126 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_3034 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_3034  putative signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 433 aa  816    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.494184  hitchhiker  0.00256181 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2544  putative signal transduction histidine kinase  62.38 
 
 		 455 aa  338  9.999999999999999e-92  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.283862  normal  0.629362 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28330  signal transduction histidine kinase  55.5 
 
 		 480 aa  330  2e-89  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.658456  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0709  putative signal transduction histidine kinase  59.62 
 
 		 484 aa  319  5e-86  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0655  putative signal transduction histidine kinase  47.65 
 
 		 449 aa  305  1.0000000000000001e-81  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.1704 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1770  putative stress-responsive transcriptional regulator  42.72 
 
 		 427 aa  285  1.0000000000000001e-75  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1254  putative signal transduction histidine kinase  41.97 
 
 		 458 aa  247  3e-64  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.473052  normal  0.219719 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2711  putative signal transduction histidine kinase  45.95 
 
 		 477 aa  234  2.0000000000000002e-60  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00959084 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4227  putative signal transduction histidine kinase  40.24 
 
 		 394 aa  231  2e-59  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0914  putative signal transduction histidine kinase  41.49 
 
 		 466 aa  224  2e-57  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0278  putative signal transduction histidine kinase  44.5 
 
 		 413 aa  224  3e-57  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0211669  normal  0.0366909 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2999  putative signal transduction histidine kinase  50 
 
 		 480 aa  222  9.999999999999999e-57  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.942912  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4438  putative signal transduction histidine kinase  44.85 
 
 		 394 aa  215  9.999999999999999e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.175729  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0648  putative signal transduction histidine kinase  39.31 
 
 		 404 aa  211  2e-53  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.448149 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1736  PspC domain protein  41.12 
 
 		 421 aa  210  4e-53  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.586033  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3607  ATPase domain-containing protein  40.86 
 
 		 440 aa  203  4e-51  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6526  putative signal transduction histidine kinase  38.85 
 
 		 444 aa  201  1.9999999999999998e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04810  signal transduction histidine kinase  39.01 
 
 		 481 aa  201  1.9999999999999998e-50  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4215  putative signal transduction histidine kinase  41.67 
 
 		 423 aa  196  9e-49  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0640253 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1650  putative signal transduction histidine kinase  39.96 
 
 		 418 aa  192  1e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.347734  normal  0.354634 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3825  ATPase domain-containing protein  38.33 
 
 		 441 aa  183  6e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.331829  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2583  putative two-component system sensor kinase  40.46 
 
 		 394 aa  177  3e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.589839  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5232  putative signal transduction histidine kinase  38.95 
 
 		 400 aa  175  1.9999999999999998e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0452492  hitchhiker  0.00276259 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1228  Signal transduction histidine kinase-like protein  37.8 
 
 		 404 aa  169  8e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.120133  hitchhiker  0.00954124 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6084  putative signal transduction histidine kinase  43.38 
 
 		 364 aa  169  8e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17350  signal transduction histidine kinase  39.68 
 
 		 419 aa  164  3e-39  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5558  Signal transduction histidine kinase-like protein  45.83 
 
 		 417 aa  136  9e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.379544  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6043  putative signal transduction histidine kinase  39.13 
 
 		 333 aa  128  2.0000000000000002e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5725  putative signal transduction histidine kinase  46.7 
 
 		 398 aa  108  2e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.333911  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0280  Signal transduction histidine kinase-like protein  32.21 
 
 		 382 aa  67  0.0000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0162  putative signal transduction histidine kinase  34.02 
 
 		 258 aa  63.2  0.000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.632322  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39500  signal transduction histidine kinase  29.41 
 
 		 383 aa  62.8  0.00000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.410485 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3031  putative signal transduction histidine kinase  34.88 
 
 		 381 aa  59.3  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3090  putative signal transduction histidine kinase  34.88 
 
 		 381 aa  59.3  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.237047  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2835  putative signal transduction histidine kinase  34.95 
 
 		 371 aa  58.5  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3047  putative signal transduction histidine kinase  34.42 
 
 		 381 aa  58.9  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.118132  normal  0.733528 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3580  putative signal transduction histidine kinase  34.31 
 
 		 363 aa  57  0.0000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.79128  normal  0.0360004 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3064  GAF sensor signal transduction histidine kinase  31.56 
 
 		 544 aa  56.2  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.980645 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0826  Histidine kinase  31.13 
 
 		 412 aa  55.5  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2414  GAF sensor signal transduction histidine kinase  31.56 
 
 		 545 aa  54.7  0.000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6058  putative signal transduction histidine kinase  32.44 
 
 		 501 aa  53.9  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1706  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.49 
 
 		 564 aa  53.5  0.000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.98975  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1879  putative signal transduction histidine kinase  35.68 
 
 		 368 aa  53.5  0.000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1389  nitrate/nitrite sensor protein NarX  30.65 
 
 		 598 aa  51.6  0.00003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0922186  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01200  sensory histidine kinase in two-component regulatory system with NarL  30.15 
 
 		 598 aa  51.2  0.00004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.690529  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2424  histidine kinase  30.15 
 
 		 598 aa  51.2  0.00004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0527369  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0325  putative signal transduction histidine kinase  40.95 
 
