More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A3622 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A3622  signal transduction histidine kinase-like protein  100 
 
 		 483 aa  926    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0396591  normal  0.169833 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3372  putative signal transduction histidine kinase  31.96 
 
 		 618 aa  126  9e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0378  putative signal transduction histidine kinase  30.24 
 
 		 652 aa  122  9.999999999999999e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0803  putative signal transduction histidine kinase  31.03 
 
 		 624 aa  120  4.9999999999999996e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3516  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.39 
 
 		 614 aa  119  9.999999999999999e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.510113  hitchhiker  0.00329665 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1633  putative signal transduction histidine kinase  32.62 
 
 		 636 aa  119  9.999999999999999e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0985206 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3160  two component sensor histidine kinase transcription regulator protein  27.76 
 
 		 626 aa  115  1.0000000000000001e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4987  putative sensor signal transduction histidine kinase  28.85 
 
 		 661 aa  114  5e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.244609 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6034  histidine kinase  31.58 
 
 		 659 aa  113  8.000000000000001e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.717786  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0380  histidine kinase  29.34 
 
 		 657 aa  113  8.000000000000001e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.810149  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0940  putative signal transduction histidine kinase  30.28 
 
 		 614 aa  112  2.0000000000000002e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4085  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.49 
 
 		 652 aa  106  1e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2542  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.15 
 
 		 476 aa  99  2e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0866412  normal  0.0241376 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3594  histidine kinase  27.74 
 
 		 626 aa  90.5  6e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.2055  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0613  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.57 
 
 		 645 aa  87.8  4e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.066657 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3381  putative signal transduction histidine kinase  31.82 
 
 		 305 aa  81.6  0.00000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.303158 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0448  putative signal transduction histidine kinase  28.86 
 
 		 615 aa  81.6  0.00000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.844769  normal  0.742785 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3951  histidine kinase  25.93 
 
 		 625 aa  77.8  0.0000000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.283359 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2036  histidine kinase  32.2 
 
 		 381 aa  77.8  0.0000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.103366 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0806  histidine kinase  27.03 
 
 		 921 aa  77.8  0.0000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3238  signal transduction histidine kinase-like protein  25 
 
 		 619 aa  75.1  0.000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1773  putative signal transduction histidine kinase  33.48 
 
 		 277 aa  74.3  0.000000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7008  histidine kinase  31.9 
 
 		 402 aa  74.3  0.000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.432266  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1230  two-component sensor NarX  32.22 
 
 		 622 aa  73.2  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13740  two-component sensor NarX  33.03 
 
 		 622 aa  72  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.869934  normal  0.455278 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0522  histidine kinase  31.66 
 
 		 399 aa  72.4  0.00000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7302  putative two-component system sensor kinase  34.02 
 
 		 417 aa  71.6  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5166  two-component sensor histidine kinase  29.2 
 
 		 640 aa  71.6  0.00000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.312086  normal  0.337439 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4835  histidine kinase  27.08 
 
 		 414 aa  70.9  0.00000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.951684  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3184  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.94 
 
 		 398 aa  70.9  0.00000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2107  histidine kinase  28.63 
 
 		 401 aa  70.5  0.00000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.51786 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6709  histidine kinase  29.15 
 
 		 438 aa  70.1  0.00000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.735832  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20450  signal transduction histidine kinase  29.41 
 
 		 441 aa  69.7  0.0000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0107895  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0607  histidine kinase  33.63 
 
 		 413 aa  69.3  0.0000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1587  sensor protein  29.08 
 
 		 493 aa  68.9  0.0000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.234957  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2334  sensor histidine kinase  32.88 
 
 		 470 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1108  GAF sensor signal transduction histidine kinase  29.22 
 
 		 464 aa  69.3  0.0000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08500  signal transduction histidine kinase  29.09 
 
 		 420 aa  68.2  0.0000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.115699  normal  0.612619 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2226  histidine kinase  32.1 
 
 		 370 aa  68.6  0.0000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0564  histidine kinase  30.94 
 
 		 368 aa  67.8  0.0000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3279  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.24 
 
 		 405 aa  67.8  0.0000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1543  putative signal transduction histidine kinase  26.05 
 
 		 413 aa  67.4  0.0000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00220  signal transduction histidine kinase  29.88 
 
 		 391 aa  67.4  0.0000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.208854 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3096  GAF sensor signal transduction histidine kinase  28.51 
 
 		 578 aa  66.6  0.0000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3280  histidine kinase  31.65 
 
 		 664 aa  66.2  0.000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00155771  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1872  sensor histidine kinase  24.67 
 
 		 1046 aa  66.2  0.000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1634  histidine kinase  32.34 
 
 		 384 aa  66.2  0.000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.262727  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0200  Signal transduction histidine kinase-like protein  30.15 
 
 		 424 aa  65.1  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5967  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.82 
 
