262 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_2544 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014151  Cfla_2544  putative signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 455 aa  858    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.283862  normal  0.629362 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3034  putative signal transduction histidine kinase  63.11 
 
 		 433 aa  392  1e-108  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.494184  hitchhiker  0.00256181 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0709  putative signal transduction histidine kinase  59.76 
 
 		 484 aa  349  6e-95  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28330  signal transduction histidine kinase  55.96 
 
 		 480 aa  328  1.0000000000000001e-88  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.658456  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0655  putative signal transduction histidine kinase  46.8 
 
 		 449 aa  306  7e-82  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.1704 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1770  putative stress-responsive transcriptional regulator  42.15 
 
 		 427 aa  286  4e-76  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4227  putative signal transduction histidine kinase  43.2 
 
 		 394 aa  234  2.0000000000000002e-60  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2711  putative signal transduction histidine kinase  39.54 
 
 		 477 aa  230  3e-59  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00959084 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1254  putative signal transduction histidine kinase  41.36 
 
 		 458 aa  231  3e-59  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.473052  normal  0.219719 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6526  putative signal transduction histidine kinase  41.74 
 
 		 444 aa  227  3e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04810  signal transduction histidine kinase  40.09 
 
 		 481 aa  223  6e-57  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3607  ATPase domain-containing protein  41.24 
 
 		 440 aa  218  2e-55  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0648  putative signal transduction histidine kinase  39.09 
 
 		 404 aa  216  5e-55  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.448149 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4438  putative signal transduction histidine kinase  44.6 
 
 		 394 aa  213  4.9999999999999996e-54  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.175729  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0278  putative signal transduction histidine kinase  43.25 
 
 		 413 aa  213  7e-54  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0211669  normal  0.0366909 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1736  PspC domain protein  39.09 
 
 		 421 aa  212  9e-54  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.586033  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0914  putative signal transduction histidine kinase  41.76 
 
 		 466 aa  211  2e-53  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2999  putative signal transduction histidine kinase  51.33 
 
 		 480 aa  211  3e-53  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.942912  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4215  putative signal transduction histidine kinase  41.08 
 
 		 423 aa  195  1e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0640253 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1650  putative signal transduction histidine kinase  40.09 
 
 		 418 aa  193  5e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.347734  normal  0.354634 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3825  ATPase domain-containing protein  39.56 
 
 		 441 aa  189  5.999999999999999e-47  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.331829  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6084  putative signal transduction histidine kinase  51.98 
 
 		 364 aa  181  2.9999999999999997e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2583  putative two-component system sensor kinase  52.51 
 
 		 394 aa  179  1e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.589839  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5232  putative signal transduction histidine kinase  40.24 
 
 		 400 aa  174  2.9999999999999996e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0452492  hitchhiker  0.00276259 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1228  Signal transduction histidine kinase-like protein  38.52 
 
 		 404 aa  167  2.9999999999999998e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.120133  hitchhiker  0.00954124 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17350  signal transduction histidine kinase  42.82 
 
 		 419 aa  164  2.0000000000000002e-39  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5558  Signal transduction histidine kinase-like protein  46.84 
 
 		 417 aa  142  9.999999999999999e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.379544  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6043  putative signal transduction histidine kinase  41.34 
 
 		 333 aa  117  6e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5725  putative signal transduction histidine kinase  44.51 
 
 		 398 aa  112  1.0000000000000001e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.333911  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0162  putative signal transduction histidine kinase  35.58 
 
 		 258 aa  70.1  0.00000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.632322  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3031  putative signal transduction histidine kinase  30.89 
 
 		 381 aa  67.8  0.0000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3090  putative signal transduction histidine kinase  30.89 
 
 		 381 aa  67.8  0.0000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.237047  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39500  signal transduction histidine kinase  33.18 
 
 		 383 aa  66.2  0.000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.410485 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3047  putative signal transduction histidine kinase  33.19 
 
 		 381 aa  66.2  0.000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.118132  normal  0.733528 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3580  putative signal transduction histidine kinase  36.06 
 
 		 363 aa  65.1  0.000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.79128  normal  0.0360004 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2835  putative signal transduction histidine kinase  31.13 
 
 		 371 aa  64.3  0.000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3230  histidine kinase  31.53 
 
 		 1033 aa  63.5  0.000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.704109  normal  0.047539 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21830  histidine kinase  24.55 
 
 		 391 aa  63.2  0.000000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00305219  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0280  Signal transduction histidine kinase-like protein  33.18 
 
 		 382 aa  62  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1285  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.57 
 
 		 742 aa  61.6  0.00000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0826  Histidine kinase  32.87 
 
 		 412 aa  59.7  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1102  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.17 
 
 		 364 aa  59.3  0.0000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1700  GAF sensor signal transduction histidine kinase  27.19 
 
 		 535 aa  58.9  0.0000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0180519 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2912  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  23.5 
 
 		 339 aa  59.3  0.0000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0798  putative signal transduction histidine kinase  34.33 
 
 		 767 aa  58.5  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01200  sensory histidine kinase in two-component regulatory system with NarL  32.84 
 
 		 598 aa  58.2  0.0000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.690529  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2424  histidine kinase  32.84 
 
