More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_3516 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007802  Jann_3516  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 614 aa  1238    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.510113  hitchhiker  0.00329665 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4987  putative sensor signal transduction histidine kinase  26.92 
 
 		 661 aa  166  1.0000000000000001e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.244609 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0803  putative signal transduction histidine kinase  27.5 
 
 		 624 aa  166  2.0000000000000002e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0380  histidine kinase  28.82 
 
 		 657 aa  161  3e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.810149  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1633  putative signal transduction histidine kinase  30.19 
 
 		 636 aa  161  4e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0985206 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4085  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.76 
 
 		 652 aa  143  9.999999999999999e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3160  two component sensor histidine kinase transcription regulator protein  26.35 
 
 		 626 aa  142  3e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2542  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.39 
 
 		 476 aa  123  8e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0866412  normal  0.0241376 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6034  histidine kinase  30.28 
 
 		 659 aa  119  1.9999999999999998e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.717786  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3622  signal transduction histidine kinase-like protein  30.72 
 
 		 483 aa  119  1.9999999999999998e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0396591  normal  0.169833 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0378  putative signal transduction histidine kinase  25 
 
 		 652 aa  111  3e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0940  putative signal transduction histidine kinase  24.53 
 
 		 614 aa  110  7.000000000000001e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0613  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  25.7 
 
 		 645 aa  110  9.000000000000001e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.066657 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3594  histidine kinase  26.47 
 
 		 626 aa  107  5e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.2055  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0448  putative signal transduction histidine kinase  25.83 
 
 		 615 aa  104  4e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.844769  normal  0.742785 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3372  putative signal transduction histidine kinase  23.72 
 
 		 618 aa  101  3e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3951  histidine kinase  24.74 
 
 		 625 aa  96.7  1e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.283359 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3238  signal transduction histidine kinase-like protein  22.41 
 
 		 619 aa  95.9  2e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0806  histidine kinase  24.22 
 
 		 921 aa  94.7  5e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1543  putative signal transduction histidine kinase  33.96 
 
 		 413 aa  92.8  2e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1773  putative signal transduction histidine kinase  34.69 
 
 		 277 aa  89.4  2e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3381  putative signal transduction histidine kinase  31.7 
 
 		 305 aa  84  0.000000000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.303158 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5166  two-component sensor histidine kinase  30 
 
 		 640 aa  83.6  0.00000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.312086  normal  0.337439 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2549  GAF sensor signal transduction histidine kinase  34.78 
 
 		 456 aa  80.9  0.00000000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3908  GAF sensor signal transduction histidine kinase  28.79 
 
 		 423 aa  80.9  0.00000000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5558  histidine kinase  30.16 
 
 		 620 aa  80.5  0.00000000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.810149  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5739  putative signal transduction histidine kinase  28.33 
 
 		 412 aa  80.5  0.00000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3101  histidine kinase  33.33 
 
 		 1037 aa  80.1  0.0000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.377571  normal  0.147743 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0456  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.41 
 
 		 775 aa  77.8  0.0000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00143274 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5321  putative signal transduction histidine kinase  27.62 
 
 		 417 aa  77  0.0000000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0967984  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3373  histidine kinase  27.68 
 
 		 1048 aa  75.9  0.000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.228028  normal  0.520662 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4642  putative signal transduction histidine kinase  31.91 
 
 		 412 aa  75.9  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03552  sensory histidine kinase in two-component regulatory sytem with UhpA  29.28 
 
 		 500 aa  75.1  0.000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0035  histidine kinase  29.28 
 
 		 500 aa  75.1  0.000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4176  sensory histidine kinase UhpB  29.28 
 
 		 497 aa  75.1  0.000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4564  histidine kinase  34.76 
 
 		 460 aa  75.5  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.562879  normal  0.0736505 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3881  sensory histidine kinase UhpB  29.28 
 
 		 497 aa  75.1  0.000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03494  hypothetical protein  29.28 
 
 		 500 aa  75.1  0.000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2334  sensor histidine kinase  29.96 
 
 		 470 aa  75.5  0.000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5188  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.76 
 
 		 480 aa  75.1  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5671  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.76 
 
 		 480 aa  75.1  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0241273 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4251  sensory histidine kinase UhpB  29.28 
 
 		 497 aa  75.1  0.000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0031  sensory histidine kinase UhpB  29.28 
 
 		 500 aa  75.1  0.000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3132  putative sensor histidine kinase  30.53 
 
 		 466 aa  75.1  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01515  sensor histidine kinase  30.17 
 
 		 447 aa  74.7  0.000000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19690  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.57 
 
 		 352 aa  74.7  0.000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5098  sensory histidine kinase UhpB  29.28 
 
 		 501 aa  74.7  0.000000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.118457 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2497  histidine kinase  30.64 
 
 		 1031 aa  74.3  0.000000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0918719  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0027  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.29 
 
