More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_0803 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_0803  putative signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 624 aa  1226    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3516  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  27.32 
 
 		 614 aa  160  6e-38  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.510113  hitchhiker  0.00329665 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3160  two component sensor histidine kinase transcription regulator protein  28.76 
 
 		 626 aa  151  4e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4085  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.71 
 
 		 652 aa  147  4.0000000000000006e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4987  putative sensor signal transduction histidine kinase  28.49 
 
 		 661 aa  144  6e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.244609 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0380  histidine kinase  28.93 
 
 		 657 aa  142  1.9999999999999998e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.810149  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3594  histidine kinase  28.46 
 
 		 626 aa  141  3.9999999999999997e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.2055  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0613  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  26.75 
 
 		 645 aa  130  1.0000000000000001e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.066657 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0378  putative signal transduction histidine kinase  27.64 
 
 		 652 aa  129  2.0000000000000002e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0940  putative signal transduction histidine kinase  26.93 
 
 		 614 aa  127  6e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3372  putative signal transduction histidine kinase  26.06 
 
 		 618 aa  121  3.9999999999999996e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6034  histidine kinase  31.67 
 
 		 659 aa  120  6e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.717786  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3622  signal transduction histidine kinase-like protein  34.24 
 
 		 483 aa  118  3e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0396591  normal  0.169833 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2542  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 476 aa  109  1e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0866412  normal  0.0241376 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1633  putative signal transduction histidine kinase  27.19 
 
 		 636 aa  105  3e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0985206 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0806  histidine kinase  26.78 
 
 		 921 aa  102  3e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3951  histidine kinase  32.88 
 
 		 625 aa  99.4  2e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.283359 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3238  signal transduction histidine kinase-like protein  25.09 
 
 		 619 aa  96.3  1e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1006  histidine kinase  33.66 
 
 		 967 aa  92  3e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08500  signal transduction histidine kinase  35.1 
 
 		 420 aa  90.1  1e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.115699  normal  0.612619 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5078  histidine kinase  37.44 
 
 		 368 aa  89.7  2e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.9788 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5035  sensor histidine kinase  24.57 
 
 		 376 aa  88.6  3e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5445  sensor histidine kinase  24.57 
 
 		 376 aa  89  3e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0448  putative signal transduction histidine kinase  24.46 
 
 		 615 aa  88.2  4e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.844769  normal  0.742785 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5051  sensor histidine kinase  22.79 
 
 		 376 aa  87.4  8e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5201  sensor histidine kinase  26.09 
 
 		 376 aa  86.3  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5598  sensor histidine kinase  26.09 
 
 		 376 aa  86.3  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1351  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.91 
 
 		 394 aa  84.3  0.000000000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.403859  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1543  putative signal transduction histidine kinase  25.93 
 
 		 413 aa  84  0.000000000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2821  histidine kinase  35.29 
 
 		 423 aa  83.6  0.000000000000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0543421  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5476  sensor histidine kinase  24.48 
 
 		 376 aa  83.6  0.00000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.412372  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5476  sensor histidine kinase  23.1 
 
 		 376 aa  82.4  0.00000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.324928  hitchhiker  0.0000000000347721 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5166  two-component sensor histidine kinase  28.57 
 
 		 640 aa  82.8  0.00000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.312086  normal  0.337439 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4277  histidine kinase  28.64 
 
 		 659 aa  82.8  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.186124 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1697  histidine kinase  32.98 
 
 		 664 aa  82  0.00000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.182651 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5483  sensor histidine kinase  25.22 
 
 		 376 aa  81.3  0.00000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0456  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.15 
 
 		 775 aa  81.6  0.00000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00143274 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1647  histidine kinase  33.78 
 
 		 308 aa  80.9  0.00000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.97721 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1685  Histidine kinase  30.18 
 
 		 397 aa  80.9  0.00000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.842631 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5532  sensor histidine kinase  25.22 
 
 		 376 aa  79.7  0.0000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0442  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.2 
 
 		 485 aa  79.7  0.0000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.12569  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2942  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.44 
 
 		 333 aa  79.3  0.0000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.940404  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1615  histidine kinase  34.38 
 
 		 407 aa  79  0.0000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0650745  normal  0.0536208 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5151  histidine kinase  23.18 
 
 		 376 aa  78.2  0.0000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2064  histidine kinase  34.39 
 
 		 400 aa  78.2  0.0000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.673954 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1872  sensor histidine kinase  28.22 
 
 		 1046 aa  77.8  0.0000000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0200  Signal transduction histidine kinase-like protein  37.19 
 
 		 424 aa  77  0.0000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0106  membrane-associated sensory histidine kinase-like ATPase  26.29 
 
 		 632 aa  76.6  0.000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.100844  normal  0.392929 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1773  putative signal transduction histidine kinase  32.84 
 
 		 277 aa  75.9  0.000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0184  putative signal transduction histidine kinase  34.85 
 
