More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_2641 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008781  Pnap_2641  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 
468 aa  936    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2272  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  44.03 
 
 
471 aa  218  2e-55  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0358  two-component sensor histidine kinase-like protein  36.49 
 
 
488 aa  213  7e-54  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0264511  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0814  signal transduction histidine kinase, glucose-6-phosphate specific  31.03 
 
 
466 aa  204  3e-51  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000114737  normal 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5445  histidine kinase  43.18 
 
 
478 aa  197  4.0000000000000005e-49  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.403934  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0778  methanol utilization control sensor protein moxY, putative  36.53 
 
 
439 aa  186  1.0000000000000001e-45  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.125881  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7262  histidine kinase  40.07 
 
 
453 aa  182  9.000000000000001e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.374696  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6074  putative two-component sensor histidine kinase  33.55 
 
 
521 aa  179  7e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3827  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.41 
 
 
472 aa  166  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.935643  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3269  ATPase domain-containing protein  34.93 
 
 
446 aa  165  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.329893  normal  0.409282 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0321  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.36 
 
 
476 aa  162  9e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5349  two-component sensor histidine kinase  32.54 
 
 
452 aa  161  3e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0266421 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3044  methanol utilization control sensor protein MoxY, putative  30.47 
 
 
475 aa  158  2e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.739153  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5892  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.67 
 
 
446 aa  152  1e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.141729 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3467  putative signal transduction histidine kinase  39.4 
 
 
446 aa  149  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.548069  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1715  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.29 
 
 
573 aa  149  2.0000000000000003e-34  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000284252 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0243  histidine kinase  32.78 
 
 
490 aa  146  1e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00127323 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3598  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.73 
 
 
439 aa  145  1e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2472  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  40.45 
 
 
336 aa  144  2e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.651291 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3151  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.82 
 
 
453 aa  142  9.999999999999999e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2723  signal transduction histidine kinase, glucose-6-phosphate specific  34.59 
 
 
486 aa  142  9.999999999999999e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.208049 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3593  histidine kinase  33.5 
 
 
446 aa  140  4.999999999999999e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1029  signal transduction histidine kinase, glucose-6-phosphate specific  35.87 
 
 
462 aa  140  6e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0484  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.03 
 
 
473 aa  136  9.999999999999999e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7524  histidine kinase  35.56 
 
 
477 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.293229  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0817  signal transduction histidine kinase, glucose-6-phosphate specific  37.85 
 
 
466 aa  130  7.000000000000001e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000394288  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3059  histidine kinase  27.33 
 
 
459 aa  128  2.0000000000000002e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.548972  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3394  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.44 
 
 
493 aa  127  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.12188 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3849  histidine kinase  35.5 
 
 
497 aa  127  5e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6780  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.21 
 
 
476 aa  124  3e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0356204  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0302  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.42 
 
 
560 aa  123  8e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.09388 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2671  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.13 
 
 
424 aa  122  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.329696  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5940  signal transduction histidine kinase, glucose-6-phosphate specific  32.43 
 
 
448 aa  120  3.9999999999999996e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.779513  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1399  PAS  35.37 
 
 
683 aa  120  6e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.04458 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2854  histidine kinase  33.74 
 
 
468 aa  119  9e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1786  signal transduction histidine kinase, glucose-6-phosphate specific  33.8 
 
 
479 aa  118  1.9999999999999998e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.663112  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3092  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.53 
 
 
425 aa  119  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.300177  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1872  sensor histidine kinase  34.07 
 
 
1046 aa  118  3e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0477  two-component sensor histidine kinase  39.13 
 
 
488 aa  116  7.999999999999999e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.046141 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20450  signal transduction histidine kinase  38.46 
 
 
441 aa  115  2.0000000000000002e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0107895  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0649  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.3 
 
 
490 aa  115  2.0000000000000002e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4452  ATPase domain-containing protein  32.12 
 
 
509 aa  114  5e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.570646 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4916  histidine kinase  32.12 
 
 
509 aa  114  5e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.69179 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0848  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.69 
 
 
363 aa  113  8.000000000000001e-24  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3302  histidine kinase  31.68 
 
 
455 aa  113  8.000000000000001e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.26779 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1231  histidine kinase  26.99 
 
 
482 aa  111  2.0000000000000002e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2604  signal transduction histidine kinase glucose-6-phosphate-like protein  34.28 
 
 
495 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0835  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.36 
 
 
513 aa  111  3e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.506396  normal  0.822234 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3830  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.25 
 
