More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_0378 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_0378  putative signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 652 aa  1284    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4085  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.06 
 
 		 652 aa  381  1e-104  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6034  histidine kinase  37.94 
 
 		 659 aa  339  9.999999999999999e-92  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.717786  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3160  two component sensor histidine kinase transcription regulator protein  36.9 
 
 		 626 aa  337  3.9999999999999995e-91  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0380  histidine kinase  38.52 
 
 		 657 aa  328  2.0000000000000001e-88  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.810149  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0940  putative signal transduction histidine kinase  31.85 
 
 		 614 aa  164  4.0000000000000004e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4987  putative sensor signal transduction histidine kinase  29.18 
 
 		 661 aa  141  3e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.244609 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3372  putative signal transduction histidine kinase  29.4 
 
 		 618 aa  139  2e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1633  putative signal transduction histidine kinase  30.47 
 
 		 636 aa  138  3.0000000000000003e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0985206 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0803  putative signal transduction histidine kinase  27.64 
 
 		 624 aa  137  6.0000000000000005e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3622  signal transduction histidine kinase-like protein  30.24 
 
 		 483 aa  126  1e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0396591  normal  0.169833 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3594  histidine kinase  28.45 
 
 		 626 aa  121  3e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.2055  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3516  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  25.41 
 
 		 614 aa  117  6.9999999999999995e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.510113  hitchhiker  0.00329665 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0613  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  26.01 
 
 		 645 aa  100  9e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.066657 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2542  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.09 
 
 		 476 aa  98.2  4e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0866412  normal  0.0241376 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3238  signal transduction histidine kinase-like protein  25.25 
 
 		 619 aa  97.1  9e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0806  histidine kinase  26.03 
 
 		 921 aa  86.7  0.000000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3381  putative signal transduction histidine kinase  32.42 
 
 		 305 aa  82.4  0.00000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.303158 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1644  histidine kinase  32.34 
 
 		 296 aa  82  0.00000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.518526  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1668  histidine kinase  32.72 
 
 		 298 aa  81.6  0.00000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.891257 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0448  putative signal transduction histidine kinase  25.83 
 
 		 615 aa  81.6  0.00000000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.844769  normal  0.742785 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1773  putative signal transduction histidine kinase  34.78 
 
 		 277 aa  81.6  0.00000000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2942  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.48 
 
 		 333 aa  81.3  0.00000000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.940404  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3614  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.98 
 
 		 298 aa  80.9  0.00000000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.753486  normal  0.27992 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2127  sensor histidine kinase  32 
 
 		 313 aa  80.5  0.00000000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.289713  normal  0.113702 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3951  histidine kinase  24.78 
 
 		 625 aa  79.3  0.0000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.283359 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4289  GAF sensor signal transduction histidine kinase  27.98 
 
 		 552 aa  79.3  0.0000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5166  two-component sensor histidine kinase  29.51 
 
 		 640 aa  78.6  0.0000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.312086  normal  0.337439 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4230  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.91 
 
 		 478 aa  78.6  0.0000000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.304751 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1983  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.46 
 
 		 469 aa  77.8  0.0000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.143525 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1141  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.17 
 
 		 445 aa  77.4  0.0000000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.697723  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4365  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.59 
 
 		 468 aa  76.3  0.000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.665132  normal  0.714097 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1029  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.67 
 
 		 411 aa  76.3  0.000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.342445  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5078  histidine kinase  33 
 
 		 368 aa  75.9  0.000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.9788 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0744  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.8 
 
 		 660 aa  75.5  0.000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3261  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.37 
 
 		 463 aa  75.5  0.000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0456  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.44 
 
 		 775 aa  72.8  0.00000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00143274 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5201  GAF sensor signal transduction histidine kinase  31.8 
 
 		 393 aa  71.6  0.00000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.849708 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1809  histidine kinase  29.92 
 
 		 640 aa  71.2  0.00000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0153  histidine kinase  30.47 
 
 		 325 aa  71.2  0.00000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1992  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.62 
 
 		 574 aa  71.2  0.00000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0873865  normal  0.754427 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2918  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.49 
 
 		 658 aa  71.2  0.00000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1462  sensor kinase protein  29.06 
 
 		 466 aa  70.5  0.00000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3247  putative sensor histidine kinase  29.06 
 
 		 466 aa  70.5  0.00000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1006  histidine kinase  30.04 
 
 		 967 aa  70.5  0.00000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3420  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.92 
 
 		 440 aa  70.9  0.00000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0662145 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3418  sensor histidine kinase  28.06 
 
 		 481 aa  70.1  0.0000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.986219  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3956  histidine kinase, dimerization and phosphoacceptor region  30.69 
 
 		 323 aa  70.1  0.0000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3132  putative sensor histidine kinase  29.49 
 
 		 466 aa  70.1  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0243  histidine kinase  32.31 
 
