More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_3064 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_3064  putative signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 801 aa  1614    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.998121  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4226  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.2 
 
 		 682 aa  136  1.9999999999999998e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.203059 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1105  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.74 
 
 		 546 aa  135  3.9999999999999996e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1706  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  38.65 
 
 		 564 aa  128  3e-28  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.98975  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0341  GAF sensor signal transduction histidine kinase  38.24 
 
 		 725 aa  121  4.9999999999999996e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0143238  hitchhiker  0.0051816 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2080  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.19 
 
 		 370 aa  113  1.0000000000000001e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19690  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.91 
 
 		 352 aa  108  5e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3827  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.18 
 
 		 472 aa  106  2e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.935643  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2729  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.96 
 
 		 665 aa  106  2e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1231  histidine kinase  30.36 
 
 		 482 aa  105  4e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3669  histidine kinase  33.21 
 
 		 489 aa  105  5e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1315  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.76 
 
 		 344 aa  104  6e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4230  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.12 
 
 		 478 aa  104  6e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.304751 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0507  Histidine kinase  34.18 
 
 		 373 aa  103  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2027  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  30.09 
 
 		 401 aa  101  4e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.109719  normal  0.72788 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2849  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.88 
 
 		 682 aa  101  7e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.790064  normal  0.747278 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3248  histidine kinase  33.83 
 
 		 403 aa  100  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.298805  normal  0.646005 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0649  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.54 
 
 		 490 aa  100  1e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5206  GAF sensor signal transduction histidine kinase  31.82 
 
 		 523 aa  99  3e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1362  histidine kinase  30.8 
 
 		 351 aa  99  3e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0117705  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5416  sensor histidine kinase  32.37 
 
 		 516 aa  99  3e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3850  sensor histidine kinase  32.57 
 
 		 351 aa  98.6  4e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000154691  hitchhiker  0.000000000165716 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1494  sensor histidine kinase  32.57 
 
 		 351 aa  98.6  4e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000467986  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1321  sensor histidine kinase  32.57 
 
 		 351 aa  98.2  5e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000375238  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1320  sensor histidine kinase  32.57 
 
 		 351 aa  98.2  5e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00123004  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1530  sensor histidine kinase  32.57 
 
 		 351 aa  98.2  5e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.90364e-25 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1347  sensor histidine kinase  32.57 
 
 		 351 aa  98.2  6e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.31288  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1456  sensor histidine kinase  32.57 
 
 		 351 aa  98.2  6e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00592106  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0826  Histidine kinase  32.5 
 
 		 412 aa  97.8  7e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0227  GAF sensor signal transduction histidine kinase  32.24 
 
 		 421 aa  96.7  1e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0814  signal transduction histidine kinase, glucose-6-phosphate specific  30.1 
 
 		 466 aa  96.7  1e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000114737  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0153  histidine kinase  31.87 
 
 		 325 aa  96.3  2e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1562  sensor histidine kinase  30 
 
 		 351 aa  95.9  3e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000749794  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5541  sensor histidine kinase, putative  34.57 
 
 		 523 aa  95.5  3e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1600  sensor histidine kinase  30 
 
 		 351 aa  95.5  3e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000696667  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2521  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.88 
 
 		 594 aa  95.5  3e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0533071  normal  0.360744 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5329  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.75 
 
 		 595 aa  95.1  4e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5536  sensor histidine kinase  31.67 
 
 		 523 aa  95.1  4e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1193  histidine kinase  29.97 
 
 		 497 aa  94.7  5e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0280854  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3498  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.17 
 
 		 596 aa  95.1  5e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00492042 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5264  two-component sensor protein, C-terminus  32.97 
 
 		 193 aa  94.7  6e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0159  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.35 
 
 		 508 aa  94.4  7e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5092  two-component sensor protein  33.51 
 
 		 523 aa  93.6  1e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0276  Histidine kinase  29.91 
 
 		 387 aa  93.6  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2131  sensor histidine kinase  33.33 
 
 		 394 aa  93.2  2e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5109  sensor histidine kinase  33.51 
 
 		 523 aa  93.2  2e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4486  GAF sensor signal transduction histidine kinase  33.64 
 
 		 582 aa  93.2  2e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3391  histidine kinase  33.78 
 
 		 356 aa  93.2  2e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.382044  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5507  sensor histidine kinase  33.51 
 
