More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_1601 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_1601  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 
581 aa  1167    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0159  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  40.91 
 
 
508 aa  138  3.0000000000000003e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0117  serine/threonine protein kinase and signal transduction histidine kinase with GAF and PAS/PAC sensor  35.56 
 
 
2361 aa  136  9.999999999999999e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4896  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.34 
 
 
517 aa  134  3.9999999999999996e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0133704  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3542  histidine kinase  36.64 
 
 
431 aa  132  2.0000000000000002e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.787824 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1070  histidine kinase  39.73 
 
 
430 aa  130  7.000000000000001e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0826  Histidine kinase  39.39 
 
 
412 aa  128  3e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2580  histidine kinase  37.96 
 
 
422 aa  128  3e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.880661  normal  0.0603036 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2497  histidine kinase  36.97 
 
 
1031 aa  127  4.0000000000000003e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0918719  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0614  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.74 
 
 
468 aa  126  9e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4921  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.06 
 
 
412 aa  126  1e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0892179  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1308  GAF sensor signal transduction histidine kinase  30.65 
 
 
381 aa  126  1e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000110665  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0276  Histidine kinase  37.56 
 
 
387 aa  126  1e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1928  GAF sensor signal transduction histidine kinase  30.19 
 
 
652 aa  124  4e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.18674  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3230  histidine kinase  34.2 
 
 
1033 aa  124  4e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.704109  normal  0.047539 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1685  Histidine kinase  38.03 
 
 
397 aa  124  5e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.842631 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4605  histidine kinase  40.26 
 
 
403 aa  123  9.999999999999999e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.506334 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0174  histidine kinase  39.9 
 
 
432 aa  121  3.9999999999999996e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4745  Histidine kinase  39.34 
 
 
362 aa  120  6e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.65465  normal  0.54089 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1105  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.8 
 
 
546 aa  119  1.9999999999999998e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1285  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.29 
 
 
742 aa  119  1.9999999999999998e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0341  GAF sensor signal transduction histidine kinase  34.6 
 
 
725 aa  118  3e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0143238  hitchhiker  0.0051816 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2487  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  39.18 
 
 
412 aa  118  3e-25  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1050  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.05 
 
 
490 aa  117  6.9999999999999995e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0890149 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3248  histidine kinase  36.64 
 
 
403 aa  115  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.298805  normal  0.646005 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1400  histidine kinase  37.29 
 
 
413 aa  115  3e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.558809 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3812  histidine kinase  34.39 
 
 
402 aa  115  3e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00313261 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2927  histidine kinase  35.27 
 
 
717 aa  114  4.0000000000000004e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.340579  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2729  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.7 
 
 
665 aa  114  7.000000000000001e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0602  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.4 
 
 
584 aa  112  1.0000000000000001e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.416305  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1029  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.04 
 
 
411 aa  113  1.0000000000000001e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.342445  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1992  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.61 
 
 
574 aa  112  2.0000000000000002e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0873865  normal  0.754427 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1551  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.96 
 
 
407 aa  112  2.0000000000000002e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.538677  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2027  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  31.44 
 
 
401 aa  109  1e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.109719  normal  0.72788 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0927  Histidine kinase  35.45 
 
 
407 aa  108  3e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.163259  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1652  histidine kinase  36 
 
 
373 aa  107  4e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000168648  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0347  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.72 
 
 
442 aa  107  5e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0286068  normal  0.880673 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1108  GAF sensor signal transduction histidine kinase  28.8 
 
 
464 aa  107  5e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2882  Histidine kinase  32.74 
 
 
413 aa  107  7e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00350907  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0227  GAF sensor signal transduction histidine kinase  31.58 
 
 
421 aa  105  2e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1864  Sensor DegS domain protein  33.17 
 
 
391 aa  105  2e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000165606  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3575  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.11 
 
 
475 aa  105  2e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19690  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.39 
 
 
352 aa  105  3e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3926  histidine kinase  31.45 
 
 
598 aa  105  3e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6981  histidine kinase  35.84 
 
 
389 aa  105  3e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.69549  normal  0.8933 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0507  Histidine kinase  32.16 
 
 
373 aa  105  3e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3373  histidine kinase  30.93 
 
 
1048 aa  105  3e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.228028  normal  0.520662 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2521  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.42 
 
 
594 aa  104  4e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0533071  normal  0.360744 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3594  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.45 
 
 
598 aa  104  4e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5716  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.38 
 
 
700 aa  104  5e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00700823 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2170  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.44 
 
