More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtpsy_1773 on replicon NC_011992
Organism: Acidovorax ebreus TPSY



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_1773  putative signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 277 aa  541  1e-153  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3381  putative signal transduction histidine kinase  41.23 
 
 		 305 aa  135  5e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.303158 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2542  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.32 
 
 		 476 aa  124  2e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0866412  normal  0.0241376 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3516  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.69 
 
 		 614 aa  100  2e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.510113  hitchhiker  0.00329665 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3372  putative signal transduction histidine kinase  37.79 
 
 		 618 aa  90.5  3e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3622  signal transduction histidine kinase-like protein  33.48 
 
 		 483 aa  90.5  3e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0396591  normal  0.169833 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0378  putative signal transduction histidine kinase  34.78 
 
 		 652 aa  89  8e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0803  putative signal transduction histidine kinase  32.84 
 
 		 624 aa  86.3  4e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4987  putative sensor signal transduction histidine kinase  31.22 
 
 		 661 aa  85.9  7e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.244609 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1633  putative signal transduction histidine kinase  32.87 
 
 		 636 aa  83.6  0.000000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0985206 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6034  histidine kinase  37.5 
 
 		 659 aa  81.6  0.00000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.717786  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0380  histidine kinase  33.51 
 
 		 657 aa  80.9  0.00000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.810149  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4085  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.2 
 
 		 652 aa  78.6  0.0000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3160  two component sensor histidine kinase transcription regulator protein  32.77 
 
 		 626 aa  76.6  0.0000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3951  histidine kinase  28.5 
 
 		 625 aa  74.3  0.000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.283359 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3594  histidine kinase  32.8 
 
 		 626 aa  73.6  0.000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.2055  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0321  sensor histidine kinase, putative  27.83 
 
 		 339 aa  73.2  0.000000000005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6313  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.63 
 
 		 448 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1006  histidine kinase  28.11 
 
 		 967 aa  71.6  0.00000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0940  putative signal transduction histidine kinase  33.78 
 
 		 614 aa  71.6  0.00000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0456  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.63 
 
 		 775 aa  71.6  0.00000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00143274 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3614  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.12 
 
 		 298 aa  69.7  0.00000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.753486  normal  0.27992 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2127  sensor histidine kinase  30.29 
 
 		 313 aa  68.6  0.0000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.289713  normal  0.113702 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0613  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.5 
 
 		 645 aa  68.2  0.0000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.066657 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3238  signal transduction histidine kinase-like protein  29.61 
 
 		 619 aa  67  0.0000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1538  putative PAS/PAC sensor protein  30.37 
 
 		 495 aa  66.6  0.0000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0806  histidine kinase  28.71 
 
 		 921 aa  66.2  0.0000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4255  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.17 
 
 		 703 aa  65.5  0.0000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1400  histidine kinase  28.23 
 
 		 413 aa  65.1  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.558809 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08896  putative transmembrane protein  23.79 
 
 		 680 aa  65.1  0.000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2080  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.4 
 
 		 370 aa  64.3  0.000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0448  putative signal transduction histidine kinase  28.42 
 
 		 615 aa  64.7  0.000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.844769  normal  0.742785 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1668  histidine kinase  29.68 
 
 		 298 aa  64.3  0.000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.891257 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3744  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.02 
 
 		 412 aa  63.9  0.000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1543  putative signal transduction histidine kinase  24.88 
 
 		 413 aa  63.9  0.000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1077  GAF sensor signal transduction histidine kinase  29.91 
 
 		 566 aa  63.9  0.000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1093  GAF sensor signal transduction histidine kinase  29.91 
 
 		 566 aa  63.9  0.000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.209887 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1104  GAF sensor signal transduction histidine kinase  29.91 
 
 		 566 aa  63.9  0.000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0022  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  26.67 
 
 		 487 aa  63.2  0.000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000238684 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1268  histidine kinase  30.05 
 
 		 392 aa  62.8  0.000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1851  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  28.36 
 
 		 450 aa  62.8  0.000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6241  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.86 
 
 		 748 aa  62.8  0.000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1644  histidine kinase  29.55 
 
 		 296 aa  62.8  0.000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.518526  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3937  histidine kinase  26.07 
 
 		 366 aa  62.4  0.000000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0383335  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2027  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  26.74 
 
 		 401 aa  61.6  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.109719  normal  0.72788 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0437  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32 
 
 		 513 aa  61.6  0.00000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4738  histidine kinase  24.64 
 
 		 264 aa  62  0.00000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.977544  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0582  signal transduction histidine kinase-like protein  30.59 
 
 		 394 aa  62  0.00000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6490  ATP-binding region ATPase domain protein  27.1 
 
 		 636 aa  60.8  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3956  histidine kinase, dimerization and phosphoacceptor region  27.78 
 
 		 323 aa  61.2  0.00000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0725  histidine kinase  23.7 
 