 		 523 aa  93.2  2e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3926  histidine kinase  33.47 
 
 		 598 aa  92.8  2e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5201  GAF sensor signal transduction histidine kinase  33.78 
 
 		 393 aa  92.4  3e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.849708 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5592  sensor histidine kinase  33.51 
 
 		 523 aa  92.4  3e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1992  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.11 
 
 		 574 aa  92.4  3e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0873865  normal  0.754427 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2810  putative signal transduction histidine kinase  27.95 
 
 		 501 aa  92.4  3e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3594  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.47 
 
 		 598 aa  92.4  3e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6241  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 748 aa  92.4  3e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3542  histidine kinase  31.4 
 
 		 431 aa  92  4e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.787824 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0966  Signal transduction histidine kinase  29.08 
 
 		 332 aa  91.7  4e-17  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.763704  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0252  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.66 
 
 		 591 aa  92  4e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0165579 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1356  histidine kinase  34.21 
 
 		 282 aa  91.7  5e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0235  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.95 
 
 		 402 aa  90.9  7e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1423  sensor histidine kinase VraS  32.16 
 
 		 348 aa  91.3  7e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0789  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.18 
 
 		 469 aa  91.3  7e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1232  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.79 
 
 		 334 aa  90.9  8e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.380961  normal  0.783946 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21830  histidine kinase  31.47 
 
 		 391 aa  90.5  1e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00305219  n/a   
 
 
-
 
NC_013207  Aaci_3079  histidine kinase  32.67 
 
 		 223 aa  90.5  1e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0284  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.66 
 
 		 591 aa  90.1  2e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0408  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.5 
 
 		 357 aa  90.1  2e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.414543  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1941  sensor histidine kinase  35.06 
 
 		 394 aa  89.7  2e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1285  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.06 
 
 		 742 aa  89.7  2e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3044  Sensor DegS domain protein  32.66 
 
 		 381 aa  89.7  2e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000367044  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0064  GAF sensor signal transduction histidine kinase  32 
 
 		 396 aa  89.7  2e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.693223  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0432  signal transduction histidine kinase, nitrate/nitrite-specific, NarQ  31.51 
 
 		 638 aa  89.7  2e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0431  sensory box sensor histidine kinase  32 
 
 		 357 aa  89  3e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.431568  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1159  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.71 
 
 		 355 aa  88.6  4e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1006  histidine kinase  33.8 
 
 		 967 aa  88.6  4e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0602  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.16 
 
 		 584 aa  88.6  4e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.416305  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_373  sensor histidine kinase  32 
 
 		 357 aa  89  4e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0559697  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0939  histidine kinase  31.73 
 
 		 363 aa  88.2  5e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0301  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.66 
 
 		 748 aa  88.2  5e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0442  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.94 
 
 		 485 aa  88.6  5e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.12569  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4564  histidine kinase  33.19 
 
 		 460 aa  88.6  5e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.562879  normal  0.0736505 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4477  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.8 
 
 		 471 aa  88.6  5e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2203  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.35 
 
 		 526 aa  87.8  6e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3956  histidine kinase, dimerization and phosphoacceptor region  33.01 
 
 		 323 aa  87.8  6e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5188  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.19 
 
 		 480 aa  87.8  7e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3993  histidine kinase  37.17 
 
 		 456 aa  87.8  7e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.841388  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5671  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.19 
 
 		 480 aa  87.8  7e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0241273 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1809  histidine kinase  29.39 
 
 		 640 aa  87.8  8e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1029  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.71 
 
 		 411 aa  87.8  8e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.342445  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0614  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.5 
 
 		 468 aa  87.4  8e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1894  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.41 
 
 		 546 aa  87.4  9e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.640259  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1121  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.59 
 
 		 661 aa  87.4  9e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1289  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  25.78 
 
 		 1168 aa  87  0.000000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4005  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.05 
 
 		 801 aa  87  0.000000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1870  signal transduction histidine kinase, nitrate/nitrite-specific, NarQ  32.5 
 
 		 636 aa  87.4  0.000000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5078  histidine kinase  32.09 
 
 		 368 aa  87  0.000000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.9788 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0347  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.1 
 
 		 442 aa  87  0.000000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0286068  normal  0.880673 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1292  sensory box histidine kinase  29.96 
 
 		 384 aa  86.7  0.000000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6470  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.26 
 
 		 471 aa  86.3  0.000000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.629472  normal  0.491206 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>