More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_0613 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_0613  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 645 aa  1298    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.066657 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3594  histidine kinase  49.83 
 
 		 626 aa  529  1e-149  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.2055  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0448  putative signal transduction histidine kinase  40.3 
 
 		 615 aa  408  1.0000000000000001e-112  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.844769  normal  0.742785 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0806  histidine kinase  38.58 
 
 		 921 aa  369  1e-100  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5166  two-component sensor histidine kinase  38.59 
 
 		 640 aa  365  1e-99  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.312086  normal  0.337439 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1633  putative signal transduction histidine kinase  27.92 
 
 		 636 aa  170  7e-41  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0985206 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4987  putative sensor signal transduction histidine kinase  27.85 
 
 		 661 aa  157  5.0000000000000005e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.244609 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0380  histidine kinase  27.96 
 
 		 657 aa  152  1e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.810149  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3238  signal transduction histidine kinase-like protein  28.88 
 
 		 619 aa  146  1e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3160  two component sensor histidine kinase transcription regulator protein  28.06 
 
 		 626 aa  137  4e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0803  putative signal transduction histidine kinase  26.94 
 
 		 624 aa  138  4e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4085  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.7 
 
 		 652 aa  131  5.0000000000000004e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6034  histidine kinase  26.09 
 
 		 659 aa  128  3e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.717786  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3372  putative signal transduction histidine kinase  25.21 
 
 		 618 aa  127  5e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3951  histidine kinase  27.88 
 
 		 625 aa  127  6e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.283359 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3516  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  26.21 
 
 		 614 aa  111  3e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.510113  hitchhiker  0.00329665 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0744  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.87 
 
 		 660 aa  110  6e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0378  putative signal transduction histidine kinase  25.85 
 
 		 652 aa  104  5e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2918  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.42 
 
 		 658 aa  101  3e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1783  histidine kinase  34.01 
 
 		 501 aa  100  7e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000211372 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0940  putative signal transduction histidine kinase  25.4 
 
 		 614 aa  99.8  2e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4477  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.64 
 
 		 471 aa  95.9  2e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0789  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.72 
 
 		 469 aa  94.7  5e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3594  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.89 
 
 		 598 aa  92.8  2e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3956  histidine kinase, dimerization and phosphoacceptor region  34.34 
 
 		 323 aa  89.4  2e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1265  two-component sensor histidine kinase  31.31 
 
 		 585 aa  89.4  2e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3926  histidine kinase  30.15 
 
 		 598 aa  88.6  3e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3622  signal transduction histidine kinase-like protein  27.53 
 
 		 483 aa  87.4  8e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0396591  normal  0.169833 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1685  Histidine kinase  29.66 
 
 		 397 aa  86.3  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.842631 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1285  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.4 
 
 		 742 aa  85.1  0.000000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0159  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.72 
 
 		 508 aa  84.3  0.000000000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6470  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.6 
 
 		 471 aa  84.3  0.000000000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.629472  normal  0.491206 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1485  two-component hybrid sensor and regulator  30.22 
 
 		 575 aa  82.4  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2388  histidine kinase  29.89 
 
 		 653 aa  82.8  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.255891  normal  0.393123 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4503  histidine kinase  30.36 
 
 		 643 aa  82.8  0.00000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.604782 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1352  putative membrane sensor histidine kinase  30.22 
 
 		 575 aa  82.4  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3187  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.96 
 
 		 459 aa  82  0.00000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.134921 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1345  putative membrane sensor histidine kinase  29.85 
 
 		 575 aa  82  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0895  sensor histidine kinase  29.41 
 
 		 451 aa  82  0.00000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.622783  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6236  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.82 
 
 		 553 aa  82  0.00000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.914679 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2521  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.17 
 
 		 594 aa  81.6  0.00000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0533071  normal  0.360744 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4564  histidine kinase  30.89 
 
 		 460 aa  81.3  0.00000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.562879  normal  0.0736505 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4896  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.64 
 
 		 517 aa  80.9  0.00000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0133704  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6579  Histidine kinase  34.32 
 
 		 689 aa  80.9  0.00000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.218867  normal  0.148163 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5188  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.89 
 
 		 480 aa  80.5  0.00000000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5671  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.89 
 
 		 480 aa  80.5  0.00000000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0241273 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0235  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.49 
 
 		 402 aa  79.7  0.0000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0456  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.74 
 
 		 775 aa  79.7  0.0000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00143274 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2542  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.86 
 
 		 476 aa  79.7  0.0000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0866412  normal  0.0241376 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7760  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.28 
 
 		 486 aa  80.5  0.0000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003135  sensor histidine kinase  30.2 
 
