More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_0050 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014151  Cfla_0050  putative signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 739 aa  1406    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.300283  normal  0.0383844 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4834  putative signal transduction histidine kinase  30.04 
 
 		 782 aa  116  2.0000000000000002e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1879  putative signal transduction histidine kinase  35.77 
 
 		 368 aa  85.9  0.000000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3447  putative signal transduction histidine kinase  39.17 
 
 		 894 aa  85.5  0.000000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0798  putative signal transduction histidine kinase  30.87 
 
 		 767 aa  76.6  0.000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6903  putative signal transduction histidine kinase  36.7 
 
 		 780 aa  76.6  0.000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3825  ATPase domain-containing protein  33.51 
 
 		 441 aa  69.3  0.0000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.331829  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0486  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.49 
 
 		 406 aa  68.9  0.0000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.569431  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1400  histidine kinase  25.52 
 
 		 413 aa  67.8  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.558809 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0799  putative signal transduction histidine kinase  25.9 
 
 		 745 aa  67.8  0.0000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.838075  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4215  putative signal transduction histidine kinase  35.26 
 
 		 423 aa  67  0.000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0640253 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1809  histidine kinase  29.82 
 
 		 640 aa  64.7  0.000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1998  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30 
 
 		 658 aa  62.4  0.00000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5875  putative signal transduction histidine kinase  38.18 
 
 		 851 aa  62  0.00000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.339217  normal  0.551311 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0276  Histidine kinase  36.7 
 
 		 387 aa  61.6  0.00000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1706  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.17 
 
 		 564 aa  61.6  0.00000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.98975  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39500  signal transduction histidine kinase  28.23 
 
 		 383 aa  61.6  0.00000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.410485 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1685  Histidine kinase  39.22 
 
 		 397 aa  61.2  0.00000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.842631 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4438  putative signal transduction histidine kinase  47.56 
 
 		 394 aa  61.2  0.00000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.175729  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4905  Signal transduction histidine kinase-like protein  25.32 
 
 		 731 aa  60.5  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.31139  normal  0.688455 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2070  sensor histidine kinase  27.46 
 
 		 466 aa  59.7  0.0000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0711  histidine kinase  33.55 
 
 		 337 aa  59.3  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1462  sensor kinase protein  27.27 
 
 		 466 aa  58.9  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41030  Periplasmic sensory histidine protein kinase, two-component  40.22 
 
 		 458 aa  58.9  0.0000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0649951  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1783  histidine kinase  25.81 
 
 		 501 aa  59.3  0.0000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000211372 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1099  sensor histidine kinase  27.46 
 
 		 466 aa  59.3  0.0000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1378  sensor histidine kinase  27.46 
 
 		 466 aa  59.3  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.922617  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3247  putative sensor histidine kinase  27.27 
 
 		 466 aa  58.9  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2363  sensor histidine kinase  27.46 
 
 		 466 aa  59.3  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3115  histidine kinase  31.86 
 
 		 483 aa  58.9  0.0000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1880  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.13 
 
 		 662 aa  58.5  0.0000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0862215  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0507  Histidine kinase  47.66 
 
 		 373 aa  58.9  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2783  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.58 
 
 		 513 aa  58.5  0.0000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2179  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  30.87 
 
 		 385 aa  58.9  0.0000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.901266 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6820  histidine kinase  23.21 
 
 		 278 aa  58.2  0.0000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.519919  normal  0.0817727 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0325  putative signal transduction histidine kinase  31.31 
 
 		 440 aa  58.5  0.0000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4063  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.2 
 
 		 372 aa  58.2  0.0000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0966  Signal transduction histidine kinase  25.11 
 
 		 332 aa  58.2  0.0000006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.763704  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2080  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.56 
 
 		 370 aa  57.8  0.0000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3132  putative sensor histidine kinase  27.27 
 
 		 466 aa  57.8  0.0000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6981  histidine kinase  29.24 
 
 		 389 aa  57.4  0.0000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.69549  normal  0.8933 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4281  putative signal transduction histidine kinase  31.86 
 
 		 408 aa  57.4  0.0000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.445439  normal  0.105633 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3542  histidine kinase  36.15 
 
 		 431 aa  57  0.000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.787824 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0833  GAF:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, HAMP region:histidine kinase, dimerization and phosphoacceptor region  33.33 
 
 		 646 aa  57  0.000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0228489 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4502  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.19 
 
 		 391 aa  56.6  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00405521  normal  0.0184903 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0643  histidine kinase  30.88 
 
 		 400 aa  57.4  0.000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1965  histidine kinase  29.69 
 
 		 662 aa  57.4  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.632766  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4226  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.66 
 
 		 682 aa  57  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.203059 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1308  GAF sensor signal transduction histidine kinase  35.24 
 