 		 390 aa  76.3  0.000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.709555  normal  0.941469 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1232  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.3 
 
 		 334 aa  76.3  0.000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.380961  normal  0.783946 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3872  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.57 
 
 		 376 aa  75.1  0.000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0238476  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1029  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.06 
 
 		 411 aa  75.1  0.000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.342445  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1385  sensor histidine kinase  27.83 
 
 		 377 aa  74.7  0.000000000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00939681  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1872  histidine kinase  33.74 
 
 		 422 aa  74.7  0.000000000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.235373  normal  0.411466 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2521  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.64 
 
 		 594 aa  74.3  0.000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0533071  normal  0.360744 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1108  GAF sensor signal transduction histidine kinase  29.6 
 
 		 464 aa  74.3  0.000000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0918  histidine kinase  27.69 
 
 		 405 aa  74.3  0.000000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1568  histidine kinase  31.08 
 
 		 462 aa  73.9  0.000000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1400  histidine kinase  30 
 
 		 413 aa  74.3  0.000000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.558809 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3381  putative signal transduction histidine kinase  33.77 
 
 		 305 aa  73.9  0.000000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.303158 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0888  sensor histidine kinase, putative  27.27 
 
 		 364 aa  73.2  0.00000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000307966  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3926  histidine kinase  32.89 
 
 		 598 aa  73.2  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0778  methanol utilization control sensor protein moxY, putative  30.08 
 
 		 439 aa  72.8  0.00000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.125881  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0276  Histidine kinase  32.59 
 
 		 387 aa  72.8  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1236  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.5 
 
 		 692 aa  72.4  0.00000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1265  histidine kinase  32.79 
 
 		 386 aa  72.8  0.00000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.99067 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0744  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.62 
 
 		 660 aa  72.8  0.00000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1941  sensor histidine kinase  32.55 
 
 		 394 aa  72  0.00000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6208  histidine kinase  26.82 
 
 		 657 aa  72  0.00000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0153  histidine kinase  34.06 
 
 		 325 aa  72  0.00000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1101  sensor histidine kinase, putative  25.42 
 
 		 405 aa  71.6  0.00000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0028  sensory histidine kinase UhpB  28.38 
 
 		 499 aa  71.6  0.00000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.457313 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5739  putative signal transduction histidine kinase  30.67 
 
 		 412 aa  71.2  0.00000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3999  sensory histidine kinase UhpB  26.61 
 
 		 500 aa  71.2  0.00000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4015  sensory histidine kinase UhpB  26.61 
 
 		 500 aa  71.2  0.00000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3594  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.89 
 
 		 598 aa  71.2  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3908  GAF sensor signal transduction histidine kinase  30.3 
 
 		 423 aa  71.2  0.00000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1316  sensor histidine protein kinase  28.57 
 
 		 525 aa  70.9  0.00000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.176896  normal  0.0650582 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4033  sensory histidine kinase UhpB  27.47 
 
 		 500 aa  70.9  0.00000000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.406028 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0357  sensor histidine kinase  29.79 
 
 		 459 aa  70.5  0.00000000008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.450318  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2136  histidine kinase  28.42 
 
 		 638 aa  70.5  0.00000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.204065  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1347  sensor histidine kinase  26.42 
 
 		 351 aa  70.5  0.00000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.31288  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1321  sensor histidine kinase  26.42 
 
 		 351 aa  70.5  0.00000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000375238  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1320  sensor histidine kinase  26.42 
 
 		 351 aa  70.5  0.00000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00123004  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06146  sensory box histidine kinase  33.04 
 
 		 710 aa  70.5  0.00000000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0682167  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01020  sensory box histidine kinase  33.04 
 
 		 710 aa  70.5  0.00000000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0755055  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1456  sensor histidine kinase  26.42 
 
 		 351 aa  70.5  0.00000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00592106  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1530  sensor histidine kinase  26.42 
 
 		 351 aa  70.5  0.00000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.90364e-25 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0952  histidine kinase  33.66 
 
 		 408 aa  70.1  0.0000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.849135  normal  0.301378 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4921  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.74 
 
 		 412 aa  70.1  0.0000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0892179  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3669  histidine kinase  32.3 
 
 		 489 aa  70.1  0.0000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4854  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.18 
 
 		 394 aa  70.5  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0459585  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1121  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.86 
 
 		 661 aa  70.1  0.0000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2634  histidine kinase  33.49 
 
 		 343 aa  68.9  0.0000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000175326  hitchhiker  0.00557176 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0213  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.03 
 
 		 397 aa  69.7  0.0000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4120  sensory histidine kinase UhpB  26.18 
 
 		 500 aa  69.3  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.44208  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0760  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.7 
 
 		 610 aa  69.3  0.0000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000018635  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4898  ATPase domain-containing protein  32.39 
 
 		 491 aa  69.3  0.0000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.246184  normal  0.165682 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20450  signal transduction histidine kinase  27.46 
 
 		 441 aa  68.9  0.0000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0107895  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>