 		 490 aa  69.3  0.0000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00127323 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1543  putative signal transduction histidine kinase  26.89 
 
 		 413 aa  68.9  0.0000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1099  sensor histidine kinase  28.63 
 
 		 466 aa  68.6  0.0000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1378  sensor histidine kinase  28.63 
 
 		 466 aa  68.6  0.0000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.922617  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2363  sensor histidine kinase  28.63 
 
 		 466 aa  68.6  0.0000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06640  histidine kinase  29.96 
 
 		 404 aa  67.8  0.0000000005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.106239  normal  0.143286 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1399  PAS  29.05 
 
 		 683 aa  67.8  0.0000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.04458 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0766  histidine kinase  31.83 
 
 		 464 aa  67.8  0.0000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.701174  normal  0.667801 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1315  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.85 
 
 		 344 aa  67.8  0.0000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1215  PAS  29.18 
 
 		 515 aa  67.8  0.0000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0760  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.81 
 
 		 610 aa  67.4  0.0000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000018635  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3746  GAF sensor signal transduction histidine kinase  31.33 
 
 		 373 aa  67.4  0.0000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.200726  normal  0.275416 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1596  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.57 
 
 		 420 aa  67.4  0.0000000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.310205  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1608  histidine kinase  27.11 
 
 		 565 aa  67.4  0.0000000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1232  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.66 
 
 		 334 aa  67.4  0.0000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.380961  normal  0.783946 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5558  histidine kinase  29.66 
 
 		 620 aa  66.2  0.000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.810149  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2070  sensor histidine kinase  28.21 
 
 		 466 aa  66.2  0.000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1568  histidine kinase  27.62 
 
 		 462 aa  65.9  0.000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3510  histidine kinase  33.85 
 
 		 559 aa  66.2  0.000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.026405 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0826  Histidine kinase  32.44 
 
 		 412 aa  65.9  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0106  membrane-associated sensory histidine kinase-like ATPase  23.98 
 
 		 632 aa  65.9  0.000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.100844  normal  0.392929 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5787  histidine kinase  28.43 
 
 		 415 aa  66.2  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.634184 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2631  GAF sensor signal transduction histidine kinase  29.96 
 
 		 655 aa  65.9  0.000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1783  histidine kinase  30.21 
 
 		 501 aa  65.5  0.000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000211372 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5321  putative signal transduction histidine kinase  27.62 
 
 		 417 aa  65.5  0.000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0967984  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0294  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.71 
 
 		 410 aa  65.5  0.000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3993  histidine kinase  31.54 
 
 		 456 aa  65.5  0.000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.841388  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1316  sensor histidine protein kinase  28.91 
 
 		 525 aa  65.5  0.000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.176896  normal  0.0650582 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5739  putative signal transduction histidine kinase  27.57 
 
 		 412 aa  65.1  0.000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1400  histidine kinase  29.58 
 
 		 413 aa  65.1  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.558809 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6528  histidine kinase  28.43 
 
 		 592 aa  65.1  0.000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3748  histidine kinase  31.33 
 
 		 287 aa  64.7  0.000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3744  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.21 
 
 		 412 aa  64.7  0.000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1872  sensor histidine kinase  23.08 
 
 		 1046 aa  64.7  0.000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2334  sensor histidine kinase  28.21 
 
 		 470 aa  64.7  0.000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4898  ATPase domain-containing protein  28.19 
 
 		 491 aa  64.7  0.000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.246184  normal  0.165682 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17340  intracellular sensory histidine protein kinase, two component  32.3 
 
 		 356 aa  64.3  0.000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3325  histidine kinase  32.87 
 
 		 696 aa  63.9  0.000000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.868866  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1285  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.22 
 
 		 742 aa  64.3  0.000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2703  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.48 
 
 		 552 aa  63.9  0.000000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.191431 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1204  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.65 
 
 		 779 aa  63.9  0.000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2056  histidine kinase  25.7 
 
 		 475 aa  63.9  0.000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0507  Histidine kinase  34.29 
 
 		 373 aa  63.2  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1289  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  29.25 
 
 		 1168 aa  63.2  0.00000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2027  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  28.97 
 
 		 401 aa  63.9  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.109719  normal  0.72788 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0227  GAF sensor signal transduction histidine kinase  27.97 
 
 		 421 aa  63.5  0.00000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0384  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.97 
 
 		 348 aa  63.5  0.00000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3162  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.35 
 
 		 381 aa  63.5  0.00000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.541775  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3997  Signal transduction histidine kinase-like protein  32.23 
 
 		 567 aa  62.4  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.224789  normal  0.328912 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0814  signal transduction histidine kinase, glucose-6-phosphate specific  28.64 
 
 		 466 aa  62.8  0.00000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000114737  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2641  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31 
 
 		 468 aa  62.8  0.00000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>