More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_1345 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011831  Cagg_1345  histidine kinase  100 
 
 
338 aa  667    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000383255 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1580  histidine kinase  53.37 
 
 
349 aa  323  2e-87  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0939  histidine kinase  52.66 
 
 
363 aa  315  5e-85  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0711  histidine kinase  51.14 
 
 
337 aa  263  4e-69  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2107  histidine kinase  36.44 
 
 
379 aa  155  8e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1268  histidine kinase  34.64 
 
 
392 aa  153  4e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2043  histidine kinase  32.61 
 
 
388 aa  152  1e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21830  histidine kinase  36.28 
 
 
391 aa  150  3e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00305219  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3044  Sensor DegS domain protein  32.81 
 
 
381 aa  145  7.0000000000000006e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000367044  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4910  histidine kinase  31.25 
 
 
347 aa  142  6e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00236658  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0798  histidine kinase  37.5 
 
 
347 aa  142  7e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1033  Histidine kinase  43.67 
 
 
395 aa  139  6e-32  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0602  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.32 
 
 
584 aa  139  7.999999999999999e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.416305  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1913  histidine kinase  30.06 
 
 
353 aa  138  2e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000343654  normal  0.0175391 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2414  GAF sensor signal transduction histidine kinase  41.46 
 
 
545 aa  133  5e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1864  Sensor DegS domain protein  34.56 
 
 
391 aa  133  6e-30  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000165606  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1998  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  40.28 
 
 
658 aa  132  7.999999999999999e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1880  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.28 
 
 
662 aa  132  1.0000000000000001e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0862215  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1965  histidine kinase  40.28 
 
 
662 aa  132  1.0000000000000001e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.632766  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1122  histidine kinase  31.21 
 
 
357 aa  130  3e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.277853  normal  0.812788 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1204  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36 
 
 
779 aa  130  3e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3064  GAF sensor signal transduction histidine kinase  39.72 
 
 
544 aa  130  4.0000000000000003e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.980645 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1809  histidine kinase  38.86 
 
 
640 aa  129  7.000000000000001e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2820  GAF sensor signal transduction histidine kinase  38.14 
 
 
545 aa  128  1.0000000000000001e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.771324  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1231  histidine kinase  35.02 
 
 
482 aa  127  3e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0284  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.53 
 
 
591 aa  126  5e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3762  histidine kinase  33.03 
 
 
358 aa  126  5e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00011366  unclonable  0.0000145112 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1193  histidine kinase  34.11 
 
 
497 aa  125  7e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0280854  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0185  histidine kinase  32.12 
 
 
395 aa  124  2e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000303796  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0252  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.14 
 
 
591 aa  124  3e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0165579 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3775  GAF sensor signal transduction histidine kinase  35.05 
 
 
548 aa  124  3e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2790  Sensor DegS domain protein  30.22 
 
 
393 aa  123  4e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3241  Histidine kinase  35.2 
 
 
393 aa  123  5e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1265  two-component sensor histidine kinase  33.03 
 
 
585 aa  122  8e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1108  GAF sensor signal transduction histidine kinase  37.75 
 
 
464 aa  120  3e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013207  Aaci_3079  histidine kinase  32.58 
 
 
223 aa  117  3e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4226  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.42 
 
 
682 aa  116  5e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.203059 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2326  histidine kinase  30.11 
 
 
396 aa  115  1.0000000000000001e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2912  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.13 
 
 
339 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003135  sensor histidine kinase  33.64 
 
 
451 aa  114  3e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.291514  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1983  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.89 
 
 
469 aa  113  4.0000000000000004e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.143525 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0641  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.44 
 
 
1648 aa  112  6e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2549  GAF sensor signal transduction histidine kinase  35.61 
 
 
456 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0974  histidine kinase  36.14 
 
 
384 aa  111  2.0000000000000002e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.103866  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02702  histidine kinase  32.73 
 
 
456 aa  110  3e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3261  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.93 
 
 
463 aa  110  4.0000000000000004e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0649  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.6 
 
 
490 aa  108  1e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0253  sensory box histidine kinase  33.85 
 
 
830 aa  107  2e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3391  histidine kinase  35.4 
 
 
356 aa  108  2e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.382044  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6031  Histidine kinase  37.93 
 
