More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_4303 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_4303  ATP-binding region ATPase domain protein  100 
 
 		 404 aa  793    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3047  putative signal transduction histidine kinase  55.38 
 
 		 381 aa  365  1e-99  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.118132  normal  0.733528 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3031  putative signal transduction histidine kinase  55.38 
 
 		 381 aa  362  6e-99  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3090  putative signal transduction histidine kinase  55.38 
 
 		 381 aa  362  6e-99  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.237047  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2835  putative signal transduction histidine kinase  52.83 
 
 		 371 aa  359  5e-98  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3580  putative signal transduction histidine kinase  53.41 
 
 		 363 aa  351  2e-95  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.79128  normal  0.0360004 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0353  putative signal transduction histidine kinase  50 
 
 		 401 aa  286  2.9999999999999996e-76  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.661618  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7054  putative signal transduction histidine kinase  43.4 
 
 		 381 aa  248  2e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39500  signal transduction histidine kinase  40.05 
 
 		 383 aa  243  3e-63  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.410485 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0280  Signal transduction histidine kinase-like protein  39.68 
 
 		 382 aa  210  3e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6058  putative signal transduction histidine kinase  38.13 
 
 		 501 aa  185  1.0000000000000001e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3125  putative signal transduction histidine kinase  45.13 
 
 		 351 aa  144  2e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6597  putative signal transduction histidine kinase  52.73 
 
 		 441 aa  114  2.0000000000000002e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1685  Histidine kinase  28.64 
 
 		 397 aa  73.9  0.000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.842631 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1289  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  29.41 
 
 		 1168 aa  71.2  0.00000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4438  putative signal transduction histidine kinase  33.61 
 
 		 394 aa  71.6  0.00000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.175729  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2631  GAF sensor signal transduction histidine kinase  28.35 
 
 		 655 aa  69.7  0.00000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3825  ATPase domain-containing protein  29 
 
 		 441 aa  69.7  0.00000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.331829  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1736  PspC domain protein  32.39 
 
 		 421 aa  69.7  0.00000000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.586033  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1600  sensor histidine kinase  23.42 
 
 		 351 aa  69.7  0.00000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000696667  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1362  histidine kinase  23.1 
 
 		 351 aa  68.2  0.0000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0117705  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4215  putative signal transduction histidine kinase  30.08 
 
 		 423 aa  68.2  0.0000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0640253 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2999  putative signal transduction histidine kinase  31.96 
 
 		 480 aa  67.8  0.0000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.942912  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1321  sensor histidine kinase  22.74 
 
 		 351 aa  67  0.0000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000375238  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1320  sensor histidine kinase  22.74 
 
 		 351 aa  67  0.0000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00123004  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0648  putative signal transduction histidine kinase  32.87 
 
 		 404 aa  67  0.0000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.448149 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1530  sensor histidine kinase  22.74 
 
 		 351 aa  67  0.0000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.90364e-25 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4227  putative signal transduction histidine kinase  33.97 
 
 		 394 aa  67  0.0000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1347  sensor histidine kinase  22.74 
 
 		 351 aa  67  0.0000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.31288  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1456  sensor histidine kinase  22.74 
 
 		 351 aa  67  0.0000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00592106  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1485  two-component hybrid sensor and regulator  30.67 
 
 		 575 aa  66.6  0.0000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1108  GAF sensor signal transduction histidine kinase  27.54 
 
 		 464 aa  66.6  0.0000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1352  putative membrane sensor histidine kinase  30.67 
 
 		 575 aa  66.6  0.0000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1562  sensor histidine kinase  23.1 
 
 		 351 aa  65.9  0.000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000749794  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04810  signal transduction histidine kinase  31.28 
 
 		 481 aa  66.2  0.000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1345  putative membrane sensor histidine kinase  30.25 
 
 		 575 aa  66.2  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1494  sensor histidine kinase  22.43 
 
 		 351 aa  65.5  0.000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000467986  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0914  putative signal transduction histidine kinase  31.5 
 
 		 466 aa  65.5  0.000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3850  sensor histidine kinase  22.43 
 
 		 351 aa  65.5  0.000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000154691  hitchhiker  0.000000000165716 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1265  two-component sensor histidine kinase  24.44 
 
 		 585 aa  64.3  0.000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2711  putative signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 477 aa  63.9  0.000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00959084 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2580  histidine kinase  29.17 
 
 		 422 aa  64.3  0.000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.880661  normal  0.0603036 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4329  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.07 
 
 		 683 aa  63.2  0.000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.213628  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1650  putative signal transduction histidine kinase  33.5 
 
 		 418 aa  63.2  0.000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.347734  normal  0.354634 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3542  histidine kinase  28.11 
 
 		 431 aa  62.8  0.00000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.787824 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1228  Signal transduction histidine kinase-like protein  29.47 
 
 		 404 aa  62.8  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.120133  hitchhiker  0.00954124 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1070  histidine kinase  28.71 
 