 		 451 aa  79.3  0.0000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.291514  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6208  histidine kinase  29.1 
 
 		 657 aa  79.7  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3254  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.12 
 
 		 561 aa  79.3  0.0000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2912  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.1 
 
 		 339 aa  78.6  0.0000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5127  PAS/PAC sensor Signal transduction histidine kinase  32.76 
 
 		 799 aa  79  0.0000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2882  two-component hybrid sensor and regulator  29.23 
 
 		 740 aa  78.6  0.0000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1400  histidine kinase  30 
 
 		 413 aa  78.6  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.558809 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0744  sensory box histidine kinase  30.08 
 
 		 799 aa  78.2  0.0000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.13864  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6559  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.56 
 
 		 541 aa  78.2  0.0000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.59439 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0027  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.8 
 
 		 461 aa  78.2  0.0000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.755533 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4945  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.36 
 
 		 459 aa  78.6  0.0000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0549839 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5497  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.36 
 
 		 459 aa  77.8  0.0000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00170786 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0778  methanol utilization control sensor protein moxY, putative  31.54 
 
 		 439 aa  77.8  0.0000000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.125881  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3872  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.73 
 
 		 376 aa  77.8  0.0000000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0238476  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3744  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.57 
 
 		 412 aa  78.2  0.0000000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3230  histidine kinase  27.47 
 
 		 1033 aa  78.2  0.0000000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.704109  normal  0.047539 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3261  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.46 
 
 		 463 aa  77.8  0.0000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02702  histidine kinase  31.37 
 
 		 456 aa  77.8  0.0000000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4230  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.09 
 
 		 478 aa  77.8  0.0000000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.304751 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1644  histidine kinase  32.84 
 
 		 296 aa  77.4  0.0000000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.518526  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2729  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.58 
 
 		 665 aa  77.4  0.0000000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41030  Periplasmic sensory histidine protein kinase, two-component  28.15 
 
 		 458 aa  77  0.0000000000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0649951  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0732  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.62 
 
 		 812 aa  77  0.0000000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.113199  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2070  sensor histidine kinase  31.48 
 
 		 466 aa  76.6  0.000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2580  histidine kinase  34.33 
 
 		 422 aa  77  0.000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.880661  normal  0.0603036 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2510  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.22 
 
 		 640 aa  77  0.000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2483  histidine kinase  49.43 
 
 		 401 aa  77  0.000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0411509  normal  0.969327 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3132  putative sensor histidine kinase  31.78 
 
 		 466 aa  76.6  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2660  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.03 
 
 		 494 aa  76.3  0.000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.575282 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4257  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.42 
 
 		 425 aa  75.9  0.000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.944202  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2549  GAF sensor signal transduction histidine kinase  30.91 
 
 		 456 aa  76.3  0.000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1462  sensor kinase protein  31.48 
 
 		 466 aa  76.3  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1099  sensor histidine kinase  31.48 
 
 		 466 aa  75.9  0.000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0227  GAF sensor signal transduction histidine kinase  30.28 
 
 		 421 aa  76.3  0.000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1378  sensor histidine kinase  31.48 
 
 		 466 aa  75.9  0.000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.922617  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3247  putative sensor histidine kinase  31.48 
 
 		 466 aa  76.3  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2363  sensor histidine kinase  31.48 
 
 		 466 aa  75.9  0.000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1983  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.13 
 
 		 469 aa  75.5  0.000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.143525 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0817  signal transduction histidine kinase, glucose-6-phosphate specific  29.95 
 
 		 466 aa  75.5  0.000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000394288  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4552  histidine kinase  29.7 
 
 		 738 aa  75.5  0.000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00113459  normal  0.0314449 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07820  putative histidine kinase  29.79 
 
 		 797 aa  75.5  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0365473 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3668  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.29 
 
 		 650 aa  75.1  0.000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3023  response regulator  27.83 
 
 		 597 aa  75.1  0.000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000011368  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4226  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.63 
 
 		 682 aa  75.1  0.000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.203059 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1006  histidine kinase  29.87 
 
 		 967 aa  75.1  0.000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1654  GAF sensor signal transduction histidine kinase  32.13 
 
 		 567 aa  75.1  0.000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.309377  normal  0.649993 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21830  histidine kinase  26.17 
 
 		 391 aa  74.7  0.000000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00305219  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3993  histidine kinase  31.47 
 
 		 456 aa  74.7  0.000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.841388  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5321  histidine kinase  31.25 
 
 		 470 aa  74.7  0.000000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3498  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.47 
 
 		 596 aa  74.3  0.000000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00492042 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>