 		 461 aa  74.3  0.000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.755533 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0789  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.14 
 
 		 469 aa  74.3  0.000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1744  histidine kinase  32.5 
 
 		 399 aa  74.3  0.000000000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.376505  normal  0.0197179 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1462  sensor kinase protein  30.53 
 
 		 466 aa  74.3  0.000000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4945  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.88 
 
 		 459 aa  73.9  0.000000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0549839 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3247  putative sensor histidine kinase  30.53 
 
 		 466 aa  74.3  0.000000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4033  sensory histidine kinase UhpB  28.83 
 
 		 500 aa  73.6  0.00000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.406028 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6208  histidine kinase  26 
 
 		 657 aa  73.2  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0213  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.22 
 
 		 397 aa  73.2  0.00000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5497  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.47 
 
 		 459 aa  73.6  0.00000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00170786 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2903  transmembrane sensor kinase vsrA transcription regulator protein  30.89 
 
 		 459 aa  73.6  0.00000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.419301  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5967  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.54 
 
 		 605 aa  73.2  0.00000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.142305 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0725  histidine kinase  31 
 
 		 1036 aa  72.4  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3085  putative two component signal transduction protein  33.47 
 
 		 467 aa  72  0.00000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3575  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.2 
 
 		 475 aa  72  0.00000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1099  sensor histidine kinase  30.09 
 
 		 466 aa  72  0.00000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1378  sensor histidine kinase  30.09 
 
 		 466 aa  72  0.00000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.922617  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2363  sensor histidine kinase  30.09 
 
 		 466 aa  72  0.00000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1265  histidine kinase  33.19 
 
 		 386 aa  71.6  0.00000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.99067 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1809  histidine kinase  30.62 
 
 		 640 aa  71.6  0.00000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5260  ComP, putative  26.14 
 
 		 772 aa  71.6  0.00000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1880  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.3 
 
 		 662 aa  71.6  0.00000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0862215  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1108  GAF sensor signal transduction histidine kinase  28.77 
 
 		 464 aa  71.2  0.00000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1998  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.92 
 
 		 658 aa  71.2  0.00000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1400  histidine kinase  30.39 
 
 		 413 aa  71.2  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.558809 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0133  sensory histidine kinase UhpB  29.39 
 
 		 513 aa  71.2  0.00000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4249  putative PAS/PAC sensor protein  30.74 
 
 		 579 aa  70.9  0.00000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.279897 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4477  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.11 
 
 		 471 aa  70.9  0.00000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0744  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.47 
 
 		 660 aa  70.5  0.00000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0106  membrane-associated sensory histidine kinase-like ATPase  27.72 
 
 		 632 aa  70.5  0.00000000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.100844  normal  0.392929 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2043  histidine kinase  28.29 
 
 		 388 aa  70.5  0.00000000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4178  sensory histidine kinase UhpB  28.83 
 
 		 500 aa  69.7  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4015  sensory histidine kinase UhpB  28.83 
 
 		 500 aa  69.7  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2070  sensor histidine kinase  30.4 
 
 		 466 aa  70.1  0.0000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3187  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.78 
 
 		 459 aa  69.7  0.0000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.134921 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0835  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.93 
 
 		 513 aa  69.7  0.0000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.506396  normal  0.822234 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0028  sensory histidine kinase UhpB  29.63 
 
 		 499 aa  70.1  0.0000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.457313 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1965  histidine kinase  30.89 
 
 		 662 aa  69.7  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.632766  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0649  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.05 
 
 		 490 aa  70.1  0.0000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3999  sensory histidine kinase UhpB  28.83 
 
 		 500 aa  69.7  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1608  histidine kinase  37.61 
 
 		 565 aa  69.3  0.0000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4120  sensory histidine kinase UhpB  28.83 
 
 		 500 aa  69.7  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.44208  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1687  signal transduction histidine kinase, nitrate/nitrite-specific, NarQ  30.41 
 
 		 643 aa  69.3  0.0000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.461201  normal  0.659068 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5452  sensor histidine kinase  28.45 
 
 		 556 aa  68.9  0.0000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2036  histidine kinase  33.78 
 
 		 381 aa  68.6  0.0000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.103366 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2388  histidine kinase  28.92 
 
 		 653 aa  68.9  0.0000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.255891  normal  0.393123 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6490  ATP-binding region ATPase domain protein  22.89 
 
 		 636 aa  68.6  0.0000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3993  histidine kinase  32.38 
 
 		 456 aa  68.6  0.0000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.841388  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0384  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.38 
 
 		 348 aa  68.2  0.0000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0766  histidine kinase  31.78 
 
 		 464 aa  68.6  0.0000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.701174  normal  0.667801 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1808  histidine kinase  29.66 
 
 		 461 aa  68.6  0.0000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0582  signal transduction histidine kinase-like protein  30.08 
 
 		 394 aa  68.2  0.0000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>