More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_3607 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_3607  ATPase domain-containing protein  100 
 
 		 440 aa  858    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4227  putative signal transduction histidine kinase  42.45 
 
 		 394 aa  292  1e-77  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04810  signal transduction histidine kinase  44.39 
 
 		 481 aa  278  2e-73  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6526  putative signal transduction histidine kinase  42.86 
 
 		 444 aa  278  2e-73  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1254  putative signal transduction histidine kinase  42.01 
 
 		 458 aa  271  2e-71  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.473052  normal  0.219719 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0648  putative signal transduction histidine kinase  40.74 
 
 		 404 aa  267  2.9999999999999995e-70  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.448149 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1650  putative signal transduction histidine kinase  44.6 
 
 		 418 aa  253  6e-66  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.347734  normal  0.354634 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5232  putative signal transduction histidine kinase  44.36 
 
 		 400 aa  249  8e-65  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0452492  hitchhiker  0.00276259 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2583  putative two-component system sensor kinase  43.58 
 
 		 394 aa  246  4.9999999999999997e-64  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.589839  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4215  putative signal transduction histidine kinase  39.72 
 
 		 423 aa  230  3e-59  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0640253 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1770  putative stress-responsive transcriptional regulator  36.56 
 
 		 427 aa  229  6e-59  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0914  putative signal transduction histidine kinase  40.89 
 
 		 466 aa  229  8e-59  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1736  PspC domain protein  40.3 
 
 		 421 aa  228  2e-58  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.586033  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4438  putative signal transduction histidine kinase  54.32 
 
 		 394 aa  226  5.0000000000000005e-58  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.175729  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6084  putative signal transduction histidine kinase  40.73 
 
 		 364 aa  224  2e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3825  ATPase domain-containing protein  42.53 
 
 		 441 aa  221  1.9999999999999999e-56  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.331829  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1228  Signal transduction histidine kinase-like protein  38.76 
 
 		 404 aa  221  3e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.120133  hitchhiker  0.00954124 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0278  putative signal transduction histidine kinase  43 
 
 		 413 aa  219  1e-55  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0211669  normal  0.0366909 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2999  putative signal transduction histidine kinase  47.84 
 
 		 480 aa  212  1e-53  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.942912  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0655  putative signal transduction histidine kinase  35.82 
 
 		 449 aa  210  5e-53  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.1704 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2711  putative signal transduction histidine kinase  43.45 
 
 		 477 aa  200  3.9999999999999996e-50  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00959084 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0709  putative signal transduction histidine kinase  42.48 
 
 		 484 aa  200  5e-50  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28330  signal transduction histidine kinase  43.46 
 
 		 480 aa  191  2.9999999999999997e-47  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.658456  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17350  signal transduction histidine kinase  43.28 
 
 		 419 aa  182  1e-44  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3034  putative signal transduction histidine kinase  52.63 
 
 		 433 aa  177  4e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.494184  hitchhiker  0.00256181 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5725  putative signal transduction histidine kinase  55.06 
 
 		 398 aa  170  6e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.333911  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6043  putative signal transduction histidine kinase  42.94 
 
 		 333 aa  158  2e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5558  Signal transduction histidine kinase-like protein  48.92 
 
 		 417 aa  148  2.0000000000000003e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.379544  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2544  putative signal transduction histidine kinase  49.32 
 
 		 455 aa  146  7.0000000000000006e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.283862  normal  0.629362 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1706  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.74 
 
 		 564 aa  82.4  0.00000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.98975  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1879  putative signal transduction histidine kinase  38.3 
 
 		 368 aa  81.3  0.00000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0280  Signal transduction histidine kinase-like protein  31.88 
 
 		 382 aa  80.1  0.00000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3031  putative signal transduction histidine kinase  33.21 
 
 		 381 aa  73.9  0.000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3090  putative signal transduction histidine kinase  33.21 
 
 		 381 aa  73.9  0.000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.237047  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2835  putative signal transduction histidine kinase  35.83 
 
 		 371 aa  74.3  0.000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0162  putative signal transduction histidine kinase  36.79 
 
 		 258 aa  73.2  0.000000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.632322  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0185  histidine kinase  29.38 
 
 		 395 aa  72.4  0.00000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000303796  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3580  putative signal transduction histidine kinase  35.98 
 
 		 363 aa  73.2  0.00000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.79128  normal  0.0360004 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3064  putative signal transduction histidine kinase  28.43 
 
 		 801 aa  71.2  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.998121  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3047  putative signal transduction histidine kinase  31.56 
 
 		 381 aa  70.1  0.00000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.118132  normal  0.733528 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0276  Histidine kinase  34.39 
 
 		 387 aa  68.9  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0159  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.25 
 
 		 508 aa  68.9  0.0000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2866  histidine kinase  29.44 
 
 		 469 aa  68.9  0.0000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2108  sensor histidine kinase  28 
 
 		 372 aa  67.8  0.0000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2289  sensor histidine kinase  28 
 
 		 372 aa  68.2  0.0000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.25894e-17 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3261  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.5 
 
 		 463 aa  68.2  0.0000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2264  sensor histidine kinase  28 
 
