More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_3099 on replicon NC_008390
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008390  Bamb_3099  putative signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 271 aa  529  1e-149  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.568452  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2965  putative signal transduction histidine kinase  96.31 
 
 		 271 aa  511  1e-144  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.314596 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6402  putative signal transduction histidine kinase  82.29 
 
 		 271 aa  424  1e-118  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.274276 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3054  putative signal transduction histidine kinase  83.76 
 
 		 271 aa  403  1e-111  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.552919  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3073  putative signal transduction histidine kinase  83.39 
 
 		 271 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3051  putative signal transduction histidine kinase  73.72 
 
 		 274 aa  379  1e-104  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.994959  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2440  putative signal transduction histidine kinase  85.9 
 
 		 274 aa  337  9.999999999999999e-92  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0210  sensor kinase protein  62.08 
 
 		 280 aa  275  5e-73  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0232  putative sensor histidine kinase  63.22 
 
 		 282 aa  261  1e-68  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.22014  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0426  sensor kinase protein, putative  62.74 
 
 		 284 aa  260  2e-68  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0367403  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0244  putative sensor histidine kinase  62.26 
 
 		 286 aa  258  5.0000000000000005e-68  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0375  putative signal transduction histidine kinase  51.97 
 
 		 292 aa  242  5e-63  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4346  putative signal transduction histidine kinase  49.31 
 
 		 288 aa  234  9e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.727332 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0098  histidine kinase  53.54 
 
 		 288 aa  230  2e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.625315  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2903  transmembrane sensor kinase vsrA transcription regulator protein  38.03 
 
 		 459 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.419301  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0921  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.62 
 
 		 446 aa  115  6e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0880  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.32 
 
 		 446 aa  112  5e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.263045  normal  0.427062 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2127  sensor histidine kinase  37.39 
 
 		 313 aa  107  3e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.289713  normal  0.113702 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3614  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.32 
 
 		 298 aa  107  3e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.753486  normal  0.27992 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1808  histidine kinase  34.12 
 
 		 461 aa  106  4e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3956  histidine kinase, dimerization and phosphoacceptor region  33.92 
 
 		 323 aa  105  5e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0766  histidine kinase  35.65 
 
 		 464 aa  104  2e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.701174  normal  0.667801 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0652  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 382 aa  103  3e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.625385 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1399  PAS  35.51 
 
 		 683 aa  102  7e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.04458 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0253  sensory box histidine kinase  32.66 
 
 		 830 aa  102  8e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2043  histidine kinase  31.63 
 
 		 388 aa  102  9e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1668  histidine kinase  34.39 
 
 		 298 aa  100  3e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.891257 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3863  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.94 
 
 		 446 aa  100  3e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.165954  normal  0.826823 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4381  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  32.72 
 
 		 372 aa  100  3e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2833  histidine kinase  33.8 
 
 		 447 aa  100  4e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.665069  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4109  histidine kinase  34.4 
 
 		 439 aa  99.8  4e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3510  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.8 
 
 		 447 aa  99.8  4e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1874  histidine kinase  35.78 
 
 		 293 aa  99.8  5e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0031  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.6 
 
 		 468 aa  99.4  6e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.231222  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2291  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.4 
 
 		 464 aa  99.4  6e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1573  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, dimerization and phosphoacceptor region  34.1 
 
 		 373 aa  99  8e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1644  histidine kinase  33.03 
 
 		 296 aa  98.6  9e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.518526  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0476  histidine kinase  37.79 
 
 		 464 aa  98.6  1e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_935  sensor histidine kinase  31.96 
 
 		 1226 aa  98.6  1e-19  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3748  histidine kinase  30.26 
 
 		 287 aa  97.4  2e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5321  histidine kinase  33.48 
 
 		 470 aa  96.7  4e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0895  sensor histidine kinase  33.17 
 
 		 451 aa  96.3  5e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.622783  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1587  sensor protein  31.82 
 
 		 493 aa  95.9  6e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.234957  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5549  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.74 
 
 		 370 aa  95.9  6e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.441753  normal  0.532681 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0357  sensor histidine kinase  32.3 
 
 		 459 aa  95.9  7e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.450318  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2388  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.47 
 
 		 535 aa  95.5  7e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.219764  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3211  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  31.05 
 
 		 394 aa  95.5  7e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2438  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.24 
 
 		 599 aa  95.5  8e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0442  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.6 
 
