More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_3580 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_3580  putative signal transduction histidine kinase  100 
 
 
363 aa  704    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.79128  normal  0.0360004 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2835  putative signal transduction histidine kinase  84.85 
 
 
371 aa  610  1e-173  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3031  putative signal transduction histidine kinase  75.76 
 
 
381 aa  495  1e-139  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3090  putative signal transduction histidine kinase  75.76 
 
 
381 aa  495  1e-139  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.237047  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3047  putative signal transduction histidine kinase  74.93 
 
 
381 aa  492  9.999999999999999e-139  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.118132  normal  0.733528 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4303  ATP-binding region ATPase domain protein  53.41 
 
 
404 aa  329  5.0000000000000004e-89  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0353  putative signal transduction histidine kinase  47.15 
 
 
401 aa  260  3e-68  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.661618  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39500  signal transduction histidine kinase  41.87 
 
 
383 aa  251  2e-65  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.410485 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7054  putative signal transduction histidine kinase  43.13 
 
 
381 aa  245  8e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0280  Signal transduction histidine kinase-like protein  39.07 
 
 
382 aa  194  1e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6058  putative signal transduction histidine kinase  41.8 
 
 
501 aa  183  4.0000000000000006e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3125  putative signal transduction histidine kinase  47.16 
 
 
351 aa  141  9.999999999999999e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6597  putative signal transduction histidine kinase  36.71 
 
 
441 aa  114  3e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3607  ATPase domain-containing protein  35.98 
 
 
440 aa  73.6  0.000000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0648  putative signal transduction histidine kinase  32.2 
 
 
404 aa  73.2  0.000000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.448149 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1254  putative signal transduction histidine kinase  32.51 
 
 
458 aa  73.2  0.000000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.473052  normal  0.219719 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0895  sensor histidine kinase  27.78 
 
 
451 aa  72.8  0.000000000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.622783  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04810  signal transduction histidine kinase  34.86 
 
 
481 aa  71.6  0.00000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4227  putative signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 
394 aa  71.2  0.00000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0655  putative signal transduction histidine kinase  29.81 
 
 
449 aa  68.9  0.0000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.1704 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5232  putative signal transduction histidine kinase  35.6 
 
 
400 aa  67.8  0.0000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0452492  hitchhiker  0.00276259 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4438  putative signal transduction histidine kinase  35 
 
 
394 aa  66.6  0.0000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.175729  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1770  putative stress-responsive transcriptional regulator  30.5 
 
 
427 aa  66.6  0.0000000007  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1228  Signal transduction histidine kinase-like protein  32.6 
 
 
404 aa  65.9  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.120133  hitchhiker  0.00954124 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02702  histidine kinase  25 
 
 
456 aa  64.7  0.000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19690  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  23.56 
 
 
352 aa  65.5  0.000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003135  sensor histidine kinase  25.97 
 
 
451 aa  64.3  0.000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.291514  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2583  putative two-component system sensor kinase  32.62 
 
 
394 aa  63.9  0.000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.589839  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3825  ATPase domain-containing protein  34.36 
 
 
441 aa  64.3  0.000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.331829  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1736  PspC domain protein  30.92 
 
 
421 aa  63.2  0.000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.586033  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18540  signal transduction histidine kinase  32.79 
 
 
458 aa  63.2  0.000000007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1650  putative signal transduction histidine kinase  35.15 
 
 
418 aa  62.4  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.347734  normal  0.354634 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6526  putative signal transduction histidine kinase  32.35 
 
 
444 aa  62.4  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4215  putative signal transduction histidine kinase  34.36 
 
 
423 aa  62  0.00000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0640253 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0914  putative signal transduction histidine kinase  36.71 
 
 
466 aa  61.6  0.00000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2711  putative signal transduction histidine kinase  33 
 
 
477 aa  60.8  0.00000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00959084 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28330  signal transduction histidine kinase  31.07 
 
 
480 aa  60.5  0.00000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.658456  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1879  putative signal transduction histidine kinase  37.1 
 
 
368 aa  60.5  0.00000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3261  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.96 
 
 
463 aa  60.1  0.00000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1600  sensor histidine kinase  26.82 
 
 
351 aa  60.1  0.00000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000696667  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0084  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.12 
 
 
449 aa  59.7  0.00000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2999  putative signal transduction histidine kinase  34.63 
 
 
480 aa  58.9  0.0000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.942912  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1530  sensor histidine kinase  26.36 
 
 
351 aa  58.5  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.90364e-25 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1347  sensor histidine kinase  26.36 
 
 
351 aa  58.2  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.31288  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1321  sensor histidine kinase  26.36 
 
 
351 aa  58.5  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000375238  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1320  sensor histidine kinase  26.36 
 
 
351 aa  58.5  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00123004  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1456  sensor histidine kinase  26.36 
 
 
351 aa  58.2  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00592106  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3542  histidine kinase  30.41 
 
