More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_3125 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_3125  putative signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 351 aa  676    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0280  Signal transduction histidine kinase-like protein  47.19 
 
 		 382 aa  260  3e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39500  signal transduction histidine kinase  42.09 
 
 		 383 aa  216  5.9999999999999996e-55  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.410485 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6058  putative signal transduction histidine kinase  44.2 
 
 		 501 aa  215  7e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7054  putative signal transduction histidine kinase  40.91 
 
 		 381 aa  202  6e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3047  putative signal transduction histidine kinase  42.81 
 
 		 381 aa  190  4e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.118132  normal  0.733528 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3031  putative signal transduction histidine kinase  42.81 
 
 		 381 aa  189  5e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3090  putative signal transduction histidine kinase  42.81 
 
 		 381 aa  189  5e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.237047  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3580  putative signal transduction histidine kinase  46.37 
 
 		 363 aa  176  6e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.79128  normal  0.0360004 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2835  putative signal transduction histidine kinase  36.72 
 
 		 371 aa  175  9.999999999999999e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6597  putative signal transduction histidine kinase  41.33 
 
 		 441 aa  165  9e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4303  ATP-binding region ATPase domain protein  44.21 
 
 		 404 aa  164  3e-39  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0353  putative signal transduction histidine kinase  37.68 
 
 		 401 aa  158  1e-37  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.661618  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1254  putative signal transduction histidine kinase  31.83 
 
 		 458 aa  82.8  0.000000000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.473052  normal  0.219719 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1736  PspC domain protein  31.5 
 
 		 421 aa  76.6  0.0000000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.586033  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3607  ATPase domain-containing protein  30.59 
 
 		 440 aa  76.6  0.0000000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2999  putative signal transduction histidine kinase  32.26 
 
 		 480 aa  67  0.0000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.942912  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04810  signal transduction histidine kinase  33.18 
 
 		 481 aa  66.6  0.0000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6526  putative signal transduction histidine kinase  29.41 
 
 		 444 aa  66.2  0.0000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1108  GAF sensor signal transduction histidine kinase  24.79 
 
 		 464 aa  63.2  0.000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4438  putative signal transduction histidine kinase  32 
 
 		 394 aa  62.8  0.000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.175729  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1770  putative stress-responsive transcriptional regulator  29.15 
 
 		 427 aa  62.8  0.00000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3447  putative signal transduction histidine kinase  30.89 
 
 		 894 aa  61.6  0.00000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3373  histidine kinase  34.21 
 
 		 1048 aa  60.8  0.00000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.228028  normal  0.520662 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0050  putative signal transduction histidine kinase  39.52 
 
 		 739 aa  60.5  0.00000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.300283  normal  0.0383844 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0655  putative signal transduction histidine kinase  29.18 
 
 		 449 aa  60.5  0.00000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.1704 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3230  histidine kinase  31.16 
 
 		 1033 aa  60.1  0.00000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.704109  normal  0.047539 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1600  sensor histidine kinase  26.61 
 
 		 351 aa  60.1  0.00000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000696667  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1362  histidine kinase  27.06 
 
 		 351 aa  60.1  0.00000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0117705  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3405  histidine kinase  39.05 
 
 		 488 aa  59.7  0.00000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.352666  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1387  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.45 
 
 		 367 aa  59.7  0.00000008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.246252  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0709  putative signal transduction histidine kinase  30.94 
 
 		 484 aa  58.9  0.0000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1494  sensor histidine kinase  26.61 
 
 		 351 aa  58.9  0.0000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000467986  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3850  sensor histidine kinase  26.61 
 
 		 351 aa  58.5  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000154691  hitchhiker  0.000000000165716 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3728  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.1 
 
 		 488 aa  58.5  0.0000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0021  transmembrane sensor histidine kinase transcription regulator protein  34.82 
 
 		 487 aa  57  0.0000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.130425  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1321  sensor histidine kinase  26.15 
 
 		 351 aa  57.4  0.0000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000375238  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1320  sensor histidine kinase  26.15 
 
 		 351 aa  57.4  0.0000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00123004  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2326  histidine kinase  30.21 
 
 		 396 aa  57.4  0.0000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1530  sensor histidine kinase  26.15 
 
 		 351 aa  57.4  0.0000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.90364e-25 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1347  sensor histidine kinase  26.15 
 
 		 351 aa  57  0.0000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.31288  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1456  sensor histidine kinase  26.15 
 
 		 351 aa  57  0.0000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00592106  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0648  putative signal transduction histidine kinase  27.97 
 
 		 404 aa  56.6  0.0000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.448149 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1562  sensor histidine kinase  26.15 
 
 		 351 aa  56.6  0.0000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000749794  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5558  Signal transduction histidine kinase-like protein  32.09 
 
 		 417 aa  56.2  0.0000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.379544  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2583  putative two-component system sensor kinase  28.23 
 
 		 394 aa  55.8  0.0000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.589839  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2711  putative signal transduction histidine kinase  27.57 
 
 		 477 aa  55.5  0.000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00959084 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2442  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  25.35 
 