 		 485 aa  95.5  9e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.12569  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1988  putative signal transduction histidine kinase  29.3 
 
 		 479 aa  94.7  1e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00146198  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1456  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.32 
 
 		 489 aa  95.1  1e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.249637 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003135  sensor histidine kinase  31.67 
 
 		 451 aa  94.7  1e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.291514  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0142  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.48 
 
 		 485 aa  94.7  1e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.843077 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6241  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.42 
 
 		 748 aa  94  2e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2660  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.32 
 
 		 494 aa  94.4  2e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.575282 
 
 
-
 
NC_002936  DET1064  sensory box sensor histidine kinase  30 
 
 		 1101 aa  93.6  3e-18  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0946  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.17 
 
 		 1229 aa  93.6  3e-18  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07820  putative histidine kinase  33.18 
 
 		 797 aa  93.6  3e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0365473 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2714  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.69 
 
 		 1168 aa  93.6  3e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0674  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.46 
 
 		 447 aa  94  3e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.504244  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0409  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.6 
 
 		 795 aa  93.2  4e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0443  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.6 
 
 		 795 aa  93.2  4e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.351986  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3067  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  33.64 
 
 		 373 aa  93.2  4e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0649  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.11 
 
 		 490 aa  93.2  4e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4793  cyclic nucleotide-binding protein  30.87 
 
 		 795 aa  92.8  5e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.271636  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0150  histidine kinase  34.48 
 
 		 485 aa  92.4  7e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3793  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 373 aa  92.4  7e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1596  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  33.02 
 
 		 385 aa  92.4  8e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00430448 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0744  sensory box histidine kinase  33.18 
 
 		 799 aa  92  9e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.13864  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5127  PAS/PAC sensor Signal transduction histidine kinase  30.57 
 
 		 799 aa  92  9e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0814  signal transduction histidine kinase, glucose-6-phosphate specific  31.36 
 
 		 466 aa  92  9e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000114737  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2235  histidine kinase  34.27 
 
 		 457 aa  91.7  1e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21830  histidine kinase  28.5 
 
 		 391 aa  91.7  1e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00305219  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2549  GAF sensor signal transduction histidine kinase  31.78 
 
 		 456 aa  91.7  1e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1405  sensor histidine kinase  30.43 
 
 		 483 aa  90.5  2e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0589016  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4619  PAS  32.47 
 
 		 670 aa  90.5  3e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.751025 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02702  histidine kinase  31.78 
 
 		 456 aa  90.5  3e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4289  GAF sensor signal transduction histidine kinase  33.76 
 
 		 552 aa  90.5  3e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4005  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.33 
 
 		 801 aa  90.1  3e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0582  signal transduction histidine kinase-like protein  33.33 
 
 		 394 aa  90.5  3e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6820  histidine kinase  30.45 
 
 		 278 aa  89.4  6e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.519919  normal  0.0817727 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0817  signal transduction histidine kinase, glucose-6-phosphate specific  32.41 
 
 		 466 aa  89  8e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000394288  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3041  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.6 
 
 		 691 aa  88.6  9e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00734608 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0746  histidine kinase  30.41 
 
 		 387 aa  89  9e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2179  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  32 
 
 		 385 aa  88.2  1e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.901266 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6559  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.16 
 
 		 541 aa  88.6  1e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.59439 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1512  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.45 
 
 		 514 aa  87.8  2e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1268  histidine kinase  27.7 
 
 		 392 aa  87.8  2e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2027  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  33.5 
 
 		 401 aa  87  3e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.109719  normal  0.72788 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0153  histidine kinase  33.01 
 
 		 325 aa  86.7  3e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6398  histidine kinase  30.73 
 
 		 461 aa  87  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.176497 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0321  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.1 
 
 		 476 aa  87  3e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0564  putative signal transduction histidine kinase  32.27 
 
 		 383 aa  86.7  4e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4714  Two-component sensor histidine kinase  31.42 
 
 		 447 aa  86.3  4e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5078  histidine kinase  35.15 
 
 		 368 aa  86.3  5e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.9788 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0440  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.52 
 
 		 795 aa  85.9  6e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5967  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.72 
 
 		 605 aa  85.9  6e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.142305 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1238  histidine kinase  31.78 
 
 		 377 aa  85.9  6e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0477765  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2912  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.03 
 
 		 339 aa  85.9  7e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3243  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.57 
 
 		 784 aa  85.9  7e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>