 		 381 aa  57  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000110665  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2535  ATP-binding region ATPase domain protein  30.21 
 
 		 666 aa  57  0.000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1935  Histidine kinase  30.3 
 
 		 364 aa  57  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2810  putative signal transduction histidine kinase  40.45 
 
 		 501 aa  57  0.000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0914  putative signal transduction histidine kinase  42.35 
 
 		 466 aa  57  0.000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6597  putative signal transduction histidine kinase  41.12 
 
 		 441 aa  57.4  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0927  Histidine kinase  33.33 
 
 		 407 aa  56.6  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.163259  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0614  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.55 
 
 		 468 aa  57  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2583  putative two-component system sensor kinase  29.89 
 
 		 394 aa  56.2  0.000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.589839  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0893  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  35.61 
 
 		 359 aa  55.8  0.000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6084  putative signal transduction histidine kinase  33.16 
 
 		 364 aa  56.6  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1238  histidine kinase  29.9 
 
 		 377 aa  56.6  0.000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0477765  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1105  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.3 
 
 		 546 aa  56.2  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01090  histidine kinase with GAF domain protein  37.74 
 
 		 385 aa  55.8  0.000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4230  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.36 
 
 		 478 aa  55.5  0.000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.304751 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0031  multi-sensor signal transduction histidine kinase  41.11 
 
 		 468 aa  55.8  0.000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.231222  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5558  Signal transduction histidine kinase-like protein  44.05 
 
 		 417 aa  55.8  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.379544  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3607  ATPase domain-containing protein  42.86 
 
 		 440 aa  55.1  0.000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2580  histidine kinase  31.37 
 
 		 422 aa  55.5  0.000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.880661  normal  0.0603036 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0456  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.9 
 
 		 775 aa  55.1  0.000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00143274 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0280  Signal transduction histidine kinase-like protein  31.28 
 
 		 382 aa  54.7  0.000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2631  GAF sensor signal transduction histidine kinase  39.39 
 
 		 655 aa  54.7  0.000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4345  putative signal transduction histidine kinase  45.12 
 
 		 466 aa  54.7  0.000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.262209 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1289  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  30.85 
 
 		 1168 aa  54.7  0.000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2027  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  24.53 
 
 		 401 aa  54.7  0.000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.109719  normal  0.72788 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3373  histidine kinase  34.23 
 
 		 1048 aa  54.7  0.000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.228028  normal  0.520662 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0243  histidine kinase  27.97 
 
 		 490 aa  54.3  0.000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00127323 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1133  putative signal transduction histidine kinase  31.28 
 
 		 403 aa  53.5  0.00001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4390  putative signal transduction histidine kinase  35.05 
 
 		 795 aa  53.9  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4896  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.36 
 
 		 517 aa  53.5  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0133704  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0347  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.56 
 
 		 442 aa  53.5  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0286068  normal  0.880673 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3152  putative signal transduction histidine kinase  35.38 
 
 		 396 aa  53.5  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.807347  normal  0.708256 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0159  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  40.2 
 
 		 508 aa  53.5  0.00001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1390  putative signal transduction histidine kinase  32.89 
 
 		 462 aa  53.9  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7756  PAS sensor protein  38.1 
 
 		 1809 aa  53.9  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1654  GAF sensor signal transduction histidine kinase  41 
 
 		 567 aa  53.9  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.309377  normal  0.649993 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1285  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.24 
 
 		 742 aa  53.9  0.00001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5386  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.3 
 
 		 398 aa  53.5  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1736  PspC domain protein  40.48 
 
 		 421 aa  53.1  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.586033  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4477  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.75 
 
 		 471 aa  53.1  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0974  histidine kinase  36.9 
 
 		 384 aa  53.1  0.00002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.103866  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0826  Histidine kinase  32.5 
 
 		 412 aa  52.8  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0646  histidine kinase  30.26 
 
 		 380 aa  52.8  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.411945  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1029  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.99 
 
 		 411 aa  52.8  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.342445  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0946  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.67 
 
 		 1229 aa  53.1  0.00002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2835  putative signal transduction histidine kinase  32.84 
 
 		 371 aa  53.1  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6058  putative signal transduction histidine kinase  33.18 
 
 		 501 aa  52.8  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1292  sensory box histidine kinase  30.56 
 
 		 384 aa  52.4  0.00003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3277  histidine kinase  32.07 
 
 		 405 aa  52.4  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.389696  normal  0.564269 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4861  histidine kinase  34.58 
 
 		 390 aa  52.4  0.00003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.164786 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1496  putative signal transduction histidine kinase  32.43 
 
 		 462 aa  52.4  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0938967  normal  0.650695 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4661  histidine kinase  27.97 
 
 		 380 aa  52.4  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.249963  hitchhiker  0.00746099 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>