 		 440 aa  51.2  0.00004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0821  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.5 
 
 		 473 aa  51.2  0.00004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1331  nitrate/nitrite sensor protein NarX  30.15 
 
 		 598 aa  50.8  0.00004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.150699  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1372  nitrate/nitrite sensor protein NarX  30.15 
 
 		 598 aa  51.2  0.00004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.497152  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0602  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.32 
 
 		 584 aa  51.2  0.00004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.416305  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2401  nitrate/nitrite sensor protein NarX  30.15 
 
 		 598 aa  51.2  0.00004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000322457 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1918  nitrate/nitrite sensor protein NarX  30.15 
 
 		 598 aa  51.2  0.00004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0184147  normal  0.168413 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1705  nitrate/nitrite sensor protein NarX  30.15 
 
 		 598 aa  51.2  0.00004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.55706  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28340  putative stress-responsive transcriptional regulator  51.85 
 
 		 533 aa  51.2  0.00004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0709411  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01210  hypothetical protein  30.15 
 
 		 598 aa  51.2  0.00004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.678292  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2388  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25.65 
 
 		 535 aa  50.4  0.00006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.219764  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3230  histidine kinase  28.63 
 
 		 1033 aa  50.4  0.00006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.704109  normal  0.047539 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1880  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.84 
 
 		 662 aa  50.4  0.00006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0862215  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19690  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.19 
 
 		 352 aa  50.4  0.00006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0613  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  27.96 
 
 		 645 aa  49.3  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.066657 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2855  putative stress-responsive transcriptional regulator  40.74 
 
 		 86 aa  48.5  0.0002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3775  GAF sensor signal transduction histidine kinase  26.61 
 
 		 548 aa  48.5  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0789  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  27.82 
 
 		 469 aa  48.1  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4063  histidine kinase  30.73 
 
 		 249 aa  48.1  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.460066  normal  0.0775473 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41030  Periplasmic sensory histidine protein kinase, two-component  28.8 
 
 		 458 aa  48.1  0.0003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0649951  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2810  putative signal transduction histidine kinase  31.22 
 
 		 501 aa  47.8  0.0004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1601  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.86 
 
 		 581 aa  47.8  0.0004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7054  putative signal transduction histidine kinase  30.3 
 
 		 381 aa  47.8  0.0004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0050  putative signal transduction histidine kinase  34.72 
 
 		 739 aa  47.4  0.0005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.300283  normal  0.0383844 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1902  nitrate/nitrite sensor protein NarX  29.65 
 
 		 598 aa  47.4  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0021  transmembrane sensor histidine kinase transcription regulator protein  25.75 
 
 		 487 aa  47  0.0006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.130425  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1265  two-component sensor histidine kinase  22.49 
 
 		 585 aa  47  0.0006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4276  histidine kinase  30.14 
 
 		 309 aa  47  0.0006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.574796  normal  0.165932 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1897  nitrate/nitrite sensor protein NarX  29.65 
 
 		 598 aa  47  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.149462 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1961  nitrate/nitrite sensor protein NarX  29.65 
 
 		 598 aa  47  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.68817 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1374  nitrate/nitrite sensor protein NarX  29.65 
 
 		 613 aa  47.4  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0573196  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1557  nitrate/nitrite sensor protein NarX  29.65 
 
 		 598 aa  47  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0417714 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1400  histidine kinase  23.66 
 
 		 413 aa  47.4  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.558809 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2820  GAF sensor signal transduction histidine kinase  27.69 
 
 		 545 aa  46.6  0.0008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.771324  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1102  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.27 
 
 		 364 aa  46.6  0.0008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1735  PspC domain protein  42.31 
 
 		 445 aa  46.6  0.0008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4905  Signal transduction histidine kinase-like protein  39.08 
 
 		 731 aa  46.2  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.31139  normal  0.688455 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2317  nitrate/nitrite sensor protein NarX  28.14 
 
 		 598 aa  45.8  0.001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.797915 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0456  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.7 
 
 		 775 aa  46.2  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00143274 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4670  phage shock protein C, PspC  37.88 
 
 		 143 aa  46.2  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1385  sensor histidine kinase  22.17 
 
 		 377 aa  45.4  0.002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00939681  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3436  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.13 
 
 		 606 aa  45.8  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.637225  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1387  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.33 
 
 		 367 aa  45.4  0.002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.246252  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4462  phage shock protein C, PspC  32.31 
 
 		 86 aa  45.8  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3608  PspC domain-containing protein  48.15 
 
 		 419 aa  45.4  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1983  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.88 
 
 		 469 aa  45.8  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.143525 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6597  putative signal transduction histidine kinase  37 
 
 		 441 aa  45.4  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1105  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.67 
 
 		 546 aa  45.1  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2497  histidine kinase  27.03 
 
 		 1031 aa  45.4  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0918719  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3728  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.79 
 
 		 488 aa  45.4  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3508  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.11 
 
 		 376 aa  45.4  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.479931  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3044  Sensor DegS domain protein  25.12 
 
 		 381 aa  45.8  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000367044  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3405  histidine kinase  26.79 
 
 		 488 aa  45.1  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.352666  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3125  putative signal transduction histidine kinase  33.05 
 
 		 351 aa  45.8  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>