kinase  35.27 
 
 		 338 aa  108  4e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000383255 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3491  putative signal transduction histidine kinase  37.16 
 
 		 624 aa  108  4e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0227  GAF sensor signal transduction histidine kinase  37.45 
 
 		 421 aa  108  4e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0191  transmembrane two component system sensor kinase transcription regulator protein  39.41 
 
 		 458 aa  107  5e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0364977 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5329  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 595 aa  108  5e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2549  GAF sensor signal transduction histidine kinase  31.02 
 
 		 456 aa  107  7e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4560  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.97 
 
 		 462 aa  107  8e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.140942  normal  0.159095 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4427  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.97 
 
 		 462 aa  107  8e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0253  sensory box histidine kinase  35.78 
 
 		 830 aa  106  1e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2131  sensor histidine kinase  37.09 
 
 		 394 aa  107  1e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3498  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.02 
 
 		 596 aa  105  2e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00492042 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38430  PAS domain S-box  37.06 
 
 		 552 aa  106  2e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3775  GAF sensor signal transduction histidine kinase  30.28 
 
 		 548 aa  105  2e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0607  histidine kinase  36.03 
 
 		 413 aa  105  4e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2942  ATPase domain-containing protein  41.31 
 
 		 485 aa  104  4e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0602  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.2 
 
 		 584 aa  104  5e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.416305  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0284  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.01 
 
 		 591 aa  104  5e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1941  sensor histidine kinase  38.53 
 
 		 394 aa  104  6e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4289  GAF sensor signal transduction histidine kinase  31.64 
 
 		 552 aa  104  6e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2849  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.56 
 
 		 682 aa  103  1e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.790064  normal  0.747278 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5303  putative two-component system sensor kinase  37.56 
 
 		 367 aa  103  1e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0551174  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0674  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.33 
 
 		 447 aa  103  1e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.504244  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1864  Sensor DegS domain protein  29.73 
 
 		 391 aa  103  1e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000165606  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2107  histidine kinase  32.13 
 
 		 379 aa  103  1e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0476  histidine kinase  38.12 
 
 		 464 aa  103  2e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1983  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.6 
 
 		 469 aa  102  2e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.143525 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3261  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.79 
 
 		 463 aa  102  2e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1268  histidine kinase  29.95 
 
 		 392 aa  102  2e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1568  histidine kinase  35.92 
 
 		 462 aa  102  2e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4896  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.02 
 
 		 517 aa  102  2e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0133704  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2043  histidine kinase  27.73 
 
 		 388 aa  102  3e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1231  histidine kinase  29.91 
 
 		 482 aa  102  3e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1652  histidine kinase  39 
 
 		 373 aa  102  3e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000168648  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4905  ATPase domain-containing protein  38.92 
 
 		 496 aa  101  4e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.92947  normal  0.728538 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2729  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.84 
 
 		 665 aa  101  4e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2521  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.99 
 
 		 594 aa  101  5e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0533071  normal  0.360744 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1564  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  30.5 
 
 		 395 aa  100  6e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3669  histidine kinase  34.74 
 
 		 489 aa  100  8e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2820  GAF sensor signal transduction histidine kinase  30.83 
 
 		 545 aa  100  9e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.771324  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5541  sensor histidine kinase, putative  28.86 
 
 		 523 aa  100  1e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1596  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.91 
 
 		 420 aa  99.8  1e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.310205  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2433  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.74 
 
 		 461 aa  99.4  2e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.189775  normal  0.142881 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4255  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.71 
 
 		 703 aa  99.4  2e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7687  Signal transduction histidine kinase-like protein  28.38 
 
 		 587 aa  99.8  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6138  Signal transduction histidine kinase-like protein  37.73 
 
 		 403 aa  99  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.278868  normal  0.229544 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1809  histidine kinase  32.64 
 
 		 640 aa  99.4  2e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4528  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.96 
 
 		 461 aa  99.4  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.25442  normal  0.575982 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4230  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.03 
 
 		 478 aa  99.4  2e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.304751 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4728  histidine kinase  34.82 
 
 		 429 aa  98.6  3e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5592  sensor histidine kinase  29.45 
 
 		 523 aa  98.6  3e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0817  signal transduction histidine kinase, glucose-6-phosphate specific  31.4 
 
 		 466 aa  99  3e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000394288  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2714  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.56 
 
 		 1168 aa  99  3e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6241  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.59 
 
 		 748 aa  98.6  4e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5902  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.78 
 
 		 671 aa  98.2  4e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.773791  normal  0.148169 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1232  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.51 
 
 		 334 aa  98.6  4e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.380961  normal  0.783946 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5200  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.37 
 
 		 695 aa  98.2  5e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1312  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.02 
 
 		 484 aa  97.8  6e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0729257  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>