More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_3381 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_3381  putative signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 305 aa  577  1e-164  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.303158 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1773  putative signal transduction histidine kinase  42.68 
 
 		 277 aa  135  9.999999999999999e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2542  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.44 
 
 		 476 aa  124  2e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0866412  normal  0.0241376 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3516  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.05 
 
 		 614 aa  86.3  6e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.510113  hitchhiker  0.00329665 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1633  putative signal transduction histidine kinase  34.45 
 
 		 636 aa  84.7  0.000000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0985206 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3622  signal transduction histidine kinase-like protein  31.82 
 
 		 483 aa  81.6  0.00000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0396591  normal  0.169833 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0378  putative signal transduction histidine kinase  32.42 
 
 		 652 aa  77.4  0.0000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0803  putative signal transduction histidine kinase  32.92 
 
 		 624 aa  77  0.0000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4987  putative sensor signal transduction histidine kinase  32.78 
 
 		 661 aa  75.5  0.000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.244609 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0380  histidine kinase  25.83 
 
 		 657 aa  68.2  0.0000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.810149  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5549  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.06 
 
 		 370 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.441753  normal  0.532681 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0974  putative signal transduction histidine kinase  45.45 
 
 		 584 aa  67.4  0.0000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.575526  normal  0.658515 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4085  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.13 
 
 		 652 aa  67.4  0.0000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3594  histidine kinase  33.48 
 
 		 626 aa  66.6  0.0000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.2055  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3372  putative signal transduction histidine kinase  28.57 
 
 		 618 aa  65.5  0.000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0064  GAF sensor signal transduction histidine kinase  29.32 
 
 		 396 aa  64.7  0.000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.693223  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2228  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.38 
 
 		 654 aa  63.9  0.000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.728607  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0940  putative signal transduction histidine kinase  30.77 
 
 		 614 aa  63.5  0.000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5166  two-component sensor histidine kinase  27.8 
 
 		 640 aa  63.5  0.000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.312086  normal  0.337439 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2549  GAF sensor signal transduction histidine kinase  28.25 
 
 		 456 aa  63.2  0.000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1543  putative signal transduction histidine kinase  25.1 
 
 		 413 aa  62.8  0.000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2388  histidine kinase  27 
 
 		 653 aa  60.8  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.255891  normal  0.393123 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2311  putative two-component sensor histidine kinase transcription regulator protein  28.75 
 
 		 383 aa  60.5  0.00000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.615957  normal  0.235814 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0384  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.99 
 
 		 348 aa  60.1  0.00000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3160  two component sensor histidine kinase transcription regulator protein  27.93 
 
 		 626 aa  59.3  0.00000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3064  putative signal transduction histidine kinase  28.26 
 
 		 801 aa  59.3  0.00000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.998121  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2525  histidine kinase  33.61 
 
 		 434 aa  58.5  0.0000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0362104  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4714  Two-component sensor histidine kinase  26.78 
 
 		 447 aa  58.5  0.0000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06146  sensory box histidine kinase  28.63 
 
 		 710 aa  58.5  0.0000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0682167  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01020  sensory box histidine kinase  28.63 
 
 		 710 aa  58.5  0.0000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0755055  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6034  histidine kinase  27.85 
 
 		 659 aa  58.2  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.717786  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2962  histidine kinase  22.79 
 
 		 287 aa  58.2  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0560  histidine kinase  24.79 
 
 		 670 aa  58.2  0.0000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.618015  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1006  histidine kinase  26.94 
 
 		 967 aa  58.2  0.0000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1082  GAF sensor signal transduction histidine kinase  29.35 
 
 		 401 aa  58.2  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1568  histidine kinase  30.13 
 
 		 462 aa  57.4  0.0000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0448  putative signal transduction histidine kinase  26.46 
 
 		 615 aa  57  0.0000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.844769  normal  0.742785 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6033  histidine kinase  28.07 
 
 		 726 aa  57.4  0.0000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.579668 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5015  GAF sensor signal transduction histidine kinase  29.14 
 
 		 399 aa  57  0.0000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.36327  normal  0.324397 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0744  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.03 
 
 		 660 aa  56.6  0.0000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1204  multi-sensor signal transduction histidine kinase  24.79 
 
 		 779 aa  56.2  0.0000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3325  histidine kinase  34.35 
 
 		 696 aa  55.8  0.0000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.868866  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1913  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.76 
 
 		 700 aa  55.8  0.0000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.6571 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3096  GAF sensor signal transduction histidine kinase  30.38 
 
 		 578 aa  55.5  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6402  putative signal transduction histidine kinase  31.74 
 
 		 271 aa  55.1  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.274276 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1121  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.94 
 
 		 661 aa  55.1  0.000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1357  GAF sensor signal transduction histidine kinase  28.77 
 
 		 403 aa  55.8  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.246673  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3669  histidine kinase  30.47 
 