 
496 aa  111  3e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0270261 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000090  sensor histidine protein kinase UhpB glucose-6-phosphate specific  32.55 
 
 
500 aa  110  4.0000000000000004e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4966  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.12 
 
 
506 aa  110  5e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.111121  normal  0.0306012 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3132  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.73 
 
 
424 aa  110  5e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.345137  normal  0.393373 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2298  histidine kinase  32.2 
 
 
1093 aa  110  8.000000000000001e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0082  sensory histidine kinase UhpB  29.49 
 
 
509 aa  109  1e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.908057  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1573  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, dimerization and phosphoacceptor region  31.02 
 
 
373 aa  109  1e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1236  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.99 
 
 
692 aa  109  1e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4079  sensory histidine kinase UhpB  29.49 
 
 
509 aa  108  1e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1913  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.81 
 
 
700 aa  109  1e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.6571 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4131  sensory histidine kinase UhpB  29.49 
 
 
509 aa  109  1e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.812455  normal  0.258097 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1950  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.66 
 
 
421 aa  108  2e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.222367  normal  0.821107 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3924  PAS/PAC sensor Signal transduction histidine kinase  35.37 
 
 
363 aa  108  2e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.278559  hitchhiker  0.00726573 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01020  sensory box histidine kinase  36.36 
 
 
710 aa  108  2e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0755055  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06146  sensory box histidine kinase  36.36 
 
 
710 aa  108  2e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0682167  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3669  histidine kinase  31.21 
 
 
489 aa  108  3e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1701  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  35.75 
 
 
521 aa  107  4e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.279897 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2405  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  34.6 
 
 
376 aa  107  5e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.90978  normal  0.0505439 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7700  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.48 
 
 
541 aa  107  6e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.163324  normal  0.507763 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2159  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.78 
 
 
439 aa  106  7e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0525823 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6559  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 
541 aa  106  8e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.59439 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2991  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.98 
 
 
475 aa  105  2e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.259312 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0766  histidine kinase  36 
 
 
464 aa  104  3e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.701174  normal  0.667801 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4005  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.64 
 
 
801 aa  104  4e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2634  histidine kinase  33.73 
 
 
343 aa  104  4e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000175326  hitchhiker  0.00557176 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1783  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.72 
 
 
468 aa  104  4e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  decreased coverage  0.0029863  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1248  sensory box histidine kinase/response regulator  32.17 
 
 
687 aa  103  5e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.535727  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0623  sensor protein UhpB  32.89 
 
 
527 aa  103  5e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01515  sensor histidine kinase  27.41 
 
 
447 aa  103  6e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7756  PAS sensor protein  37.1 
 
 
1809 aa  103  7e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4453  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  31.8 
 
 
376 aa  103  7e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2942  ATPase domain-containing protein  38.21 
 
 
485 aa  103  7e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1296  GAF sensor signal transduction histidine kinase  34.74 
 
 
386 aa  103  8e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.99492 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4033  sensory histidine kinase UhpB  35.32 
 
 
500 aa  103  9e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.406028 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03552  sensory histidine kinase in two-component regulatory sytem with UhpA  35.32 
 
 
500 aa  102  1e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0035  histidine kinase  35.32 
 
 
500 aa  102  1e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0031  sensory histidine kinase UhpB  35.32 
 
 
500 aa  102  1e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1289  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  32.08 
 
 
1168 aa  102  1e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0126  sensory box histidine kinase/response regulator  31.6 
 
 
619 aa  102  1e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.799989  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03494  hypothetical protein  35.32 
 
 
500 aa  102  1e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4176  sensory histidine kinase UhpB  35.32 
 
 
497 aa  102  1e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4251  sensory histidine kinase UhpB  35.32 
 
 
497 aa  102  1e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3881  sensory histidine kinase UhpB  35.32 
 
 
497 aa  102  1e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1145  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.46 
 
 
490 aa  102  1e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.894172  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2020  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.41 
 
 
771 aa  102  2e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4249  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.48 
 
 
684 aa  102  2e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.136482  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1550  sensory box histidine kinase  31.6 
 
 
680 aa  102  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1009  sensory box histidine kinase/response regulator  30.84 
 
 
463 aa  102  2e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4427  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.42 
 
 
462 aa  102  2e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3775  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.48 
 
 
707 aa  102  2e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.235944 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4560  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.42 
 
 
462 aa  102  2e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.140942  normal  0.159095 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5809  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.58 
 
 
366 aa  101  3e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.325789  normal  0.250191 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>