More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_2542 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_2542  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 476 aa  966    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0866412  normal  0.0241376 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3381  putative signal transduction histidine kinase  37.44 
 
 		 305 aa  124  3e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.303158 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3516  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.39 
 
 		 614 aa  123  6e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.510113  hitchhiker  0.00329665 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4987  putative sensor signal transduction histidine kinase  30.63 
 
 		 661 aa  116  8.999999999999998e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.244609 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0803  putative signal transduction histidine kinase  34.5 
 
 		 624 aa  109  1e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1773  putative signal transduction histidine kinase  36.32 
 
 		 277 aa  106  7e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6034  histidine kinase  33.33 
 
 		 659 aa  102  1e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.717786  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4085  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.16 
 
 		 652 aa  100  8e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0380  histidine kinase  34.2 
 
 		 657 aa  99.8  1e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.810149  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3622  signal transduction histidine kinase-like protein  29.15 
 
 		 483 aa  99  2e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0396591  normal  0.169833 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3160  two component sensor histidine kinase transcription regulator protein  32.82 
 
 		 626 aa  97.1  6e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3951  histidine kinase  30.3 
 
 		 625 aa  92.4  1e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.283359 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0378  putative signal transduction histidine kinase  31.09 
 
 		 652 aa  92.4  1e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3238  signal transduction histidine kinase-like protein  30.73 
 
 		 619 aa  91.3  4e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1633  putative signal transduction histidine kinase  32.67 
 
 		 636 aa  90.1  8e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0985206 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3594  histidine kinase  34.17 
 
 		 626 aa  89.4  1e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.2055  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3372  putative signal transduction histidine kinase  32.24 
 
 		 618 aa  86.3  0.000000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1913  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.89 
 
 		 700 aa  83.6  0.000000000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.6571 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2580  histidine kinase  32.38 
 
 		 422 aa  83.2  0.000000000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.880661  normal  0.0603036 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0966  Signal transduction histidine kinase  29.39 
 
 		 332 aa  82.4  0.00000000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.763704  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06146  sensory box histidine kinase  34.83 
 
 		 710 aa  82  0.00000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0682167  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01020  sensory box histidine kinase  34.83 
 
 		 710 aa  82  0.00000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0755055  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5166  two-component sensor histidine kinase  34.38 
 
 		 640 aa  80.9  0.00000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.312086  normal  0.337439 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33000  PAS domain S-box  31.19 
 
 		 547 aa  80.5  0.00000000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.569309  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6031  Histidine kinase  32.55 
 
 		 338 aa  79.7  0.00000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.542402  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3391  histidine kinase  33.76 
 
 		 356 aa  79.7  0.0000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.382044  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3261  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.23 
 
 		 463 aa  79.7  0.0000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0940  putative signal transduction histidine kinase  30 
 
 		 614 aa  78.2  0.0000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3924  PAS/PAC sensor Signal transduction histidine kinase  29.81 
 
 		 363 aa  78.2  0.0000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.278559  hitchhiker  0.00726573 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2634  histidine kinase  31.94 
 
 		 343 aa  77.8  0.0000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000175326  hitchhiker  0.00557176 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6402  putative signal transduction histidine kinase  33.16 
 
 		 271 aa  77  0.0000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.274276 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1543  putative signal transduction histidine kinase  29.32 
 
 		 413 aa  76.6  0.0000000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0814  signal transduction histidine kinase, glucose-6-phosphate specific  30.62 
 
 		 466 aa  77  0.0000000000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000114737  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3908  GAF sensor signal transduction histidine kinase  30.04 
 
 		 423 aa  77  0.0000000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5078  histidine kinase  34.35 
 
 		 368 aa  76.3  0.000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.9788 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1006  histidine kinase  28.3 
 
 		 967 aa  76.3  0.000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2203  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.89 
 
 		 526 aa  75.1  0.000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5321  putative signal transduction histidine kinase  33.17 
 
 		 417 aa  74.7  0.000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0967984  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8792  Signal transduction histidine kinase-like protein  30.5 
 
 		 380 aa  75.1  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.524564  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0895  sensor histidine kinase  25.48 
 
 		 451 aa  74.7  0.000000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.622783  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0778  methanol utilization control sensor protein moxY, putative  29.15 
 
 		 439 aa  73.9  0.000000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.125881  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1564  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  30.52 
 
 		 395 aa  73.9  0.000000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1983  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.75 
 
 		 469 aa  73.9  0.000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.143525 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3073  putative signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 271 aa  73.6  0.000000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0153  histidine kinase  30.88 
 
 		 325 aa  73.6  0.000000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6559  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.41 
 
 		 541 aa  73.6  0.000000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.59439 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3054  putative signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 271 aa  73.6  0.000000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.552919  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0631  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.92 
 
 		 381 aa  72.8  0.00000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000982334  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0431  sensory box sensor histidine kinase  30.05 
 