 
438 aa  104  5e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.289043  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4063  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.21 
 
 
372 aa  104  5e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1268  histidine kinase  29.3 
 
 
392 aa  103  6e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2631  GAF sensor signal transduction histidine kinase  25.93 
 
 
655 aa  103  9e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2043  histidine kinase  27.31 
 
 
388 aa  103  1e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7345  histidine kinase  36.41 
 
 
448 aa  103  1e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0358279 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4257  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.97 
 
 
425 aa  102  1e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.944202  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2849  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.74 
 
 
682 aa  102  2e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.790064  normal  0.747278 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4226  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.81 
 
 
682 aa  102  2e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.203059 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2107  histidine kinase  30.77 
 
 
379 aa  101  3e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1935  Histidine kinase  38.27 
 
 
364 aa  102  3e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1677  GAF sensor signal transduction histidine kinase  33.99 
 
 
770 aa  101  5e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2020  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 
771 aa  99  2e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0456  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.67 
 
 
775 aa  99  2e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00143274 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0814  signal transduction histidine kinase, glucose-6-phosphate specific  33.18 
 
 
466 aa  98.2  3e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000114737  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1055  putative signal transduction histidine kinase  36.49 
 
 
401 aa  98.6  3e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.64157  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1071  GAF sensor signal transduction histidine kinase  36.49 
 
 
401 aa  98.6  3e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0809665 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2803  histidine kinase  33.91 
 
 
422 aa  98.2  4e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.367455 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0252  multi-sensor signal transduction histidine kinase  24.7 
 
 
591 aa  97.8  4e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0165579 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3420  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.32 
 
 
440 aa  98.2  4e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0662145 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2790  Sensor DegS domain protein  26.79 
 
 
393 aa  98.2  4e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0718  histidine kinase  36.32 
 
 
433 aa  97.8  5e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.217794 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1706  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.13 
 
 
564 aa  97.8  5e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.98975  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4478  histidine kinase  32.91 
 
 
400 aa  97.4  7e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.334166 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1562  sensor histidine kinase  30.34 
 
 
351 aa  97.1  7e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000749794  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8792  Signal transduction histidine kinase-like protein  34.83 
 
 
380 aa  97.4  7e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.524564  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0833  GAF:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, HAMP region:histidine kinase, dimerization and phosphoacceptor region  25.19 
 
 
646 aa  97.1  8e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0228489 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1687  signal transduction histidine kinase, nitrate/nitrite-specific, NarQ  27.68 
 
 
643 aa  97.1  8e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.461201  normal  0.659068 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3498  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.05 
 
 
596 aa  97.1  8e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00492042 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2612  GAF sensor signal transduction histidine kinase  34.86 
 
 
391 aa  96.7  9e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3418  sensor histidine kinase  33.49 
 
 
481 aa  96.3  1e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.986219  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1600  sensor histidine kinase  30.64 
 
 
351 aa  96.7  1e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000696667  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2882  two-component hybrid sensor and regulator  33.2 
 
 
740 aa  96.7  1e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0301  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.38 
 
 
748 aa  96.7  1e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3850  sensor histidine kinase  30.04 
 
 
351 aa  95.9  2e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000154691  hitchhiker  0.000000000165716 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5329  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.65 
 
 
595 aa  96.3  2e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0607  histidine kinase  33.62 
 
 
413 aa  95.5  2e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1494  sensor histidine kinase  30.34 
 
 
351 aa  95.1  3e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000467986  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4854  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32 
 
 
394 aa  95.1  3e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0459585  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2442  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.33 
 
 
1030 aa  95.5  3e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.223882  normal  0.750566 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3381  histidine kinase  33.33 
 
 
433 aa  95.1  3e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0235  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.13 
 
 
402 aa  94.7  4e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1615  histidine kinase  27.88 
 
 
407 aa  94.7  4e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0650745  normal  0.0536208 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0284  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.14 
 
 
591 aa  94.7  4e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2736  histidine kinase  30.94 
 
 
430 aa  94.4  5e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.554536  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5558  histidine kinase  30.23 
 
 
620 aa  94.7  5e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.810149  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0440  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.21 
 
 
795 aa  94.4  5e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29930  signal transduction histidine kinase  37.57 
 
 
451 aa  94.4  5e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.293273  normal  0.79172 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2942  ATPase domain-containing protein  35.03 
 
 
485 aa  94.4  5e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1321  sensor histidine kinase  30.34 
 
 
351 aa  94  6e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000375238  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>