 
431 aa  58.2  0.0000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.787824 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0709  putative signal transduction histidine kinase  32.31 
 
 
484 aa  58.2  0.0000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2497  histidine kinase  28.12 
 
 
1031 aa  58.5  0.0000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0918719  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2107  histidine kinase  24.19 
 
 
379 aa  58.2  0.0000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1289  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  28.7 
 
 
1168 aa  57.8  0.0000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6084  putative signal transduction histidine kinase  33.85 
 
 
364 aa  57.4  0.0000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4921  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.03 
 
 
412 aa  57.4  0.0000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0892179  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0252  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.81 
 
 
591 aa  57  0.0000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0165579 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1362  histidine kinase  25.91 
 
 
351 aa  57  0.0000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0117705  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0284  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.93 
 
 
591 aa  57  0.0000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0614  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.48 
 
 
468 aa  56.6  0.0000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3381  histidine kinase  32.62 
 
 
433 aa  56.6  0.0000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3230  histidine kinase  30.32 
 
 
1033 aa  56.6  0.0000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.704109  normal  0.047539 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0021  transmembrane sensor histidine kinase transcription regulator protein  27.91 
 
 
487 aa  56.6  0.0000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.130425  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3728  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.04 
 
 
488 aa  56.6  0.0000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4576  histidine kinase  31.33 
 
 
394 aa  56.2  0.0000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.312812  normal  0.130927 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0278  putative signal transduction histidine kinase  33.5 
 
 
413 aa  56.2  0.0000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0211669  normal  0.0366909 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1551  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.72 
 
 
407 aa  56.2  0.0000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.538677  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1562  sensor histidine kinase  26.36 
 
 
351 aa  55.8  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000749794  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1494  sensor histidine kinase  25.45 
 
 
351 aa  55.5  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000467986  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5725  putative signal transduction histidine kinase  34.41 
 
 
398 aa  55.8  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.333911  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2631  GAF sensor signal transduction histidine kinase  28.74 
 
 
655 aa  55.8  0.000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4148  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.57 
 
 
434 aa  55.8  0.000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3418  sensor histidine kinase  31.17 
 
 
481 aa  55.1  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.986219  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3850  sensor histidine kinase  25.45 
 
 
351 aa  55.5  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000154691  hitchhiker  0.000000000165716 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5558  Signal transduction histidine kinase-like protein  36.41 
 
 
417 aa  54.3  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.379544  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3034  putative signal transduction histidine kinase  34.31 
 
 
433 aa  54.3  0.000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.494184  hitchhiker  0.00256181 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3405  histidine kinase  29.64 
 
 
488 aa  54.7  0.000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.352666  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1983  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.78 
 
 
469 aa  54.3  0.000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.143525 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2080  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.67 
 
 
370 aa  54.3  0.000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41030  Periplasmic sensory histidine protein kinase, two-component  30.17 
 
 
458 aa  54.7  0.000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0649951  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0729  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.74 
 
 
398 aa  54.7  0.000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.29297  normal  0.836482 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1401  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  26.44 
 
 
384 aa  54.3  0.000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0301  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.91 
 
 
748 aa  53.5  0.000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1486  histidine kinase  31.31 
 
 
575 aa  53.1  0.000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0336288  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0622  histidine kinase  31.28 
 
 
1013 aa  53.1  0.000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.378276 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2483  histidine kinase  23.58 
 
 
514 aa  52.8  0.000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.705062  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4226  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.15 
 
 
682 aa  53.1  0.000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.203059 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3575  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.13 
 
 
475 aa  53.1  0.000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1292  sensory box histidine kinase  28.71 
 
 
384 aa  52.8  0.00001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2127  sensor histidine kinase  27.94 
 
 
313 aa  52.4  0.00001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.289713  normal  0.113702 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2544  putative signal transduction histidine kinase  32.45 
 
 
455 aa  52.8  0.00001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.283862  normal  0.629362 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1872  histidine kinase  26.2 
 
 
422 aa  52  0.00001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.235373  normal  0.411466 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2249  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.56 
 
 
543 aa  52  0.00001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.624689  normal  0.503479 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3373  histidine kinase  28.64 
 
 
1048 aa  52.4  0.00001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.228028  normal  0.520662 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1105  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.77 
 
 
546 aa  51.6  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4874  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.62 
 
 
458 aa  51.6  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000686699  hitchhiker  0.00000000293708 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1311  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.68 
 
 
776 aa  51.6  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.103963 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3614  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.94 
 
 
298 aa  51.2  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.753486  normal  0.27992 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2296  signal transduction histidine kinase  29.03 
 
 
541 aa  51.6  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0982064  normal  0.378772 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0188  histidine kinase  21.66 
 
 
693 aa  51.6  0.00002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0798  putative signal transduction histidine kinase  30.73 
 
 
767 aa  52  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3690  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.62 
 
 
456 aa  51.6  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000509903  normal  0.82327 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>