More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_1596 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_1596  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 420 aa  850    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.310205  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4255  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.14 
 
 		 703 aa  163  7e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4001  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.36 
 
 		 700 aa  162  1e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4366  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.36 
 
 		 700 aa  162  1e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5988  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.36 
 
 		 700 aa  162  1e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5549  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.87 
 
 		 370 aa  161  2e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.441753  normal  0.532681 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4249  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.79 
 
 		 684 aa  160  5e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.136482  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3775  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.79 
 
 		 707 aa  160  5e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.235944 
 
 
-
 
NC_002936  DET1064  sensory box sensor histidine kinase  29.67 
 
 		 1101 aa  160  6e-38  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1651  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.01 
 
 		 703 aa  159  9e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.658025  normal  0.250867 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_935  sensor histidine kinase  30.14 
 
 		 1226 aa  158  1e-37  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0946  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.25 
 
 		 1229 aa  158  2e-37  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1215  PAS  34.63 
 
 		 515 aa  154  2.9999999999999998e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1401  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  38.89 
 
 		 384 aa  154  2.9999999999999998e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5902  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 671 aa  152  1e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.773791  normal  0.148169 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1289  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  32.26 
 
 		 1168 aa  151  2e-35  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6197  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.35 
 
 		 665 aa  151  3e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.163996  normal  0.752378 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1851  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  33.69 
 
 		 450 aa  150  4e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0472  sensory box histidine kinase/response regulator  31.36 
 
 		 492 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.798891  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0176  sensory box histidine kinase/response regulator  31.36 
 
 		 492 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0910  sensory box histidine kinase/response regulator  31.36 
 
 		 463 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0380  sensory box histidine kinase/response regulator  31.16 
 
 		 463 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1432  sensory box histidine kinase/response regulator  31.36 
 
 		 492 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.188442  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6313  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.05 
 
 		 448 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1842  response regulator/sensory box histidine kinase  31.36 
 
 		 492 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1932  Signal transduction histidine kinase  31.36 
 
 		 492 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0476253  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1550  sensory box histidine kinase  33.56 
 
 		 680 aa  146  7.0000000000000006e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0126  sensory box histidine kinase/response regulator  33.56 
 
 		 619 aa  146  8.000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.799989  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1399  PAS  37.35 
 
 		 683 aa  145  1e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.04458 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6559  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.07 
 
 		 541 aa  145  1e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.59439 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1633  sensory box histidine kinase  33.33 
 
 		 680 aa  144  2e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.736823  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2159  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.44 
 
 		 439 aa  144  4e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0525823 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3482  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.02 
 
 		 489 aa  144  4e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.063872  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3924  PAS/PAC sensor Signal transduction histidine kinase  29.95 
 
 		 363 aa  143  5e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.278559  hitchhiker  0.00726573 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4005  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.79 
 
 		 801 aa  143  5e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0744  sensory box histidine kinase  36.11 
 
 		 799 aa  143  7e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.13864  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1248  sensory box histidine kinase/response regulator  32.43 
 
 		 687 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.535727  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7700  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.8 
 
 		 541 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.163324  normal  0.507763 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07820  putative histidine kinase  35.42 
 
 		 797 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0365473 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5809  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.22 
 
 		 366 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.325789  normal  0.250191 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0440  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.59 
 
 		 795 aa  140  4.999999999999999e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1145  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.64 
 
 		 490 aa  140  6e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.894172  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6236  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.57 
 
 		 553 aa  139  1e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.914679 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0409  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.17 
 
 		 795 aa  139  1e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2882  two-component hybrid sensor and regulator  33.09 
 
 		 740 aa  139  1e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0443  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.17 
 
 		 795 aa  139  1e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.351986  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1608  histidine kinase  34.88 
 
 		 565 aa  139  1e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0253  sensory box histidine kinase  29.54 
 
 		 830 aa  138  2e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1009  sensory box histidine kinase/response regulator  30.4 
 
 		 463 aa  138  2e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3744  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.7 
 
 		 412 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1485  two-component hybrid sensor and regulator  33.09 
 