 		 489 aa  54.3  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003135  sensor histidine kinase  24.14 
 
 		 451 aa  54.3  0.000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.291514  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0649  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.9 
 
 		 490 aa  54.3  0.000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1055  putative signal transduction histidine kinase  30.43 
 
 		 401 aa  54.7  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.64157  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1071  GAF sensor signal transduction histidine kinase  30.43 
 
 		 401 aa  54.7  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0809665 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1215  PAS  27.9 
 
 		 515 aa  53.9  0.000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6031  Histidine kinase  30.04 
 
 		 338 aa  53.9  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.542402  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2603  Histidine kinase  29.55 
 
 		 720 aa  53.9  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00739798  normal  0.140215 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6050  histidine kinase  30.08 
 
 		 442 aa  53.5  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1610  putative signal transduction histidine kinase  32.33 
 
 		 485 aa  53.5  0.000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.149131 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0610  putative two-component system sensor kinase  32.5 
 
 		 372 aa  53.9  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3491  putative signal transduction histidine kinase  30.95 
 
 		 624 aa  53.9  0.000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2036  histidine kinase  29.15 
 
 		 381 aa  53.5  0.000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.103366 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3278  ATPase domain-containing protein  29.26 
 
 		 563 aa  53.9  0.000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.471224  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4390  putative signal transduction histidine kinase  29.57 
 
 		 795 aa  53.5  0.000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0806  histidine kinase  26.94 
 
 		 921 aa  53.5  0.000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0613  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.1 
 
 		 645 aa  52.4  0.000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.066657 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3510  histidine kinase  30.04 
 
 		 559 aa  52.4  0.000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.026405 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0966  Signal transduction histidine kinase  24.48 
 
 		 332 aa  52.8  0.000008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.763704  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0431  sensory box sensor histidine kinase  27.43 
 
 		 357 aa  52.4  0.000009  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.431568  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3575  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  26.38 
 
 		 475 aa  52.4  0.000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08896  putative transmembrane protein  22.81 
 
 		 680 aa  52.4  0.000009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1538  putative PAS/PAC sensor protein  31.3 
 
 		 495 aa  52  0.00001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0408  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.43 
 
 		 357 aa  52  0.00001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.414543  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2080  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.59 
 
 		 370 aa  52  0.00001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3391  histidine kinase  30.47 
 
 		 356 aa  52.4  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.382044  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1395  GAF sensor signal transduction histidine kinase  27.34 
 
 		 559 aa  52.4  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.735957  normal  0.354354 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1964  histidine kinase  35 
 
 		 475 aa  51.6  0.00001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06640  histidine kinase  28.02 
 
 		 404 aa  51.6  0.00001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.106239  normal  0.143286 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_373  sensor histidine kinase  27.43 
 
 		 357 aa  52  0.00001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0559697  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4291  histidine kinase  24.18 
 
 		 954 aa  52.4  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.608548  normal  0.104271 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4456  histidine kinase  30.6 
 
 		 410 aa  51.6  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2908  histidine kinase  26.79 
 
 		 246 aa  51.6  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.108136  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4870  GAF sensor signal transduction histidine kinase  29.63 
 
 		 566 aa  51.2  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.125677  normal  0.401535 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0153  histidine kinase  28.74 
 
 		 325 aa  51.6  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0199  histidine kinase  32.06 
 
 		 452 aa  51.2  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3099  putative signal transduction histidine kinase  29.57 
 
 		 271 aa  51.2  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.568452  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4230  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.3 
 
 		 478 aa  51.2  0.00002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.304751 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5386  two component sensor kinase  30.99 
 
 		 361 aa  51.2  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1652  histidine kinase  32.07 
 
 		 373 aa  50.8  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000168648  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0554  Histidine kinase  30.45 
 
 		 687 aa  50.4  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.158949  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1315  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  23.97 
 
 		 344 aa  50.8  0.00003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01310  signal transduction histidine kinase  23.84 
 
 		 421 aa  50.8  0.00003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.192062  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0123  sensor histidine kinase  27.27 
 
 		 466 aa  50.8  0.00003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2521  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.33 
 
 		 594 aa  50.8  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0533071  normal  0.360744 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2497  histidine kinase  28.4 
 
 		 1031 aa  50.4  0.00003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0918719  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1706  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.29 
 
 		 564 aa  50.4  0.00003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.98975  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0456  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.02 
 
 		 775 aa  50.4  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00143274 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1133  putative signal transduction histidine kinase  31.06 
 
 		 403 aa  50.4  0.00003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5321  histidine kinase  29.67 
 
 		 470 aa  50.8  0.00003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0321  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.43 
 
 		 476 aa  50.8  0.00003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0484  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.6 
 
 		 473 aa  50.1  0.00004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0185  histidine kinase  24.69 
 
 		 395 aa  50.4  0.00004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000303796  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>