More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_7687 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_7687  Signal transduction histidine kinase-like protein  100 
 
 
587 aa  1118    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4606  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  44.61 
 
 
417 aa  133  9e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0890367  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6491  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.38 
 
 
576 aa  131  3e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.194722  normal  0.40327 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0085  putative signal transduction histidine kinase  42.5 
 
 
587 aa  127  5e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0319  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  40.89 
 
 
382 aa  127  5e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.499307  normal  0.099987 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2433  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.11 
 
 
461 aa  122  1.9999999999999998e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.189775  normal  0.142881 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3718  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.32 
 
 
586 aa  122  1.9999999999999998e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.118329  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6138  Signal transduction histidine kinase-like protein  41.99 
 
 
403 aa  122  1.9999999999999998e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.278868  normal  0.229544 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2641  histidine kinase  35.27 
 
 
453 aa  121  3e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0175588  hitchhiker  0.00721729 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7224  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  45.45 
 
 
594 aa  121  3.9999999999999996e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6699  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.92 
 
 
621 aa  119  1.9999999999999998e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0811  histidine kinase  41.41 
 
 
580 aa  117  3.9999999999999997e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4660  histidine kinase  44.85 
 
 
402 aa  115  2.0000000000000002e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6579  Histidine kinase  27.95 
 
 
689 aa  115  3e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.218867  normal  0.148163 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0531  histidine kinase  43.63 
 
 
429 aa  114  4.0000000000000004e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.005431  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3200  Signal transduction histidine kinase-like protein  39.6 
 
 
395 aa  114  4.0000000000000004e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0602  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.23 
 
 
584 aa  113  1.0000000000000001e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.416305  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0199  histidine kinase  39.23 
 
 
452 aa  111  3e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2301  Histidine kinase  41.29 
 
 
412 aa  111  3e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0329  signal transduction histidine kinase  40.29 
 
 
435 aa  112  3e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.982298  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1255  histidine kinase  39.5 
 
 
463 aa  111  4.0000000000000004e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2091  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.63 
 
 
466 aa  110  5e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4728  histidine kinase  37.88 
 
 
429 aa  110  6e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1744  putative signal transduction histidine kinase  36.45 
 
 
723 aa  110  9.000000000000001e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.0103404 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0949  histidine kinase  35.27 
 
 
416 aa  110  9.000000000000001e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2507  Signal transduction histidine kinase-like protein  41.45 
 
 
405 aa  109  1e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.401085  normal  0.727575 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2444  histidine kinase  39.25 
 
 
425 aa  109  1e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000824837  normal  0.0922124 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3934  histidine kinase  39.8 
 
 
442 aa  108  2e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0386  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.39 
 
 
418 aa  107  6e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.482475 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1961  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.76 
 
 
444 aa  107  6e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  unclonable  0.000000367534  hitchhiker  0.000000631341 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3230  sensory box histidine kinase  35.16 
 
 
518 aa  107  8e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0301  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.79 
 
 
748 aa  106  1e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2540  putative signal transduction histidine kinase  31.8 
 
 
570 aa  105  2e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1809  histidine kinase  34.75 
 
 
640 aa  105  2e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2510  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.47 
 
 
640 aa  105  3e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3669  histidine kinase  33.96 
 
 
489 aa  104  6e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1652  Histidine kinase  37.37 
 
 
439 aa  103  7e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.527879  normal  0.680022 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0252  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.61 
 
 
591 aa  103  7e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0165579 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2071  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.86 
 
 
725 aa  103  9e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.249392  normal  0.37167 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12660  signal transduction histidine kinase  39.45 
 
 
444 aa  102  1e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.224023  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0354  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.31 
 
 
438 aa  103  1e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2927  histidine kinase  41.29 
 
 
383 aa  102  1e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000936268  hitchhiker  0.0000101948 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2340  histidine kinase  39.02 
 
 
388 aa  102  2e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0211  histidine kinase  40.2 
 
 
463 aa  101  3e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3763  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.39 
 
 
375 aa  102  3e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.200679  normal  0.834979 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2132  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.29 
 
 
433 aa  101  4e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.569038  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3907  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.41 
 
 
428 aa  101  4e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1652  histidine kinase  35.88 
 
 
373 aa  100  5e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000168648  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2757  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  38.34 
 
 
433 aa  100  6e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.128423  normal  0.0502627 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0308  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.31 
 
 
405 aa  100  6e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.130128 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1360  histidine kinase  37.37 
 
