More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_1543 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_1543  putative signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 413 aa  842    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1678  putative PAS/PAC sensor protein  33 
 
 		 625 aa  127  4.0000000000000003e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0321383  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6208  histidine kinase  28.27 
 
 		 657 aa  107  3e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1119  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.89 
 
 		 502 aa  100  7e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.092302  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1685  diguanylate cyclase  28.81 
 
 		 385 aa  99.8  8e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0888  sensor histidine kinase, putative  24.8 
 
 		 364 aa  97.8  3e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000307966  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3516  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.96 
 
 		 614 aa  92.4  1e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.510113  hitchhiker  0.00329665 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2966  GGDEF  25.94 
 
 		 378 aa  87.8  3e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.682773  normal  0.664944 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0257  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.51 
 
 		 404 aa  86.7  8e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.5208 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0184  putative signal transduction histidine kinase  24.5 
 
 		 390 aa  85.1  0.000000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.709555  normal  0.941469 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1913  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.15 
 
 		 700 aa  84.7  0.000000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.6571 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17340  intracellular sensory histidine protein kinase, two component  26.64 
 
 		 356 aa  84  0.000000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0803  putative signal transduction histidine kinase  25.93 
 
 		 624 aa  84  0.000000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1668  histidine kinase  26.01 
 
 		 298 aa  81.6  0.00000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.891257 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3101  histidine kinase  27.1 
 
 		 1037 aa  82  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.377571  normal  0.147743 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3872  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.96 
 
 		 376 aa  81.3  0.00000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0238476  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06146  sensory box histidine kinase  28.14 
 
 		 710 aa  81.6  0.00000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0682167  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01020  sensory box histidine kinase  28.14 
 
 		 710 aa  81.6  0.00000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0755055  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2714  putative signal transduction histidine kinase  28.29 
 
 		 614 aa  80.9  0.00000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3594  histidine kinase  29.21 
 
 		 626 aa  80.5  0.00000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.2055  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4858  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.23 
 
 		 382 aa  80.5  0.00000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.935263  normal  0.172343 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5452  sensor histidine kinase  27.38 
 
 		 556 aa  80.1  0.00000000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3238  signal transduction histidine kinase-like protein  26.83 
 
 		 619 aa  79.7  0.00000000000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6050  histidine kinase  29.52 
 
 		 442 aa  79  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1928  GAF sensor signal transduction histidine kinase  31.19 
 
 		 652 aa  78.2  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.18674  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1285  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.93 
 
 		 742 aa  78.6  0.0000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3951  histidine kinase  28.77 
 
 		 625 aa  78.2  0.0000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.283359 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0380  histidine kinase  21.88 
 
 		 657 aa  77.8  0.0000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.810149  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1265  histidine kinase  28.35 
 
 		 386 aa  78.2  0.0000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.99067 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3614  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.27 
 
 		 298 aa  77.8  0.0000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.753486  normal  0.27992 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4255  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.89 
 
 		 703 aa  77.4  0.0000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2228  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.27 
 
 		 654 aa  77.4  0.0000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.728607  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5151  histidine kinase  26.24 
 
 		 376 aa  77.4  0.0000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2542  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.32 
 
 		 476 aa  77  0.0000000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0866412  normal  0.0241376 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2483  histidine kinase  22.19 
 
 		 514 aa  76.6  0.0000000000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.705062  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01000  signal transduction histidine kinase  31.66 
 
 		 372 aa  76.6  0.0000000000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0507  Histidine kinase  27.8 
 
 		 373 aa  76.6  0.0000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0835  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.9 
 
 		 513 aa  76.6  0.0000000000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.506396  normal  0.822234 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0654  histidine kinase  28.77 
 
 		 385 aa  76.6  0.0000000000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1268  histidine kinase  27.62 
 
 		 392 aa  76.3  0.0000000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2605  Histidine kinase  25.2 
 
 		 650 aa  76.3  0.0000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.209527  normal  0.327771 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0346  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.11 
 
 		 359 aa  75.9  0.000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.35429  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0708  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  26.61 
 
 		 553 aa  75.9  0.000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013207  Aaci_3079  histidine kinase  26.98 
 
 		 223 aa  75.9  0.000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0353  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.11 
 
 		 359 aa  75.9  0.000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6470  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.91 
 
 		 471 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.629472  normal  0.491206 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02210  signal transduction histidine kinase  21.99 
 
 		 372 aa  75.1  0.000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0744  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.75 
 
 		 660 aa  75.5  0.000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0348  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.57 
 
 		 359 aa  75.1  0.000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2127  sensor histidine kinase  25.75 
 
 		 313 aa  74.3  0.000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.289713  normal  0.113702 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5051  sensor histidine kinase  26.24 
 