 		 575 aa  136  6.0000000000000005e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1677  GAF sensor signal transduction histidine kinase  35.02 
 
 		 770 aa  136  6.0000000000000005e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1352  putative membrane sensor histidine kinase  33.09 
 
 		 575 aa  136  7.000000000000001e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1345  putative membrane sensor histidine kinase  33.09 
 
 		 575 aa  136  7.000000000000001e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0294  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.48 
 
 		 410 aa  135  9e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1573  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, dimerization and phosphoacceptor region  36.05 
 
 		 373 aa  134  3e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2020  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.64 
 
 		 771 aa  134  3e-30  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5127  PAS/PAC sensor Signal transduction histidine kinase  31.87 
 
 		 799 aa  134  3e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0179  histidine kinase  38.7 
 
 		 418 aa  134  3.9999999999999996e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3788  phytochrome  32.45 
 
 		 772 aa  133  5e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0317187 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1587  sensor protein  32.09 
 
 		 493 aa  133  6e-30  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.234957  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4515  two-component regulatory system sensory histidine kinase  33.8 
 
 		 383 aa  133  6e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0377261  normal  0.0581519 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0191  transmembrane two component system sensor kinase transcription regulator protein  33.45 
 
 		 458 aa  133  6.999999999999999e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0364977 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1092  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.98 
 
 		 493 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.614695 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4034  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.82 
 
 		 775 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1701  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  38.37 
 
 		 521 aa  131  2.0000000000000002e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.279897 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3424  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.84 
 
 		 378 aa  130  3e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.164628  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4793  cyclic nucleotide-binding protein  28.99 
 
 		 795 aa  130  3e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.271636  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3077  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.57 
 
 		 378 aa  130  6e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4619  PAS  36.49 
 
 		 670 aa  129  7.000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.751025 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2171  histidine kinase  37.26 
 
 		 594 aa  128  2.0000000000000002e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0754  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.85 
 
 		 384 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.961024  normal  0.0913306 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0301  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30 
 
 		 748 aa  127  3e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2521  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.36 
 
 		 594 aa  127  3e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0533071  normal  0.360744 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0559  sensory box histidine kinase  34.72 
 
 		 671 aa  127  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4560  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.13 
 
 		 462 aa  126  7e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.140942  normal  0.159095 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4427  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.13 
 
 		 462 aa  126  7e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5329  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.09 
 
 		 595 aa  126  7e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2334  sensor histidine kinase  36.78 
 
 		 470 aa  125  1e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3495  signal transduction histidine kinase-like protein  33.45 
 
 		 410 aa  124  2e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0736574  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0031  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.51 
 
 		 468 aa  125  2e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.231222  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3594  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.98 
 
 		 598 aa  125  2e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3080  bacteriophytochrome  37.2 
 
 		 783 aa  124  3e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3498  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.34 
 
 		 596 aa  124  3e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00492042 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0153  histidine kinase  38.57 
 
 		 325 aa  124  3e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1872  sensor histidine kinase  32.62 
 
 		 1046 aa  123  6e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3132  putative sensor histidine kinase  37.55 
 
 		 466 aa  123  7e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3926  histidine kinase  34.87 
 
 		 598 aa  122  9e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4393  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.3 
 
 		 582 aa  122  9.999999999999999e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4526  histidine kinase  32.3 
 
 		 582 aa  122  9.999999999999999e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.218354 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1099  sensor histidine kinase  37.08 
 
 		 466 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1378  sensor histidine kinase  37.08 
 
 		 466 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.922617  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2363  sensor histidine kinase  37.08 
 
 		 466 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1462  sensor kinase protein  37.08 
 
 		 466 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1763  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  39.17 
 
 		 594 aa  121  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3247  putative sensor histidine kinase  37.08 
 
 		 466 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1894  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.59 
 
 		 546 aa  120  3e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.640259  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3669  histidine kinase  36.59 
 
 		 489 aa  120  3.9999999999999996e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0662  sensor histidine kinase  32.63 
 
 		 381 aa  120  6e-26  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_600  sensor histidine kinase  32.63 
 
 		 381 aa  120  6e-26  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0751439  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>