 		 365 aa  67.8  0.0000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.361221  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2045  sensor histidine kinase  28.32 
 
 		 372 aa  67.4  0.0000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6903  putative signal transduction histidine kinase  34.41 
 
 		 780 aa  67.4  0.0000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2374  sensor histidine kinase  28.44 
 
 		 372 aa  67  0.0000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0968027  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2047  sensor histidine kinase  28 
 
 		 372 aa  67  0.0000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.362734  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1685  Histidine kinase  28.16 
 
 		 397 aa  67  0.0000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.842631 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3125  putative signal transduction histidine kinase  31.03 
 
 		 351 aa  66.6  0.0000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1983  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.06 
 
 		 469 aa  66.6  0.0000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.143525 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2292  sensor histidine kinase  28 
 
 		 365 aa  64.3  0.000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0974  histidine kinase  28.57 
 
 		 384 aa  63.9  0.000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.103866  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2810  putative signal transduction histidine kinase  46.05 
 
 		 501 aa  63.9  0.000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2244  sensor histidine kinase  27.56 
 
 		 372 aa  63.5  0.000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2729  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.7 
 
 		 665 aa  63.5  0.000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39500  signal transduction histidine kinase  30.81 
 
 		 383 aa  63.5  0.000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.410485 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1105  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.21 
 
 		 546 aa  62.8  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1268  histidine kinase  26.67 
 
 		 392 aa  62.8  0.00000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0798  putative signal transduction histidine kinase  33.61 
 
 		 767 aa  63.2  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3079  sensor histidine kinase  28 
 
 		 372 aa  61.6  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000507367 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3747  ATP-binding region ATPase domain protein  32.63 
 
 		 434 aa  62  0.00000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2086  GAF sensor signal transduction histidine kinase  26.7 
 
 		 372 aa  61.6  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0443237  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1567  histidine kinase  28.71 
 
 		 452 aa  61.2  0.00000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5875  putative signal transduction histidine kinase  39.09 
 
 		 851 aa  60.5  0.00000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.339217  normal  0.551311 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1289  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  29.35 
 
 		 1168 aa  60.8  0.00000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3447  putative signal transduction histidine kinase  42.86 
 
 		 894 aa  60.8  0.00000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2510  multi-sensor signal transduction histidine kinase  46.84 
 
 		 640 aa  60.5  0.00000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0284  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.73 
 
 		 591 aa  60.5  0.00000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3788  phytochrome  28.57 
 
 		 772 aa  60.5  0.00000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0317187 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3064  GAF sensor signal transduction histidine kinase  29.71 
 
 		 544 aa  60.5  0.00000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.980645 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2703  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.31 
 
 		 552 aa  60.1  0.00000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.191431 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19690  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  22.17 
 
 		 352 aa  59.3  0.0000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4034  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.08 
 
 		 775 aa  59.3  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0321  sensor histidine kinase, putative  25.35 
 
 		 339 aa  58.5  0.0000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0833  GAF:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, HAMP region:histidine kinase, dimerization and phosphoacceptor region  27.52 
 
 		 646 aa  58.9  0.0000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0228489 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3937  putative signal transduction histidine kinase  32.75 
 
 		 396 aa  58.9  0.0000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.24552  normal  0.0307354 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0613  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.1 
 
 		 645 aa  58.5  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.066657 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0946  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.54 
 
 		 1229 aa  58.9  0.0000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3230  histidine kinase  30.52 
 
 		 1033 aa  58.9  0.0000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.704109  normal  0.047539 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0602  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.11 
 
 		 584 aa  58.2  0.0000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.416305  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1568  histidine kinase  29.81 
 
 		 462 aa  57.8  0.0000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0252  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.59 
 
 		 591 aa  58.2  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0165579 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2020  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.6 
 
 		 771 aa  57.8  0.0000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0432  signal transduction histidine kinase, nitrate/nitrite-specific, NarQ  30.33 
 
 		 638 aa  57.8  0.0000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4276  histidine kinase  31.64 
 
 		 309 aa  57.4  0.0000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.574796  normal  0.165932 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0347  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.46 
 
 		 442 aa  57.4  0.0000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0286068  normal  0.880673 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0423  GAF sensor signal transduction histidine kinase  30.92 
 
 		 638 aa  57.4  0.0000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1385  sensor histidine kinase  24.66 
 
 		 377 aa  57  0.0000006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00939681  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2487  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  27.84 
 
 		 412 aa  57.4  0.0000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1064  sensory box sensor histidine kinase  26.57 
 
 		 1101 aa  57  0.0000007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1285  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.03 
 
 		 742 aa  57  0.0000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_935  sensor histidine kinase  27.05 
 
 		 1226 aa  56.6  0.0000008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4834  putative signal transduction histidine kinase  30.46 
 
 		 782 aa  56.6  0.0000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4893  putative signal transduction histidine kinase  25.28 
 
 		 364 aa  56.6  0.0000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0826  Histidine kinase  30.32 
 
 		 412 aa  56.2  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2631  GAF sensor signal transduction histidine kinase  30.88 
 
 		 655 aa  56.2  0.000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>