More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_1502 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013739  Cwoe_1502  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 
535 aa  1038    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.175509 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6491  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.73 
 
 
576 aa  148  2.0000000000000003e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.194722  normal  0.40327 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0085  putative signal transduction histidine kinase  39.32 
 
 
587 aa  128  2.0000000000000002e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4606  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.53 
 
 
417 aa  120  7e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0890367  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3763  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.23 
 
 
375 aa  116  7.999999999999999e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.200679  normal  0.834979 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4660  histidine kinase  38.29 
 
 
402 aa  117  7.999999999999999e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2433  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.14 
 
 
461 aa  116  7.999999999999999e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.189775  normal  0.142881 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2641  histidine kinase  37.27 
 
 
453 aa  115  1.0000000000000001e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0175588  hitchhiker  0.00721729 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3491  putative signal transduction histidine kinase  36.91 
 
 
624 aa  116  1.0000000000000001e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3718  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.05 
 
 
586 aa  112  2.0000000000000002e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.118329  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2132  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.08 
 
 
433 aa  110  5e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.569038  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1744  putative signal transduction histidine kinase  35 
 
 
723 aa  109  1e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.0103404 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7224  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.05 
 
 
594 aa  109  1e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0308  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.35 
 
 
405 aa  109  1e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.130128 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3200  Signal transduction histidine kinase-like protein  36.97 
 
 
395 aa  109  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2927  histidine kinase  37.39 
 
 
383 aa  108  2e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000936268  hitchhiker  0.0000101948 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0635  histidine kinase  35.61 
 
 
430 aa  108  2e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.181904 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6699  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.32 
 
 
621 aa  107  5e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2507  Signal transduction histidine kinase-like protein  36.43 
 
 
405 aa  104  4e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.401085  normal  0.727575 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0319  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.1 
 
 
382 aa  103  9e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.499307  normal  0.099987 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2091  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.57 
 
 
466 aa  102  1e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2301  Histidine kinase  40.91 
 
 
412 aa  101  3e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0199  histidine kinase  38.11 
 
 
452 aa  101  3e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1255  histidine kinase  35.55 
 
 
463 aa  101  4e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0329  signal transduction histidine kinase  37.73 
 
 
435 aa  99.4  1e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.982298  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0153  histidine kinase  34.1 
 
 
325 aa  99.4  1e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07210  histidine kinase  35.96 
 
 
237 aa  99.8  1e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5647  histidine kinase  31.18 
 
 
433 aa  98.6  2e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.559873  normal  0.146404 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4728  histidine kinase  34.4 
 
 
429 aa  99  2e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2757  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  35.63 
 
 
433 aa  98.6  2e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.128423  normal  0.0502627 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3907  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37 
 
 
428 aa  99  2e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1961  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.77 
 
 
444 aa  99  2e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  unclonable  0.000000367534  hitchhiker  0.000000631341 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6138  Signal transduction histidine kinase-like protein  38.31 
 
 
403 aa  97.4  5e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.278868  normal  0.229544 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4415  Signal transduction histidine kinase-like protein  34.24 
 
 
386 aa  97.4  5e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0384972 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0531  histidine kinase  36.02 
 
 
429 aa  96.7  9e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.005431  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0811  histidine kinase  34.1 
 
 
580 aa  96.7  1e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2700  histidine kinase  36.24 
 
 
429 aa  95.9  2e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000000394923  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4333  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.09 
 
 
343 aa  95.5  2e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0375931  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3934  histidine kinase  33.06 
 
 
442 aa  95.9  2e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0211  histidine kinase  38.65 
 
 
463 aa  94.7  3e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3908  putative signal transduction histidine kinase  34.4 
 
 
435 aa  95.1  3e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3982  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.4 
 
 
435 aa  95.1  3e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.335335  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3923  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.4 
 
 
435 aa  95.1  3e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.534106  normal  0.212662 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2249  histidine kinase  34.53 
 
 
420 aa  94.7  4e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.795375  normal  0.159293 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8723  Histidine kinase  39.9 
 
 
365 aa  94.4  5e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4456  histidine kinase  35.98 
 
 
410 aa  91.7  3e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09220  signal transduction histidine kinase  35.51 
 
 
492 aa  91.3  4e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.253701 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2281  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.96 
 
 
445 aa  90.9  6e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.67096  normal  0.255683 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2758  histidine kinase  36.79 
 
 
389 aa  90.1  8e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00845914  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0386  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.19 
 
 
418 aa  89.7  1e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.482475 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0949  histidine kinase  33.18 
 