 		 357 aa  72.4  0.00000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.431568  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0662  sensor histidine kinase  31.46 
 
 		 381 aa  72  0.00000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7700  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.11 
 
 		 541 aa  72  0.00000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.163324  normal  0.507763 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3575  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.88 
 
 		 475 aa  72  0.00000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_600  sensor histidine kinase  31.46 
 
 		 381 aa  72  0.00000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0751439  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3099  putative signal transduction histidine kinase  31.19 
 
 		 271 aa  72.4  0.00000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.568452  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3594  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.99 
 
 		 598 aa  72.4  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3482  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.05 
 
 		 489 aa  72.4  0.00000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.063872  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3495  signal transduction histidine kinase-like protein  31.53 
 
 		 410 aa  72.4  0.00000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0736574  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1399  PAS  28.57 
 
 		 683 aa  71.6  0.00000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.04458 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1401  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  39.62 
 
 		 384 aa  71.6  0.00000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1685  Histidine kinase  26.25 
 
 		 397 aa  71.2  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.842631 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3119  ATPase domain-containing protein  29.82 
 
 		 535 aa  71.6  0.00000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0622  histidine kinase  30.62 
 
 		 1013 aa  71.2  0.00000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.378276 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3956  histidine kinase, dimerization and phosphoacceptor region  28.17 
 
 		 323 aa  71.2  0.00000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1652  histidine kinase  32.71 
 
 		 373 aa  71.2  0.00000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000168648  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2965  putative signal transduction histidine kinase  32.32 
 
 		 271 aa  70.9  0.00000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.314596 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0649  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.84 
 
 		 490 aa  70.9  0.00000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3926  histidine kinase  30.99 
 
 		 598 aa  70.9  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5739  putative signal transduction histidine kinase  30.24 
 
 		 412 aa  70.5  0.00000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5329  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.81 
 
 		 595 aa  70.5  0.00000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1550  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  30.05 
 
 		 350 aa  70.9  0.00000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.711179 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1352  putative membrane sensor histidine kinase  30.1 
 
 		 575 aa  70.5  0.00000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4921  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.6 
 
 		 412 aa  70.5  0.00000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0892179  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3498  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.99 
 
 		 596 aa  70.1  0.00000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00492042 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1485  two-component hybrid sensor and regulator  30.1 
 
 		 575 aa  70.1  0.00000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0554  Histidine kinase  29.53 
 
 		 687 aa  70.1  0.00000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.158949  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2487  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.08 
 
 		 412 aa  70.1  0.00000000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1345  putative membrane sensor histidine kinase  30.1 
 
 		 575 aa  70.1  0.00000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6981  histidine kinase  30.69 
 
 		 389 aa  70.1  0.00000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.69549  normal  0.8933 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2131  sensor histidine kinase  29.91 
 
 		 394 aa  70.1  0.00000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1880  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.04 
 
 		 662 aa  70.1  0.00000000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0862215  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1644  histidine kinase  29.49 
 
 		 296 aa  70.1  0.00000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.518526  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0409  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.11 
 
 		 795 aa  69.7  0.0000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1108  GAF sensor signal transduction histidine kinase  30.56 
 
 		 464 aa  69.3  0.0000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0117  serine/threonine protein kinase and signal transduction histidine kinase with GAF and PAS/PAC sensor  28.91 
 
 		 2361 aa  69.3  0.0000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5321  histidine kinase  32.27 
 
 		 470 aa  69.7  0.0000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2882  two-component hybrid sensor and regulator  30.1 
 
 		 740 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2564  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  49.43 
 
 		 388 aa  69.3  0.0000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.214404  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0754  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.92 
 
 		 384 aa  69.7  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.961024  normal  0.0913306 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0443  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.11 
 
 		 795 aa  69.7  0.0000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.351986  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0357  sensor histidine kinase  28.14 
 
 		 459 aa  69.7  0.0000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.450318  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0408  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.51 
 
 		 357 aa  68.9  0.0000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.414543  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1101  sensor histidine kinase, putative  25.94 
 
 		 405 aa  68.9  0.0000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0744  sensory box histidine kinase  32.55 
 
 		 799 aa  68.9  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.13864  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2056  histidine kinase  30.39 
 
 		 475 aa  68.9  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0440  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.38 
 
 		 795 aa  68.9  0.0000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0294  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.44 
 
 		 410 aa  68.6  0.0000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_373  sensor histidine kinase  29.58 
 
 		 357 aa  69.3  0.0000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0559697  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4898  ATPase domain-containing protein  31.68 
 
 		 491 aa  68.6  0.0000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.246184  normal  0.165682 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003135  sensor histidine kinase  25.33 
 
 		 451 aa  68.9  0.0000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.291514  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5408  histidine kinase  28.5 
 
 		 494 aa  68.6  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0406252  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>