 		 1036 aa  60.8  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4001  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.7 
 
 		 700 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4366  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.7 
 
 		 700 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2908  histidine kinase  27.54 
 
 		 246 aa  60.5  0.00000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.108136  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2549  GAF sensor signal transduction histidine kinase  27.36 
 
 		 456 aa  60.5  0.00000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1399  PAS  27.01 
 
 		 683 aa  60.1  0.00000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.04458 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1988  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.63 
 
 		 730 aa  60.1  0.00000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.465421  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13153  two component system sensor histidine kinase devS  29.53 
 
 		 578 aa  60.1  0.00000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0028  sensory histidine kinase UhpB  30.73 
 
 		 499 aa  59.7  0.00000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.457313 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4226  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.24 
 
 		 682 aa  59.7  0.00000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.203059 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0910  sensory box histidine kinase/response regulator  30.09 
 
 		 463 aa  59.3  0.00000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0380  sensory box histidine kinase/response regulator  30.09 
 
 		 463 aa  59.7  0.00000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3821  sensor histidine kinase, putative  25.2 
 
 		 380 aa  59.7  0.00000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1842  response regulator/sensory box histidine kinase  30.09 
 
 		 492 aa  59.7  0.00000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1432  sensory box histidine kinase/response regulator  30.09 
 
 		 492 aa  59.7  0.00000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.188442  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0472  sensory box histidine kinase/response regulator  30.09 
 
 		 492 aa  59.7  0.00000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.798891  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0176  sensory box histidine kinase/response regulator  30.09 
 
 		 492 aa  59.7  0.00000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1932  Signal transduction histidine kinase  30.09 
 
 		 492 aa  59.3  0.00000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0476253  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18330  histidine kinase  29.28 
 
 		 382 aa  59.3  0.00000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1530  sensor histidine kinase  26.73 
 
 		 351 aa  59.3  0.00000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.90364e-25 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1321  sensor histidine kinase  26.73 
 
 		 351 aa  59.3  0.00000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000375238  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1320  sensor histidine kinase  26.73 
 
 		 351 aa  59.3  0.00000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00123004  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0227  GAF sensor signal transduction histidine kinase  28.97 
 
 		 421 aa  59.3  0.00000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3280  histidine kinase  29.92 
 
 		 664 aa  59.3  0.00000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00155771  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0432  signal transduction histidine kinase, nitrate/nitrite-specific, NarQ  31.28 
 
 		 638 aa  59.3  0.00000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5549  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.3 
 
 		 370 aa  58.9  0.00000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.441753  normal  0.532681 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1347  sensor histidine kinase  26.73 
 
 		 351 aa  58.9  0.00000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.31288  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4502  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.61 
 
 		 391 aa  58.9  0.00000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00405521  normal  0.0184903 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1456  sensor histidine kinase  26.73 
 
 		 351 aa  58.9  0.00000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00592106  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0423  GAF sensor signal transduction histidine kinase  31.28 
 
 		 638 aa  58.9  0.00000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03530  signal transduction histidine kinase  31.1 
 
 		 484 aa  58.5  0.0000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0011  histidine kinase  34.07 
 
 		 261 aa  58.5  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5739  putative signal transduction histidine kinase  26.44 
 
 		 412 aa  58.5  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3765  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.57 
 
 		 638 aa  58.2  0.0000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06146  sensory box histidine kinase  28.84 
 
 		 710 aa  57.8  0.0000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0682167  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1651  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.24 
 
 		 703 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.658025  normal  0.250867 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1239  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.57 
 
 		 358 aa  57.4  0.0000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0721  putative signal transduction histidine kinase  27.35 
 
 		 989 aa  57.8  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0872972  normal  0.491998 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4125  putative signal transduction histidine kinase  28.7 
 
 		 568 aa  58.2  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4200  GAF sensor signal transduction histidine kinase  28.7 
 
 		 568 aa  58.2  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.112122  normal  0.730315 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4178  sensory histidine kinase UhpB  29.52 
 
 		 500 aa  57.8  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4120  sensory histidine kinase UhpB  29.52 
 
 		 500 aa  57.8  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.44208  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01020  sensory box histidine kinase  28.84 
 
 		 710 aa  57.8  0.0000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0755055  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4070  sensory histidine kinase UhpB  29.52 
 
 		 500 aa  57.4  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5988  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.24 
 
 		 700 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0888  sensor histidine kinase, putative  24.76 
 
 		 364 aa  57.4  0.0000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000307966  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4896  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.81 
 
 		 517 aa  57.4  0.0000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0133704  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3101  histidine kinase  25.48 
 
 		 1037 aa  57.4  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.377571  normal  0.147743 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3574  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.69 
 
 		 466 aa  57.4  0.0000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.382428 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4356  GAF sensor signal transduction histidine kinase  28.7 
 
 		 568 aa  57  0.0000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.641048  normal  0.232825 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>