More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_3031 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_3031  putative signal transduction histidine kinase  100 
 
 
381 aa  737    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3090  putative signal transduction histidine kinase  100 
 
 
381 aa  737    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.237047  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3047  putative signal transduction histidine kinase  98.95 
 
 
381 aa  731    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.118132  normal  0.733528 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2835  putative signal transduction histidine kinase  75.54 
 
 
371 aa  521  1e-147  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3580  putative signal transduction histidine kinase  75.76 
 
 
363 aa  498  1e-140  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.79128  normal  0.0360004 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4303  ATP-binding region ATPase domain protein  55.38 
 
 
404 aa  346  4e-94  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0353  putative signal transduction histidine kinase  49.74 
 
 
401 aa  286  5.999999999999999e-76  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.661618  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39500  signal transduction histidine kinase  43.13 
 
 
383 aa  259  4e-68  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.410485 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7054  putative signal transduction histidine kinase  43.63 
 
 
381 aa  248  2e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0280  Signal transduction histidine kinase-like protein  40.71 
 
 
382 aa  196  8.000000000000001e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6058  putative signal transduction histidine kinase  41.41 
 
 
501 aa  190  2.9999999999999997e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3125  putative signal transduction histidine kinase  49.14 
 
 
351 aa  150  4e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6597  putative signal transduction histidine kinase  36.87 
 
 
441 aa  137  3.0000000000000003e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0648  putative signal transduction histidine kinase  30.56 
 
 
404 aa  79.7  0.00000000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.448149 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1770  putative stress-responsive transcriptional regulator  33.04 
 
 
427 aa  75.5  0.000000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0914  putative signal transduction histidine kinase  32.17 
 
 
466 aa  74.7  0.000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3607  ATPase domain-containing protein  33.21 
 
 
440 aa  74.3  0.000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1736  PspC domain protein  34.47 
 
 
421 aa  73.9  0.000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.586033  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0655  putative signal transduction histidine kinase  28.5 
 
 
449 aa  73.9  0.000000000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.1704 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4438  putative signal transduction histidine kinase  36.12 
 
 
394 aa  72.8  0.000000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.175729  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6526  putative signal transduction histidine kinase  30.94 
 
 
444 aa  71.6  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28330  signal transduction histidine kinase  32.11 
 
 
480 aa  71.2  0.00000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.658456  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04810  signal transduction histidine kinase  31.39 
 
 
481 aa  71.2  0.00000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19690  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  22.04 
 
 
352 aa  70.5  0.00000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5232  putative signal transduction histidine kinase  35.75 
 
 
400 aa  69.3  0.00000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0452492  hitchhiker  0.00276259 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1254  putative signal transduction histidine kinase  33.01 
 
 
458 aa  69.3  0.0000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.473052  normal  0.219719 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3542  histidine kinase  32.42 
 
 
431 aa  67.4  0.0000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.787824 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4227  putative signal transduction histidine kinase  32.35 
 
 
394 aa  67  0.0000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3825  ATPase domain-containing protein  34.98 
 
 
441 aa  65.1  0.000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.331829  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2583  putative two-component system sensor kinase  32.12 
 
 
394 aa  65.1  0.000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.589839  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0188  histidine kinase  22 
 
 
693 aa  64.3  0.000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4281  putative signal transduction histidine kinase  32.82 
 
 
408 aa  64.3  0.000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.445439  normal  0.105633 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4148  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  27.42 
 
 
434 aa  63.5  0.000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1228  Signal transduction histidine kinase-like protein  31.32 
 
 
404 aa  63.5  0.000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.120133  hitchhiker  0.00954124 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0895  sensor histidine kinase  26.53 
 
 
451 aa  63.2  0.000000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.622783  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4605  histidine kinase  31.65 
 
 
403 aa  63.2  0.000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.506334 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2999  putative signal transduction histidine kinase  31.92 
 
 
480 aa  63.2  0.000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.942912  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1401  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  28.62 
 
 
384 aa  61.6  0.00000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4215  putative signal transduction histidine kinase  33.51 
 
 
423 aa  61.2  0.00000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0640253 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1070  histidine kinase  30.23 
 
 
430 aa  61.2  0.00000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02702  histidine kinase  23.35 
 
 
456 aa  61.2  0.00000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3230  histidine kinase  29.82 
 
 
1033 aa  61.2  0.00000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.704109  normal  0.047539 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0799  putative signal transduction histidine kinase  31.71 
 
 
745 aa  60.8  0.00000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.838075  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5558  Signal transduction histidine kinase-like protein  36.55 
 
 
417 aa  60.1  0.00000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.379544  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3373  histidine kinase  27.43 
 
 
1048 aa  60.1  0.00000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.228028  normal  0.520662 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4226  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.28 
 
 
682 aa  60.1  0.00000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.203059 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003135  sensor histidine kinase  24.24 
 
 
451 aa  59.7  0.00000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.291514  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1600  sensor histidine kinase  23.48 
 