 		 605 aa  65.9  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.142305 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2232  histidine kinase  33.77 
 
 		 399 aa  65.9  0.000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000209414  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2636  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.82 
 
 		 583 aa  65.9  0.000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0761488  normal  0.0281081 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4661  histidine kinase  31.86 
 
 		 380 aa  65.1  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.249963  hitchhiker  0.00746099 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3677  histidine kinase  30.8 
 
 		 408 aa  65.9  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.10393  normal  0.0950882 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1950  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 421 aa  65.5  0.000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.222367  normal  0.821107 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4257  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.03 
 
 		 425 aa  65.9  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.944202  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3101  histidine kinase  25.74 
 
 		 1037 aa  64.7  0.000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.377571  normal  0.147743 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5303  putative two-component system sensor kinase  31.42 
 
 		 367 aa  65.1  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0551174  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06640  histidine kinase  29.33 
 
 		 404 aa  64.7  0.000000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.106239  normal  0.143286 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7116  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.35 
 
 		 388 aa  64.7  0.000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2849  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.38 
 
 		 682 aa  65.1  0.000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.790064  normal  0.747278 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1697  histidine kinase  28.3 
 
 		 664 aa  64.7  0.000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.182651 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5904  Histidine kinase  28.08 
 
 		 399 aa  64.7  0.000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0106883  normal  0.0686301 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3523  Histidine kinase  33.49 
 
 		 591 aa  64.3  0.000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0630905  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4980  GAF sensor signal transduction histidine kinase  28.76 
 
 		 631 aa  64.7  0.000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.691708  normal  0.877049 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0028  sensory histidine kinase UhpB  27.23 
 
 		 499 aa  64.3  0.000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.457313 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2918  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.99 
 
 		 658 aa  63.9  0.000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1864  Sensor DegS domain protein  29.24 
 
 		 391 aa  64.3  0.000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000165606  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4896  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.28 
 
 		 517 aa  64.3  0.000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0133704  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4277  histidine kinase  30.14 
 
 		 659 aa  64.3  0.000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.186124 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2111  ATP-binding region ATPase domain protein  26.91 
 
 		 645 aa  64.3  0.000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.184163  normal  0.230765 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2709  histidine kinase  27.87 
 
 		 397 aa  63.9  0.000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.607523  normal  0.683898 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3248  histidine kinase  30.52 
 
 		 403 aa  63.9  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.298805  normal  0.646005 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2532  Signal transduction histidine kinase-like protein  30.56 
 
 		 400 aa  63.5  0.000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.76647 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4576  histidine kinase  30.57 
 
 		 394 aa  63.2  0.000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.312812  normal  0.130927 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0652  histidine kinase  32.62 
 
 		 395 aa  63.2  0.00000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4478  histidine kinase  29.86 
 
 		 400 aa  63.2  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.334166 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3744  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.8 
 
 		 412 aa  62.8  0.00000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3575  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.41 
 
 		 475 aa  62.8  0.00000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2821  histidine kinase  30.3 
 
 		 423 aa  63.2  0.00000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0543421  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1842  histidine kinase  29.69 
 
 		 529 aa  62.8  0.00000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1400  histidine kinase  27.98 
 
 		 413 aa  62.8  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.558809 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3908  GAF sensor signal transduction histidine kinase  28.26 
 
 		 423 aa  62.8  0.00000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4178  sensory histidine kinase UhpB  27.38 
 
 		 500 aa  62  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1733  histidine kinase  28.63 
 
 		 687 aa  62  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.568791  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3999  sensory histidine kinase UhpB  27.38 
 
 		 500 aa  62  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3427  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  33.98 
 
 		 378 aa  62  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.117  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3039  histidine kinase  32.3 
 
 		 376 aa  62  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0758324  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3245  Signal transduction histidine kinase-like protein  27.95 
 
 		 430 aa  62.4  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.000678537  normal  0.37846 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5558  histidine kinase  28.24 
 
 		 620 aa  62  0.00000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.810149  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1510  histidine kinase  31.69 
 
 		 378 aa  62  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0382398 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4070  sensory histidine kinase UhpB  27.38 
 
 		 500 aa  62.4  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2736  histidine kinase  29.46 
 
 		 430 aa  62  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.554536  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2961  ATP-binding region ATPase domain protein  26.79 
 
 		 645 aa  62  0.00000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.10084  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4015  sensory histidine kinase UhpB  27.38 
 
 		 500 aa  62  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1462  sensor kinase protein  31.96 
 
 		 466 aa  62  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0821  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.41 
 
 		 418 aa  62  0.00000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0823  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.41 
 
 		 417 aa  61.6  0.00000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0233  putative two-component system sensor kinase  29.69 
 
 		 379 aa  61.6  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3247  putative sensor histidine kinase  31.96 
 
 		 466 aa  62  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1006  histidine kinase  27.48 
 
 		 967 aa  61.6  0.00000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>