More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_0806 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_0806  histidine kinase  100 
 
 		 921 aa  1823    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5166  two-component sensor histidine kinase  49.62 
 
 		 640 aa  565  1.0000000000000001e-159  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.312086  normal  0.337439 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0448  putative signal transduction histidine kinase  50 
 
 		 615 aa  559  1e-158  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.844769  normal  0.742785 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0613  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  38.41 
 
 		 645 aa  369  1e-100  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.066657 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3594  histidine kinase  38.81 
 
 		 626 aa  345  2.9999999999999997e-93  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.2055  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0380  histidine kinase  28.42 
 
 		 657 aa  131  6e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.810149  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1633  putative signal transduction histidine kinase  27.46 
 
 		 636 aa  125  4e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0985206 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4987  putative sensor signal transduction histidine kinase  25.38 
 
 		 661 aa  124  6e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.244609 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3160  two component sensor histidine kinase transcription regulator protein  27.51 
 
 		 626 aa  123  9.999999999999999e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3238  signal transduction histidine kinase-like protein  26.01 
 
 		 619 aa  122  3e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6034  histidine kinase  28.24 
 
 		 659 aa  106  3e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.717786  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0803  putative signal transduction histidine kinase  25.35 
 
 		 624 aa  105  4e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0940  putative signal transduction histidine kinase  26.17 
 
 		 614 aa  102  3e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4085  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.29 
 
 		 652 aa  99.4  3e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3372  putative signal transduction histidine kinase  23.65 
 
 		 618 aa  95.9  3e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3951  histidine kinase  25 
 
 		 625 aa  94  1e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.283359 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3516  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  24.3 
 
 		 614 aa  91.3  7e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.510113  hitchhiker  0.00329665 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6208  histidine kinase  27.99 
 
 		 657 aa  82.8  0.00000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3087  PAS sensor signal transduction histidine kinase  33.03 
 
 		 312 aa  82.4  0.00000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.230742  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4005  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.84 
 
 		 801 aa  82  0.00000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0159  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.94 
 
 		 508 aa  81.6  0.00000000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0378  putative signal transduction histidine kinase  25.52 
 
 		 652 aa  81.6  0.00000000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0744  sensory box histidine kinase  34.67 
 
 		 799 aa  81.3  0.00000000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.13864  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07820  putative histidine kinase  34.67 
 
 		 797 aa  79.7  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0365473 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1006  histidine kinase  29.77 
 
 		 967 aa  77.8  0.0000000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3993  histidine kinase  32.38 
 
 		 456 aa  77.4  0.000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.841388  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1285  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.23 
 
 		 742 aa  76.6  0.000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5188  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.56 
 
 		 480 aa  76.3  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5671  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.56 
 
 		 480 aa  76.3  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0241273 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3622  signal transduction histidine kinase-like protein  27.9 
 
 		 483 aa  76.3  0.000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0396591  normal  0.169833 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4564  histidine kinase  32.56 
 
 		 460 aa  75.9  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.562879  normal  0.0736505 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0778  methanol utilization control sensor protein moxY, putative  28.73 
 
 		 439 aa  75.5  0.000000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.125881  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0826  Histidine kinase  33.2 
 
 		 412 aa  74.7  0.000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6470  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  46.15 
 
 		 471 aa  74.3  0.000000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.629472  normal  0.491206 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2334  sensor histidine kinase  31.98 
 
 		 470 aa  73.9  0.00000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3101  histidine kinase  26.6 
 
 		 1037 aa  73.9  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.377571  normal  0.147743 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41030  Periplasmic sensory histidine protein kinase, two-component  39.78 
 
 		 458 aa  73.6  0.00000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0649951  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1964  histidine kinase  31.58 
 
 		 475 aa  73.9  0.00000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0027  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.31 
 
 		 461 aa  73.2  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.755533 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2810  putative signal transduction histidine kinase  30.92 
 
 		 501 aa  73.6  0.00000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2497  histidine kinase  29.66 
 
 		 1031 aa  72.8  0.00000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0918719  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3542  histidine kinase  30.77 
 
 		 431 aa  72.8  0.00000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.787824 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2580  histidine kinase  29.72 
 
 		 422 aa  72.4  0.00000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.880661  normal  0.0603036 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0614  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.48 
 
 		 468 aa  72  0.00000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3522  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.22 
 
 		 477 aa  72  0.00000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3132  putative sensor histidine kinase  30.99 
 
 		 466 aa  71.6  0.00000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2487  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.45 
 
 		 412 aa  71.6  0.00000000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1399  PAS  27.48 
 
 		 683 aa  71.2  0.00000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.04458 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1685  Histidine kinase  26.76 
 
 		 397 aa  70.5  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.842631 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2070  sensor histidine kinase  30.99 
 
 		 466 aa  70.9  0.0000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1462  sensor kinase protein  30.99 
 