 
338 aa  107  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.542402  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0895  sensor histidine kinase  32.58 
 
 
451 aa  108  2e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.622783  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3669  histidine kinase  33.8 
 
 
489 aa  107  3e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41030  Periplasmic sensory histidine protein kinase, two-component  33.78 
 
 
458 aa  106  7e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0649951  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2388  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.36 
 
 
535 aa  105  9e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.219764  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5201  GAF sensor signal transduction histidine kinase  32.11 
 
 
393 aa  105  1e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.849708 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3211  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  31.58 
 
 
394 aa  105  1e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0560  histidine kinase  30.29 
 
 
670 aa  105  1e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.618015  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2416  histidine kinase  29.6 
 
 
344 aa  104  2e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2291  histidine kinase  31.89 
 
 
596 aa  104  2e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5078  histidine kinase  31.97 
 
 
368 aa  104  2e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.9788 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2464  ATPase domain-containing protein  29.6 
 
 
344 aa  104  2e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2047  sensor histidine kinase  31.68 
 
 
372 aa  104  3e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.362734  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5716  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.99 
 
 
700 aa  103  3e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00700823 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4230  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.96 
 
 
478 aa  103  3e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.304751 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2131  sensor histidine kinase  34.51 
 
 
394 aa  103  4e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4063  histidine kinase  34.67 
 
 
249 aa  103  5e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.460066  normal  0.0775473 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3937  histidine kinase  27.15 
 
 
366 aa  103  6e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0383335  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2244  sensor histidine kinase  32.84 
 
 
372 aa  102  8e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1874  histidine kinase  34.48 
 
 
293 aa  102  8e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1296  GAF sensor signal transduction histidine kinase  38.21 
 
 
386 aa  102  8e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.99492 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0821  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 
473 aa  102  8e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2080  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.29 
 
 
370 aa  102  9e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0662  sensor histidine kinase  37.67 
 
 
381 aa  102  1e-20  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_600  sensor histidine kinase  37.67 
 
 
381 aa  102  1e-20  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0751439  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2292  sensor histidine kinase  31.34 
 
 
365 aa  102  1e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2108  sensor histidine kinase  31.68 
 
 
372 aa  101  1e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2264  sensor histidine kinase  31.68 
 
 
365 aa  102  1e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.361221  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1568  histidine kinase  34.95 
 
 
462 aa  102  1e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1706  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.89 
 
 
564 aa  102  1e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.98975  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2510  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.29 
 
 
640 aa  102  1e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1122  histidine kinase  34.12 
 
 
467 aa  102  1e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.94341 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3041  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.51 
 
 
691 aa  102  1e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00734608 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2703  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.27 
 
 
552 aa  101  2e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.191431 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1215  PAS  31.84 
 
 
515 aa  101  2e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0117  serine/threonine protein kinase and signal transduction histidine kinase with GAF and PAS/PAC sensor  35.15 
 
 
2361 aa  101  2e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1842  histidine kinase  32.43 
 
 
529 aa  101  2e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2289  sensor histidine kinase  31.19 
 
 
372 aa  101  2e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.25894e-17 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0631  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.35 
 
 
381 aa  101  2e-20  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000982334  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3748  histidine kinase  31.82 
 
 
287 aa  101  2e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0176  sensory box histidine kinase/response regulator  35.65 
 
 
492 aa  100  3e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0910  sensory box histidine kinase/response regulator  35.65 
 
 
463 aa  100  3e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0746  histidine kinase  32.41 
 
 
387 aa  100  3e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3079  sensor histidine kinase  31.84 
 
 
372 aa  100  3e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000507367 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4005  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.74 
 
 
801 aa  100  3e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1932  Signal transduction histidine kinase  35.65 
 
 
492 aa  100  3e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0476253  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1432  sensory box histidine kinase/response regulator  35.65 
 
 
492 aa  100  3e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.188442  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1842  response regulator/sensory box histidine kinase  35.65 
 
 
492 aa  100  3e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0699  histidine kinase  29.28 
 
 
526 aa  100  3e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00253859  normal  0.376247 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19690  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.85 
 
 
352 aa  100  3e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0472  sensory box histidine kinase/response regulator  35.65 
 
 
492 aa  100  3e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.798891  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>