More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_0914 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_0914  putative signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 466 aa  913    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1736  PspC domain protein  55.84 
 
 		 421 aa  374  1e-102  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.586033  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1254  putative signal transduction histidine kinase  49.08 
 
 		 458 aa  350  3e-95  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.473052  normal  0.219719 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04810  signal transduction histidine kinase  45.69 
 
 		 481 aa  309  8e-83  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6526  putative signal transduction histidine kinase  48.01 
 
 		 444 aa  301  2e-80  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4227  putative signal transduction histidine kinase  43.36 
 
 		 394 aa  280  4e-74  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4438  putative signal transduction histidine kinase  44.25 
 
 		 394 aa  256  7e-67  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.175729  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0648  putative signal transduction histidine kinase  41.12 
 
 		 404 aa  253  5.000000000000001e-66  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.448149 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3607  ATPase domain-containing protein  39.44 
 
 		 440 aa  238  1e-61  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1650  putative signal transduction histidine kinase  41.36 
 
 		 418 aa  220  5e-56  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.347734  normal  0.354634 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4215  putative signal transduction histidine kinase  38.33 
 
 		 423 aa  216  9e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0640253 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1770  putative stress-responsive transcriptional regulator  36.9 
 
 		 427 aa  216  9.999999999999999e-55  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3825  ATPase domain-containing protein  39.14 
 
 		 441 aa  214  2.9999999999999995e-54  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.331829  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6084  putative signal transduction histidine kinase  39.89 
 
 		 364 aa  207  4e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2999  putative signal transduction histidine kinase  48.44 
 
 		 480 aa  205  2e-51  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.942912  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1228  Signal transduction histidine kinase-like protein  41.43 
 
 		 404 aa  203  5e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.120133  hitchhiker  0.00954124 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5232  putative signal transduction histidine kinase  39.09 
 
 		 400 aa  203  6e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0452492  hitchhiker  0.00276259 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28330  signal transduction histidine kinase  39.48 
 
 		 480 aa  202  8e-51  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.658456  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2583  putative two-component system sensor kinase  38.65 
 
 		 394 aa  202  9.999999999999999e-51  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.589839  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3034  putative signal transduction histidine kinase  42.04 
 
 		 433 aa  201  1.9999999999999998e-50  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.494184  hitchhiker  0.00256181 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0655  putative signal transduction histidine kinase  36.21 
 
 		 449 aa  196  7e-49  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.1704 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0278  putative signal transduction histidine kinase  40.94 
 
 		 413 aa  189  1e-46  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0211669  normal  0.0366909 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2711  putative signal transduction histidine kinase  39.94 
 
 		 477 aa  187  3e-46  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00959084 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0709  putative signal transduction histidine kinase  39.86 
 
 		 484 aa  179  9e-44  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17350  signal transduction histidine kinase  38.57 
 
 		 419 aa  166  8e-40  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2544  putative signal transduction histidine kinase  41.94 
 
 		 455 aa  164  4.0000000000000004e-39  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.283862  normal  0.629362 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5725  putative signal transduction histidine kinase  39.69 
 
 		 398 aa  159  1e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.333911  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5558  Signal transduction histidine kinase-like protein  47.62 
 
 		 417 aa  151  2e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.379544  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6043  putative signal transduction histidine kinase  40.56 
 
 		 333 aa  113  8.000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0280  Signal transduction histidine kinase-like protein  35 
 
 		 382 aa  89  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3031  putative signal transduction histidine kinase  32.82 
 
 		 381 aa  80.1  0.00000000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3090  putative signal transduction histidine kinase  32.82 
 
 		 381 aa  80.1  0.00000000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.237047  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3230  histidine kinase  31.42 
 
 		 1033 aa  79.7  0.0000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.704109  normal  0.047539 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3047  putative signal transduction histidine kinase  32.44 
 
 		 381 aa  79.3  0.0000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.118132  normal  0.733528 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39500  signal transduction histidine kinase  30.6 
 
 		 383 aa  79  0.0000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.410485 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0276  Histidine kinase  33.33 
 
 		 387 aa  77  0.0000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0159  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.03 
 
 		 508 aa  75.1  0.000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1105  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.84 
 
 		 546 aa  73.2  0.00000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3580  putative signal transduction histidine kinase  36.71 
 
 		 363 aa  71.2  0.00000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.79128  normal  0.0360004 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2631  GAF sensor signal transduction histidine kinase  34.95 
 
 		 655 aa  71.2  0.00000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1706  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.8 
 
 		 564 aa  70.9  0.00000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.98975  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2086  GAF sensor signal transduction histidine kinase  27.32 
 
 		 372 aa  70.9  0.00000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0443237  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3542  histidine kinase  33.98 
 
 		 431 aa  70.1  0.00000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.787824 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3926  histidine kinase  30.33 
 
 		 598 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2374  sensor histidine kinase  26.15 
 
 		 372 aa  68.6  0.0000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0968027  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3079  sensor histidine kinase  27.18 
 
 		 372 aa  67.8  0.0000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000507367 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2264  sensor histidine kinase  25.6 
 
 		 365 aa  67.4  0.0000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.361221  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2045  sensor histidine kinase  25.6 
 