 		 1030 aa  55.5  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.223882  normal  0.750566 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3034  putative signal transduction histidine kinase  32.62 
 
 		 433 aa  55.5  0.000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.494184  hitchhiker  0.00256181 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1406  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.64 
 
 		 484 aa  55.1  0.000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.197112  normal  0.954465 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0278  putative signal transduction histidine kinase  28.57 
 
 		 413 aa  54.7  0.000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0211669  normal  0.0366909 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4281  putative signal transduction histidine kinase  36.21 
 
 		 408 aa  55.1  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.445439  normal  0.105633 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07820  putative histidine kinase  28.2 
 
 		 797 aa  53.9  0.000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0365473 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4215  putative signal transduction histidine kinase  29.69 
 
 		 423 aa  53.9  0.000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0640253 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0744  sensory box histidine kinase  28.2 
 
 		 799 aa  53.5  0.000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.13864  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0914  putative signal transduction histidine kinase  40.86 
 
 		 466 aa  53.1  0.000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1311  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.09 
 
 		 776 aa  52  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.103963 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5875  putative signal transduction histidine kinase  33 
 
 		 851 aa  52  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.339217  normal  0.551311 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1983  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.23 
 
 		 469 aa  52.4  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.143525 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1706  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.19 
 
 		 564 aa  52.4  0.00001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.98975  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1568  histidine kinase  30.24 
 
 		 462 aa  52.8  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1105  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.7 
 
 		 546 aa  52.8  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0188  histidine kinase  18.91 
 
 		 693 aa  51.6  0.00002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3261  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.91 
 
 		 463 aa  51.6  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3825  ATPase domain-containing protein  30.12 
 
 		 441 aa  52  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.331829  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0711  histidine kinase  30.4 
 
 		 337 aa  52  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0974  histidine kinase  40 
 
 		 384 aa  51.2  0.00002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.103866  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1998  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.92 
 
 		 658 aa  51.6  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6084  putative signal transduction histidine kinase  26.8 
 
 		 364 aa  52  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3341  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.9 
 
 		 365 aa  51.6  0.00002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.049327 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1605  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  41.24 
 
 		 431 aa  51.6  0.00002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.430021  normal  0.604384 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2875  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.87 
 
 		 1261 aa  51.6  0.00002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.948484 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1687  signal transduction histidine kinase, nitrate/nitrite-specific, NarQ  29.24 
 
 		 643 aa  51.6  0.00002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.461201  normal  0.659068 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7008  histidine kinase  31.56 
 
 		 402 aa  51.6  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.432266  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0162  putative signal transduction histidine kinase  30 
 
 		 258 aa  50.8  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.632322  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2521  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.15 
 
 		 594 aa  51.2  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0533071  normal  0.360744 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1652  histidine kinase  32.1 
 
 		 373 aa  50.8  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000168648  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0276  Histidine kinase  31.94 
 
 		 387 aa  51.2  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3067  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  30.32 
 
 		 373 aa  51.2  0.00003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0748  GAF sensor signal transduction histidine kinase  28.19 
 
 		 815 aa  51.2  0.00003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5809  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  41.11 
 
 		 366 aa  51.2  0.00003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.325789  normal  0.250191 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1845  histidine kinase  29.72 
 
 		 428 aa  51.2  0.00003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.307294  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0613  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.86 
 
 		 475 aa  50.4  0.00004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0282412 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1485  two-component hybrid sensor and regulator  27.54 
 
 		 575 aa  50.4  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1759  histidine kinase  40.96 
 
 		 596 aa  50.8  0.00004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.37697  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1345  putative membrane sensor histidine kinase  27.54 
 
 		 575 aa  50.8  0.00004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1352  putative membrane sensor histidine kinase  27.54 
 
 		 575 aa  50.8  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2681  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.3 
 
 		 426 aa  50.1  0.00006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.716667 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1899  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.38 
 
 		 694 aa  50.1  0.00006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0149051  hitchhiker  0.00556122 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1937  histidine kinase dimerisation and phosphoacceptor region  23.08 
 
 		 370 aa  50.1  0.00006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000507079  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1903  GAF sensor signal transduction histidine kinase  23.08 
 
 		 370 aa  50.1  0.00006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000111521  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0833  GAF:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, HAMP region:histidine kinase, dimerization and phosphoacceptor region  22.96 
 
 		 646 aa  49.7  0.00007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0228489 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2849  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.29 
 
 		 682 aa  49.7  0.00007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.790064  normal  0.747278 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17350  signal transduction histidine kinase  32.91 
 
 		 419 aa  49.7  0.00007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5296  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.6 
 
 		 776 aa  49.7  0.00008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0902  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.5 
 
 		 509 aa  49.7  0.00008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0723  histidine kinase  26.97 
 
 		 406 aa  49.7  0.00008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1027  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.12 
 
 		 473 aa  49.7  0.00008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3793  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  31.31 
 
 		 373 aa  49.7  0.00008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3526  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.96 
 
 		 584 aa  49.3  0.00009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>