 		 598 aa  58.2  0.0000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0527369  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01210  hypothetical protein  32.84 
 
 		 598 aa  58.2  0.0000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.678292  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1705  nitrate/nitrite sensor protein NarX  32.84 
 
 		 598 aa  58.2  0.0000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.55706  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1918  nitrate/nitrite sensor protein NarX  32.84 
 
 		 598 aa  58.2  0.0000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0184147  normal  0.168413 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2401  nitrate/nitrite sensor protein NarX  32.84 
 
 		 598 aa  58.2  0.0000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000322457 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1372  nitrate/nitrite sensor protein NarX  32.84 
 
 		 598 aa  58.2  0.0000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.497152  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1331  nitrate/nitrite sensor protein NarX  32.84 
 
 		 598 aa  58.2  0.0000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.150699  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0833  GAF:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, HAMP region:histidine kinase, dimerization and phosphoacceptor region  28.84 
 
 		 646 aa  57.8  0.0000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0228489 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2899  nitrate/nitrite sensor protein NarX  31.66 
 
 		 594 aa  57.8  0.0000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3447  putative signal transduction histidine kinase  35.35 
 
 		 894 aa  57  0.0000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0982  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.47 
 
 		 346 aa  57  0.0000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1677  GAF sensor signal transduction histidine kinase  26.94 
 
 		 770 aa  57  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2043  histidine kinase  24.68 
 
 		 388 aa  56.6  0.0000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19690  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.47 
 
 		 352 aa  56.2  0.000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1601  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.62 
 
 		 581 aa  56.2  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0821  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.55 
 
 		 473 aa  55.8  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01475  histidine kinase sensor protein  26 
 
 		 668 aa  55.5  0.000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.399099  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2107  histidine kinase  25.24 
 
 		 379 aa  55.5  0.000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1389  nitrate/nitrite sensor protein NarX  32.35 
 
 		 598 aa  55.1  0.000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0922186  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2497  histidine kinase  27.93 
 
 		 1031 aa  55.1  0.000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0918719  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0188  histidine kinase  20.64 
 
 		 693 aa  55.1  0.000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1387  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.99 
 
 		 367 aa  55.1  0.000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.246252  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0760  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.05 
 
 		 610 aa  54.7  0.000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000018635  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4605  histidine kinase  29.38 
 
 		 403 aa  55.1  0.000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.506334 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3087  PAS sensor signal transduction histidine kinase  28.96 
 
 		 312 aa  54.3  0.000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.230742  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2810  putative signal transduction histidine kinase  30.69 
 
 		 501 aa  54.7  0.000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1105  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.82 
 
 		 546 aa  54.3  0.000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3651  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.78 
 
 		 345 aa  53.9  0.000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.375417  normal  0.773266 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1706  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.04 
 
 		 564 aa  53.5  0.000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.98975  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0613  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  27.64 
 
 		 645 aa  53.1  0.000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.066657 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3151  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.85 
 
 		 453 aa  53.1  0.00001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6597  putative signal transduction histidine kinase  39.34 
 
 		 441 aa  53.1  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2261  nitrate/nitrite sensor protein NarX  29.55 
 
 		 602 aa  52.8  0.00001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0999245  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2712  nitrate/nitrite sensor protein NarQ  29.06 
 
 		 572 aa  52.8  0.00001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1879  putative signal transduction histidine kinase  32.98 
 
 		 368 aa  52.4  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7054  putative signal transduction histidine kinase  31.09 
 
 		 381 aa  52  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2882  two-component hybrid sensor and regulator  27.62 
 
 		 740 aa  52  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3064  putative signal transduction histidine kinase  29.13 
 
 		 801 aa  52  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.998121  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1568  histidine kinase  30.77 
 
 		 462 aa  52.4  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2232  nitrate/nitrite sensor protein NarX  27.15 
 
 		 593 aa  52.4  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3460  putative signal transduction histidine kinase  28.22 
 
 		 556 aa  52.4  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2244  sensor histidine kinase  26.5 
 
 		 372 aa  52.4  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2388  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.93 
 
 		 535 aa  52.4  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.219764  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2203  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  24.44 
 
 		 526 aa  52.4  0.00002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1687  signal transduction histidine kinase, nitrate/nitrite-specific, NarQ  31.73 
 
 		 643 aa  52  0.00002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.461201  normal  0.659068 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4905  Signal transduction histidine kinase-like protein  32.63 
 
 		 731 aa  52.4  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.31139  normal  0.688455 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4276  histidine kinase  32.88 
 
 		 309 aa  52  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.574796  normal  0.165932 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2123  nitrate/nitrite sensor protein NarX  27.15 
 
 		 593 aa  52.4  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1289  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  28.02 
 
 		 1168 aa  51.6  0.00003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6058  putative signal transduction histidine kinase  33.04 
 
 		 501 aa  51.6  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1308  GAF sensor signal transduction histidine kinase  28.57 
 
 		 381 aa  51.6  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000110665  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0614  nitrate/nitrite sensor protein NarQ  24.77 
 
 		 583 aa  51.2  0.00004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.797988  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0276  Histidine kinase  35.29 
 
 		 387 aa  51.2  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2567  nitrate/nitrite sensor protein NarX  28.64 
 
 		 623 aa  50.8  0.00005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>