65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_1745 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_1745  hypothetical protein  100 
 
 		 414 aa  796    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.736982  normal  0.0165675 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3491  putative signal transduction histidine kinase  33.99 
 
 		 624 aa  69.7  0.00000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0354  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.44 
 
 		 438 aa  62  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0424  histidine kinase  34.39 
 
 		 438 aa  60.1  0.00000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.680525  hitchhiker  0.00719111 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2700  histidine kinase  35.25 
 
 		 429 aa  60.1  0.00000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000000394923  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3408  histidine kinase  28.65 
 
 		 686 aa  59.7  0.0000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000158036  hitchhiker  0.000062789 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3763  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.12 
 
 		 375 aa  58.5  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.200679  normal  0.834979 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2281  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.35 
 
 		 445 aa  58.5  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.67096  normal  0.255683 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3934  histidine kinase  32.64 
 
 		 442 aa  57.8  0.0000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0949  histidine kinase  34.83 
 
 		 416 aa  57.4  0.0000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4606  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.44 
 
 		 417 aa  56.6  0.0000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0890367  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5647  histidine kinase  30.42 
 
 		 433 aa  56.6  0.0000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.559873  normal  0.146404 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1434  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.9 
 
 		 731 aa  56.2  0.0000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.278277  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2298  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.14 
 
 		 432 aa  55.1  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.317439  normal  0.783172 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6491  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.35 
 
 		 576 aa  55.5  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.194722  normal  0.40327 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2507  Signal transduction histidine kinase-like protein  33.77 
 
 		 405 aa  54.7  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.401085  normal  0.727575 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09220  signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 492 aa  54.7  0.000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.253701 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2927  histidine kinase  37.58 
 
 		 383 aa  53.9  0.000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000936268  hitchhiker  0.0000101948 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2641  histidine kinase  24.82 
 
 		 453 aa  53.9  0.000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0175588  hitchhiker  0.00721729 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1961  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.85 
 
 		 444 aa  53.9  0.000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  unclonable  0.000000367534  hitchhiker  0.000000631341 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0085  putative signal transduction histidine kinase  32.28 
 
 		 587 aa  53.9  0.000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2758  histidine kinase  32.26 
 
 		 389 aa  53.9  0.000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00845914  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2445  hypothetical protein  28.4 
 
 		 685 aa  53.5  0.000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000212553  normal  0.0137307 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3718  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.8 
 
 		 586 aa  53.5  0.000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.118329  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0635  histidine kinase  34.75 
 
 		 430 aa  52.8  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.181904 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1255  histidine kinase  37.62 
 
 		 463 aa  52.4  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4021  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.15 
 
 		 411 aa  51.6  0.00002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0185539  normal  0.088504 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3907  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.96 
 
 		 428 aa  52  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0199  histidine kinase  30.5 
 
 		 452 aa  50.8  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4385  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.54 
 
 		 445 aa  50.8  0.00005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0386  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.2 
 
 		 418 aa  50.4  0.00006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.482475 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1360  histidine kinase  31.71 
 
 		 476 aa  50.1  0.00007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.388977 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4415  Signal transduction histidine kinase-like protein  34.62 
 
 		 386 aa  50.1  0.00008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0384972 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0811  histidine kinase  27.07 
 
 		 580 aa  48.1  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2301  Histidine kinase  37.36 
 
 		 412 aa  48.1  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4728  histidine kinase  30.72 
 
 		 429 aa  48.1  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3516  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.68 
 
 		 388 aa  47.4  0.0004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.370817  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1916  histidine kinase  34.62 
 
 		 410 aa  47.4  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0609  histidine kinase  34.46 
 
 		 442 aa  47.4  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.54142 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4688  histidine kinase  30.17 
 
 		 419 aa  47.8  0.0004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3669  histidine kinase  37.97 
 
 		 489 aa  47.8  0.0004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0681  sensory box histidine kinase  27.52 
 
 		 356 aa  47.4  0.0005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.393599  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4660  histidine kinase  30.95 
 
 		 402 aa  46.2  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5166  putative signal transduction histidine kinase  31.82 
 
 		 537 aa  46.6  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.153671  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3330  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.68 
 
 		 398 aa  46.2  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0149067  normal  0.138525 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07210  histidine kinase  30.19 
 
 		 237 aa  45.4  0.002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4456  histidine kinase  40 
 
 		 410 aa  44.7  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3546  histidine kinase  29.14 
 
 		 489 aa  44.7  0.003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.871685 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4726  histidine kinase  41.54 
 
 		 405 aa  44.7  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2249  histidine kinase  29.45 
 
 		 420 aa  44.7  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.795375  normal  0.159293 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0329  signal transduction histidine kinase  29.49 
 
 		 435 aa  44.7  0.004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.982298  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2340  histidine kinase  29.68 
 
 		 388 aa  44.3  0.004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2525  histidine kinase  36.56 
 
 		 434 aa  44.3  0.004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0362104  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3867  histidine kinase  37.66 
 
 		 434 aa  44.3  0.004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.265271  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0906  sensor histidine kinase  27.68 
 
 		 469 aa  43.9  0.005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0178022  hitchhiker  0.0000002134 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3923  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.48 
 
 		 435 aa  43.9  0.005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.534106  normal  0.212662 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2071  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30 
 
 		 725 aa  43.9  0.005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.249392  normal  0.37167 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9331  Signal transduction histidine kinase-like protein  28.78 
 
 		 508 aa  44.3  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.542521 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3982  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.48 
 
 		 435 aa  43.9  0.005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.335335  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3908  putative signal transduction histidine kinase  34.48 
 
 		 435 aa  43.9  0.005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7224  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.14 
 
 		 594 aa  43.5  0.006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1390  putative signal transduction histidine kinase  25.66 
 
 		 462 aa  43.5  0.007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0649  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  23.31 
 
 		 490 aa  43.1  0.008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2540  putative signal transduction histidine kinase  27.89 
 
 		 570 aa  43.1  0.01  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0227  GAF sensor signal transduction histidine kinase  26.12 
 
 		 421 aa  43.1  0.01  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>