272 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_28330 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_28330  signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 480 aa  925    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.658456  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0655  putative signal transduction histidine kinase  54.13 
 
 		 449 aa  418  9.999999999999999e-116  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.1704 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0709  putative signal transduction histidine kinase  59.27 
 
 		 484 aa  330  2e-89  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3034  putative signal transduction histidine kinase  56.76 
 
 		 433 aa  320  3e-86  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.494184  hitchhiker  0.00256181 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2544  putative signal transduction histidine kinase  55.04 
 
 		 455 aa  290  5.0000000000000004e-77  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.283862  normal  0.629362 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1770  putative stress-responsive transcriptional regulator  42.11 
 
 		 427 aa  279  7e-74  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4227  putative signal transduction histidine kinase  41.13 
 
 		 394 aa  249  6e-65  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2711  putative signal transduction histidine kinase  45.65 
 
 		 477 aa  242  1e-62  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00959084 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2999  putative signal transduction histidine kinase  49.5 
 
 		 480 aa  242  1e-62  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.942912  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0648  putative signal transduction histidine kinase  39.85 
 
 		 404 aa  236  8e-61  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.448149 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1254  putative signal transduction histidine kinase  38.91 
 
 		 458 aa  231  3e-59  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.473052  normal  0.219719 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3607  ATPase domain-containing protein  39.56 
 
 		 440 aa  228  2e-58  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6526  putative signal transduction histidine kinase  38.97 
 
 		 444 aa  225  1e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0914  putative signal transduction histidine kinase  40.65 
 
 		 466 aa  224  2e-57  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04810  signal transduction histidine kinase  40.46 
 
 		 481 aa  221  1.9999999999999999e-56  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0278  putative signal transduction histidine kinase  40.54 
 
 		 413 aa  221  3e-56  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0211669  normal  0.0366909 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2583  putative two-component system sensor kinase  45.17 
 
 		 394 aa  209  7e-53  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.589839  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1650  putative signal transduction histidine kinase  41.31 
 
 		 418 aa  208  2e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.347734  normal  0.354634 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5232  putative signal transduction histidine kinase  47.6 
 
 		 400 aa  199  6e-50  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0452492  hitchhiker  0.00276259 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1736  PspC domain protein  39.81 
 
 		 421 aa  194  3e-48  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.586033  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1228  Signal transduction histidine kinase-like protein  37.31 
 
 		 404 aa  186  7e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.120133  hitchhiker  0.00954124 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4215  putative signal transduction histidine kinase  38.53 
 
 		 423 aa  186  8e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0640253 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3825  ATPase domain-containing protein  37.95 
 
 		 441 aa  183  6e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.331829  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17350  signal transduction histidine kinase  43.07 
 
 		 419 aa  179  1e-43  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6084  putative signal transduction histidine kinase  39.18 
 
 		 364 aa  172  1e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5558  Signal transduction histidine kinase-like protein  48.45 
 
 		 417 aa  153  5e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.379544  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5725  putative signal transduction histidine kinase  46.99 
 
 		 398 aa  134  3.9999999999999996e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.333911  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6043  putative signal transduction histidine kinase  44.52 
 
 		 333 aa  90.1  8e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3031  putative signal transduction histidine kinase  33.49 
 
 		 381 aa  73.2  0.00000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3090  putative signal transduction histidine kinase  33.49 
 
 		 381 aa  73.2  0.00000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.237047  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3047  putative signal transduction histidine kinase  33.03 
 
 		 381 aa  72  0.00000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.118132  normal  0.733528 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0162  putative signal transduction histidine kinase  35.68 
 
 		 258 aa  71.6  0.00000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.632322  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39500  signal transduction histidine kinase  32.04 
 
 		 383 aa  71.2  0.00000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.410485 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2835  putative signal transduction histidine kinase  33.97 
 
 		 371 aa  71.2  0.00000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0280  Signal transduction histidine kinase-like protein  34.74 
 
 		 382 aa  66.6  0.0000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3230  histidine kinase  32.88 
 
 		 1033 aa  65.9  0.000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.704109  normal  0.047539 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3580  putative signal transduction histidine kinase  33.01 
 
 		 363 aa  65.5  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.79128  normal  0.0360004 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1385  sensor histidine kinase  26.05 
 
 		 377 aa  64.3  0.000000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00939681  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2810  putative signal transduction histidine kinase  30.62 
 
 		 501 aa  62.8  0.00000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3651  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.32 
 
 		 345 aa  62.4  0.00000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.375417  normal  0.773266 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1879  putative signal transduction histidine kinase  32.12 
 
 		 368 aa  61.2  0.00000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0798  putative signal transduction histidine kinase  34.16 
 
 		 767 aa  61.2  0.00000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1706  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.12 
 
 		 564 aa  60.5  0.00000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.98975  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0185  histidine kinase  27.1 
 
 		 395 aa  58.9  0.0000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000303796  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1142  Signal transduction histidine kinase  23.67 
 
 		 402 aa  58.5  0.0000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.230499  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4303  ATP-binding region ATPase domain protein  33.33 
 
 		 404 aa  58.5  0.0000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6058  putative signal transduction histidine kinase  32.85 
 