 		 376 aa  74.7  0.000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29930  signal transduction histidine kinase  25.84 
 
 		 451 aa  74.3  0.000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.293273  normal  0.79172 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6579  Histidine kinase  27.37 
 
 		 689 aa  74.7  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.218867  normal  0.148163 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08896  putative transmembrane protein  28.7 
 
 		 680 aa  74.3  0.000000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1685  Histidine kinase  26.76 
 
 		 397 aa  74.7  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.842631 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5483  sensor histidine kinase  25.37 
 
 		 376 aa  74.3  0.000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5201  sensor histidine kinase  25.37 
 
 		 376 aa  74.3  0.000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0664  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.07 
 
 		 640 aa  74.3  0.000000000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5598  sensor histidine kinase  25.37 
 
 		 376 aa  74.3  0.000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0356  histidine kinase  25 
 
 		 359 aa  74.3  0.000000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.143013  decreased coverage  0.0000000113905 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3230  histidine kinase  24.66 
 
 		 1033 aa  73.9  0.000000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.704109  normal  0.047539 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5476  sensor histidine kinase  26.11 
 
 		 376 aa  73.9  0.000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.324928  hitchhiker  0.0000000000347721 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0877  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  26.15 
 
 		 474 aa  73.6  0.000000000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.858486  normal  0.37178 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4159  histidine kinase  23.79 
 
 		 1017 aa  73.6  0.000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0934723  normal  0.139569 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01310  signal transduction histidine kinase  24.64 
 
 		 421 aa  73.6  0.000000000007  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.192062  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5035  sensor histidine kinase  25.37 
 
 		 376 aa  73.2  0.000000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1633  putative signal transduction histidine kinase  28.69 
 
 		 636 aa  72.8  0.000000000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0985206 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5445  sensor histidine kinase  25.37 
 
 		 376 aa  73.2  0.000000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4276  histidine kinase  29.58 
 
 		 309 aa  72.4  0.00000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.574796  normal  0.165932 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5549  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  24.89 
 
 		 370 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.441753  normal  0.532681 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0564  putative signal transduction histidine kinase  28.78 
 
 		 383 aa  72.4  0.00000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1006  histidine kinase  24.75 
 
 		 967 aa  72.4  0.00000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1551  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  23.05 
 
 		 407 aa  72.8  0.00000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.538677  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0744  sensory box histidine kinase  28.1 
 
 		 799 aa  72.8  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.13864  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4257  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.97 
 
 		 425 aa  71.6  0.00000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.944202  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1399  PAS  27.62 
 
 		 683 aa  71.6  0.00000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.04458 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1573  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, dimerization and phosphoacceptor region  28.44 
 
 		 373 aa  72  0.00000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2249  response regulator/GGDEF domain-containing protein  26.32 
 
 		 400 aa  72  0.00000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1070  histidine kinase  23.86 
 
 		 430 aa  72  0.00000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5476  sensor histidine kinase  24.88 
 
 		 376 aa  72  0.00000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.412372  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5497  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.03 
 
 		 459 aa  72  0.00000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00170786 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4921  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27 
 
 		 412 aa  71.6  0.00000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0892179  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4001  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.56 
 
 		 700 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0106  membrane-associated sensory histidine kinase-like ATPase  29.21 
 
 		 632 aa  71.6  0.00000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.100844  normal  0.392929 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1029  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.02 
 
 		 411 aa  71.6  0.00000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.342445  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4366  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.56 
 
 		 700 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0437  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.02 
 
 		 513 aa  72  0.00000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0347  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.18 
 
 		 442 aa  72.4  0.00000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0286068  normal  0.880673 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5532  sensor histidine kinase  25.74 
 
 		 376 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4477  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.91 
 
 		 471 aa  72  0.00000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1027  putative transmembrane sensor histidine kinase transcription regulator protein  29.52 
 
 		 456 aa  72  0.00000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.573227  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6241  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.03 
 
 		 748 aa  72.4  0.00000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2111  ATP-binding region ATPase domain protein  26.85 
 
 		 645 aa  71.2  0.00000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.184163  normal  0.230765 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2603  Histidine kinase  27.81 
 
 		 720 aa  71.2  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00739798  normal  0.140215 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5988  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.56 
 
 		 700 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2626  putative signal transduction histidine kinase  28.57 
 
 		 372 aa  70.9  0.00000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3993  histidine kinase  29.19 
 
 		 456 aa  70.9  0.00000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.841388  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3821  sensor histidine kinase, putative  29.1 
 
 		 380 aa  70.9  0.00000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4945  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  27.03 
 
 		 459 aa  70.9  0.00000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0549839 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5127  PAS/PAC sensor Signal transduction histidine kinase  28.64 
 
 		 799 aa  70.9  0.00000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>