 
351 aa  59.7  0.00000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000696667  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4576  histidine kinase  32.19 
 
 
394 aa  58.9  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.312812  normal  0.130927 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1321  sensor histidine kinase  25.11 
 
 
351 aa  58.2  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000375238  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1320  sensor histidine kinase  25.11 
 
 
351 aa  58.2  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00123004  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5386  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.19 
 
 
398 aa  58.2  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18540  signal transduction histidine kinase  29.96 
 
 
458 aa  58.5  0.0000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3034  putative signal transduction histidine kinase  34.88 
 
 
433 aa  58.5  0.0000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.494184  hitchhiker  0.00256181 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0276  Histidine kinase  28.57 
 
 
387 aa  58.2  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1530  sensor histidine kinase  25.11 
 
 
351 aa  58.2  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.90364e-25 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0729  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.65 
 
 
398 aa  58.2  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.29297  normal  0.836482 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0614  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.88 
 
 
468 aa  58.5  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1650  putative signal transduction histidine kinase  34.48 
 
 
418 aa  58.5  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.347734  normal  0.354634 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1347  sensor histidine kinase  25.11 
 
 
351 aa  57.8  0.0000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.31288  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6084  putative signal transduction histidine kinase  31.97 
 
 
364 aa  57.8  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0278  putative signal transduction histidine kinase  32.5 
 
 
413 aa  57.8  0.0000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0211669  normal  0.0366909 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1456  sensor histidine kinase  25.11 
 
 
351 aa  57.8  0.0000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00592106  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2339  histidine kinase  31.13 
 
 
1009 aa  57.8  0.0000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0693  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  23.61 
 
 
474 aa  57.8  0.0000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2497  histidine kinase  25.94 
 
 
1031 aa  57.8  0.0000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0918719  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41030  Periplasmic sensory histidine protein kinase, two-component  30.99 
 
 
458 aa  57.8  0.0000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0649951  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3381  histidine kinase  30.23 
 
 
433 aa  57.8  0.0000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0301  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.95 
 
 
748 aa  57.4  0.0000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1362  histidine kinase  23.17 
 
 
351 aa  57.4  0.0000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0117705  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3956  histidine kinase, dimerization and phosphoacceptor region  30.05 
 
 
323 aa  57  0.0000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2107  histidine kinase  24.3 
 
 
379 aa  57  0.0000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1311  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.78 
 
 
776 aa  56.6  0.0000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.103963 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3261  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.36 
 
 
463 aa  56.6  0.0000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2544  putative signal transduction histidine kinase  31.25 
 
 
455 aa  56.2  0.0000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.283862  normal  0.629362 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1562  sensor histidine kinase  23.17 
 
 
351 aa  55.8  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000749794  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0622  histidine kinase  30.62 
 
 
1013 aa  55.8  0.000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.378276 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3850  sensor histidine kinase  24.23 
 
 
351 aa  55.5  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000154691  hitchhiker  0.000000000165716 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0974  histidine kinase  40.86 
 
 
384 aa  55.1  0.000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.103866  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2442  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  25.11 
 
 
1030 aa  55.1  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.223882  normal  0.750566 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0486  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.69 
 
 
406 aa  55.5  0.000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.569431  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1879  putative signal transduction histidine kinase  29.13 
 
 
368 aa  55.1  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3275  PAS sensor protein  26.85 
 
 
1015 aa  55.1  0.000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.991698  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1108  GAF sensor signal transduction histidine kinase  26.2 
 
 
464 aa  55.5  0.000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1494  sensor histidine kinase  24.23 
 
 
351 aa  55.1  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000467986  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2580  histidine kinase  30.41 
 
 
422 aa  54.7  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.880661  normal  0.0603036 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1983  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.77 
 
 
469 aa  54.7  0.000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.143525 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5296  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.01 
 
 
776 aa  54.3  0.000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3926  histidine kinase  29.56 
 
 
598 aa  54.7  0.000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3427  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  29.18 
 
 
378 aa  53.9  0.000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.117  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1105  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.87 
 
 
546 aa  53.5  0.000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0252  multi-sensor signal transduction histidine kinase  24.89 
 
 
591 aa  53.9  0.000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0165579 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0159  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 
508 aa  53.5  0.000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0709  putative signal transduction histidine kinase  31.09 
 
 
484 aa  53.1  0.000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1992  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.13 
 
 
574 aa  53.5  0.000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0873865  normal  0.754427 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0162  putative signal transduction histidine kinase  29.02 
 
 
258 aa  53.1  0.000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.632322  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1847  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.41 
 
 
509 aa  53.1  0.000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.645356  normal  0.352228 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0760  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  23.98 
 
 
610 aa  52.8  0.000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000018635  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2711  putative signal transduction histidine kinase  30.05 
 
 
477 aa  53.1  0.000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00959084 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5725  putative signal transduction histidine kinase  34.39 
 
 
398 aa  52.8  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.333911  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>