 
476 aa  100  1e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.388977 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3546  histidine kinase  36.32 
 
 
489 aa  99.8  1e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.871685 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1998  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.49 
 
 
658 aa  99.8  1e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2549  GAF sensor signal transduction histidine kinase  32.53 
 
 
456 aa  99.4  1e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5647  histidine kinase  36.32 
 
 
433 aa  99.8  1e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.559873  normal  0.146404 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3491  putative signal transduction histidine kinase  39.22 
 
 
624 aa  99.8  1e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1706  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.21 
 
 
564 aa  99  2e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.98975  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0971  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 
417 aa  99.4  2e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5166  putative signal transduction histidine kinase  38.58 
 
 
537 aa  98.6  3e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.153671  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1880  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.49 
 
 
662 aa  97.8  4e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0862215  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1231  histidine kinase  30.19 
 
 
482 aa  98.2  4e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1965  histidine kinase  33.49 
 
 
662 aa  98.2  4e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.632766  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3104  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.46 
 
 
485 aa  98.2  4e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6198  Signal transduction histidine kinase-like protein  38.42 
 
 
415 aa  97.8  5e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.129005  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0284  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.45 
 
 
591 aa  97.4  6e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0248  putative signal transduction histidine kinase  35.32 
 
 
470 aa  97.1  9e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3956  histidine kinase, dimerization and phosphoacceptor region  30.84 
 
 
323 aa  97.1  9e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2612  GAF sensor signal transduction histidine kinase  38.17 
 
 
391 aa  97.1  9e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9331  Signal transduction histidine kinase-like protein  35.83 
 
 
508 aa  96.7  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.542521 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0424  histidine kinase  39.78 
 
 
438 aa  96.3  1e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.680525  hitchhiker  0.00719111 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2107  histidine kinase  29.86 
 
 
379 aa  96.7  1e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0357  sensor histidine kinase  31.02 
 
 
459 aa  96.3  1e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.450318  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2298  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.25 
 
 
432 aa  95.9  2e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.317439  normal  0.783172 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0153  histidine kinase  32.42 
 
 
325 aa  95.9  2e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1872  sensor histidine kinase  29.05 
 
 
1046 aa  95.5  2e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0729  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.17 
 
 
398 aa  95.9  2e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.29297  normal  0.836482 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2281  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.65 
 
 
445 aa  95.9  2e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.67096  normal  0.255683 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0906  sensor histidine kinase  30.66 
 
 
469 aa  94.7  4e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0178022  hitchhiker  0.0000002134 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0826  Histidine kinase  35.75 
 
 
412 aa  94.7  4e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0227  GAF sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 
421 aa  94.7  4e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0635  histidine kinase  38.02 
 
 
430 aa  94.7  4e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.181904 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3049  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.8 
 
 
565 aa  94.4  5e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0199075  normal  0.598323 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0744  sensory box histidine kinase  32.39 
 
 
799 aa  94.7  5e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.13864  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2291  histidine kinase  27.06 
 
 
596 aa  94.4  6e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0649  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.07 
 
 
490 aa  94  7e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2294  histidine kinase  31.5 
 
 
381 aa  94  7e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.02124  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1447  Histidine kinase  27.76 
 
 
691 aa  93.6  8e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.705239  normal  0.184804 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1316  sensor histidine protein kinase  29.85 
 
 
525 aa  94  8e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.176896  normal  0.0650582 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0442  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.13 
 
 
485 aa  93.6  9e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.12569  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1685  Histidine kinase  35.26 
 
 
397 aa  93.2  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.842631 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4415  Signal transduction histidine kinase-like protein  35.15 
 
 
386 aa  92.8  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0384972 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3867  histidine kinase  37.01 
 
 
434 aa  93.6  1e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.265271  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07820  putative histidine kinase  32.54 
 
 
797 aa  93.6  1e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0365473 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1357  GAF sensor signal transduction histidine kinase  35.32 
 
 
403 aa  93.2  1e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.246673  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0456  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.77 
 
 
775 aa  93.2  1e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00143274 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1983  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.5 
 
 
469 aa  92.8  1e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.143525 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17590  signal transduction histidine kinase  35.32 
 
 
326 aa  92.8  1e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0109488  normal  0.353356 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1580  histidine kinase  33.91 
 
 
349 aa  92.8  2e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1502  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.27 
 
 
535 aa  92.8  2e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.175509 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1864  Sensor DegS domain protein  27.27 
 
 
391 aa  92.4  2e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000165606  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>