 		 372 aa  67  0.0000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2289  sensor histidine kinase  25.6 
 
 		 372 aa  67  0.0000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.25894e-17 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2244  sensor histidine kinase  26.67 
 
 		 372 aa  67  0.0000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2108  sensor histidine kinase  25.6 
 
 		 372 aa  67  0.0000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1289  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  29.15 
 
 		 1168 aa  67  0.0000000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2835  putative signal transduction histidine kinase  33.81 
 
 		 371 aa  66.6  0.0000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2047  sensor histidine kinase  25.6 
 
 		 372 aa  66.2  0.000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.362734  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3594  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30 
 
 		 598 aa  66.2  0.000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0613  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.73 
 
 		 645 aa  65.9  0.000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.066657 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0826  Histidine kinase  32.84 
 
 		 412 aa  65.9  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5875  putative signal transduction histidine kinase  39.78 
 
 		 851 aa  65.1  0.000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.339217  normal  0.551311 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3125  putative signal transduction histidine kinase  31.82 
 
 		 351 aa  65.1  0.000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2580  histidine kinase  31.55 
 
 		 422 aa  65.1  0.000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.880661  normal  0.0603036 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1879  putative signal transduction histidine kinase  44.83 
 
 		 368 aa  64.3  0.000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1685  Histidine kinase  28.15 
 
 		 397 aa  64.3  0.000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.842631 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1700  GAF sensor signal transduction histidine kinase  28.64 
 
 		 535 aa  64.7  0.000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0180519 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0341  GAF sensor signal transduction histidine kinase  31.55 
 
 		 725 aa  64.3  0.000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0143238  hitchhiker  0.0051816 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4276  histidine kinase  32.27 
 
 		 309 aa  64.3  0.000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.574796  normal  0.165932 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4303  ATP-binding region ATPase domain protein  32.47 
 
 		 404 aa  64.3  0.000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2292  sensor histidine kinase  25.6 
 
 		 365 aa  63.9  0.000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0974  histidine kinase  28.3 
 
 		 384 aa  63.5  0.000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.103866  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1578  ATPase domain-containing protein  33.17 
 
 		 573 aa  63.5  0.000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.593562 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1108  GAF sensor signal transduction histidine kinase  29.96 
 
 		 464 aa  63.2  0.000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1029  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.34 
 
 		 411 aa  63.2  0.00000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.342445  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0725  histidine kinase  26.29 
 
 		 1036 aa  62.8  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0798  putative signal transduction histidine kinase  33.95 
 
 		 767 aa  62.8  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0833  GAF:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, HAMP region:histidine kinase, dimerization and phosphoacceptor region  28.16 
 
 		 646 aa  62.4  0.00000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0228489 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3373  histidine kinase  28.04 
 
 		 1048 aa  62.4  0.00000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.228028  normal  0.520662 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2810  putative signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 501 aa  62.4  0.00000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5716  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.36 
 
 		 700 aa  62.4  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00700823 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3261  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.59 
 
 		 463 aa  61.6  0.00000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_935  sensor histidine kinase  23.94 
 
 		 1226 aa  61.6  0.00000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1687  signal transduction histidine kinase, nitrate/nitrite-specific, NarQ  30.37 
 
 		 643 aa  61.6  0.00000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.461201  normal  0.659068 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0946  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.24 
 
 		 1229 aa  61.6  0.00000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1064  sensory box sensor histidine kinase  23.81 
 
 		 1101 aa  60.8  0.00000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7054  putative signal transduction histidine kinase  30.81 
 
 		 381 aa  61.2  0.00000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1400  histidine kinase  26.96 
 
 		 413 aa  61.2  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.558809 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1142  Signal transduction histidine kinase  24.26 
 
 		 402 aa  61.2  0.00000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.230499  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1983  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.13 
 
 		 469 aa  60.8  0.00000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.143525 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1998  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  40.38 
 
 		 658 aa  60.8  0.00000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3241  Histidine kinase  35.04 
 
 		 393 aa  60.8  0.00000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0227  GAF sensor signal transduction histidine kinase  29.47 
 
 		 421 aa  60.5  0.00000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1102  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.35 
 
 		 364 aa  60.5  0.00000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2634  ATPase domain-containing protein  30.73 
 
 		 434 aa  60.5  0.00000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0432  signal transduction histidine kinase, nitrate/nitrite-specific, NarQ  27.8 
 
 		 638 aa  60.5  0.00000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2510  multi-sensor signal transduction histidine kinase  41.24 
 
 		 640 aa  60.1  0.00000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0188  histidine kinase  24.2 
 
 		 693 aa  60.1  0.00000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1847  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.86 
 
 		 509 aa  59.3  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.645356  normal  0.352228 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0181  GAF sensor signal transduction histidine kinase  39.13 
 
 		 388 aa  59.3  0.0000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.610235  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2291  histidine kinase  27.35 
 
 		 596 aa  59.3  0.0000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0347  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.65 
 
 		 442 aa  59.3  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0286068  normal  0.880673 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1006  histidine kinase  28.99 
 
 		 967 aa  59.3  0.0000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3747  ATP-binding region ATPase domain protein  28.03 
 
 		 434 aa  59.3  0.0000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>