 		 501 aa  57.8  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19690  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  22.73 
 
 		 352 aa  57.4  0.0000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1285  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.63 
 
 		 742 aa  57.4  0.0000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0760  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.73 
 
 		 610 aa  57.4  0.0000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000018635  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2580  histidine kinase  31.68 
 
 		 422 aa  57.4  0.0000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.880661  normal  0.0603036 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0341  GAF sensor signal transduction histidine kinase  28.97 
 
 		 725 aa  57.4  0.0000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0143238  hitchhiker  0.0051816 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0649  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.54 
 
 		 490 aa  57  0.0000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3238  signal transduction histidine kinase-like protein  30.29 
 
 		 619 aa  57  0.0000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3261  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.4 
 
 		 463 aa  57  0.0000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4276  histidine kinase  32.44 
 
 		 309 aa  56.6  0.0000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.574796  normal  0.165932 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4063  histidine kinase  31.4 
 
 		 249 aa  56.6  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.460066  normal  0.0775473 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4230  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.02 
 
 		 478 aa  56.6  0.000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.304751 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2232  nitrate/nitrite sensor protein NarX  28.57 
 
 		 593 aa  55.5  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5875  putative signal transduction histidine kinase  37.63 
 
 		 851 aa  55.8  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.339217  normal  0.551311 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2522  nitrate/nitrite sensor protein NarX  28.57 
 
 		 380 aa  55.5  0.000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1983  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.71 
 
 		 469 aa  55.8  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.143525 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2123  nitrate/nitrite sensor protein NarX  28.57 
 
 		 593 aa  55.5  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1568  histidine kinase  31.19 
 
 		 462 aa  54.7  0.000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1485  two-component hybrid sensor and regulator  28.24 
 
 		 575 aa  55.1  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3542  histidine kinase  31.73 
 
 		 431 aa  55.1  0.000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.787824 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5445  histidine kinase  32.08 
 
 		 478 aa  55.1  0.000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.403934  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1345  putative membrane sensor histidine kinase  28.24 
 
 		 575 aa  55.1  0.000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1352  putative membrane sensor histidine kinase  28.24 
 
 		 575 aa  55.1  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2414  GAF sensor signal transduction histidine kinase  29.74 
 
 		 545 aa  54.7  0.000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0602  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.72 
 
 		 584 aa  54.7  0.000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.416305  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2882  two-component hybrid sensor and regulator  28.17 
 
 		 740 aa  54.7  0.000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2703  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.99 
 
 		 552 aa  54.3  0.000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.191431 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2291  histidine kinase  27.52 
 
 		 596 aa  53.9  0.000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0325  putative signal transduction histidine kinase  31.29 
 
 		 440 aa  53.5  0.000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3064  GAF sensor signal transduction histidine kinase  28.7 
 
 		 544 aa  53.5  0.000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.980645 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2388  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.7 
 
 		 535 aa  53.5  0.000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.219764  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0507  Histidine kinase  34.17 
 
 		 373 aa  53.5  0.000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0622  histidine kinase  28.03 
 
 		 1013 aa  52.8  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.378276 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7054  putative signal transduction histidine kinase  31.28 
 
 		 381 aa  52.8  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0966  Signal transduction histidine kinase  27.78 
 
 		 332 aa  52.8  0.00001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.763704  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3937  putative signal transduction histidine kinase  31.37 
 
 		 396 aa  52.8  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.24552  normal  0.0307354 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3746  GAF sensor signal transduction histidine kinase  32.85 
 
 		 373 aa  53.1  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.200726  normal  0.275416 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1029  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.43 
 
 		 411 aa  52.4  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.342445  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2866  histidine kinase  30.52 
 
 		 469 aa  52.4  0.00002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3064  putative signal transduction histidine kinase  28.99 
 
 		 801 aa  52  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.998121  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0276  Histidine kinase  31.68 
 
 		 387 aa  52  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4905  Signal transduction histidine kinase-like protein  31.37 
 
 		 731 aa  52.4  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.31139  normal  0.688455 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1809  histidine kinase  29.47 
 
 		 640 aa  52.4  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0321  sensor histidine kinase, putative  24.04 
 
 		 339 aa  51.6  0.00003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3044  Sensor DegS domain protein  25.35 
 
 		 381 aa  51.6  0.00003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000367044  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0821  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.37 
 
 		 473 aa  51.6  0.00003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2535  ATP-binding region ATPase domain protein  29 
 
 		 666 aa  51.6  0.00003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3436  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.75 
 
 		 606 aa  51.6  0.00003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.637225  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4502  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 391 aa  51.6  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00405521  normal  0.0184903 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1122  histidine kinase  27.76 
 
 		 467 aa  51.2  0.00004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.94341 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2964  nitrate/nitrite sensor protein NarQ  30.43 
 
 		 564 aa  51.2  0.00004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.551015 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2631  GAF sensor signal transduction histidine kinase  28.99 
 
 		 655 aa  51.2  0.00004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1268  histidine kinase  22.32 
 
 		 392 aa  50.8  0.00005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0252  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.69 
 
 		 591 aa  50.8  0.00005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0165579 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>