 		 430 aa  62.4  0.00000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3230  histidine kinase  30.18 
 
 		 1033 aa  62.8  0.00000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.704109  normal  0.047539 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1254  putative signal transduction histidine kinase  27.5 
 
 		 458 aa  61.6  0.00000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.473052  normal  0.219719 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0895  sensor histidine kinase  27.73 
 
 		 451 aa  61.6  0.00000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.622783  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3261  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.09 
 
 		 463 aa  61.6  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0760  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  23.55 
 
 		 610 aa  62  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000018635  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3607  ATPase domain-containing protein  33 
 
 		 440 aa  62  0.00000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0655  putative signal transduction histidine kinase  27.18 
 
 		 449 aa  62.4  0.00000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.1704 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6526  putative signal transduction histidine kinase  30.85 
 
 		 444 aa  61.2  0.00000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1098  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.64 
 
 		 398 aa  61.2  0.00000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0159  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.36 
 
 		 508 aa  61.2  0.00000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2882  two-component hybrid sensor and regulator  30.47 
 
 		 740 aa  60.8  0.00000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28330  signal transduction histidine kinase  32.06 
 
 		 480 aa  60.5  0.00000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.658456  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1935  Histidine kinase  28.44 
 
 		 364 aa  60.5  0.00000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4605  histidine kinase  30.28 
 
 		 403 aa  60.5  0.00000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.506334 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5232  putative signal transduction histidine kinase  28.88 
 
 		 400 aa  60.5  0.00000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0452492  hitchhiker  0.00276259 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5386  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.01 
 
 		 398 aa  60.1  0.00000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3966  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.57 
 
 		 817 aa  59.7  0.00000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1983  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.63 
 
 		 469 aa  59.7  0.00000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.143525 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2070  sensor histidine kinase  30.4 
 
 		 466 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2583  putative two-component system sensor kinase  32.09 
 
 		 394 aa  59.7  0.0000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.589839  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2363  sensor histidine kinase  30.4 
 
 		 466 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0278  putative signal transduction histidine kinase  30.38 
 
 		 413 aa  59.7  0.0000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0211669  normal  0.0366909 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0966  Signal transduction histidine kinase  27.27 
 
 		 332 aa  59.3  0.0000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.763704  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1099  sensor histidine kinase  30.4 
 
 		 466 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1378  sensor histidine kinase  30.4 
 
 		 466 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.922617  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29930  signal transduction histidine kinase  31.75 
 
 		 451 aa  58.5  0.0000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.293273  normal  0.79172 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4502  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.94 
 
 		 391 aa  58.5  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00405521  normal  0.0184903 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1462  sensor kinase protein  30.09 
 
 		 466 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3132  putative sensor histidine kinase  30.09 
 
 		 466 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5127  PAS/PAC sensor Signal transduction histidine kinase  27.41 
 
 		 799 aa  58.9  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3381  histidine kinase  31.36 
 
 		 433 aa  58.9  0.0000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5844  histidine kinase  25.85 
 
 		 270 aa  58.9  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.330539 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3247  putative sensor histidine kinase  30.09 
 
 		 466 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4049  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.31 
 
 		 883 aa  58.2  0.0000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2334  sensor histidine kinase  29.18 
 
 		 470 aa  58.2  0.0000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0507  Histidine kinase  32.46 
 
 		 373 aa  58.2  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0973  putative signal transduction histidine kinase  28.64 
 
 		 592 aa  57.8  0.0000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0709163  normal  0.0408636 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1142  Signal transduction histidine kinase  23.98 
 
 		 402 aa  57.8  0.0000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.230499  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4148  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  27.92 
 
 		 434 aa  57.8  0.0000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3373  histidine kinase  25.97 
 
 		 1048 aa  57.8  0.0000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.228028  normal  0.520662 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0614  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.78 
 
 		 468 aa  57  0.0000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0486  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.44 
 
 		 406 aa  57.4  0.0000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.569431  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0709  putative signal transduction histidine kinase  32.16 
 
 		 484 aa  57  0.0000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3418  sensor histidine kinase  28.51 
 
 		 481 aa  56.6  0.0000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.986219  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2549  GAF sensor signal transduction histidine kinase  29.96 
 
 		 456 aa  56.6  0.0000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1027  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.19 
 
 		 473 aa  56.6  0.0000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1998  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.73 
 
 		 658 aa  56.6  0.0000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0744  sensory box histidine kinase  27.67 
 
 		 799 aa  56.2  0.0000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.13864  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0347  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.94 
 
 		 442 aa  56.2  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0286068  normal  0.880673 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2339  histidine kinase  28.88 
 
 		 1009 aa  56.2  0.000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02702  histidine kinase  25.45 
 
 		 456 aa  55.8  0.000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4230  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.46 
 
 		 478 aa  56.2  0.000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.304751 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5096  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.63 
 
 		 592 aa  56.2  0.000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.207763 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>