 
416 aa  90.1  1e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0971  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.2 
 
 
417 aa  89.7  1e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2071  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.74 
 
 
725 aa  89.7  1e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.249392  normal  0.37167 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5907  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.24 
 
 
408 aa  89.4  1e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.155683  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3546  histidine kinase  35.59 
 
 
489 aa  89  2e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.871685 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0893  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  32.75 
 
 
359 aa  88.6  3e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3049  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.84 
 
 
565 aa  87.4  6e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0199075  normal  0.598323 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4713  histidine kinase  32.17 
 
 
404 aa  87  7e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.739692 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6198  Signal transduction histidine kinase-like protein  32.94 
 
 
415 aa  87  9e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.129005  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4385  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.05 
 
 
445 aa  86.3  0.000000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2525  histidine kinase  38.86 
 
 
434 aa  85.9  0.000000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0362104  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0967  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.56 
 
 
408 aa  85.1  0.000000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.849709 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12660  signal transduction histidine kinase  32.58 
 
 
444 aa  85.1  0.000000000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.224023  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3916  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40 
 
 
431 aa  85.1  0.000000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.257994  normal  0.0672811 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0609  histidine kinase  31.53 
 
 
442 aa  84.3  0.000000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.54142 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1360  histidine kinase  34.12 
 
 
476 aa  84.7  0.000000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.388977 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2942  ATPase domain-containing protein  34.62 
 
 
485 aa  84.3  0.000000000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4289  GAF sensor signal transduction histidine kinase  30.74 
 
 
552 aa  83.6  0.000000000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2340  histidine kinase  33.62 
 
 
388 aa  83.6  0.000000000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9331  Signal transduction histidine kinase-like protein  34.65 
 
 
508 aa  83.2  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.542521 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4344  ATPase domain-containing protein  31.78 
 
 
404 aa  82.8  0.00000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0554  Histidine kinase  37.28 
 
 
687 aa  82.4  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.158949  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5166  putative signal transduction histidine kinase  35.41 
 
 
537 aa  82.4  0.00000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.153671  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0456  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.29 
 
 
775 aa  81.6  0.00000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00143274 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3867  histidine kinase  35.11 
 
 
434 aa  82  0.00000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.265271  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1993  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35 
 
 
422 aa  81.6  0.00000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0674  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.77 
 
 
447 aa  81.3  0.00000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.504244  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1573  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, dimerization and phosphoacceptor region  30.74 
 
 
373 aa  80.9  0.00000000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17590  signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 
326 aa  81.3  0.00000000000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0109488  normal  0.353356 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3330  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.92 
 
 
398 aa  80.5  0.00000000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0149067  normal  0.138525 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0204  histidine kinase  33.07 
 
 
446 aa  80.5  0.00000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4726  histidine kinase  37.14 
 
 
405 aa  80.1  0.00000000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2388  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.93 
 
 
535 aa  80.1  0.00000000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.219764  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3418  sensor histidine kinase  30.42 
 
 
481 aa  79.7  0.0000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.986219  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3104  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.49 
 
 
459 aa  79.7  0.0000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.8316  hitchhiker  0.000380562 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0424  histidine kinase  33.66 
 
 
438 aa  80.1  0.0000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.680525  hitchhiker  0.00719111 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06146  sensory box histidine kinase  31.93 
 
 
710 aa  79.3  0.0000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0682167  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2521  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31 
 
 
594 aa  79  0.0000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0533071  normal  0.360744 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1916  histidine kinase  37.13 
 
 
410 aa  78.6  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01020  sensory box histidine kinase  31.93 
 
 
710 aa  79.3  0.0000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0755055  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4245  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.44 
 
 
595 aa  79  0.0000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4050  Histidine kinase  35.81 
 
 
374 aa  79.3  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.313821  hitchhiker  0.00550271 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0559  sensory box histidine kinase  31.51 
 
 
671 aa  78.6  0.0000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0442  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.43 
 
 
485 aa  78.6  0.0000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.12569  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3575  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.39 
 
 
475 aa  78.2  0.0000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2298  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.58 
 
 
432 aa  78.2  0.0000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.317439  normal  0.783172 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1965  histidine kinase  32.27 
 
 
662 aa  77.8  0.0000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.632766  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2027  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  29.62 
 
 
401 aa  77.8  0.0000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.109719  normal  0.72788 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1809  histidine kinase  30.04 
 
 
640 aa  77.8  0.0000000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07820  putative histidine kinase  31.44 
 
 
797 aa  77.8  0.0000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0365473 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>