 		 466 aa  70.9  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2549  GAF sensor signal transduction histidine kinase  26.46 
 
 		 456 aa  70.5  0.0000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2388  histidine kinase  29.67 
 
 		 653 aa  70.9  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.255891  normal  0.393123 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3230  histidine kinase  27.68 
 
 		 1033 aa  70.5  0.0000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.704109  normal  0.047539 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3247  putative sensor histidine kinase  30.99 
 
 		 466 aa  70.9  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2363  sensor histidine kinase  30.99 
 
 		 466 aa  70.1  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5201  GAF sensor signal transduction histidine kinase  27.73 
 
 		 393 aa  69.7  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.849708 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6981  histidine kinase  31.37 
 
 		 389 aa  70.1  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.69549  normal  0.8933 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4503  histidine kinase  41.98 
 
 		 643 aa  70.1  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.604782 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0507  Histidine kinase  31.98 
 
 		 373 aa  69.7  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2170  GAF sensor signal transduction histidine kinase  27.27 
 
 		 550 aa  70.1  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1783  histidine kinase  29.19 
 
 		 501 aa  70.1  0.0000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000211372 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2918  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  23.42 
 
 		 658 aa  70.5  0.0000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1099  sensor histidine kinase  30.99 
 
 		 466 aa  70.1  0.0000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1027  putative transmembrane sensor histidine kinase transcription regulator protein  31.31 
 
 		 456 aa  70.1  0.0000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.573227  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1248  signal transduction histidine kinase-like protein  29.49 
 
 		 768 aa  69.7  0.0000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.52923  normal  0.223351 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1378  sensor histidine kinase  30.99 
 
 		 466 aa  70.1  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.922617  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1239  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.31 
 
 		 358 aa  69.3  0.0000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0982  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.21 
 
 		 346 aa  68.9  0.0000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4486  GAF sensor signal transduction histidine kinase  28.19 
 
 		 582 aa  68.9  0.0000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08896  putative transmembrane protein  23.05 
 
 		 680 aa  68.6  0.0000000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0641  two component transcriptional regulator, LuxR family  27.59 
 
 		 1648 aa  68.2  0.0000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5127  PAS/PAC sensor Signal transduction histidine kinase  30.45 
 
 		 799 aa  68.2  0.0000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0276  Histidine kinase  32.24 
 
 		 387 aa  68.2  0.0000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3495  signal transduction histidine kinase-like protein  27.82 
 
 		 410 aa  68.2  0.0000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0736574  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1405  sensor histidine kinase  35.56 
 
 		 483 aa  68.2  0.0000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0589016  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2912  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.27 
 
 		 339 aa  68.2  0.0000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4619  PAS  32.73 
 
 		 670 aa  67  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.751025 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3418  sensor histidine kinase  30.8 
 
 		 481 aa  67  0.000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.986219  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0696  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  23.56 
 
 		 790 aa  67.4  0.000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4945  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.33 
 
 		 459 aa  67  0.000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0549839 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0895  sensor histidine kinase  28.22 
 
 		 451 aa  67.4  0.000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.622783  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5497  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.33 
 
 		 459 aa  66.6  0.000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00170786 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2086  signal transduction histidine kinase NarQ  31.15 
 
 		 671 aa  66.2  0.000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.252663 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1983  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.88 
 
 		 469 aa  67  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.143525 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4230  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.21 
 
 		 478 aa  66.2  0.000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.304751 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3187  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.66 
 
 		 459 aa  66.2  0.000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.134921 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4420  sensor histidine kinase  22.51 
 
 		 766 aa  66.2  0.000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0037892  normal  0.407304 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0559  sensory box histidine kinase  31.28 
 
 		 671 aa  66.2  0.000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1050  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.96 
 
 		 490 aa  66.2  0.000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0890149 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2027  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  26.54 
 
 		 401 aa  65.9  0.000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.109719  normal  0.72788 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2542  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.15 
 
 		 476 aa  65.9  0.000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0866412  normal  0.0241376 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4793  cyclic nucleotide-binding protein  30.45 
 
 		 795 aa  65.9  0.000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.271636  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5844  histidine kinase  28.25 
 
 		 270 aa  65.9  0.000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.330539 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4502  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.26 
 
 		 391 aa  65.9  0.000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00405521  normal  0.0184903 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1347  sensor histidine kinase  27.34 
 
 		 351 aa  65.5  0.000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.31288  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1321  sensor histidine kinase  27.34 
 
 		 351 aa  65.5  0.000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000375238  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1320  sensor histidine kinase  27.34 
 
 		 351 aa  65.5  0.000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00123004  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1456  sensor histidine kinase  27.34 
 
 		 351 aa  65.5  0.000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00592106  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0456  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.39 
 
 		 775 aa  65.1  0.000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00143274 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>